RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489160.1

CCL20-204, Transcript of C-C motif chemokine ligand 20, humanhuman

TSL 3

Gene CCL20, Length 673 nt, Biotype retained intron.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL20-204ENST00000489160 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP4.87□□□□□ -1.63
CCL20-204ENST00000489160 RSL1D1O76021 490 aaKnown RBP4.87□□□□□ -1.63
CCL20-204ENST00000489160 NGFRP08138 427 aa4.87□□□□□ -1.63
CCL20-204ENST00000489160 LINC00271P0C7V0 271 aa4.87□□□□□ -1.63
CCL20-204ENST00000489160 THEGLP0DJG4 465 aa4.87□□□□□ -1.63
CCL20-204ENST00000489160 PRLRP16471 622 aa4.87□□□□□ -1.63
CCL20-204ENST00000489160 IFNAR1P17181 557 aa4.87□□□□□ -1.63
CCL20-204ENST00000489160 S1PR1P21453 382 aa4.87□□□□□ -1.63
CCL20-204ENST00000489160 ARSEP51690 589 aa4.87□□□□□ -1.63
CCL20-204ENST00000489160 CLDN20P56880 219 aa4.87□□□□□ -1.63
CCL20-204ENST00000489160 CREB3L2Q70SY1 520 aa4.87□□□□□ -1.63
CCL20-204ENST00000489160 ZNF34Q8IZ26 560 aa4.87□□□□□ -1.63
CCL20-204ENST00000489160 MINDY1Q8N5J2 469 aa4.87□□□□□ -1.63
CCL20-204ENST00000489160 ZBTB8BQ8NAP8 495 aaPredicted RBP4.87□□□□□ -1.63
CCL20-204ENST00000489160 TDRD5Q8NAT2 981 aaKnown RBP4.87□□□□□ -1.63
CCL20-204ENST00000489160 SPC24Q8NBT2 197 aa4.87□□□□□ -1.63
CCL20-204ENST00000489160 MCUQ8NE86 351 aa4.87□□□□□ -1.63
CCL20-204ENST00000489160 ACVR1CQ8NER5 493 aa4.87□□□□□ -1.63
CCL20-204ENST00000489160 HMGCLL1Q8TB92 370 aa4.87□□□□□ -1.63
CCL20-204ENST00000489160 SETD6Q8TBK2 473 aa4.87□□□□□ -1.63
CCL20-204ENST00000489160 UTP15Q8TED0 518 aaKnown RBP4.87□□□□□ -1.63
CCL20-204ENST00000489160 LYZL4Q96KX0 146 aa4.87□□□□□ -1.63
CCL20-204ENST00000489160 ZNF385AQ96PM9 386 aaKnown RBP4.87□□□□□ -1.63
CCL20-204ENST00000489160 C2orf40Q9H1Z8 148 aa4.87□□□□□ -1.63
CCL20-204ENST00000489160 IL25Q9H293 177 aa4.87□□□□□ -1.63
CCL20-204ENST00000489160 OPA3Q9H6K4 179 aa4.87□□□□□ -1.63
CCL20-204ENST00000489160 COPS7BQ9H9Q2 264 aaPredicted RBP4.87□□□□□ -1.63
CCL20-204ENST00000489160 PTPRCP08575 1304 aa4.87□□□□□ -1.63
CCL20-204ENST00000489160 GPRASP1Q5JY77 1395 aa4.87□□□□□ -1.63
CCL20-204ENST00000489160 ARHGEF37A1IGU5 675 aa4.86□□□□□ -1.63
CCL20-204ENST00000489160 LACTBL1A8MY62 500 aa4.86□□□□□ -1.63
CCL20-204ENST00000489160 SLC7A4O43246 635 aa4.86□□□□□ -1.63
CCL20-204ENST00000489160 PLPP2O43688 288 aa4.86□□□□□ -1.63
CCL20-204ENST00000489160 PMS2P2O95744 297 aa4.86□□□□□ -1.63
CCL20-204ENST00000489160 TPOP07202 933 aa4.86□□□□□ -1.63
CCL20-204ENST00000489160 SNHG28P0DPA3 235 aa4.86□□□□□ -1.63
CCL20-204ENST00000489160 DAOP14920 347 aa4.86□□□□□ -1.63
CCL20-204ENST00000489160 PSMA3P25788 255 aa4.86□□□□□ -1.63
CCL20-204ENST00000489160 CORO1AP31146 461 aaKnown RBP4.86□□□□□ -1.63
CCL20-204ENST00000489160 GP5P40197 560 aa4.86□□□□□ -1.63
CCL20-204ENST00000489160 TMPOP42166 694 aaKnown RBP4.86□□□□□ -1.63
CCL20-204ENST00000489160 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP4.86□□□□□ -1.63
CCL20-204ENST00000489160 KRTAP10-11P60412 298 aa4.86□□□□□ -1.63
CCL20-204ENST00000489160 DLG1Q12959 904 aa4.86□□□□□ -1.63
CCL20-204ENST00000489160 GRAPQ13588 217 aa4.86□□□□□ -1.63
CCL20-204ENST00000489160 MEP1AQ16819 746 aa4.86□□□□□ -1.63
CCL20-204ENST00000489160 KRTCAP3Q53RY4 240 aa4.86□□□□□ -1.63
CCL20-204ENST00000489160 IGSF11Q5DX21 431 aa4.86□□□□□ -1.63
CCL20-204ENST00000489160 ZDHHC20Q5W0Z9 365 aa4.86□□□□□ -1.63
CCL20-204ENST00000489160 TRNP1Q6NT89 227 aa4.86□□□□□ -1.63
CCL20-204ENST00000489160 DCLRE1AQ6PJP8 1040 aa4.86□□□□□ -1.63
CCL20-204ENST00000489160 SPATA2LQ8IUW3 424 aaPredicted RBP4.86□□□□□ -1.63
CCL20-204ENST00000489160 PM20D2Q8IYS1 436 aa4.86□□□□□ -1.63
CCL20-204ENST00000489160 RNF113BQ8IZP6 322 aaKnown RBP4.86□□□□□ -1.63
CCL20-204ENST00000489160 GCSAMQ8N6F7 178 aa4.86□□□□□ -1.63
CCL20-204ENST00000489160 TRIML1Q8N9V2 468 aa4.86□□□□□ -1.63
CCL20-204ENST00000489160 Q8NFD4 153 aa4.86□□□□□ -1.63
CCL20-204ENST00000489160 OR5R1Q8NH85 324 aa4.86□□□□□ -1.63
CCL20-204ENST00000489160 SPATA22Q8NHS9 363 aa4.86□□□□□ -1.63
CCL20-204ENST00000489160 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP4.86□□□□□ -1.63
CCL20-204ENST00000489160 TMEM19Q96HH6 336 aa4.86□□□□□ -1.63
CCL20-204ENST00000489160 SPAG5Q96R06 1193 aa4.86□□□□□ -1.63
CCL20-204ENST00000489160 DDOQ99489 341 aa4.86□□□□□ -1.63
CCL20-204ENST00000489160 ZPBPQ9BS86 351 aa4.86□□□□□ -1.63
CCL20-204ENST00000489160 TM6SF1Q9BZW5 370 aa4.86□□□□□ -1.63
CCL20-204ENST00000489160 DNAI2Q9GZS0 605 aa4.86□□□□□ -1.63
CCL20-204ENST00000489160 RAD21L1Q9H4I0 556 aa4.86□□□□□ -1.63
CCL20-204ENST00000489160 AMACRQ9UHK6 382 aa4.86□□□□□ -1.63
CCL20-204ENST00000489160 ODF2LQ9ULJ1 636 aa4.86□□□□□ -1.63
CCL20-204ENST00000489160 ZNF148Q9UQR1 794 aa4.86□□□□□ -1.63
CCL20-204ENST00000489160 ABCC9O60706 1549 aa4.86□□□□□ -1.63
CCL20-204ENST00000489160 LOC102723996A0A087X1L8 192 aa4.85□□□□□ -1.63
CCL20-204ENST00000489160 A6NL46 340 aa4.85□□□□□ -1.63
CCL20-204ENST00000489160 SRRM3A6NNA2 597 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
CCL20-204ENST00000489160 DIAPH2O60879 1101 aa4.85□□□□□ -1.63
CCL20-204ENST00000489160 ZNF217O75362 1048 aa4.85□□□□□ -1.63
CCL20-204ENST00000489160 GOSR1O95249 250 aa4.85□□□□□ -1.63
CCL20-204ENST00000489160 FDPSP14324 419 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
CCL20-204ENST00000489160 KCNA5P22460 613 aa4.85□□□□□ -1.63
CCL20-204ENST00000489160 CPT2P23786 658 aa4.85□□□□□ -1.63
CCL20-204ENST00000489160 HRH2P25021 359 aa4.85□□□□□ -1.63
CCL20-204ENST00000489160 THBS3P49746 956 aa4.85□□□□□ -1.63
CCL20-204ENST00000489160 DSCR9P59020 149 aa4.85□□□□□ -1.63
CCL20-204ENST00000489160 BRWD1-AS2P59051 145 aa4.85□□□□□ -1.63
CCL20-204ENST00000489160 AP1B1Q10567 949 aa4.85□□□□□ -1.63
CCL20-204ENST00000489160 KIF5AQ12840 1032 aa4.85□□□□□ -1.63
CCL20-204ENST00000489160 IYDQ6PHW0 289 aa4.85□□□□□ -1.63
CCL20-204ENST00000489160 DENND5BQ6ZUT9 1274 aa4.85□□□□□ -1.63
CCL20-204ENST00000489160 ERC1Q8IUD2 1116 aa4.85□□□□□ -1.63
CCL20-204ENST00000489160 C1orf87Q8N0U7 546 aa4.85□□□□□ -1.63
CCL20-204ENST00000489160 SLC5A8Q8N695 610 aa4.85□□□□□ -1.63
CCL20-204ENST00000489160 DUSP19Q8WTR2 217 aa4.85□□□□□ -1.63
CCL20-204ENST00000489160 PTPMT1Q8WUK0 201 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
CCL20-204ENST00000489160 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
CCL20-204ENST00000489160 ABTB1Q969K4 478 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
CCL20-204ENST00000489160 PIGTQ969N2 578 aa4.85□□□□□ -1.63
CCL20-204ENST00000489160 TMCO6Q96DC7 493 aa4.85□□□□□ -1.63
CCL20-204ENST00000489160 RTP4Q96DX8 246 aa4.85□□□□□ -1.63
CCL20-204ENST00000489160 SMC6Q96SB8 1091 aa4.85□□□□□ -1.63
CCL20-204ENST00000489160 PCYT2Q99447 389 aa4.85□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 135.5 ms