RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490127.5

RBM3-209, Transcript of RNA binding motif protein 3, human

TSL 5

Gene RBM3, Length 567 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM3-209	ENST00000490127	PLA2G4E	Q3MJ16	856 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RBM3-209	ENST00000490127	KHDC1	Q4VXA5	237 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
RBM3-209	ENST00000490127	CRTC3	Q6UUV7	619 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RBM3-209	ENST00000490127	LRRTM4	Q86VH4	590 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RBM3-209	ENST00000490127	SFRP1	Q8N474	314 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RBM3-209	ENST00000490127	TRIM58	Q8NG06	486 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RBM3-209	ENST00000490127	OR10G6	Q8NH81	332 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RBM3-209	ENST00000490127	GDAP1	Q8TB36	358 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RBM3-209	ENST00000490127	SLC37A2	Q8TED4	501 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RBM3-209	ENST00000490127	KIAA1143	Q96AT1	154 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
RBM3-209	ENST00000490127	RTP4	Q96DX8	246 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RBM3-209	ENST00000490127	SLC45A3	Q96JT2	553 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RBM3-209	ENST00000490127	TEFM	Q96QE5	360 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
RBM3-209	ENST00000490127	SLC38A3	Q99624	504 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RBM3-209	ENST00000490127	TIMM29	Q9BSF4	260 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RBM3-209	ENST00000490127	EFHD1	Q9BUP0	239 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RBM3-209	ENST00000490127	ZCCHC2	Q9C0B9	1178 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
RBM3-209	ENST00000490127	EPN3	Q9H201	632 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RBM3-209	ENST00000490127	LRRC40	Q9H9A6	602 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RBM3-209	ENST00000490127	GPN2	Q9H9Y4	310 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
RBM3-209	ENST00000490127	SMOX	Q9NWM0	555 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RBM3-209	ENST00000490127	TMEM9	Q9P0T7	183 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RBM3-209	ENST00000490127	TBC1D29	Q9UFV1	150 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RBM3-209	ENST00000490127	FEZ2	Q9UHY8	353 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
RBM3-209	ENST00000490127	ANAPC2	Q9UJX6	822 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RBM3-209	ENST00000490127	TMPRSS11E	Q9UL52	423 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RBM3-209	ENST00000490127	ARL5A	Q9Y689	179 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RBM3-209	ENST00000490127	DOPEY2	Q9Y3R5	2298 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RBM3-209	ENST00000490127	ZFC3H1	O60293	1989 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
RBM3-209	ENST00000490127	BOD1L1	Q8NFC6	3051 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RBM3-209	ENST00000490127	ZNF106	Q9H2Y7	1883 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
RBM3-209	ENST00000490127		A6NCN8	305 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RBM3-209	ENST00000490127		A8MU76	341 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RBM3-209	ENST00000490127	GAPDHS	O14556	408 aa	Predicted RBP	11.11	□□□□□ -0.63
RBM3-209	ENST00000490127	KMO	O15229	486 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RBM3-209	ENST00000490127	NKX2-8	O15522	239 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RBM3-209	ENST00000490127	CDK14	O94921	469 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RBM3-209	ENST00000490127	PRAMEF1	O95521	474 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RBM3-209	ENST00000490127	METTL18	O95568	372 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RBM3-209	ENST00000490127	CRTAM	O95727	393 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RBM3-209	ENST00000490127	EML2	O95834	649 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RBM3-209	ENST00000490127	NTRK1	P04629	796 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RBM3-209	ENST00000490127	F3	P13726	295 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RBM3-209	ENST00000490127	LPO	P22079	712 aa	Predicted RBP	11.11	□□□□□ -0.63
RBM3-209	ENST00000490127	CSF2RB	P32927	897 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RBM3-209	ENST00000490127	CASR	P41180	1078 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RBM3-209	ENST00000490127	CLCNKA	P51800	687 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RBM3-209	ENST00000490127	PDE1B	Q01064	536 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RBM3-209	ENST00000490127	SPARCL1	Q14515	664 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RBM3-209	ENST00000490127	OASL	Q15646	514 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
RBM3-209	ENST00000490127	IGFBP7	Q16270	282 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RBM3-209	ENST00000490127	INSC	Q1MX18	579 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RBM3-209	ENST00000490127	SNAP47	Q5SQN1	464 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RBM3-209	ENST00000490127	ANKS6	Q68DC2	871 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RBM3-209	ENST00000490127	KCTD11	Q693B1	232 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RBM3-209	ENST00000490127	DENND5A	Q6IQ26	1287 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RBM3-209	ENST00000490127	NLGN4X	Q8N0W4	816 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RBM3-209	ENST00000490127	DDHD1	Q8NEL9	900 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RBM3-209	ENST00000490127	NLGN4Y	Q8NFZ3	816 aa	Predicted RBP	11.11	□□□□□ -0.63
RBM3-209	ENST00000490127	C9orf43	Q8TAL5	461 aa	Predicted RBP	11.11	□□□□□ -0.63
RBM3-209	ENST00000490127	BRSK1	Q8TDC3	778 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RBM3-209	ENST00000490127	OSGEPL1	Q9H4B0	414 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RBM3-209	ENST00000490127	STN1	Q9H668	368 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
RBM3-209	ENST00000490127	ARNT2	Q9HBZ2	717 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RBM3-209	ENST00000490127	ZNF71	Q9NQZ8	489 aa	Predicted RBP	11.11	□□□□□ -0.63
RBM3-209	ENST00000490127	KLC4	Q9NSK0	619 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RBM3-209	ENST00000490127	FKBPL	Q9UIM3	349 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RBM3-209	ENST00000490127	PILRA	Q9UKJ1	303 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RBM3-209	ENST00000490127	PPP2R2C	Q9Y2T4	447 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RBM3-209	ENST00000490127	PTPN13	Q12923	2485 aa		11.1	□□□□□ -0.63
RBM3-209	ENST00000490127	KIR2DS5	A0A0G2JLQ3	304 aa		11.1	□□□□□ -0.63
RBM3-209	ENST00000490127		A0A0G2JNG1	304 aa		11.1	□□□□□ -0.63
RBM3-209	ENST00000490127	GOLGA6L3	A6NEY3	463 aa		11.1	□□□□□ -0.63
RBM3-209	ENST00000490127	KIR2DS3	K7RE56	304 aa		11.1	□□□□□ -0.63
RBM3-209	ENST00000490127	DUX1	O43812	170 aa		11.1	□□□□□ -0.63
RBM3-209	ENST00000490127	UGT1A9	O60656	530 aa		11.1	□□□□□ -0.63
RBM3-209	ENST00000490127	SNX2	O60749	519 aa		11.1	□□□□□ -0.63
RBM3-209	ENST00000490127	AP2A1	O95782	977 aa		11.1	□□□□□ -0.63
RBM3-209	ENST00000490127	PRKAR1A	P10644	381 aa		11.1	□□□□□ -0.63
RBM3-209	ENST00000490127	ZNF7	P17097	686 aa	Predicted RBP	11.1	□□□□□ -0.63
RBM3-209	ENST00000490127	UGT1A6	P19224	532 aa		11.1	□□□□□ -0.63
RBM3-209	ENST00000490127	UGT1A1	P22309	533 aa		11.1	□□□□□ -0.63
RBM3-209	ENST00000490127	UGT1A4	P22310	534 aa		11.1	□□□□□ -0.63
RBM3-209	ENST00000490127	ZNF140	P52738	457 aa	Predicted RBP	11.1	□□□□□ -0.63
RBM3-209	ENST00000490127	FOXK1	P85037	733 aa		11.1	□□□□□ -0.63
RBM3-209	ENST00000490127	MC2R	Q01718	297 aa		11.1	□□□□□ -0.63
RBM3-209	ENST00000490127	MC1R	Q01726	317 aa		11.1	□□□□□ -0.63
RBM3-209	ENST00000490127	HHEX	Q03014	270 aa		11.1	□□□□□ -0.63
RBM3-209	ENST00000490127	TMEM115	Q12893	351 aa	Predicted RBP	11.1	□□□□□ -0.63
RBM3-209	ENST00000490127	MSLN	Q13421	630 aa	Predicted RBP	11.1	□□□□□ -0.63
RBM3-209	ENST00000490127	PTPRCAP	Q14761	206 aa		11.1	□□□□□ -0.63
RBM3-209	ENST00000490127	KIR2DS5	Q14953	304 aa		11.1	□□□□□ -0.63
RBM3-209	ENST00000490127	LDLRAP1	Q5SW96	308 aa		11.1	□□□□□ -0.63
RBM3-209	ENST00000490127	CHCHD2P9	Q5T1J5	151 aa	Predicted RBP	11.1	□□□□□ -0.63
RBM3-209	ENST00000490127	GPRC6A	Q5T6X5	926 aa		11.1	□□□□□ -0.63
RBM3-209	ENST00000490127	CEACAM20	Q6UY09	585 aa		11.1	□□□□□ -0.63
RBM3-209	ENST00000490127	SLC9B2	Q86UD5	537 aa		11.1	□□□□□ -0.63
RBM3-209	ENST00000490127	ZNF761	Q86XN6	746 aa	Predicted RBP	11.1	□□□□□ -0.63
RBM3-209	ENST00000490127	TRAPPC5	Q8IUR0	188 aa		11.1	□□□□□ -0.63
RBM3-209	ENST00000490127	ZNF547	Q8IVP9	402 aa		11.1	□□□□□ -0.63

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