RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489424.5

HDAC10-216, Transcript of histone deacetylase 10, human

TSL 5

Gene HDAC10, Length 759 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HDAC10-216	ENST00000489424	RAB33B	Q9H082	229 aa		17	■□□□□ 0.31
HDAC10-216	ENST00000489424	FBXO8	Q9NRD0	319 aa		17	■□□□□ 0.31
HDAC10-216	ENST00000489424	EPHA6	Q9UF33	1036 aa		17	■□□□□ 0.31
HDAC10-216	ENST00000489424	TMPRSS11E	Q9UL52	423 aa		17	■□□□□ 0.31
HDAC10-216	ENST00000489424	PRKAB1	Q9Y478	270 aa		17	■□□□□ 0.31
HDAC10-216	ENST00000489424	MN1	Q10571	1320 aa	Predicted RBP	16.99	■□□□□ 0.31
HDAC10-216	ENST00000489424	AHCTF1	Q8WYP5	2266 aa		16.99	■□□□□ 0.31
HDAC10-216	ENST00000489424	C9orf172	C9J069	976 aa		16.99	■□□□□ 0.31
HDAC10-216	ENST00000489424	STMND1	H3BQB6	276 aa		16.99	■□□□□ 0.31
HDAC10-216	ENST00000489424	AP3B1	O00203	1094 aa		16.99	■□□□□ 0.31
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF185	O15231	689 aa		16.99	■□□□□ 0.31
HDAC10-216	ENST00000489424	CRTAM	O95727	393 aa		16.99	■□□□□ 0.31
HDAC10-216	ENST00000489424	AGT	P01019	485 aa		16.99	■□□□□ 0.31
HDAC10-216	ENST00000489424	VIP	P01282	170 aa		16.99	■□□□□ 0.31
HDAC10-216	ENST00000489424	C9	P02748	559 aa		16.99	■□□□□ 0.31
HDAC10-216	ENST00000489424	FGF3	P11487	239 aa	Predicted RBP	16.99	■□□□□ 0.31
HDAC10-216	ENST00000489424	HGF	P14210	728 aa		16.99	■□□□□ 0.31
HDAC10-216	ENST00000489424	LAMB3	Q13751	1172 aa		16.99	■□□□□ 0.31
HDAC10-216	ENST00000489424	FAM182A	Q5T1J6	154 aa		16.99	■□□□□ 0.31
HDAC10-216	ENST00000489424	CCDC137	Q6PK04	289 aa	Known RBP	16.99	■□□□□ 0.31
HDAC10-216	ENST00000489424	TMEM26	Q6ZUK4	368 aa		16.99	■□□□□ 0.31
HDAC10-216	ENST00000489424	BEND7	Q8N7W2	519 aa	Predicted RBP	16.99	■□□□□ 0.31
HDAC10-216	ENST00000489424	BLOC1S5	Q8TDH9	187 aa		16.99	■□□□□ 0.31
HDAC10-216	ENST00000489424	CAPZA3	Q96KX2	299 aa		16.99	■□□□□ 0.31
HDAC10-216	ENST00000489424	RUNDC3B	Q96NL0	473 aa		16.99	■□□□□ 0.31
HDAC10-216	ENST00000489424	PRDM8	Q9NQV8	689 aa		16.99	■□□□□ 0.31
HDAC10-216	ENST00000489424	RAB6B	Q9NRW1	208 aa		16.99	■□□□□ 0.31
HDAC10-216	ENST00000489424	MGA	Q8IWI9	3026 aa		16.98	■□□□□ 0.31
HDAC10-216	ENST00000489424	PRAMEF33	A0A0G2JMD5	474 aa		16.98	■□□□□ 0.31
HDAC10-216	ENST00000489424	KIF2A	O00139	706 aa	Predicted RBP	16.98	■□□□□ 0.31
HDAC10-216	ENST00000489424	PRAMEF10	O60809	474 aa		16.98	■□□□□ 0.31
HDAC10-216	ENST00000489424	PHF2	O75151	1096 aa		16.98	■□□□□ 0.31
HDAC10-216	ENST00000489424	METTL18	O95568	372 aa		16.98	■□□□□ 0.31
HDAC10-216	ENST00000489424	AP2A1	O95782	977 aa		16.98	■□□□□ 0.31
HDAC10-216	ENST00000489424	ITGB2	P05107	769 aa		16.98	■□□□□ 0.31
HDAC10-216	ENST00000489424	ITIH1	P19827	911 aa		16.98	■□□□□ 0.31
HDAC10-216	ENST00000489424	CSF2RB	P32927	897 aa		16.98	■□□□□ 0.31
HDAC10-216	ENST00000489424	COIL	P38432	576 aa	Predicted RBP	16.98	■□□□□ 0.31
HDAC10-216	ENST00000489424	HADHA	P40939	763 aa		16.98	■□□□□ 0.31
HDAC10-216	ENST00000489424	ETV5	P41161	510 aa		16.98	■□□□□ 0.31
HDAC10-216	ENST00000489424	SLC19A1	P41440	591 aa		16.98	■□□□□ 0.31
HDAC10-216	ENST00000489424	CHRNA4	P43681	627 aa		16.98	■□□□□ 0.31
HDAC10-216	ENST00000489424	KCNJ1	P48048	391 aa		16.98	■□□□□ 0.31
HDAC10-216	ENST00000489424	FNTA	P49354	379 aa		16.98	■□□□□ 0.31
HDAC10-216	ENST00000489424	MC2R	Q01718	297 aa		16.98	■□□□□ 0.31
HDAC10-216	ENST00000489424	MSLN	Q13421	630 aa	Predicted RBP	16.98	■□□□□ 0.31
HDAC10-216	ENST00000489424	CYP1B1	Q16678	543 aa		16.98	■□□□□ 0.31
HDAC10-216	ENST00000489424	ARHGAP40	Q5TG30	622 aa		16.98	■□□□□ 0.31
HDAC10-216	ENST00000489424	NKAIN2	Q5VXU1	208 aa		16.98	■□□□□ 0.31
HDAC10-216	ENST00000489424	SYT10	Q6XYQ8	523 aa		16.98	■□□□□ 0.31
HDAC10-216	ENST00000489424	PPP1R21	Q6ZMI0	780 aa		16.98	■□□□□ 0.31
HDAC10-216	ENST00000489424	AMZ2	Q86W34	360 aa		16.98	■□□□□ 0.31
HDAC10-216	ENST00000489424	C17orf53	Q8N3J3	647 aa	Predicted RBP	16.98	■□□□□ 0.31
HDAC10-216	ENST00000489424	DNAAF3	Q8N9W5	541 aa		16.98	■□□□□ 0.31
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF398	Q8TD17	642 aa		16.98	■□□□□ 0.31
HDAC10-216	ENST00000489424	GORASP1	Q9BQQ3	440 aa		16.98	■□□□□ 0.31
HDAC10-216	ENST00000489424	ETNK1	Q9HBU6	452 aa		16.98	■□□□□ 0.31
HDAC10-216	ENST00000489424	CPNE5	Q9HCH3	593 aa		16.98	■□□□□ 0.31
HDAC10-216	ENST00000489424	BPIFA1	Q9NP55	256 aa		16.98	■□□□□ 0.31
HDAC10-216	ENST00000489424	SLC23A2	Q9UGH3	650 aa		16.98	■□□□□ 0.31
HDAC10-216	ENST00000489424	SMG1	Q96Q15	3661 aa	Known RBP	16.98	■□□□□ 0.31
HDAC10-216	ENST00000489424	KALRN	O60229	2985 aa		16.97	■□□□□ 0.31
HDAC10-216	ENST00000489424	GAPDHS	O14556	408 aa	Predicted RBP	16.97	■□□□□ 0.31
HDAC10-216	ENST00000489424	CAPN5	O15484	640 aa	Predicted RBP	16.97	■□□□□ 0.31
HDAC10-216	ENST00000489424	SNX2	O60749	519 aa		16.97	■□□□□ 0.31
HDAC10-216	ENST00000489424	SLC4A1	P02730	911 aa		16.97	■□□□□ 0.31
HDAC10-216	ENST00000489424	PRB1	P04280	392 aa		16.97	■□□□□ 0.31
HDAC10-216	ENST00000489424	HAL	P42357	657 aa		16.97	■□□□□ 0.31
HDAC10-216	ENST00000489424	MAPK10	P53779	464 aa		16.97	■□□□□ 0.31
HDAC10-216	ENST00000489424	SARNP	P82979	210 aa	Known RBP	16.97	■□□□□ 0.31
HDAC10-216	ENST00000489424	C19orf57	Q0VDD7	668 aa		16.97	■□□□□ 0.31
HDAC10-216	ENST00000489424	CHRNA6	Q15825	494 aa		16.97	■□□□□ 0.31
HDAC10-216	ENST00000489424	GPR33	Q49SQ1	333 aa		16.97	■□□□□ 0.31
HDAC10-216	ENST00000489424	DCAF12	Q5T6F0	453 aa		16.97	■□□□□ 0.31
HDAC10-216	ENST00000489424	TAB3	Q8N5C8	712 aa	Predicted RBP	16.97	■□□□□ 0.31
HDAC10-216	ENST00000489424	BMPER	Q8N8U9	685 aa		16.97	■□□□□ 0.31
HDAC10-216	ENST00000489424	ZSCAN1	Q8NBB4	408 aa		16.97	■□□□□ 0.31
HDAC10-216	ENST00000489424	GDAP1	Q8TB36	358 aa		16.97	■□□□□ 0.31
HDAC10-216	ENST00000489424	NCSTN	Q92542	709 aa		16.97	■□□□□ 0.31
HDAC10-216	ENST00000489424	TTC9	Q92623	222 aa		16.97	■□□□□ 0.31
HDAC10-216	ENST00000489424	ULK4	Q96C45	1275 aa		16.97	■□□□□ 0.31
HDAC10-216	ENST00000489424	LINC00615	Q96LM1	132 aa	Predicted RBP	16.97	■□□□□ 0.31
HDAC10-216	ENST00000489424	TRIT1	Q9H3H1	467 aa	Known RBP	16.97	■□□□□ 0.31
HDAC10-216	ENST00000489424	SLC40A1	Q9NP59	571 aa		16.97	■□□□□ 0.31
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF624	Q9P2J8	865 aa	Predicted RBP	16.97	■□□□□ 0.31
HDAC10-216	ENST00000489424	TRBV23OR9-2	A0A075B6M9	112 aa		16.96	■□□□□ 0.31
HDAC10-216	ENST00000489424	CCDC188	H7C350	402 aa		16.96	■□□□□ 0.31
HDAC10-216	ENST00000489424	EFS	O43281	561 aa		16.96	■□□□□ 0.31
HDAC10-216	ENST00000489424	KRT14	P02533	472 aa		16.96	■□□□□ 0.31
HDAC10-216	ENST00000489424	APRT	P07741	180 aa		16.96	■□□□□ 0.31
HDAC10-216	ENST00000489424	GSTM1	P09488	218 aa		16.96	■□□□□ 0.31
HDAC10-216	ENST00000489424	CCL4	P13236	92 aa		16.96	■□□□□ 0.31
HDAC10-216	ENST00000489424	PSMA3	P25788	255 aa		16.96	■□□□□ 0.31
HDAC10-216	ENST00000489424	RPL22	P35268	128 aa	Known RBP	16.96	■□□□□ 0.31
HDAC10-216	ENST00000489424	ATP1A2	P50993	1020 aa		16.96	■□□□□ 0.31
HDAC10-216	ENST00000489424	BASP1	P80723	227 aa	Known RBP	16.96	■□□□□ 0.31
HDAC10-216	ENST00000489424	GSTM4	Q03013	218 aa		16.96	■□□□□ 0.31
HDAC10-216	ENST00000489424	NFATC2	Q13469	925 aa		16.96	■□□□□ 0.31
HDAC10-216	ENST00000489424	PPP1R7	Q15435	360 aa		16.96	■□□□□ 0.31
HDAC10-216	ENST00000489424	KHDC1	Q4VXA5	237 aa	Known RBP	16.96	■□□□□ 0.31

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.3 ms