RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000463533.1

ANKRD28-208, Transcript of ankyrin repeat domain 28, humanhuman

TSL 3

Gene ANKRD28, Length 742 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28-208ENST00000463533 SKA1Q96BD8 255 aa8.32□□□□□ -1.08
ANKRD28-208ENST00000463533 WDR92Q96MX6 357 aa8.32□□□□□ -1.08
ANKRD28-208ENST00000463533 VPS35Q96QK1 796 aa8.32□□□□□ -1.08
ANKRD28-208ENST00000463533 NAT9Q9BTE0 207 aa8.32□□□□□ -1.08
ANKRD28-208ENST00000463533 PARD6BQ9BYG5 372 aa8.32□□□□□ -1.08
ANKRD28-208ENST00000463533 OR2AG1Q9H205 316 aa8.32□□□□□ -1.08
ANKRD28-208ENST00000463533 LRRC4CQ9HCJ2 640 aa8.32□□□□□ -1.08
ANKRD28-208ENST00000463533 TRIM39Q9HCM9 518 aa8.32□□□□□ -1.08
ANKRD28-208ENST00000463533 MRPL40Q9NQ50 206 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
ANKRD28-208ENST00000463533 GPR27Q9NS67 375 aa8.32□□□□□ -1.08
ANKRD28-208ENST00000463533 IARS2Q9NSE4 1012 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
ANKRD28-208ENST00000463533 CATSPERZQ9NTU4 200 aa8.32□□□□□ -1.08
ANKRD28-208ENST00000463533 NINJ2Q9NZG7 142 aa8.32□□□□□ -1.08
ANKRD28-208ENST00000463533 SLC17A6Q9P2U8 582 aa8.32□□□□□ -1.08
ANKRD28-208ENST00000463533 ATXN10Q9UBB4 475 aa8.32□□□□□ -1.08
ANKRD28-208ENST00000463533 NCDNQ9UBB6 729 aa8.32□□□□□ -1.08
ANKRD28-208ENST00000463533 KLQ9UEF7 1012 aa8.32□□□□□ -1.08
ANKRD28-208ENST00000463533 PNMA8BQ9ULN7 279 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
ANKRD28-208ENST00000463533 SLC6A14Q9UN76 642 aa8.32□□□□□ -1.08
ANKRD28-208ENST00000463533 ARHGEF17Q96PE2 2063 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
ANKRD28-208ENST00000463533 TRBV5-4A0A0C4DH59 114 aa8.31□□□□□ -1.08
ANKRD28-208ENST00000463533 SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 76 aa8.31□□□□□ -1.08
ANKRD28-208ENST00000463533 AGAP14A8MT82 685 aa8.31□□□□□ -1.08
ANKRD28-208ENST00000463533 PROB1E7EW31 1015 aa8.31□□□□□ -1.08
ANKRD28-208ENST00000463533 OR1I1O60431 355 aa8.31□□□□□ -1.08
ANKRD28-208ENST00000463533 MAGEC1O60732 1142 aa8.31□□□□□ -1.08
ANKRD28-208ENST00000463533 PIAS1O75925 651 aa8.31□□□□□ -1.08
ANKRD28-208ENST00000463533 TTC4O95801 387 aa8.31□□□□□ -1.08
ANKRD28-208ENST00000463533 FUCA1P04066 466 aa8.31□□□□□ -1.08
ANKRD28-208ENST00000463533 ZNF8P17098 575 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
ANKRD28-208ENST00000463533 MSH3P20585 1137 aa8.31□□□□□ -1.08
ANKRD28-208ENST00000463533 ACRV1P26436 265 aa8.31□□□□□ -1.08
ANKRD28-208ENST00000463533 HTR1BP28222 390 aa8.31□□□□□ -1.08
ANKRD28-208ENST00000463533 AKT1P31749 480 aa8.31□□□□□ -1.08
ANKRD28-208ENST00000463533 HOXD12P35452 270 aa8.31□□□□□ -1.08
ANKRD28-208ENST00000463533 CTSKP43235 329 aa8.31□□□□□ -1.08
ANKRD28-208ENST00000463533 SRP54P61011 504 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
ANKRD28-208ENST00000463533 B4GALNT1Q00973 533 aa8.31□□□□□ -1.08
ANKRD28-208ENST00000463533 OVGP1Q12889 678 aa8.31□□□□□ -1.08
ANKRD28-208ENST00000463533 TMEM115Q12893 351 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
ANKRD28-208ENST00000463533 GRIK2Q13002 908 aa8.31□□□□□ -1.08
ANKRD28-208ENST00000463533 CTBP1Q13363 440 aa8.31□□□□□ -1.08
ANKRD28-208ENST00000463533 PTK2BQ14289 1009 aa8.31□□□□□ -1.08
ANKRD28-208ENST00000463533 SF3A2Q15428 464 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
ANKRD28-208ENST00000463533 TCEA2Q15560 299 aa8.31□□□□□ -1.08
ANKRD28-208ENST00000463533 ALG11Q2TAA5 492 aa8.31□□□□□ -1.08
ANKRD28-208ENST00000463533 GPR33Q49SQ1 333 aa8.31□□□□□ -1.08
ANKRD28-208ENST00000463533 HSP90AA5PQ58FG0 334 aa8.31□□□□□ -1.08
ANKRD28-208ENST00000463533 LDLRAP1Q5SW96 308 aa8.31□□□□□ -1.08
ANKRD28-208ENST00000463533 WDR93Q6P2C0 686 aa8.31□□□□□ -1.08
ANKRD28-208ENST00000463533 SLC23A3Q6PIS1 610 aa8.31□□□□□ -1.08
ANKRD28-208ENST00000463533 MACC1Q6ZN28 852 aa8.31□□□□□ -1.08
ANKRD28-208ENST00000463533 CEP128Q6ZU80 1094 aa8.31□□□□□ -1.08
ANKRD28-208ENST00000463533 C3orf62Q6ZUJ4 267 aa8.31□□□□□ -1.08
ANKRD28-208ENST00000463533 DET1Q7L5Y6 550 aa8.31□□□□□ -1.08
ANKRD28-208ENST00000463533 PHYKPLQ8IUZ5 450 aa8.31□□□□□ -1.08
ANKRD28-208ENST00000463533 HID1Q8IV36 788 aa8.31□□□□□ -1.08
ANKRD28-208ENST00000463533 DENND6AQ8IWF6 608 aa8.31□□□□□ -1.08
ANKRD28-208ENST00000463533 RASGEF1AQ8N9B8 481 aa8.31□□□□□ -1.08
ANKRD28-208ENST00000463533 DDHD1Q8NEL9 900 aa8.31□□□□□ -1.08
ANKRD28-208ENST00000463533 UHMK1Q8TAS1 419 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
ANKRD28-208ENST00000463533 GSDMBQ8TAX9 411 aa8.31□□□□□ -1.08
ANKRD28-208ENST00000463533 OR1E3Q8WZA6 343 aa8.31□□□□□ -1.08
ANKRD28-208ENST00000463533 RUBCNQ92622 972 aa8.31□□□□□ -1.08
ANKRD28-208ENST00000463533 TBRG4Q969Z0 631 aaKnown RBP eCLIP8.31□□□□□ -1.08
ANKRD28-208ENST00000463533 COL26A1Q96A83 441 aa8.31□□□□□ -1.08
ANKRD28-208ENST00000463533 ULK4Q96C45 1275 aa8.31□□□□□ -1.08
ANKRD28-208ENST00000463533 CERS2Q96G23 380 aa8.31□□□□□ -1.08
ANKRD28-208ENST00000463533 SGSM3Q96HU1 749 aa8.31□□□□□ -1.08
ANKRD28-208ENST00000463533 BOCQ9BWV1 1114 aa8.31□□□□□ -1.08
ANKRD28-208ENST00000463533 GTPBP2Q9BX10 602 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
ANKRD28-208ENST00000463533 NUSAP1Q9BXS6 441 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
ANKRD28-208ENST00000463533 TSPYL1Q9H0U9 437 aa8.31□□□□□ -1.08
ANKRD28-208ENST00000463533 TCEAL2Q9H3H9 227 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
ANKRD28-208ENST00000463533 CDC42EP4Q9H3Q1 356 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
ANKRD28-208ENST00000463533 VPS37BQ9H9H4 285 aa8.31□□□□□ -1.08
ANKRD28-208ENST00000463533 CAPN10Q9HC96 672 aa8.31□□□□□ -1.08
ANKRD28-208ENST00000463533 CYP4F12Q9HCS2 524 aa8.31□□□□□ -1.08
ANKRD28-208ENST00000463533 FGF22Q9HCT0 170 aa8.31□□□□□ -1.08
ANKRD28-208ENST00000463533 PARD6AQ9NPB6 346 aa8.31□□□□□ -1.08
ANKRD28-208ENST00000463533 PPANQ9NQ55 473 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
ANKRD28-208ENST00000463533 SMOXQ9NWM0 555 aa8.31□□□□□ -1.08
ANKRD28-208ENST00000463533 DNAJC28Q9NX36 388 aa8.31□□□□□ -1.08
ANKRD28-208ENST00000463533 SLC17A4Q9Y2C5 497 aa8.31□□□□□ -1.08
ANKRD28-208ENST00000463533 PRKAB1Q9Y478 270 aa8.31□□□□□ -1.08
ANKRD28-208ENST00000463533 PCYT1BQ9Y5K3 369 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
ANKRD28-208ENST00000463533 PRSS21Q9Y6M0 314 aa8.31□□□□□ -1.08
ANKRD28-208ENST00000463533 EP300Q09472 2414 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
ANKRD28-208ENST00000463533 PRSS38A1L453 326 aa8.3□□□□□ -1.08
ANKRD28-208ENST00000463533 OR2AG2A6NM03 316 aa8.3□□□□□ -1.08
ANKRD28-208ENST00000463533 DNAJC6O75061 913 aa8.3□□□□□ -1.08
ANKRD28-208ENST00000463533 CDK14O94921 469 aa8.3□□□□□ -1.08
ANKRD28-208ENST00000463533 RASGRP1O95267 797 aa8.3□□□□□ -1.08
ANKRD28-208ENST00000463533 TNFP01375 233 aa8.3□□□□□ -1.08
ANKRD28-208ENST00000463533 GSTA2P09210 222 aa8.3□□□□□ -1.08
ANKRD28-208ENST00000463533 ZNF806P0C7X5 589 aa8.3□□□□□ -1.08
ANKRD28-208ENST00000463533 ENGP17813 658 aa8.3□□□□□ -1.08
ANKRD28-208ENST00000463533 KELP23276 732 aa8.3□□□□□ -1.08
ANKRD28-208ENST00000463533 PMLP29590 882 aa8.3□□□□□ -1.08
ANKRD28-208ENST00000463533 SLC1A2P43004 574 aa8.3□□□□□ -1.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.3 ms