RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489406.1

UFD1-209, Transcript of ubiquitin recognition factor in ER associated degradation 1, humanhuman

TSL 2

Gene UFD1, Length 994 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFD1-209ENST00000489406 WISP2O76076 250 aa14.64□□□□□ -0.07
UFD1-209ENST00000489406 MTA2O94776 668 aa14.64□□□□□ -0.07
UFD1-209ENST00000489406 PFKFB1P16118 471 aa14.64□□□□□ -0.07
UFD1-209ENST00000489406 ZNF8P17098 575 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
UFD1-209ENST00000489406 DRG2P55039 364 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
UFD1-209ENST00000489406 ADCY2Q08462 1091 aa14.64□□□□□ -0.07
UFD1-209ENST00000489406 TRAF2Q12933 501 aa14.64□□□□□ -0.07
UFD1-209ENST00000489406 INSCQ1MX18 579 aa14.64□□□□□ -0.07
UFD1-209ENST00000489406 TDRD12Q587J7 1177 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
UFD1-209ENST00000489406 ZNF789Q5FWF6 425 aa14.64□□□□□ -0.07
UFD1-209ENST00000489406 ZFYVE27Q5T4F4 411 aa14.64□□□□□ -0.07
UFD1-209ENST00000489406 ZNF648Q5T619 568 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
UFD1-209ENST00000489406 ZNF385CQ66K41 422 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
UFD1-209ENST00000489406 CRTC3Q6UUV7 619 aa14.64□□□□□ -0.07
UFD1-209ENST00000489406 ABRAXAS1Q6UWZ7 409 aa14.64□□□□□ -0.07
UFD1-209ENST00000489406 ISLR2Q6UXK2 745 aa14.64□□□□□ -0.07
UFD1-209ENST00000489406 USP45Q70EL2 814 aa14.64□□□□□ -0.07
UFD1-209ENST00000489406 DNAAF3Q8N9W5 541 aa14.64□□□□□ -0.07
UFD1-209ENST00000489406 OR2Y1Q8NGV0 311 aa14.64□□□□□ -0.07
UFD1-209ENST00000489406 CPLX3Q8WVH0 158 aa14.64□□□□□ -0.07
UFD1-209ENST00000489406 PPM1MQ96MI6 270 aa14.64□□□□□ -0.07
UFD1-209ENST00000489406 SLC39A8Q9C0K1 460 aa14.64□□□□□ -0.07
UFD1-209ENST00000489406 FBXL4Q9UKA2 621 aa14.64□□□□□ -0.07
UFD1-209ENST00000489406 CCDC66A2RUB6 948 aa14.63□□□□□ -0.07
UFD1-209ENST00000489406 FADS2P1A8MWK0 482 aa14.63□□□□□ -0.07
UFD1-209ENST00000489406 TMEM150CB9EJG8 249 aa14.63□□□□□ -0.07
UFD1-209ENST00000489406 KLHL18O94889 574 aa14.63□□□□□ -0.07
UFD1-209ENST00000489406 IGFBP2P18065 325 aa14.63□□□□□ -0.07
UFD1-209ENST00000489406 ARG2P78540 354 aa14.63□□□□□ -0.07
UFD1-209ENST00000489406 CUL4AQ13619 759 aa14.63□□□□□ -0.07
UFD1-209ENST00000489406 CCDC14Q49A88 953 aa14.63□□□□□ -0.07
UFD1-209ENST00000489406 ENOSF1Q7L5Y1 443 aa14.63□□□□□ -0.07
UFD1-209ENST00000489406 TMEM35BQ8NCS4 154 aa14.63□□□□□ -0.07
UFD1-209ENST00000489406 WFDC11Q8NEX6 87 aa14.63□□□□□ -0.07
UFD1-209ENST00000489406 LHPPQ9H008 270 aa14.63□□□□□ -0.07
UFD1-209ENST00000489406 CATSPERBQ9H7T0 1116 aa14.63□□□□□ -0.07
UFD1-209ENST00000489406 METTL5Q9NRN9 209 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
UFD1-209ENST00000489406 GPATCH2LQ9NWQ4 482 aa14.63□□□□□ -0.07
UFD1-209ENST00000489406 HRASLS2Q9NWW9 162 aa14.63□□□□□ -0.07
UFD1-209ENST00000489406 ABI3Q9P2A4 366 aa14.63□□□□□ -0.07
UFD1-209ENST00000489406 ADGRG1Q9Y653 693 aa14.63□□□□□ -0.07
UFD1-209ENST00000489406 PCM1Q15154 2024 aa14.63□□□□□ -0.07
UFD1-209ENST00000489406 ARHGAP42A6NI28 874 aa14.62□□□□□ -0.07
UFD1-209ENST00000489406 FOXO6A8MYZ6 492 aa14.62□□□□□ -0.07
UFD1-209ENST00000489406 ZNF749O43361 778 aa14.62□□□□□ -0.07
UFD1-209ENST00000489406 CNOT3O75175 753 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
UFD1-209ENST00000489406 SLCO2B1O94956 709 aa14.62□□□□□ -0.07
UFD1-209ENST00000489406 ZWINTO95229 277 aa14.62□□□□□ -0.07
UFD1-209ENST00000489406 UMODP07911 640 aa14.62□□□□□ -0.07
UFD1-209ENST00000489406 CBSLP0DN79 551 aa14.62□□□□□ -0.07
UFD1-209ENST00000489406 CBSP35520 551 aa14.62□□□□□ -0.07
UFD1-209ENST00000489406 MFAP5Q13361 173 aa14.62□□□□□ -0.07
UFD1-209ENST00000489406 PCOLCEQ15113 449 aa14.62□□□□□ -0.07
UFD1-209ENST00000489406 INAQ16352 499 aa14.62□□□□□ -0.07
UFD1-209ENST00000489406 CES4AQ5XG92 561 aa14.62□□□□□ -0.07
UFD1-209ENST00000489406 ARHGAP36Q6ZRI8 547 aa14.62□□□□□ -0.07
UFD1-209ENST00000489406 GPR150Q8NGU9 434 aa14.62□□□□□ -0.07
UFD1-209ENST00000489406 GPT2Q8TD30 523 aa14.62□□□□□ -0.07
UFD1-209ENST00000489406 RXFP2Q8WXD0 754 aa14.62□□□□□ -0.07
UFD1-209ENST00000489406 SDCCAG3Q96C92 435 aa14.62□□□□□ -0.07
UFD1-209ENST00000489406 ALPK1Q96QP1 1244 aa14.62□□□□□ -0.07
UFD1-209ENST00000489406 PSKH2Q96QS6 385 aa14.62□□□□□ -0.07
UFD1-209ENST00000489406 C17orf62Q9BQA9 187 aa14.62□□□□□ -0.07
UFD1-209ENST00000489406 OR2AG1Q9H205 316 aa14.62□□□□□ -0.07
UFD1-209ENST00000489406 PDCL3Q9H2J4 239 aa14.62□□□□□ -0.07
UFD1-209ENST00000489406 SP110Q9HB58 689 aa14.62□□□□□ -0.07
UFD1-209ENST00000489406 FAM207AQ9NSI2 230 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
UFD1-209ENST00000489406 DNAJB12Q9NXW2 375 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
UFD1-209ENST00000489406 KIAA1468Q9P260 1216 aa14.62□□□□□ -0.07
UFD1-209ENST00000489406 ADAM21Q9UKJ8 722 aa14.62□□□□□ -0.07
UFD1-209ENST00000489406 PLEKHA6Q9Y2H5 1048 aa14.62□□□□□ -0.07
UFD1-209ENST00000489406 OR5K3A6NET4 321 aa14.61□□□□□ -0.07
UFD1-209ENST00000489406 PROM1O43490 865 aa14.61□□□□□ -0.07
UFD1-209ENST00000489406 PGLSO95336 258 aa14.61□□□□□ -0.07
UFD1-209ENST00000489406 LY6G6DO95868 133 aa14.61□□□□□ -0.07
UFD1-209ENST00000489406 CRYABP02511 175 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
UFD1-209ENST00000489406 ZNF7P17097 686 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
UFD1-209ENST00000489406 DNASE1P24855 282 aa14.61□□□□□ -0.07
UFD1-209ENST00000489406 SDC4P31431 198 aa14.61□□□□□ -0.07
UFD1-209ENST00000489406 RENBPP51606 427 aa14.61□□□□□ -0.07
UFD1-209ENST00000489406 SLC9A5Q14940 896 aa14.61□□□□□ -0.07
UFD1-209ENST00000489406 C1orf189Q5VU69 101 aa14.61□□□□□ -0.07
UFD1-209ENST00000489406 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
UFD1-209ENST00000489406 ARCQ7LC44 396 aa14.61□□□□□ -0.07
UFD1-209ENST00000489406 SLFN11Q7Z7L1 901 aa14.61□□□□□ -0.07
UFD1-209ENST00000489406 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
UFD1-209ENST00000489406 NTAN1Q96AB6 310 aa14.61□□□□□ -0.07
UFD1-209ENST00000489406 THOC3Q96J01 351 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
UFD1-209ENST00000489406 MAGED4Q96JG8 741 aa14.61□□□□□ -0.07
UFD1-209ENST00000489406 LMF1Q96S06 567 aa14.61□□□□□ -0.07
UFD1-209ENST00000489406 WDR24Q96S15 920 aa14.61□□□□□ -0.07
UFD1-209ENST00000489406 NOD2Q9HC29 1040 aa14.61□□□□□ -0.07
UFD1-209ENST00000489406 PLA2G3Q9NZ20 509 aa14.61□□□□□ -0.07
UFD1-209ENST00000489406 NDOR1Q9UHB4 597 aa14.61□□□□□ -0.07
UFD1-209ENST00000489406 SERTAD3Q9UJW9 196 aa14.61□□□□□ -0.07
UFD1-209ENST00000489406 CDYLQ9Y232 598 aa14.61□□□□□ -0.07
UFD1-209ENST00000489406 WDR37Q9Y2I8 494 aa14.61□□□□□ -0.07
UFD1-209ENST00000489406 TRAV17A0A0B4J275 112 aa14.6□□□□□ -0.07
UFD1-209ENST00000489406 SLC9B1P1A6NJY1 282 aa14.6□□□□□ -0.07
UFD1-209ENST00000489406 IDSP22304 550 aa14.6□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 74 ms