RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468468.5

TSPAN4-211, Transcript of tetraspanin 4, humanhuman

TSL 2

Gene TSPAN4, Length 2,777 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN4-211ENST00000468468 GPSM1Q86YR5 675 aa15.61■□□□□ 0.09
TSPAN4-211ENST00000468468 ABI1Q8IZP0 508 aa15.61■□□□□ 0.09
TSPAN4-211ENST00000468468 LRRC43Q8N309 656 aa15.61■□□□□ 0.09
TSPAN4-211ENST00000468468 SMYD1Q8NB12 490 aa15.61■□□□□ 0.09
TSPAN4-211ENST00000468468 EEF1AKMT1Q8WVE0 214 aa15.61■□□□□ 0.09
TSPAN4-211ENST00000468468 MGME1Q9BQP7 344 aa15.61■□□□□ 0.09
TSPAN4-211ENST00000468468 CINPQ9BW66 212 aaPredicted RBP15.61■□□□□ 0.09
TSPAN4-211ENST00000468468 CHID1Q9BWS9 393 aa15.61■□□□□ 0.09
TSPAN4-211ENST00000468468 POLR1BQ9H9Y6 1135 aa15.61■□□□□ 0.09
TSPAN4-211ENST00000468468 TMEM161AQ9NX61 479 aa15.61■□□□□ 0.09
TSPAN4-211ENST00000468468 ZIM2Q9NZV7 527 aa15.61■□□□□ 0.09
TSPAN4-211ENST00000468468 EIF2B4Q9UI10 523 aaKnown RBP15.61■□□□□ 0.09
TSPAN4-211ENST00000468468 FNDC3AQ9Y2H6 1198 aaKnown RBP15.61■□□□□ 0.09
TSPAN4-211ENST00000468468 FAM92AA1XBS5 289 aa15.6■□□□□ 0.09
TSPAN4-211ENST00000468468 C2orf81A6NN90 581 aa15.6■□□□□ 0.09
TSPAN4-211ENST00000468468 F5H5T6 163 aa15.6■□□□□ 0.09
TSPAN4-211ENST00000468468 OR1I1O60431 355 aa15.6■□□□□ 0.09
TSPAN4-211ENST00000468468 PKMP14618 531 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
TSPAN4-211ENST00000468468 SELPP16109 830 aa15.6■□□□□ 0.09
TSPAN4-211ENST00000468468 MAGEA11P43364 429 aa15.6■□□□□ 0.09
TSPAN4-211ENST00000468468 GJA8P48165 433 aa15.6■□□□□ 0.09
TSPAN4-211ENST00000468468 KCNQ1P51787 676 aa15.6■□□□□ 0.09
TSPAN4-211ENST00000468468 OR4D2P58180 307 aa15.6■□□□□ 0.09
TSPAN4-211ENST00000468468 TCTN1Q2MV58 587 aa15.6■□□□□ 0.09
TSPAN4-211ENST00000468468 GPR107Q5VW38 600 aa15.6■□□□□ 0.09
TSPAN4-211ENST00000468468 TBPL2Q6SJ96 375 aa15.6■□□□□ 0.09
TSPAN4-211ENST00000468468 RALGPS2Q86X27 583 aaPredicted RBP15.6■□□□□ 0.09
TSPAN4-211ENST00000468468 PROSER1Q86XN7 944 aa15.6■□□□□ 0.09
TSPAN4-211ENST00000468468 PROKR1Q8TCW9 393 aa15.6■□□□□ 0.09
TSPAN4-211ENST00000468468 OSCP1Q8WVF1 389 aa15.6■□□□□ 0.09
TSPAN4-211ENST00000468468 CDK15Q96Q40 435 aa15.6■□□□□ 0.09
TSPAN4-211ENST00000468468 ZBED2Q9BTP6 218 aa15.6■□□□□ 0.09
TSPAN4-211ENST00000468468 CCSER2Q9H7U1 834 aa15.6■□□□□ 0.09
TSPAN4-211ENST00000468468 PLGRKTQ9HBL7 147 aa15.6■□□□□ 0.09
TSPAN4-211ENST00000468468 PKD2L2Q9NZM6 624 aa15.6■□□□□ 0.09
TSPAN4-211ENST00000468468 SEPT3Q9UH03 358 aa15.6■□□□□ 0.09
TSPAN4-211ENST00000468468 TRMT6Q9UJA5 497 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
TSPAN4-211ENST00000468468 ATE1O95260 518 aa15.6■□□□□ 0.09
TSPAN4-211ENST00000468468 TSPAN12O95859 305 aa15.6■□□□□ 0.09
TSPAN4-211ENST00000468468 ARL1P40616 181 aaPredicted RBP15.6■□□□□ 0.09
TSPAN4-211ENST00000468468 YAP1P46937 504 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
TSPAN4-211ENST00000468468 GNA12Q03113 381 aa15.6■□□□□ 0.09
TSPAN4-211ENST00000468468 RAB39AQ14964 217 aa15.6■□□□□ 0.09
TSPAN4-211ENST00000468468 GLYATQ6IB77 296 aa15.6■□□□□ 0.09
TSPAN4-211ENST00000468468 PSAPL1Q6NUJ1 521 aa15.6■□□□□ 0.09
TSPAN4-211ENST00000468468 PIANPQ8IYJ0 282 aa15.6■□□□□ 0.09
TSPAN4-211ENST00000468468 LINGO1Q96FE5 620 aa15.6■□□□□ 0.09
TSPAN4-211ENST00000468468 BDH2Q9BUT1 245 aa15.6■□□□□ 0.09
TSPAN4-211ENST00000468468 TRIM43BA6NCK2 446 aa15.59■□□□□ 0.09
TSPAN4-211ENST00000468468 TMX2-CTNND1H3BSU7 103 aa15.59■□□□□ 0.09
TSPAN4-211ENST00000468468 ENO2P09104 434 aaPredicted RBP15.59■□□□□ 0.09
TSPAN4-211ENST00000468468 IL2P60568 153 aa15.59■□□□□ 0.09
TSPAN4-211ENST00000468468 PRKG2Q13237 762 aa15.59■□□□□ 0.09
TSPAN4-211ENST00000468468 ATP6AP1LQ52LC2 224 aa15.59■□□□□ 0.09
TSPAN4-211ENST00000468468 SLC44A4Q53GD3 710 aa15.59■□□□□ 0.09
TSPAN4-211ENST00000468468 PYCR3Q53H96 274 aa15.59■□□□□ 0.09
TSPAN4-211ENST00000468468 KCTD8Q6ZWB6 473 aa15.59■□□□□ 0.09
TSPAN4-211ENST00000468468 HID1Q8IV36 788 aa15.59■□□□□ 0.09
TSPAN4-211ENST00000468468 NSMCE2Q96MF7 247 aa15.59■□□□□ 0.09
TSPAN4-211ENST00000468468 LRRC3Q9BY71 257 aa15.59■□□□□ 0.09
TSPAN4-211ENST00000468468 UBA2Q9UBT2 640 aaPredicted RBP15.59■□□□□ 0.09
TSPAN4-211ENST00000468468 VWA8A3KMH1 1905 aa15.59■□□□□ 0.09
TSPAN4-211ENST00000468468 E2F3O00716 465 aa15.59■□□□□ 0.09
TSPAN4-211ENST00000468468 ADARB1P78563 741 aaKnown RBP15.59■□□□□ 0.09
TSPAN4-211ENST00000468468 RING1Q06587 406 aa15.59■□□□□ 0.09
TSPAN4-211ENST00000468468 OTUD3Q5T2D3 398 aaPredicted RBP15.59■□□□□ 0.09
TSPAN4-211ENST00000468468 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP15.59■□□□□ 0.09
TSPAN4-211ENST00000468468 Q6ZSR9 355 aa15.59■□□□□ 0.09
TSPAN4-211ENST00000468468 CHST15Q7LFX5 561 aaPredicted RBP15.59■□□□□ 0.09
TSPAN4-211ENST00000468468 ZFAND4Q86XD8 727 aa15.59■□□□□ 0.09
TSPAN4-211ENST00000468468 CROCCP3Q8IVE0 287 aa15.59■□□□□ 0.09
TSPAN4-211ENST00000468468 LPCAT1Q8NF37 534 aa15.59■□□□□ 0.09
TSPAN4-211ENST00000468468 OR52B6Q8NGF0 335 aa15.59■□□□□ 0.09
TSPAN4-211ENST00000468468 PSKH2Q96QS6 385 aa15.59■□□□□ 0.09
TSPAN4-211ENST00000468468 SEPT5Q99719 369 aaPredicted RBP15.59■□□□□ 0.09
TSPAN4-211ENST00000468468 MAGEH1Q9H213 219 aa15.59■□□□□ 0.09
TSPAN4-211ENST00000468468 CRISPLD1Q9H336 500 aa15.59■□□□□ 0.09
TSPAN4-211ENST00000468468 SARS2Q9NP81 518 aaKnown RBP15.59■□□□□ 0.09
TSPAN4-211ENST00000468468 ZNF639Q9UID6 485 aa15.59■□□□□ 0.09
TSPAN4-211ENST00000468468 FKBPLQ9UIM3 349 aa15.59■□□□□ 0.09
TSPAN4-211ENST00000468468 WDR37Q9Y2I8 494 aa15.59■□□□□ 0.09
TSPAN4-211ENST00000468468 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa15.59■□□□□ 0.09
TSPAN4-211ENST00000468468 INSIG1O15503 277 aa15.58■□□□□ 0.09
TSPAN4-211ENST00000468468 PRLP01236 227 aa15.58■□□□□ 0.09
TSPAN4-211ENST00000468468 MC4RP32245 332 aa15.58■□□□□ 0.09
TSPAN4-211ENST00000468468 TTKP33981 857 aa15.58■□□□□ 0.09
TSPAN4-211ENST00000468468 ERVPABLB-1P60509 514 aa15.58■□□□□ 0.09
TSPAN4-211ENST00000468468 C16orf72Q14CZ0 275 aa15.58■□□□□ 0.09
TSPAN4-211ENST00000468468 ZRANB3Q5FWF4 1079 aa15.58■□□□□ 0.09
TSPAN4-211ENST00000468468 CTSL3PQ5NE16 218 aa15.58■□□□□ 0.09
TSPAN4-211ENST00000468468 TMEM26Q6ZUK4 368 aa15.58■□□□□ 0.09
TSPAN4-211ENST00000468468 USP51Q70EK9 711 aa15.58■□□□□ 0.09
TSPAN4-211ENST00000468468 CPNE9Q8IYJ1 553 aa15.58■□□□□ 0.09
TSPAN4-211ENST00000468468 FNDC8Q8TC99 324 aa15.58■□□□□ 0.09
TSPAN4-211ENST00000468468 PPM1MQ96MI6 270 aa15.58■□□□□ 0.09
TSPAN4-211ENST00000468468 CASD1Q96PB1 797 aa15.58■□□□□ 0.09
TSPAN4-211ENST00000468468 BPIFA1Q9NP55 256 aa15.58■□□□□ 0.09
TSPAN4-211ENST00000468468 MARCH5Q9NX47 278 aa15.58■□□□□ 0.09
TSPAN4-211ENST00000468468 SPATA7Q9P0W8 599 aa15.58■□□□□ 0.09
TSPAN4-211ENST00000468468 DYTNA2CJ06 578 aa15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 60.5 ms