RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511663.5

SH3BP2-220, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP2, Length 966 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-220ENST00000511663 UGT1A4P22310 534 aa18.89■□□□□ 0.61
SH3BP2-220ENST00000511663 FECHP22830 423 aa18.89■□□□□ 0.61
SH3BP2-220ENST00000511663 CD68P34810 354 aaPredicted RBP18.89■□□□□ 0.61
SH3BP2-220ENST00000511663 CASRP41180 1078 aa18.89■□□□□ 0.61
SH3BP2-220ENST00000511663 MAGEA1P43355 309 aa18.89■□□□□ 0.61
SH3BP2-220ENST00000511663 WASHC5Q12768 1159 aa18.89■□□□□ 0.61
SH3BP2-220ENST00000511663 PLCL1Q15111 1095 aa18.89■□□□□ 0.61
SH3BP2-220ENST00000511663 SLC1A5Q15758 541 aa18.89■□□□□ 0.61
SH3BP2-220ENST00000511663 CHRNA6Q15825 494 aa18.89■□□□□ 0.61
SH3BP2-220ENST00000511663 LONRF2Q1L5Z9 754 aa18.89■□□□□ 0.61
SH3BP2-220ENST00000511663 TMEM220Q6QAJ8 160 aa18.89■□□□□ 0.61
SH3BP2-220ENST00000511663 KDELC1Q6UW63 502 aa18.89■□□□□ 0.61
SH3BP2-220ENST00000511663 C11orf96Q7Z7L8 435 aa18.89■□□□□ 0.61
SH3BP2-220ENST00000511663 BPHLQ86WA6 291 aaPredicted RBP18.89■□□□□ 0.61
SH3BP2-220ENST00000511663 BEND7Q8N7W2 519 aaPredicted RBP18.89■□□□□ 0.61
SH3BP2-220ENST00000511663 SIDT2Q8NBJ9 832 aaKnown RBP18.89■□□□□ 0.61
SH3BP2-220ENST00000511663 KLHL6Q8WZ60 621 aa18.89■□□□□ 0.61
SH3BP2-220ENST00000511663 UBXN4Q92575 508 aa18.89■□□□□ 0.61
SH3BP2-220ENST00000511663 ZNF514Q96K75 400 aaPredicted RBP18.89■□□□□ 0.61
SH3BP2-220ENST00000511663 UGT1A7Q9HAW7 530 aa18.89■□□□□ 0.61
SH3BP2-220ENST00000511663 UGT1A10Q9HAW8 530 aa18.89■□□□□ 0.61
SH3BP2-220ENST00000511663 UGT1A8Q9HAW9 530 aa18.89■□□□□ 0.61
SH3BP2-220ENST00000511663 IL17CQ9P0M4 197 aa18.89■□□□□ 0.61
SH3BP2-220ENST00000511663 RSPH14Q9UHP6 348 aa18.89■□□□□ 0.61
SH3BP2-220ENST00000511663 CROTQ9UKG9 612 aa18.89■□□□□ 0.61
SH3BP2-220ENST00000511663 RARRES3Q9UL19 164 aa18.89■□□□□ 0.61
SH3BP2-220ENST00000511663 TMPRSS11EQ9UL52 423 aa18.89■□□□□ 0.61
SH3BP2-220ENST00000511663 WDR37Q9Y2I8 494 aa18.89■□□□□ 0.61
SH3BP2-220ENST00000511663 FLNBO75369 2602 aaKnown RBP18.88■□□□□ 0.61
SH3BP2-220ENST00000511663 PRR19A6NJB7 356 aa18.88■□□□□ 0.61
SH3BP2-220ENST00000511663 OR2AG2A6NM03 316 aa18.88■□□□□ 0.61
SH3BP2-220ENST00000511663 HACD1B0YJ81 288 aa18.88■□□□□ 0.61
SH3BP2-220ENST00000511663 F5H423 210 aaPredicted RBP18.88■□□□□ 0.61
SH3BP2-220ENST00000511663 STX7O15400 261 aaKnown RBP18.88■□□□□ 0.61
SH3BP2-220ENST00000511663 PECAM1P16284 738 aaPredicted RBP18.88■□□□□ 0.61
SH3BP2-220ENST00000511663 NELFEP18615 380 aaKnown RBP18.88■□□□□ 0.61
SH3BP2-220ENST00000511663 AKT1P31749 480 aa18.88■□□□□ 0.61
SH3BP2-220ENST00000511663 XRCC4Q13426 336 aa18.88■□□□□ 0.61
SH3BP2-220ENST00000511663 ERV3-1Q14264 604 aa18.88■□□□□ 0.61
SH3BP2-220ENST00000511663 LARP7Q4G0J3 582 aaKnown RBP eCLIP18.88■□□□□ 0.61
SH3BP2-220ENST00000511663 LACTB2Q53H82 288 aaPredicted RBP18.88■□□□□ 0.61
SH3BP2-220ENST00000511663 CCDC181Q5TID7 509 aa18.88■□□□□ 0.61
SH3BP2-220ENST00000511663 ARMC6Q6NXE6 501 aa18.88■□□□□ 0.61
SH3BP2-220ENST00000511663 ZNF567Q8N184 647 aa18.88■□□□□ 0.61
SH3BP2-220ENST00000511663 TTC30BQ8N4P2 665 aa18.88■□□□□ 0.61
SH3BP2-220ENST00000511663 RASGEF1AQ8N9B8 481 aa18.88■□□□□ 0.61
SH3BP2-220ENST00000511663 RBM41Q96IZ5 413 aaKnown RBP18.88■□□□□ 0.61
SH3BP2-220ENST00000511663 MRGPRX2Q96LB1 330 aa18.88■□□□□ 0.61
SH3BP2-220ENST00000511663 PSMD13Q9UNM6 376 aa18.88■□□□□ 0.61
SH3BP2-220ENST00000511663 POLHQ9Y253 713 aa18.88■□□□□ 0.61
SH3BP2-220ENST00000511663 MRPS18BQ9Y676 258 aaKnown RBP18.88■□□□□ 0.61
SH3BP2-220ENST00000511663 UBA6A0AVT1 1052 aaPredicted RBP18.87■□□□□ 0.61
SH3BP2-220ENST00000511663 C2orf81A6NN90 581 aa18.87■□□□□ 0.61
SH3BP2-220ENST00000511663 MKRN2OSH3BPM6 223 aa18.87■□□□□ 0.61
SH3BP2-220ENST00000511663 CHRNA4P43681 627 aa18.87■□□□□ 0.61
SH3BP2-220ENST00000511663 ACY1Q03154 408 aa18.87■□□□□ 0.61
SH3BP2-220ENST00000511663 DMPKQ09013 629 aa18.87■□□□□ 0.61
SH3BP2-220ENST00000511663 NOMO1Q15155 1222 aa18.87■□□□□ 0.61
SH3BP2-220ENST00000511663 RPE65Q16518 533 aa18.87■□□□□ 0.61
SH3BP2-220ENST00000511663 TAZQ16635 292 aa18.87■□□□□ 0.61
SH3BP2-220ENST00000511663 DDHD1Q8NEL9 900 aa18.87■□□□□ 0.61
SH3BP2-220ENST00000511663 ZNF398Q8TD17 642 aa18.87■□□□□ 0.61
SH3BP2-220ENST00000511663 HAUS1Q96CS2 278 aa18.87■□□□□ 0.61
SH3BP2-220ENST00000511663 RNF31Q96EP0 1072 aa18.87■□□□□ 0.61
SH3BP2-220ENST00000511663 FCRL4Q96PJ5 515 aa18.87■□□□□ 0.61
SH3BP2-220ENST00000511663 TSPY26PQ9H489 355 aa18.87■□□□□ 0.61
SH3BP2-220ENST00000511663 LUC7LQ9NQ29 371 aaKnown RBP18.87■□□□□ 0.61
SH3BP2-220ENST00000511663 IMP3Q9NV31 184 aaKnown RBP18.87■□□□□ 0.61
SH3BP2-220ENST00000511663 PIPSLA2A3N6 862 aa18.86■□□□□ 0.61
SH3BP2-220ENST00000511663 KLHL33A6NCF5 533 aa18.86■□□□□ 0.61
SH3BP2-220ENST00000511663 H7C0C1 242 aa18.86■□□□□ 0.61
SH3BP2-220ENST00000511663 BUD23O43709 281 aaKnown RBP18.86■□□□□ 0.61
SH3BP2-220ENST00000511663 ANXA9O76027 345 aa18.86■□□□□ 0.61
SH3BP2-220ENST00000511663 F8A1P23610 371 aa18.86■□□□□ 0.61
SH3BP2-220ENST00000511663 PBLDP30039 288 aaPredicted RBP18.86■□□□□ 0.61
SH3BP2-220ENST00000511663 ATP5OP48047 213 aa18.86■□□□□ 0.61
SH3BP2-220ENST00000511663 GEMP55040 296 aa18.86■□□□□ 0.61
SH3BP2-220ENST00000511663 PDE1BQ01064 536 aa18.86■□□□□ 0.61
SH3BP2-220ENST00000511663 TUBB3Q13509 450 aa18.86■□□□□ 0.61
SH3BP2-220ENST00000511663 KRT33BQ14525 404 aa18.86■□□□□ 0.61
SH3BP2-220ENST00000511663 PRPSAP1Q14558 356 aa18.86■□□□□ 0.61
SH3BP2-220ENST00000511663 FNBP1LQ5T0N5 605 aa18.86■□□□□ 0.61
SH3BP2-220ENST00000511663 GPRC6AQ5T6X5 926 aa18.86■□□□□ 0.61
SH3BP2-220ENST00000511663 ATP1A1-AS1Q5TC04 95 aa18.86■□□□□ 0.61
SH3BP2-220ENST00000511663 ITPRIPL1Q6GPH6 555 aa18.86■□□□□ 0.61
SH3BP2-220ENST00000511663 KATNAL2Q8IYT4 538 aa18.86■□□□□ 0.61
SH3BP2-220ENST00000511663 TWSG1Q9GZX9 223 aa18.86■□□□□ 0.61
SH3BP2-220ENST00000511663 EPN3Q9H201 632 aa18.86■□□□□ 0.61
SH3BP2-220ENST00000511663 ACSL5Q9ULC5 683 aa18.86■□□□□ 0.61
SH3BP2-220ENST00000511663 KCNMB2Q9Y691 235 aa18.86■□□□□ 0.61
SH3BP2-220ENST00000511663 hCG_1818297A0A087WSY0 165 aa18.85■□□□□ 0.61
SH3BP2-220ENST00000511663 CDC14CA4D256 554 aa18.85■□□□□ 0.61
SH3BP2-220ENST00000511663 LPOP22079 712 aaPredicted RBP18.85■□□□□ 0.61
SH3BP2-220ENST00000511663 CTNNA2P26232 953 aa18.85■□□□□ 0.61
SH3BP2-220ENST00000511663 CTSCP53634 463 aa18.85■□□□□ 0.61
SH3BP2-220ENST00000511663 HADHBP55084 474 aaKnown RBP18.85■□□□□ 0.61
SH3BP2-220ENST00000511663 NFE2L1Q14494 772 aa18.85■□□□□ 0.61
SH3BP2-220ENST00000511663 GSE1Q14687 1217 aa18.85■□□□□ 0.61
SH3BP2-220ENST00000511663 SPA17Q15506 151 aa18.85■□□□□ 0.61
SH3BP2-220ENST00000511663 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.5 ms