RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000471978.5

C9orf3-213, Transcript of chromosome 9 open reading frame 3, humanhuman

TSL 2

Gene C9orf3, Length 478 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf3-213ENST00000471978 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa22.12■■□□□ 1.13
C9orf3-213ENST00000471978 OR2AG2A6NM03 316 aa22.11■■□□□ 1.13
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C9orf3-213ENST00000471978 ANXA9O76027 345 aa22.11■■□□□ 1.13
C9orf3-213ENST00000471978 DLGAP3O95886 979 aa22.11■■□□□ 1.13
C9orf3-213ENST00000471978 NAP1L1P55209 391 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
C9orf3-213ENST00000471978 DMPKQ09013 629 aa22.11■■□□□ 1.13
C9orf3-213ENST00000471978 ABHD18Q0P651 414 aa22.11■■□□□ 1.13
C9orf3-213ENST00000471978 PTPRCAPQ14761 206 aa22.11■■□□□ 1.13
C9orf3-213ENST00000471978 TMEM220Q6QAJ8 160 aa22.11■■□□□ 1.13
C9orf3-213ENST00000471978 ACTL9Q8TC94 416 aa22.11■■□□□ 1.13
C9orf3-213ENST00000471978 GORASP1Q9BQQ3 440 aa22.11■■□□□ 1.13
C9orf3-213ENST00000471978 EFHD1Q9BUP0 239 aa22.11■■□□□ 1.13
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C9orf3-213ENST00000471978 ARL5AQ9Y689 179 aa22.11■■□□□ 1.13
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C9orf3-213ENST00000471978 DNMT3AQ9Y6K1 912 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
C9orf3-213ENST00000471978 MACROD2A1Z1Q3 448 aa22.1■■□□□ 1.13
C9orf3-213ENST00000471978 RCCD1A6NED2 376 aa22.1■■□□□ 1.13
C9orf3-213ENST00000471978 SOWAHDA6NJG2 315 aa22.1■■□□□ 1.13
C9orf3-213ENST00000471978 NKX2-8O15522 239 aa22.1■■□□□ 1.13
C9orf3-213ENST00000471978 KIF1CO43896 1103 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
C9orf3-213ENST00000471978 NDUFA10O95299 355 aa22.1■■□□□ 1.13
C9orf3-213ENST00000471978 SH3BP2P78314 561 aa22.1■■□□□ 1.13
C9orf3-213ENST00000471978 NFKB2Q00653 900 aa22.1■■□□□ 1.13
C9orf3-213ENST00000471978 OTUD4Q01804 1114 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
C9orf3-213ENST00000471978 CACHD1Q5VU97 1274 aa22.1■■□□□ 1.13
C9orf3-213ENST00000471978 IRGCQ6NXR0 463 aa22.1■■□□□ 1.13
C9orf3-213ENST00000471978 FAM83HQ6ZRV2 1179 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
C9orf3-213ENST00000471978 PRSS42Q7Z5A4 293 aa22.1■■□□□ 1.13
C9orf3-213ENST00000471978 ZNF398Q8TD17 642 aa22.1■■□□□ 1.13
C9orf3-213ENST00000471978 ZDHHC12Q96GR4 267 aa22.1■■□□□ 1.13
C9orf3-213ENST00000471978 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
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C9orf3-213ENST00000471978 OR6C1Q96RD1 312 aa22.1■■□□□ 1.13
C9orf3-213ENST00000471978 PANX2Q96RD6 677 aa22.1■■□□□ 1.13
C9orf3-213ENST00000471978 OSBPL8Q9BZF1 889 aa22.1■■□□□ 1.13
C9orf3-213ENST00000471978 ULBP3Q9BZM4 244 aa22.1■■□□□ 1.13
C9orf3-213ENST00000471978 SMOXQ9NWM0 555 aa22.1■■□□□ 1.13
C9orf3-213ENST00000471978 PSMD13Q9UNM6 376 aa22.1■■□□□ 1.13
C9orf3-213ENST00000471978 EFR3BQ9Y2G0 817 aa22.1■■□□□ 1.13
C9orf3-213ENST00000471978 MYO18BQ8IUG5 2567 aa22.1■■□□□ 1.13
C9orf3-213ENST00000471978 C2orf81A6NN90 581 aa22.09■■□□□ 1.13
C9orf3-213ENST00000471978 PRAMEF1O95521 474 aa22.09■■□□□ 1.13
C9orf3-213ENST00000471978 MSH3P20585 1137 aa22.09■■□□□ 1.13
C9orf3-213ENST00000471978 LPOP22079 712 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
C9orf3-213ENST00000471978 CTNNA2P26232 953 aa22.09■■□□□ 1.13
C9orf3-213ENST00000471978 AKT1P31749 480 aa22.09■■□□□ 1.13
C9orf3-213ENST00000471978 NFE2L1Q14494 772 aa22.09■■□□□ 1.13
C9orf3-213ENST00000471978 TAF1AQ15573 450 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
C9orf3-213ENST00000471978 RPE65Q16518 533 aa22.09■■□□□ 1.13
C9orf3-213ENST00000471978 FNBP1LQ5T0N5 605 aa22.09■■□□□ 1.13
C9orf3-213ENST00000471978 FAM92BQ6ZTR7 304 aa22.09■■□□□ 1.13
C9orf3-213ENST00000471978 CDKL3Q8IVW4 592 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
C9orf3-213ENST00000471978 ESX1Q8N693 406 aa22.09■■□□□ 1.13
C9orf3-213ENST00000471978 SLC25A18Q9H1K4 315 aa22.09■■□□□ 1.13
C9orf3-213ENST00000471978 ADNPQ9H2P0 1102 aa22.09■■□□□ 1.13
C9orf3-213ENST00000471978 EPHA6Q9UF33 1036 aa22.09■■□□□ 1.13
C9orf3-213ENST00000471978 IL17BQ9UHF5 180 aa22.09■■□□□ 1.13
C9orf3-213ENST00000471978 DUSP10Q9Y6W6 482 aa22.09■■□□□ 1.13
C9orf3-213ENST00000471978 PJA2O43164 708 aa22.08■■□□□ 1.13
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C9orf3-213ENST00000471978 PBLDP30039 288 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
C9orf3-213ENST00000471978 STAT5AP42229 794 aa22.08■■□□□ 1.13
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C9orf3-213ENST00000471978 POLE2P56282 527 aa22.08■■□□□ 1.13
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C9orf3-213ENST00000471978 MAP7Q14244 749 aa22.08■■□□□ 1.13
C9orf3-213ENST00000471978 PRPSAP1Q14558 356 aa22.08■■□□□ 1.13
C9orf3-213ENST00000471978 IL11RAQ14626 422 aa22.08■■□□□ 1.13
C9orf3-213ENST00000471978 LONRF2Q1L5Z9 754 aa22.08■■□□□ 1.13
C9orf3-213ENST00000471978 ANKRD20A2Q5SQ80 823 aa22.08■■□□□ 1.13
C9orf3-213ENST00000471978 ANKRD20A1Q5TYW2 823 aa22.08■■□□□ 1.13
C9orf3-213ENST00000471978 ANKRD20A3Q5VUR7 823 aa22.08■■□□□ 1.13
C9orf3-213ENST00000471978 RANBP10Q6VN20 620 aa22.08■■□□□ 1.13
C9orf3-213ENST00000471978 DET1Q7L5Y6 550 aa22.08■■□□□ 1.13
C9orf3-213ENST00000471978 TMTC1Q8IUR5 882 aa22.08■■□□□ 1.13
C9orf3-213ENST00000471978 BEND7Q8N7W2 519 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
C9orf3-213ENST00000471978 OR4K2Q8NGD2 314 aa22.08■■□□□ 1.13
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C9orf3-213ENST00000471978 KLHL6Q8WZ60 621 aa22.08■■□□□ 1.13
C9orf3-213ENST00000471978 RNF31Q96EP0 1072 aa22.08■■□□□ 1.13
C9orf3-213ENST00000471978 ZNF514Q96K75 400 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
C9orf3-213ENST00000471978 FAM118BQ9BPY3 351 aa22.08■■□□□ 1.13
C9orf3-213ENST00000471978 APOL2Q9BQE5 337 aa22.08■■□□□ 1.13
C9orf3-213ENST00000471978 RAB33BQ9H082 229 aa22.08■■□□□ 1.13
C9orf3-213ENST00000471978 AAR2Q9Y312 384 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
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C9orf3-213ENST00000471978 KCNN4O15554 427 aa22.07■■□□□ 1.12
C9orf3-213ENST00000471978 STK10O94804 968 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
C9orf3-213ENST00000471978 RBP3P10745 1247 aa22.07■■□□□ 1.12
C9orf3-213ENST00000471978 ZNF28P17035 718 aa22.07■■□□□ 1.12
C9orf3-213ENST00000471978 PTPN7P35236 360 aa22.07■■□□□ 1.12
C9orf3-213ENST00000471978 ADRA1AP35348 466 aa22.07■■□□□ 1.12
C9orf3-213ENST00000471978 ZNF75DP51815 510 aa22.07■■□□□ 1.12
C9orf3-213ENST00000471978 RWDD2BP57060 319 aa22.07■■□□□ 1.12
C9orf3-213ENST00000471978 KCNAB2Q13303 367 aa22.07■■□□□ 1.12
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