RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497511.5

SKAP2-209, Transcript of src kinase associated phosphoprotein 2, human

TSL 4

Gene SKAP2, Length 585 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SKAP2-209	ENST00000497511	SCRN2	Q96FV2	425 aa		10.69	□□□□□ -0.7
SKAP2-209	ENST00000497511	C9orf72	Q96LT7	481 aa		10.69	□□□□□ -0.7
SKAP2-209	ENST00000497511	NUDCD1	Q96RS6	583 aa		10.69	□□□□□ -0.7
SKAP2-209	ENST00000497511	ABCG8	Q9H221	673 aa		10.69	□□□□□ -0.7
SKAP2-209	ENST00000497511	OSGEPL1	Q9H4B0	414 aa		10.69	□□□□□ -0.7
SKAP2-209	ENST00000497511	NOD2	Q9HC29	1040 aa		10.69	□□□□□ -0.7
SKAP2-209	ENST00000497511	NLRC4	Q9NPP4	1024 aa		10.69	□□□□□ -0.7
SKAP2-209	ENST00000497511	SIDT1	Q9NXL6	827 aa	Known RBP	10.69	□□□□□ -0.7
SKAP2-209	ENST00000497511	LUZP4	Q9P127	313 aa		10.69	□□□□□ -0.7
SKAP2-209	ENST00000497511	CPNE7	Q9UBL6	633 aa		10.69	□□□□□ -0.7
SKAP2-209	ENST00000497511	TBC1D29	Q9UFV1	150 aa		10.69	□□□□□ -0.7
SKAP2-209	ENST00000497511	PCSK1N	Q9UHG2	260 aa		10.69	□□□□□ -0.7
SKAP2-209	ENST00000497511	KIR2DS5	A0A0G2JLQ3	304 aa		10.68	□□□□□ -0.7
SKAP2-209	ENST00000497511		A0A0G2JNG1	304 aa		10.68	□□□□□ -0.7
SKAP2-209	ENST00000497511	ARGFX	A6NJG6	315 aa		10.68	□□□□□ -0.7
SKAP2-209	ENST00000497511	OR5K4	A6NMS3	321 aa		10.68	□□□□□ -0.7
SKAP2-209	ENST00000497511	EIF3CL	B5ME19	914 aa	Known RBP	10.68	□□□□□ -0.7
SKAP2-209	ENST00000497511	KIR2DS3	K7RE56	304 aa		10.68	□□□□□ -0.7
SKAP2-209	ENST00000497511	ATP1A1	P05023	1023 aa	Known RBP	10.68	□□□□□ -0.7
SKAP2-209	ENST00000497511	TPM2	P07951	284 aa		10.68	□□□□□ -0.7
SKAP2-209	ENST00000497511	UNG	P13051	313 aa	Predicted RBP	10.68	□□□□□ -0.7
SKAP2-209	ENST00000497511	F3	P13726	295 aa		10.68	□□□□□ -0.7
SKAP2-209	ENST00000497511	TNFAIP3	P21580	790 aa		10.68	□□□□□ -0.7
SKAP2-209	ENST00000497511	PSMA2	P25787	234 aa		10.68	□□□□□ -0.7
SKAP2-209	ENST00000497511	GSC	P56915	257 aa	Predicted RBP	10.68	□□□□□ -0.7
SKAP2-209	ENST00000497511	RPL7A	P62424	266 aa	Known RBP	10.68	□□□□□ -0.7
SKAP2-209	ENST00000497511	ITK	Q08881	620 aa		10.68	□□□□□ -0.7
SKAP2-209	ENST00000497511	TRAF2	Q12933	501 aa		10.68	□□□□□ -0.7
SKAP2-209	ENST00000497511	PTP4A2	Q12974	167 aa		10.68	□□□□□ -0.7
SKAP2-209	ENST00000497511	CHAF1B	Q13112	559 aa		10.68	□□□□□ -0.7
SKAP2-209	ENST00000497511	MRPL49	Q13405	166 aa	Known RBP	10.68	□□□□□ -0.7
SKAP2-209	ENST00000497511	KIR2DS5	Q14953	304 aa		10.68	□□□□□ -0.7
SKAP2-209	ENST00000497511	PTPRR	Q15256	657 aa		10.68	□□□□□ -0.7
SKAP2-209	ENST00000497511	INPP5J	Q15735	1006 aa	Predicted RBP	10.68	□□□□□ -0.7
SKAP2-209	ENST00000497511	CLEC16A	Q2KHT3	1053 aa		10.68	□□□□□ -0.7
SKAP2-209	ENST00000497511	LRRC66	Q68CR7	880 aa		10.68	□□□□□ -0.7
SKAP2-209	ENST00000497511	RFLNA	Q6ZTI6	216 aa		10.68	□□□□□ -0.7
SKAP2-209	ENST00000497511	TECPR1	Q7Z6L1	1165 aa		10.68	□□□□□ -0.7
SKAP2-209	ENST00000497511	PPP1R3B	Q86XI6	285 aa		10.68	□□□□□ -0.7
SKAP2-209	ENST00000497511	PHF13	Q86YI8	300 aa	Predicted RBP	10.68	□□□□□ -0.7
SKAP2-209	ENST00000497511	ARHGAP12	Q8IWW6	846 aa		10.68	□□□□□ -0.7
SKAP2-209	ENST00000497511	SRRM1	Q8IYB3	904 aa	Known RBP	10.68	□□□□□ -0.7
SKAP2-209	ENST00000497511	CT55	Q8WUE5	264 aa		10.68	□□□□□ -0.7
SKAP2-209	ENST00000497511	THAP4	Q8WY91	577 aa		10.68	□□□□□ -0.7
SKAP2-209	ENST00000497511	NSMCE3	Q96MG7	304 aa		10.68	□□□□□ -0.7
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF599	Q96NL3	588 aa		10.68	□□□□□ -0.7
SKAP2-209	ENST00000497511	PCDHB18P	Q96TA0	734 aa		10.68	□□□□□ -0.7
SKAP2-209	ENST00000497511	EIF3C	Q99613	913 aa	Known RBP	10.68	□□□□□ -0.7
SKAP2-209	ENST00000497511	RIOK2	Q9BVS4	552 aa	Known RBP	10.68	□□□□□ -0.7
SKAP2-209	ENST00000497511	TRIM55	Q9BYV6	548 aa		10.68	□□□□□ -0.7
SKAP2-209	ENST00000497511	ACTL8	Q9H568	366 aa		10.68	□□□□□ -0.7
SKAP2-209	ENST00000497511	FAM207A	Q9NSI2	230 aa	Predicted RBP	10.68	□□□□□ -0.7
SKAP2-209	ENST00000497511	PCMTD2	Q9NV79	361 aa		10.68	□□□□□ -0.7
SKAP2-209	ENST00000497511	MN1	Q10571	1320 aa	Predicted RBP	10.67	□□□□□ -0.7
SKAP2-209	ENST00000497511		A0A0U1RQS6	177 aa		10.67	□□□□□ -0.7
SKAP2-209	ENST00000497511	LILRA5	A6NI73	299 aa		10.67	□□□□□ -0.7
SKAP2-209	ENST00000497511	TCP11X1	B4DZS4	312 aa		10.67	□□□□□ -0.7
SKAP2-209	ENST00000497511	C21orf140	B9A014	251 aa		10.67	□□□□□ -0.7
SKAP2-209	ENST00000497511	PRPSAP2	O60256	369 aa		10.67	□□□□□ -0.7
SKAP2-209	ENST00000497511	SPAG6	O75602	509 aa		10.67	□□□□□ -0.7
SKAP2-209	ENST00000497511	UBXN7	O94888	489 aa		10.67	□□□□□ -0.7
SKAP2-209	ENST00000497511	PGLS	O95336	258 aa		10.67	□□□□□ -0.7
SKAP2-209	ENST00000497511	SOD1	P00441	154 aa		10.67	□□□□□ -0.7
SKAP2-209	ENST00000497511	VIP	P01282	170 aa		10.67	□□□□□ -0.7
SKAP2-209	ENST00000497511	F13B	P05160	661 aa		10.67	□□□□□ -0.7
SKAP2-209	ENST00000497511	CELA3A	P09093	270 aa		10.67	□□□□□ -0.7
SKAP2-209	ENST00000497511	TNFRSF8	P28908	595 aa		10.67	□□□□□ -0.7
SKAP2-209	ENST00000497511	MAX	P61244	160 aa		10.67	□□□□□ -0.7
SKAP2-209	ENST00000497511	RPS15	P62841	145 aa	Known RBP	10.67	□□□□□ -0.7
SKAP2-209	ENST00000497511	PDE1B	Q01064	536 aa		10.67	□□□□□ -0.7
SKAP2-209	ENST00000497511	CA9	Q16790	459 aa		10.67	□□□□□ -0.7
SKAP2-209	ENST00000497511	ERMARD	Q5T6L9	678 aa		10.67	□□□□□ -0.7
SKAP2-209	ENST00000497511	CPZ	Q66K79	652 aa		10.67	□□□□□ -0.7
SKAP2-209	ENST00000497511	NPW	Q8N729	165 aa		10.67	□□□□□ -0.7
SKAP2-209	ENST00000497511	MCCC1	Q96RQ3	725 aa	Predicted RBP	10.67	□□□□□ -0.7
SKAP2-209	ENST00000497511	AGAP2	Q99490	1192 aa		10.67	□□□□□ -0.7
SKAP2-209	ENST00000497511	PDE7B	Q9NP56	450 aa		10.67	□□□□□ -0.7
SKAP2-209	ENST00000497511	LHX9	Q9NQ69	397 aa		10.67	□□□□□ -0.7
SKAP2-209	ENST00000497511	TAB2	Q9NYJ8	693 aa		10.67	□□□□□ -0.7
SKAP2-209	ENST00000497511	VPS18	Q9P253	973 aa		10.67	□□□□□ -0.7
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF451	Q9Y4E5	1061 aa		10.67	□□□□□ -0.7
SKAP2-209	ENST00000497511	SPEN	Q96T58	3664 aa	Known RBP	10.66	□□□□□ -0.7
SKAP2-209	ENST00000497511	PDZK1P1	A8MUH7	402 aa		10.66	□□□□□ -0.7
SKAP2-209	ENST00000497511	TOX3	O15405	576 aa	Predicted RBP	10.66	□□□□□ -0.7
SKAP2-209	ENST00000497511	DPM1	O60762	260 aa		10.66	□□□□□ -0.7
SKAP2-209	ENST00000497511	RNF8	O76064	485 aa		10.66	□□□□□ -0.7
SKAP2-209	ENST00000497511	MTA2	O94776	668 aa		10.66	□□□□□ -0.7
SKAP2-209	ENST00000497511	RECK	O95980	971 aa		10.66	□□□□□ -0.7
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF30	P17039	623 aa		10.66	□□□□□ -0.7
SKAP2-209	ENST00000497511	SSTR4	P31391	388 aa		10.66	□□□□□ -0.7
SKAP2-209	ENST00000497511	MMP13	P45452	471 aa		10.66	□□□□□ -0.7
SKAP2-209	ENST00000497511	LEPR	P48357	1165 aa	Known RBP	10.66	□□□□□ -0.7
SKAP2-209	ENST00000497511	CHRNA6	Q15825	494 aa		10.66	□□□□□ -0.7
SKAP2-209	ENST00000497511	PRR30	Q53SZ7	412 aa	Predicted RBP	10.66	□□□□□ -0.7
SKAP2-209	ENST00000497511	FKBP15	Q5T1M5	1219 aa		10.66	□□□□□ -0.7
SKAP2-209	ENST00000497511	MARC1	Q5VT66	337 aa		10.66	□□□□□ -0.7
SKAP2-209	ENST00000497511	CACHD1	Q5VU97	1274 aa		10.66	□□□□□ -0.7
SKAP2-209	ENST00000497511	IRGC	Q6NXR0	463 aa		10.66	□□□□□ -0.7
SKAP2-209	ENST00000497511	FAM92B	Q6ZTR7	304 aa		10.66	□□□□□ -0.7
SKAP2-209	ENST00000497511	MON1B	Q7L1V2	547 aa		10.66	□□□□□ -0.7

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