RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462322.2

SMKR1-201, Transcript of small lysine rich protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SMKR1, Length 1,035 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMKR1-201ENST00000462322 ITIH1P19827 911 aa23.54■■□□□ 1.36
SMKR1-201ENST00000462322 RPL22P35268 128 aaKnown RBP23.54■■□□□ 1.36
SMKR1-201ENST00000462322 HALP42357 657 aa23.54■■□□□ 1.36
SMKR1-201ENST00000462322 DMPKQ09013 629 aa23.54■■□□□ 1.36
SMKR1-201ENST00000462322 TRA2AQ13595 282 aaKnown RBP eCLIP23.54■■□□□ 1.36
SMKR1-201ENST00000462322 GPR33Q49SQ1 333 aa23.54■■□□□ 1.36
SMKR1-201ENST00000462322 SPACA3Q8IXA5 215 aa23.54■■□□□ 1.36
SMKR1-201ENST00000462322 NAT14Q8WUY8 206 aa23.54■■□□□ 1.36
SMKR1-201ENST00000462322 KCNE4Q8WWG9 221 aa23.54■■□□□ 1.36
SMKR1-201ENST00000462322 NCSTNQ92542 709 aa23.54■■□□□ 1.36
SMKR1-201ENST00000462322 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP23.54■■□□□ 1.36
SMKR1-201ENST00000462322 CXorf40BQ96DE9 158 aa23.54■■□□□ 1.36
SMKR1-201ENST00000462322 COPS8Q99627 209 aa23.54■■□□□ 1.36
SMKR1-201ENST00000462322 UCK1Q9HA47 277 aa23.54■■□□□ 1.36
SMKR1-201ENST00000462322 HOMER3Q9NSC5 361 aa23.54■■□□□ 1.36
SMKR1-201ENST00000462322 PCDHGA7Q9Y5G6 932 aa23.54■■□□□ 1.36
SMKR1-201ENST00000462322 LILRA5A6NI73 299 aa23.53■■□□□ 1.36
SMKR1-201ENST00000462322 CFAP99D6REC4 459 aa23.53■■□□□ 1.36
SMKR1-201ENST00000462322 H7C0S8 307 aa23.53■■□□□ 1.36
SMKR1-201ENST00000462322 ZSCAN12O43309 604 aa23.53■■□□□ 1.36
SMKR1-201ENST00000462322 APRTP07741 180 aa23.53■■□□□ 1.36
SMKR1-201ENST00000462322 THRAP10827 490 aa23.53■■□□□ 1.36
SMKR1-201ENST00000462322 SLC5A2P31639 672 aa23.53■■□□□ 1.36
SMKR1-201ENST00000462322 KCNJ1P48048 391 aa23.53■■□□□ 1.36
SMKR1-201ENST00000462322 MAPK10P53779 464 aa23.53■■□□□ 1.36
SMKR1-201ENST00000462322 NFE2L1Q14494 772 aa23.53■■□□□ 1.36
SMKR1-201ENST00000462322 SKIDA1Q1XH10 827 aa23.53■■□□□ 1.36
SMKR1-201ENST00000462322 CCDC38Q502W7 563 aa23.53■■□□□ 1.36
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SMKR1-201ENST00000462322 FAM83HQ6ZRV2 1179 aaPredicted RBP23.53■■□□□ 1.36
SMKR1-201ENST00000462322 TMEM26Q6ZUK4 368 aa23.53■■□□□ 1.36
SMKR1-201ENST00000462322 TAS2R42Q7RTR8 314 aa23.53■■□□□ 1.36
SMKR1-201ENST00000462322 HEXDCQ8WVB3 486 aa23.53■■□□□ 1.36
SMKR1-201ENST00000462322 CDKN2AIPNLQ96HQ2 116 aa23.53■■□□□ 1.36
SMKR1-201ENST00000462322 EPB41L1Q9H4G0 881 aa23.53■■□□□ 1.36
SMKR1-201ENST00000462322 POT1Q9NUX5 634 aa23.53■■□□□ 1.36
SMKR1-201ENST00000462322 RALYQ9UKM9 306 aaKnown RBP23.53■■□□□ 1.36
SMKR1-201ENST00000462322 WDR37Q9Y2I8 494 aa23.53■■□□□ 1.36
SMKR1-201ENST00000462322 MGAT4DA6NG13 374 aa23.52■■□□□ 1.36
SMKR1-201ENST00000462322 MROH6A6NGR9 719 aa23.52■■□□□ 1.36
SMKR1-201ENST00000462322 ETV5P41161 510 aa23.52■■□□□ 1.36
SMKR1-201ENST00000462322 GRIA1P42261 906 aa23.52■■□□□ 1.36
SMKR1-201ENST00000462322 CDKN1CP49918 316 aaPredicted RBP23.52■■□□□ 1.36
SMKR1-201ENST00000462322 CLCA4Q14CN2 919 aa23.52■■□□□ 1.36
SMKR1-201ENST00000462322 BCL7AQ4VC05 210 aa23.52■■□□□ 1.36
SMKR1-201ENST00000462322 SNAP47Q5SQN1 464 aa23.52■■□□□ 1.36
SMKR1-201ENST00000462322 C4orf22Q6V702 233 aa23.52■■□□□ 1.36
SMKR1-201ENST00000462322 MICALCLQ6ZW33 695 aa23.52■■□□□ 1.36
SMKR1-201ENST00000462322 REXO1L1PQ8IX06 675 aa23.52■■□□□ 1.36
SMKR1-201ENST00000462322 CCDC97Q96F63 343 aaPredicted RBP23.52■■□□□ 1.36
SMKR1-201ENST00000462322 KCNF1Q9H3M0 494 aa23.52■■□□□ 1.36
SMKR1-201ENST00000462322 ZDHHC3Q9NYG2 299 aa23.52■■□□□ 1.36
SMKR1-201ENST00000462322 FAM8A1Q9UBU6 413 aa23.52■■□□□ 1.36
SMKR1-201ENST00000462322 PSMD13Q9UNM6 376 aa23.52■■□□□ 1.36
SMKR1-201ENST00000462322 NBEAQ8NFP9 2946 aa23.52■■□□□ 1.36
SMKR1-201ENST00000462322 HEATR9A2RTY3 570 aa23.51■■□□□ 1.35
SMKR1-201ENST00000462322 KLK10O43240 276 aa23.51■■□□□ 1.35
SMKR1-201ENST00000462322 CSTF2P33240 577 aaKnown RBP eCLIP23.51■■□□□ 1.35
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SMKR1-201ENST00000462322 SERPINA9Q86WD7 417 aa23.51■■□□□ 1.35
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SMKR1-201ENST00000462322 PRELID2Q8N945 189 aa23.51■■□□□ 1.35
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SMKR1-201ENST00000462322 OR2L2Q8NH16 312 aa23.51■■□□□ 1.35
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SMKR1-201ENST00000462322 DPH1Q9BZG8 443 aa23.51■■□□□ 1.35
SMKR1-201ENST00000462322 SLC40A1Q9NP59 571 aa23.51■■□□□ 1.35
SMKR1-201ENST00000462322 CASS4Q9NQ75 786 aa23.51■■□□□ 1.35
SMKR1-201ENST00000462322 PDP2Q9P2J9 529 aa23.51■■□□□ 1.35
SMKR1-201ENST00000462322 PTPRQQ9UMZ3 2332 aa23.5■■□□□ 1.35
SMKR1-201ENST00000462322 TRBV5-4A0A0C4DH59 114 aa23.5■■□□□ 1.35
SMKR1-201ENST00000462322 PRAMEF33A0A0G2JMD5 474 aa23.5■■□□□ 1.35
SMKR1-201ENST00000462322 KLHL33A6NCF5 533 aa23.5■■□□□ 1.35
SMKR1-201ENST00000462322 NVLO15381 856 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
SMKR1-201ENST00000462322 SGTAO43765 313 aa23.5■■□□□ 1.35
SMKR1-201ENST00000462322 PRSS56P0CW18 603 aa23.5■■□□□ 1.35
SMKR1-201ENST00000462322 CCL4P13236 92 aa23.5■■□□□ 1.35
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SMKR1-201ENST00000462322 LINC00615Q96LM1 132 aaPredicted RBP23.5■■□□□ 1.35
SMKR1-201ENST00000462322 AHCTF1Q8WYP5 2266 aa23.5■■□□□ 1.35
SMKR1-201ENST00000462322 ZFHX4Q86UP3 3567 aa23.49■■□□□ 1.35
SMKR1-201ENST00000462322 A8MU76 341 aa23.49■■□□□ 1.35
SMKR1-201ENST00000462322 UBXN7O94888 489 aa23.49■■□□□ 1.35
SMKR1-201ENST00000462322 TYRP1P17643 537 aa23.49■■□□□ 1.35
SMKR1-201ENST00000462322 AMD1P17707 334 aa23.49■■□□□ 1.35
SMKR1-201ENST00000462322 ADRA1DP25100 572 aa23.49■■□□□ 1.35
SMKR1-201ENST00000462322 PSMA3P25788 255 aa23.49■■□□□ 1.35
SMKR1-201ENST00000462322 MSNP26038 577 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
SMKR1-201ENST00000462322 PRLHRP49683 370 aa23.49■■□□□ 1.35
SMKR1-201ENST00000462322 GPR18Q14330 331 aa23.49■■□□□ 1.35
SMKR1-201ENST00000462322 RPE65Q16518 533 aa23.49■■□□□ 1.35
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