RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498268.1

USP34-222, Transcript of ubiquitin specific peptidase 34, human

TSL 3

Gene USP34, Length 497 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
USP34-222	ENST00000498268	PNLIPRP3	Q17RR3	467 aa		3.09	□□□□□ -1.91
USP34-222	ENST00000498268	ASPRV1	Q53RT3	343 aa		3.09	□□□□□ -1.91
USP34-222	ENST00000498268	LRIF1	Q5T3J3	769 aa		3.09	□□□□□ -1.91
USP34-222	ENST00000498268	CYP4A22	Q5TCH4	519 aa		3.09	□□□□□ -1.91
USP34-222	ENST00000498268	NAA35	Q5VZE5	725 aa		3.09	□□□□□ -1.91
USP34-222	ENST00000498268	SLC16A9	Q7RTY1	509 aa		3.09	□□□□□ -1.91
USP34-222	ENST00000498268	ISCA2	Q86U28	154 aa		3.09	□□□□□ -1.91
USP34-222	ENST00000498268	PLD3	Q8IV08	490 aa		3.09	□□□□□ -1.91
USP34-222	ENST00000498268	LMNTD2	Q8IXW0	634 aa		3.09	□□□□□ -1.91
USP34-222	ENST00000498268	CRYBG2	Q8N1P7	616 aa		3.09	□□□□□ -1.91
USP34-222	ENST00000498268	FBXL16	Q8N461	479 aa		3.09	□□□□□ -1.91
USP34-222	ENST00000498268	GCSAM	Q8N6F7	178 aa		3.09	□□□□□ -1.91
USP34-222	ENST00000498268	C1orf52	Q8N6N3	182 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.91
USP34-222	ENST00000498268	TRIM63	Q969Q1	353 aa		3.09	□□□□□ -1.91
USP34-222	ENST00000498268	FGFBP2	Q9BYJ0	223 aa		3.09	□□□□□ -1.91
USP34-222	ENST00000498268	SIL1	Q9H173	461 aa		3.09	□□□□□ -1.91
USP34-222	ENST00000498268	SEMA6A	Q9H2E6	1030 aa		3.09	□□□□□ -1.91
USP34-222	ENST00000498268	MAGIX	Q9H6Y5	334 aa		3.09	□□□□□ -1.91
USP34-222	ENST00000498268	SCPEP1	Q9HB40	452 aa		3.09	□□□□□ -1.91
USP34-222	ENST00000498268	PRR34	Q9NV39	138 aa		3.09	□□□□□ -1.91
USP34-222	ENST00000498268	MTMR10	Q9NXD2	777 aa		3.09	□□□□□ -1.91
USP34-222	ENST00000498268	ARID4B	Q4LE39	1312 aa	Predicted RBP	3.09	□□□□□ -1.91
USP34-222	ENST00000498268	IGLV7-46	A0A075B6I9	117 aa		3.08	□□□□□ -1.92
USP34-222	ENST00000498268	GIMAP1-GIMAP5	A0A087WTJ2	511 aa		3.08	□□□□□ -1.92
USP34-222	ENST00000498268		A0A087WW49	117 aa		3.08	□□□□□ -1.92
USP34-222	ENST00000498268	IGLV9-49	A0A0B4J1Y8	123 aa		3.08	□□□□□ -1.92
USP34-222	ENST00000498268	OR2M5	A3KFT3	312 aa		3.08	□□□□□ -1.92
USP34-222	ENST00000498268	PRR32	B1ATL7	298 aa		3.08	□□□□□ -1.92
USP34-222	ENST00000498268	IFRD1	O00458	451 aa	Predicted RBP	3.08	□□□□□ -1.92
USP34-222	ENST00000498268	ZNF197	O14709	1029 aa		3.08	□□□□□ -1.92
USP34-222	ENST00000498268	TPD52L2	O43399	206 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
USP34-222	ENST00000498268	AP2A2	O94973	939 aa		3.08	□□□□□ -1.92
USP34-222	ENST00000498268	PAFAH1B1	P43034	410 aa		3.08	□□□□□ -1.92
USP34-222	ENST00000498268	CTSC	P53634	463 aa		3.08	□□□□□ -1.92
USP34-222	ENST00000498268	SLC8A3	P57103	927 aa		3.08	□□□□□ -1.92
USP34-222	ENST00000498268	P2RY6	Q15077	328 aa		3.08	□□□□□ -1.92
USP34-222	ENST00000498268	CTU2	Q2VPK5	515 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
USP34-222	ENST00000498268	ARHGEF16	Q5VV41	709 aa		3.08	□□□□□ -1.92
USP34-222	ENST00000498268	ALS2CL	Q60I27	953 aa		3.08	□□□□□ -1.92
USP34-222	ENST00000498268	CYP26C1	Q6V0L0	522 aa		3.08	□□□□□ -1.92
USP34-222	ENST00000498268	CNTROB	Q8N137	903 aa		3.08	□□□□□ -1.92
USP34-222	ENST00000498268	MORC4	Q8TE76	937 aa		3.08	□□□□□ -1.92
USP34-222	ENST00000498268	OMA1	Q96E52	524 aa		3.08	□□□□□ -1.92
USP34-222	ENST00000498268	GIMAP5	Q96F15	307 aa		3.08	□□□□□ -1.92
USP34-222	ENST00000498268	AGAP3	Q96P47	875 aa		3.08	□□□□□ -1.92
USP34-222	ENST00000498268	NOL12	Q9UGY1	213 aa	Known RBP eCLIP	3.08	□□□□□ -1.92
USP34-222	ENST00000498268	KLK13	Q9UKR3	277 aa		3.08	□□□□□ -1.92
USP34-222	ENST00000498268	RABGAP1	Q9Y3P9	1069 aa		3.08	□□□□□ -1.92
USP34-222	ENST00000498268	CSAG2	Q9Y5P2	127 aa		3.08	□□□□□ -1.92
USP34-222	ENST00000498268	CYP46A1	Q9Y6A2	500 aa		3.08	□□□□□ -1.92
USP34-222	ENST00000498268	MAU2	Q9Y6X3	613 aa		3.08	□□□□□ -1.92
USP34-222	ENST00000498268	KDM3A	Q9Y4C1	1321 aa		3.08	□□□□□ -1.92
USP34-222	ENST00000498268	IGHV4-4	A0A075B6R2	117 aa		3.07	□□□□□ -1.92
USP34-222	ENST00000498268	ZNF217	O75362	1048 aa		3.07	□□□□□ -1.92
USP34-222	ENST00000498268	CSPG5	O95196	566 aa		3.07	□□□□□ -1.92
USP34-222	ENST00000498268	CEBPZ	Q03701	1054 aa	Known RBP	3.07	□□□□□ -1.92
USP34-222	ENST00000498268	PRKAA1	Q13131	559 aa		3.07	□□□□□ -1.92
USP34-222	ENST00000498268	FRG1	Q14331	258 aa	Known RBP	3.07	□□□□□ -1.92
USP34-222	ENST00000498268	TAF12	Q16514	161 aa		3.07	□□□□□ -1.92
USP34-222	ENST00000498268	CDC73	Q6P1J9	531 aa		3.07	□□□□□ -1.92
USP34-222	ENST00000498268	ANKRD18A	Q8IVF6	992 aa		3.07	□□□□□ -1.92
USP34-222	ENST00000498268	ANKRD42	Q8N9B4	389 aa		3.07	□□□□□ -1.92
USP34-222	ENST00000498268	ZNF383	Q8NA42	475 aa		3.07	□□□□□ -1.92
USP34-222	ENST00000498268	ZFAND2B	Q8WV99	257 aa		3.07	□□□□□ -1.92
USP34-222	ENST00000498268	SMPDL3B	Q92485	455 aa		3.07	□□□□□ -1.92
USP34-222	ENST00000498268	HTRA1	Q92743	480 aa		3.07	□□□□□ -1.92
USP34-222	ENST00000498268	SAAL1	Q96ER3	474 aa		3.07	□□□□□ -1.92
USP34-222	ENST00000498268	FOXN4	Q96NZ1	517 aa		3.07	□□□□□ -1.92
USP34-222	ENST00000498268	TRIM51	Q9BSJ1	452 aa		3.07	□□□□□ -1.92
USP34-222	ENST00000498268	RANGRF	Q9HD47	186 aa	Predicted RBP	3.07	□□□□□ -1.92
USP34-222	ENST00000498268	ECHDC1	Q9NTX5	307 aa		3.07	□□□□□ -1.92
USP34-222	ENST00000498268	COQ3	Q9NZJ6	369 aa		3.07	□□□□□ -1.92
USP34-222	ENST00000498268	TMEM184B	Q9Y519	407 aa	Predicted RBP	3.07	□□□□□ -1.92
USP34-222	ENST00000498268	OR6C76	A6NM76	312 aa		3.06	□□□□□ -1.92
USP34-222	ENST00000498268	EIF3CL	B5ME19	914 aa	Known RBP	3.06	□□□□□ -1.92
USP34-222	ENST00000498268	GPR137B	O60478	399 aa		3.06	□□□□□ -1.92
USP34-222	ENST00000498268	PAGE4	O60829	102 aa		3.06	□□□□□ -1.92
USP34-222	ENST00000498268	EDN1	P05305	212 aa		3.06	□□□□□ -1.92
USP34-222	ENST00000498268	DNAH10OS	P0CZ25	163 aa		3.06	□□□□□ -1.92
USP34-222	ENST00000498268	CKMT2	P17540	419 aa		3.06	□□□□□ -1.92
USP34-222	ENST00000498268	EPHA8	P29322	1005 aa	Predicted RBP	3.06	□□□□□ -1.92
USP34-222	ENST00000498268	PRCP	P42785	496 aa		3.06	□□□□□ -1.92
USP34-222	ENST00000498268	TUB	P50607	506 aa		3.06	□□□□□ -1.92
USP34-222	ENST00000498268	CDH11	P55287	796 aa		3.06	□□□□□ -1.92
USP34-222	ENST00000498268	EIF3B	P55884	814 aa	Known RBP	3.06	□□□□□ -1.92
USP34-222	ENST00000498268	VAMP2	P63027	116 aa		3.06	□□□□□ -1.92
USP34-222	ENST00000498268	MFAP5	Q13361	173 aa		3.06	□□□□□ -1.92
USP34-222	ENST00000498268	TRPC3	Q13507	836 aa		3.06	□□□□□ -1.92
USP34-222	ENST00000498268	DENND5B	Q6ZUT9	1274 aa		3.06	□□□□□ -1.92
USP34-222	ENST00000498268	CDC20B	Q86Y33	519 aa		3.06	□□□□□ -1.92
USP34-222	ENST00000498268	CEP97	Q8IW35	865 aa		3.06	□□□□□ -1.92
USP34-222	ENST00000498268	LINC00612	Q8N6U2	182 aa		3.06	□□□□□ -1.92
USP34-222	ENST00000498268	NFKBID	Q8NI38	313 aa		3.06	□□□□□ -1.92
USP34-222	ENST00000498268	PIP5K1A	Q99755	562 aa		3.06	□□□□□ -1.92
USP34-222	ENST00000498268	SYT15	Q9BQS2	421 aa		3.06	□□□□□ -1.92
USP34-222	ENST00000498268	HERPUD2	Q9BSE4	406 aa		3.06	□□□□□ -1.92
USP34-222	ENST00000498268	TAB2	Q9NYJ8	693 aa		3.06	□□□□□ -1.92
USP34-222	ENST00000498268	IGHV4-61	A0A0C4DH41	118 aa		3.05	□□□□□ -1.92
USP34-222	ENST00000498268		A0A1W2PQF6	199 aa		3.05	□□□□□ -1.92
USP34-222	ENST00000498268	TMEM189-UBE2V1	I3L0A0	370 aa		3.05	□□□□□ -1.92

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