RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489337.5

SMTN-218, Transcript of smoothelin, humanhuman

TSL 2

Gene SMTN, Length 3,560 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMTN-218ENST00000489337 PPP2R2DQ66LE6 453 aa11.63□□□□□ -0.55
SMTN-218ENST00000489337 C8orf82Q6P1X6 216 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
SMTN-218ENST00000489337 USP43Q70EL4 1123 aa11.63□□□□□ -0.55
SMTN-218ENST00000489337 TBC1D21Q8IYX1 336 aa11.63□□□□□ -0.55
SMTN-218ENST00000489337 DNAJB14Q8TBM8 379 aa11.63□□□□□ -0.55
SMTN-218ENST00000489337 ZNF486Q96H40 463 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
SMTN-218ENST00000489337 ELMO2Q96JJ3 720 aa11.63□□□□□ -0.55
SMTN-218ENST00000489337 HHIPL1Q96JK4 782 aa11.63□□□□□ -0.55
SMTN-218ENST00000489337 DACH2Q96NX9 599 aa11.63□□□□□ -0.55
SMTN-218ENST00000489337 BDH2Q9BUT1 245 aa11.63□□□□□ -0.55
SMTN-218ENST00000489337 FSD1LQ9BXM9 530 aa11.63□□□□□ -0.55
SMTN-218ENST00000489337 SCUBE2Q9NQ36 999 aa11.63□□□□□ -0.55
SMTN-218ENST00000489337 HPS4Q9NQG7 708 aa11.63□□□□□ -0.55
SMTN-218ENST00000489337 MAP10Q9P2G4 905 aa11.63□□□□□ -0.55
SMTN-218ENST00000489337 WDFY4Q6ZS81 3184 aa11.63□□□□□ -0.55
SMTN-218ENST00000489337 LRRC37A2A6NM11 1700 aa11.63□□□□□ -0.55
SMTN-218ENST00000489337 ERI2A8K979 691 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
SMTN-218ENST00000489337 H0YAE9 185 aa11.63□□□□□ -0.55
SMTN-218ENST00000489337 ZNF623O75123 536 aa11.63□□□□□ -0.55
SMTN-218ENST00000489337 UGT2B11O75310 529 aa11.63□□□□□ -0.55
SMTN-218ENST00000489337 DLGAP3O95886 979 aa11.63□□□□□ -0.55
SMTN-218ENST00000489337 AHSGP02765 367 aa11.63□□□□□ -0.55
SMTN-218ENST00000489337 CKMP06732 381 aa11.63□□□□□ -0.55
SMTN-218ENST00000489337 ENO2P09104 434 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
SMTN-218ENST00000489337 BMP4P12644 408 aa11.63□□□□□ -0.55
SMTN-218ENST00000489337 CRHBPP24387 322 aa11.63□□□□□ -0.55
SMTN-218ENST00000489337 MZF1P28698 734 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
SMTN-218ENST00000489337 RPL9P32969 192 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
SMTN-218ENST00000489337 COPZ1P61923 177 aa11.63□□□□□ -0.55
SMTN-218ENST00000489337 CYP4F8P98187 520 aa11.63□□□□□ -0.55
SMTN-218ENST00000489337 CSHL1Q14406 222 aa11.63□□□□□ -0.55
SMTN-218ENST00000489337 TXNDC8Q6A555 127 aa11.63□□□□□ -0.55
SMTN-218ENST00000489337 PRMT9Q6P2P2 845 aa11.63□□□□□ -0.55
SMTN-218ENST00000489337 CD300LGQ6UXG3 332 aa11.63□□□□□ -0.55
SMTN-218ENST00000489337 TMC5Q6UXY8 1006 aa11.63□□□□□ -0.55
SMTN-218ENST00000489337 LINGO4Q6UY18 593 aa11.63□□□□□ -0.55
SMTN-218ENST00000489337 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
SMTN-218ENST00000489337 STK32CQ86UX6 486 aa11.63□□□□□ -0.55
SMTN-218ENST00000489337 CEP97Q8IW35 865 aa11.63□□□□□ -0.55
SMTN-218ENST00000489337 C8orf59Q8N0T1 100 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
SMTN-218ENST00000489337 SLC22A17Q8WUG5 538 aa11.63□□□□□ -0.55
SMTN-218ENST00000489337 FKBP10Q96AY3 582 aa11.63□□□□□ -0.55
SMTN-218ENST00000489337 PIF1Q9H611 641 aa11.63□□□□□ -0.55
SMTN-218ENST00000489337 CMTM6Q9NX76 183 aa11.63□□□□□ -0.55
SMTN-218ENST00000489337 VWA7Q9Y334 891 aa11.63□□□□□ -0.55
SMTN-218ENST00000489337 LCHNA4D1U4 455 aa11.63□□□□□ -0.55
SMTN-218ENST00000489337 GABRDO14764 452 aa11.63□□□□□ -0.55
SMTN-218ENST00000489337 AP2A1O95782 977 aa11.63□□□□□ -0.55
SMTN-218ENST00000489337 RPS24P62847 133 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
SMTN-218ENST00000489337 CDH17Q12864 832 aa11.63□□□□□ -0.55
SMTN-218ENST00000489337 POU6F1Q14863 301 aa11.63□□□□□ -0.55
SMTN-218ENST00000489337 POM121L1PQ3SYA9 428 aa11.63□□□□□ -0.55
SMTN-218ENST00000489337 ARHGAP17Q68EM7 881 aa11.63□□□□□ -0.55
SMTN-218ENST00000489337 PRR23BQ6ZRT6 265 aa11.63□□□□□ -0.55
SMTN-218ENST00000489337 SLC16A12Q6ZSM3 486 aa11.63□□□□□ -0.55
SMTN-218ENST00000489337 NPAS4Q8IUM7 802 aa11.63□□□□□ -0.55
SMTN-218ENST00000489337 LEMD2Q8NC56 503 aa11.63□□□□□ -0.55
SMTN-218ENST00000489337 ING5Q8WYH8 240 aa11.63□□□□□ -0.55
SMTN-218ENST00000489337 SUSD3Q96L08 255 aa11.63□□□□□ -0.55
SMTN-218ENST00000489337 SMIM14Q96QK8 99 aa11.63□□□□□ -0.55
SMTN-218ENST00000489337 MRPL57Q9BQC6 102 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
SMTN-218ENST00000489337 ACBD6Q9BR61 282 aa11.63□□□□□ -0.55
SMTN-218ENST00000489337 HOXD1Q9GZZ0 328 aa11.63□□□□□ -0.55
SMTN-218ENST00000489337 RNF38Q9H0F5 515 aa11.63□□□□□ -0.55
SMTN-218ENST00000489337 IGFLR1Q9H665 355 aa11.63□□□□□ -0.55
SMTN-218ENST00000489337 MARCH7Q9H992 704 aa11.63□□□□□ -0.55
SMTN-218ENST00000489337 MOV10Q9HCE1 1003 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
SMTN-218ENST00000489337 MARCH2Q9P0N8 246 aa11.63□□□□□ -0.55
SMTN-218ENST00000489337 ENPP5Q9UJA9 477 aa11.63□□□□□ -0.55
SMTN-218ENST00000489337 NDUFAF1Q9Y375 327 aa11.63□□□□□ -0.55
SMTN-218ENST00000489337 PSMD3O43242 534 aa11.62□□□□□ -0.55
SMTN-218ENST00000489337 NUAK1O60285 661 aa11.62□□□□□ -0.55
SMTN-218ENST00000489337 RFPL2O75678 378 aa11.62□□□□□ -0.55
SMTN-218ENST00000489337 CLTBP09497 229 aa11.62□□□□□ -0.55
SMTN-218ENST00000489337 HSD17B1P14061 328 aa11.62□□□□□ -0.55
SMTN-218ENST00000489337 CHRNA4P43681 627 aa11.62□□□□□ -0.55
SMTN-218ENST00000489337 YBX1P67809 324 aaKnown RBP11.62□□□□□ -0.55
SMTN-218ENST00000489337 ILF2Q12905 390 aaKnown RBP11.62□□□□□ -0.55
SMTN-218ENST00000489337 DGUOKQ16854 277 aa11.62□□□□□ -0.55
SMTN-218ENST00000489337 DENND6AQ8IWF6 608 aa11.62□□□□□ -0.55
SMTN-218ENST00000489337 DCP1BQ8IZD4 617 aaKnown RBP11.62□□□□□ -0.55
SMTN-218ENST00000489337 TMEM86AQ8N2M4 240 aa11.62□□□□□ -0.55
SMTN-218ENST00000489337 PPHLN1Q8NEY8 458 aaKnown RBP11.62□□□□□ -0.55
SMTN-218ENST00000489337 HEXDCQ8WVB3 486 aa11.62□□□□□ -0.55
SMTN-218ENST00000489337 OSCP1Q8WVF1 389 aa11.62□□□□□ -0.55
SMTN-218ENST00000489337 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP11.62□□□□□ -0.55
SMTN-218ENST00000489337 TRHDEQ9UKU6 1024 aa11.62□□□□□ -0.55
SMTN-218ENST00000489337 PDE10AQ9Y233 779 aa11.62□□□□□ -0.55
SMTN-218ENST00000489337 CNTRLQ7Z7A1 2325 aa11.62□□□□□ -0.55
SMTN-218ENST00000489337 FAM95CA0A1B0GW59 222 aa11.62□□□□□ -0.55
SMTN-218ENST00000489337 INMTO95050 263 aa11.62□□□□□ -0.55
SMTN-218ENST00000489337 SEC24AO95486 1093 aa11.62□□□□□ -0.55
SMTN-218ENST00000489337 SLC6A2P23975 617 aa11.62□□□□□ -0.55
SMTN-218ENST00000489337 CASP2P42575 452 aa11.62□□□□□ -0.55
SMTN-218ENST00000489337 SEPHS1P49903 392 aa11.62□□□□□ -0.55
SMTN-218ENST00000489337 RYBPQ8N488 228 aaPredicted RBP11.62□□□□□ -0.55
SMTN-218ENST00000489337 CASD1Q96PB1 797 aa11.62□□□□□ -0.55
SMTN-218ENST00000489337 CHID1Q9BWS9 393 aa11.62□□□□□ -0.55
SMTN-218ENST00000489337 OSBPL10Q9BXB5 764 aa11.62□□□□□ -0.55
SMTN-218ENST00000489337 ENTPD7Q9NQZ7 604 aa11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23 ms