RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000473406.5

RABGGTB-209, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTB, Length 721 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-209ENST00000473406 ZNF540Q8NDQ6 660 aa5.93□□□□□ -1.46
RABGGTB-209ENST00000473406 CNNM3Q8NE01 707 aa5.93□□□□□ -1.46
RABGGTB-209ENST00000473406 ARRDC2Q8TBH0 407 aa5.93□□□□□ -1.46
RABGGTB-209ENST00000473406 SLC9A6Q92581 669 aa5.93□□□□□ -1.46
RABGGTB-209ENST00000473406 PRCCQ92733 491 aaPredicted RBP5.93□□□□□ -1.46
RABGGTB-209ENST00000473406 EME1Q96AY2 570 aa5.93□□□□□ -1.46
RABGGTB-209ENST00000473406 CPNE1Q99829 537 aa5.93□□□□□ -1.46
RABGGTB-209ENST00000473406 SH3GL2Q99962 352 aa5.93□□□□□ -1.46
RABGGTB-209ENST00000473406 MSTO1Q9BUK6 570 aa5.93□□□□□ -1.46
RABGGTB-209ENST00000473406 GTPBP2Q9BX10 602 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
RABGGTB-209ENST00000473406 KCNN2Q9H2S1 579 aa5.93□□□□□ -1.46
RABGGTB-209ENST00000473406 ZCCHC4Q9H5U6 513 aa5.93□□□□□ -1.46
RABGGTB-209ENST00000473406 SEBOXQ9HB31 216 aaPredicted RBP5.93□□□□□ -1.46
RABGGTB-209ENST00000473406 DPP3Q9NY33 737 aa5.93□□□□□ -1.46
RABGGTB-209ENST00000473406 SERGEFQ9UGK8 458 aa5.93□□□□□ -1.46
RABGGTB-209ENST00000473406 XPO7Q9UIA9 1087 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
RABGGTB-209ENST00000473406 TMEM184BQ9Y519 407 aaPredicted RBP5.93□□□□□ -1.46
RABGGTB-209ENST00000473406 SQORQ9Y6N5 450 aa5.93□□□□□ -1.46
RABGGTB-209ENST00000473406 AP1M2Q9Y6Q5 423 aa5.93□□□□□ -1.46
RABGGTB-209ENST00000473406 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP5.93□□□□□ -1.46
RABGGTB-209ENST00000473406 SLC9B1P1A6NJY1 282 aa5.92□□□□□ -1.46
RABGGTB-209ENST00000473406 SDR42E2A6NKP2 422 aa5.92□□□□□ -1.46
RABGGTB-209ENST00000473406 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP5.92□□□□□ -1.46
RABGGTB-209ENST00000473406 ZNF217O75362 1048 aa5.92□□□□□ -1.46
RABGGTB-209ENST00000473406 HEXBP07686 556 aa5.92□□□□□ -1.46
RABGGTB-209ENST00000473406 SCP2P22307 547 aa5.92□□□□□ -1.46
RABGGTB-209ENST00000473406 HRH2P25021 359 aa5.92□□□□□ -1.46
RABGGTB-209ENST00000473406 CFPP27918 469 aa5.92□□□□□ -1.46
RABGGTB-209ENST00000473406 TKTP29401 623 aaKnown RBP5.92□□□□□ -1.46
RABGGTB-209ENST00000473406 PIGAP37287 484 aa5.92□□□□□ -1.46
RABGGTB-209ENST00000473406 AVPR1AP37288 418 aa5.92□□□□□ -1.46
RABGGTB-209ENST00000473406 PPP3CCP48454 512 aa5.92□□□□□ -1.46
RABGGTB-209ENST00000473406 COMPP49747 757 aaPredicted RBP5.92□□□□□ -1.46
RABGGTB-209ENST00000473406 ASCL1P50553 236 aa5.92□□□□□ -1.46
RABGGTB-209ENST00000473406 TKTL1P51854 596 aa5.92□□□□□ -1.46
RABGGTB-209ENST00000473406 ATXN3P54252 364 aaPredicted RBP5.92□□□□□ -1.46
RABGGTB-209ENST00000473406 SOX10P56693 466 aa5.92□□□□□ -1.46
RABGGTB-209ENST00000473406 SIM1P81133 766 aaPredicted RBP5.92□□□□□ -1.46
RABGGTB-209ENST00000473406 TRA2AQ13595 282 aaKnown RBP eCLIP5.92□□□□□ -1.46
RABGGTB-209ENST00000473406 TUBA3CQ13748 450 aa5.92□□□□□ -1.46
RABGGTB-209ENST00000473406 MIDNQ504T8 468 aa5.92□□□□□ -1.46
RABGGTB-209ENST00000473406 DCST1Q5T197 706 aa5.92□□□□□ -1.46
RABGGTB-209ENST00000473406 XP32Q5T750 250 aa5.92□□□□□ -1.46
RABGGTB-209ENST00000473406 ALS2CLQ60I27 953 aa5.92□□□□□ -1.46
RABGGTB-209ENST00000473406 TXNRD3NBQ6F5E7 133 aa5.92□□□□□ -1.46
RABGGTB-209ENST00000473406 TUBA3EQ6PEY2 450 aa5.92□□□□□ -1.46
RABGGTB-209ENST00000473406 ZNF813Q6ZN06 617 aa5.92□□□□□ -1.46
RABGGTB-209ENST00000473406 MIER3Q7Z3K6 550 aa5.92□□□□□ -1.46
RABGGTB-209ENST00000473406 AMIGO2Q86SJ2 522 aa5.92□□□□□ -1.46
RABGGTB-209ENST00000473406 ADCK1Q86TW2 530 aa5.92□□□□□ -1.46
RABGGTB-209ENST00000473406 TEX45Q8NA69 505 aa5.92□□□□□ -1.46
RABGGTB-209ENST00000473406 RAD54LQ92698 747 aa5.92□□□□□ -1.46
RABGGTB-209ENST00000473406 CENPTQ96BT3 561 aa5.92□□□□□ -1.46
RABGGTB-209ENST00000473406 BICD1Q96G01 975 aa5.92□□□□□ -1.46
RABGGTB-209ENST00000473406 C5orf30Q96GV9 206 aa5.92□□□□□ -1.46
RABGGTB-209ENST00000473406 GRAMD2BQ96HH9 432 aa5.92□□□□□ -1.46
RABGGTB-209ENST00000473406 FAM111AQ96PZ2 611 aa5.92□□□□□ -1.46
RABGGTB-209ENST00000473406 OR6C1Q96RD1 312 aa5.92□□□□□ -1.46
RABGGTB-209ENST00000473406 FEVQ99581 238 aa5.92□□□□□ -1.46
RABGGTB-209ENST00000473406 GFI1Q99684 422 aa5.92□□□□□ -1.46
RABGGTB-209ENST00000473406 OSBPL8Q9BZF1 889 aa5.92□□□□□ -1.46
RABGGTB-209ENST00000473406 KLHL31Q9H511 634 aa5.92□□□□□ -1.46
RABGGTB-209ENST00000473406 AKIRIN1Q9H9L7 192 aaPredicted RBP5.92□□□□□ -1.46
RABGGTB-209ENST00000473406 MMP25Q9NPA2 562 aa5.92□□□□□ -1.46
RABGGTB-209ENST00000473406 IL17RBQ9NRM6 502 aa5.92□□□□□ -1.46
RABGGTB-209ENST00000473406 DNAJC11Q9NVH1 559 aa5.92□□□□□ -1.46
RABGGTB-209ENST00000473406 TMEM161AQ9NX61 479 aa5.92□□□□□ -1.46
RABGGTB-209ENST00000473406 FLRT1Q9NZU1 646 aa5.92□□□□□ -1.46
RABGGTB-209ENST00000473406 TBC1D7Q9P0N9 293 aa5.92□□□□□ -1.46
RABGGTB-209ENST00000473406 FBXL5Q9UKA1 691 aa5.92□□□□□ -1.46
RABGGTB-209ENST00000473406 MTUS1Q9ULD2 1270 aa5.92□□□□□ -1.46
RABGGTB-209ENST00000473406 B3GALT5Q9Y2C3 310 aa5.92□□□□□ -1.46
RABGGTB-209ENST00000473406 RNF114Q9Y508 228 aa5.92□□□□□ -1.46
RABGGTB-209ENST00000473406 TEX264Q9Y6I9 313 aa5.92□□□□□ -1.46
RABGGTB-209ENST00000473406 A0A0A6YYC8 382 aaPredicted RBP5.91□□□□□ -1.46
RABGGTB-209ENST00000473406 FEZF1A0PJY2 475 aa5.91□□□□□ -1.46
RABGGTB-209ENST00000473406 STMND1H3BQB6 276 aa5.91□□□□□ -1.46
RABGGTB-209ENST00000473406 I3L1I5 382 aaPredicted RBP5.91□□□□□ -1.46
RABGGTB-209ENST00000473406 K7EPI3 171 aa5.91□□□□□ -1.46
RABGGTB-209ENST00000473406 MEIS2O14770 477 aa5.91□□□□□ -1.46
RABGGTB-209ENST00000473406 TTI1O43156 1089 aa5.91□□□□□ -1.46
RABGGTB-209ENST00000473406 AP5Z1O43299 807 aa5.91□□□□□ -1.46
RABGGTB-209ENST00000473406 PLA2G4BP0C869 781 aa5.91□□□□□ -1.46
RABGGTB-209ENST00000473406 FERP16591 822 aa5.91□□□□□ -1.46
RABGGTB-209ENST00000473406 VCLP18206 1134 aa5.91□□□□□ -1.46
RABGGTB-209ENST00000473406 FASLGP48023 281 aa5.91□□□□□ -1.46
RABGGTB-209ENST00000473406 CAMLGP49069 296 aa5.91□□□□□ -1.46
RABGGTB-209ENST00000473406 POLR2LP62875 67 aaKnown RBP5.91□□□□□ -1.46
RABGGTB-209ENST00000473406 CSNK2A1P68400 391 aaPredicted RBP5.91□□□□□ -1.46
RABGGTB-209ENST00000473406 RABEP1Q15276 862 aa5.91□□□□□ -1.46
RABGGTB-209ENST00000473406 WSCD2Q2TBF2 565 aa5.91□□□□□ -1.46
RABGGTB-209ENST00000473406 IQCCQ4KMZ1 466 aa5.91□□□□□ -1.46
RABGGTB-209ENST00000473406 LBHQ53QV2 105 aaPredicted RBP5.91□□□□□ -1.46
RABGGTB-209ENST00000473406 LRRC73Q5JTD7 316 aa5.91□□□□□ -1.46
RABGGTB-209ENST00000473406 ENPP7Q6UWV6 458 aa5.91□□□□□ -1.46
RABGGTB-209ENST00000473406 PATL1Q86TB9 770 aaKnown RBP5.91□□□□□ -1.46
RABGGTB-209ENST00000473406 C1QL4Q86Z23 238 aa5.91□□□□□ -1.46
RABGGTB-209ENST00000473406 SIAH3Q8IW03 269 aa5.91□□□□□ -1.46
RABGGTB-209ENST00000473406 CCDC83Q8IWF9 413 aa5.91□□□□□ -1.46
RABGGTB-209ENST00000473406 DSELQ8IZU8 1212 aa5.91□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.8 ms