RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000470737.1

SEMA3F-208, Transcript of semaphorin 3F, human

TSL 5

Gene SEMA3F, Length 566 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SEMA3F-208	ENST00000470737	NDST3	O95803	873 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SEMA3F-208	ENST00000470737	TPM1	P09493	284 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SEMA3F-208	ENST00000470737	FECH	P22830	423 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SEMA3F-208	ENST00000470737	TBX2	Q13207	712 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
SEMA3F-208	ENST00000470737	SLC14A2	Q15849	920 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SEMA3F-208	ENST00000470737	UGT8	Q16880	541 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SEMA3F-208	ENST00000470737	ATP13A5	Q4VNC0	1218 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SEMA3F-208	ENST00000470737	DNTTIP2	Q5QJE6	756 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
SEMA3F-208	ENST00000470737	ZDHHC20	Q5W0Z9	365 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SEMA3F-208	ENST00000470737	PWWP2B	Q6NUJ5	590 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SEMA3F-208	ENST00000470737	SYVN1	Q86TM6	617 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SEMA3F-208	ENST00000470737	AMZ2	Q86W34	360 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SEMA3F-208	ENST00000470737	ZNF547	Q8IVP9	402 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SEMA3F-208	ENST00000470737	PLD5	Q8N7P1	536 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SEMA3F-208	ENST00000470737	GALNT11	Q8NCW6	608 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SEMA3F-208	ENST00000470737	SLC41A2	Q96JW4	573 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SEMA3F-208	ENST00000470737	ESPL1	Q14674	2120 aa		13.58	□□□□□ -0.23
SEMA3F-208	ENST00000470737		A0A0A6YYK5	440 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
SEMA3F-208	ENST00000470737	IGHV5-51	A0A0C4DH38	117 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SEMA3F-208	ENST00000470737	SSU72P8	A0A1W2PR75	194 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SEMA3F-208	ENST00000470737	ZNF487	B1APH4	448 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SEMA3F-208	ENST00000470737	CPNE3	O75131	537 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
SEMA3F-208	ENST00000470737	TIAF1	O95411	115 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SEMA3F-208	ENST00000470737	EBLN1	P0CF75	366 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SEMA3F-208	ENST00000470737	FOLR1	P15328	257 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SEMA3F-208	ENST00000470737	ZFX	P17010	805 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
SEMA3F-208	ENST00000470737	GNLY	P22749	145 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SEMA3F-208	ENST00000470737	PTPN4	P29074	926 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SEMA3F-208	ENST00000470737	KCNAB1	Q14722	419 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SEMA3F-208	ENST00000470737	KHDC1	Q4VXA5	237 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
SEMA3F-208	ENST00000470737	TMTC4	Q5T4D3	741 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SEMA3F-208	ENST00000470737	ARMC6	Q6NXE6	501 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SEMA3F-208	ENST00000470737	KMT5C	Q86Y97	462 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SEMA3F-208	ENST00000470737	TMEM126B	Q8IUX1	230 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SEMA3F-208	ENST00000470737	CNGA4	Q8IV77	575 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SEMA3F-208	ENST00000470737	RAPGEF5	Q92565	580 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SEMA3F-208	ENST00000470737	MR1	Q95460	341 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SEMA3F-208	ENST00000470737	MRFAP1L1	Q96HT8	127 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SEMA3F-208	ENST00000470737	ZNF514	Q96K75	400 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
SEMA3F-208	ENST00000470737	CD180	Q99467	661 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SEMA3F-208	ENST00000470737	TRIM55	Q9BYV6	548 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SEMA3F-208	ENST00000470737	TRABD	Q9H4I3	376 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SEMA3F-208	ENST00000470737	FGF21	Q9NSA1	209 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SEMA3F-208	ENST00000470737	IGF2BP1	Q9NZI8	577 aa	Known RBP eCLIP	13.58	□□□□□ -0.24
SEMA3F-208	ENST00000470737	SEMA5B	Q9P283	1151 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SEMA3F-208	ENST00000470737	NENF	Q9UMX5	172 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SEMA3F-208	ENST00000470737	WDR37	Q9Y2I8	494 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SEMA3F-208	ENST00000470737	PCDHGA9	Q9Y5G4	932 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
SEMA3F-208	ENST00000470737	TLCD2	A6NGC4	264 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SEMA3F-208	ENST00000470737	ARGFX	A6NJG6	315 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SEMA3F-208	ENST00000470737	MFAP3L	O75121	409 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SEMA3F-208	ENST00000470737	PMPCB	O75439	489 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SEMA3F-208	ENST00000470737	MT-CYB	P00156	380 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
SEMA3F-208	ENST00000470737	PDGFA	P04085	211 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SEMA3F-208	ENST00000470737	SPAM1	P38567	509 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SEMA3F-208	ENST00000470737	UQCRFS1	P47985	274 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SEMA3F-208	ENST00000470737	CCL11	P51671	97 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SEMA3F-208	ENST00000470737	PPP1CA	P62136	330 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SEMA3F-208	ENST00000470737	RPS18	P62269	152 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
SEMA3F-208	ENST00000470737	HSD11B2	P80365	405 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SEMA3F-208	ENST00000470737	DMPK	Q09013	629 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SEMA3F-208	ENST00000470737	XRCC4	Q13426	336 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SEMA3F-208	ENST00000470737	MESD	Q14696	234 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SEMA3F-208	ENST00000470737	RPE65	Q16518	533 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SEMA3F-208	ENST00000470737	PPP2R5E	Q16537	467 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SEMA3F-208	ENST00000470737	ASTE1	Q2TB18	679 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
SEMA3F-208	ENST00000470737	LDLRAP1	Q5SW96	308 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SEMA3F-208	ENST00000470737	SLC9A4	Q6AI14	798 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SEMA3F-208	ENST00000470737	CAPRIN2	Q6IMN6	1127 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
SEMA3F-208	ENST00000470737	FAM199X	Q6PEV8	388 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
SEMA3F-208	ENST00000470737	C11orf96	Q7Z7L8	435 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SEMA3F-208	ENST00000470737	OOSP2	Q86WS3	158 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SEMA3F-208	ENST00000470737	RFX6	Q8HWS3	928 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SEMA3F-208	ENST00000470737	TTC30B	Q8N4P2	665 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SEMA3F-208	ENST00000470737	GPR150	Q8NGU9	434 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SEMA3F-208	ENST00000470737	SPATA22	Q8NHS9	363 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SEMA3F-208	ENST00000470737	MAP3K3	Q99759	626 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SEMA3F-208	ENST00000470737	TRIM5	Q9C035	493 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SEMA3F-208	ENST00000470737	RBSN	Q9H1K0	784 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SEMA3F-208	ENST00000470737	GLOD4	Q9HC38	313 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SEMA3F-208	ENST00000470737	ABHD10	Q9NUJ1	306 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SEMA3F-208	ENST00000470737	IMP3	Q9NV31	184 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
SEMA3F-208	ENST00000470737	ZNHIT6	Q9NWK9	470 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
SEMA3F-208	ENST00000470737	PLEKHB1	Q9UF11	243 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
SEMA3F-208	ENST00000470737	PSMD13	Q9UNM6	376 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SEMA3F-208	ENST00000470737	FARSA	Q9Y285	508 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
SEMA3F-208	ENST00000470737	DNMT3A	Q9Y6K1	912 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
SEMA3F-208	ENST00000470737	AURKA	O14965	403 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SEMA3F-208	ENST00000470737	SCRG1	O75711	98 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SEMA3F-208	ENST00000470737	POP7	O75817	140 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
SEMA3F-208	ENST00000470737	KLK3	P07288	261 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
SEMA3F-208	ENST00000470737	PBLD	P30039	288 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
SEMA3F-208	ENST00000470737	HMGCL	P35914	325 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SEMA3F-208	ENST00000470737	TUBB4B	P68371	445 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SEMA3F-208	ENST00000470737	CHAF1B	Q13112	559 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SEMA3F-208	ENST00000470737	ITGA9	Q13797	1035 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SEMA3F-208	ENST00000470737	TUBB2A	Q13885	445 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SEMA3F-208	ENST00000470737	CHRNA6	Q15825	494 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SEMA3F-208	ENST00000470737	SLC18A3	Q16572	532 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SEMA3F-208	ENST00000470737	TEX44	Q53QW1	395 aa		13.56	□□□□□ -0.24

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