RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487547.1

USP34-216, Transcript of ubiquitin specific peptidase 34, humanhuman

TSL 3

Gene USP34, Length 612 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP34-216ENST00000487547 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
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USP34-216ENST00000487547 ALG14Q96F25 216 aa5.65□□□□□ -1.5
USP34-216ENST00000487547 OXNAD1Q96HP4 312 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
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USP34-216ENST00000487547 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa5.59□□□□□ -1.51
USP34-216ENST00000487547 A6NCN8 305 aa5.59□□□□□ -1.51
USP34-216ENST00000487547 B4DLN1 442 aa5.59□□□□□ -1.51
USP34-216ENST00000487547 BLOC1S5-TXNDC5H3BN57 136 aa5.59□□□□□ -1.51
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USP34-216ENST00000487547 H1F0P07305 194 aaKnown RBP5.59□□□□□ -1.51
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