RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000459627.1

SH3BP5-208, Transcript of SH3 domain binding protein 5, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP5, Length 473 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP5-208ENST00000459627 THRAP10827 490 aa23.46■■□□□ 1.35
SH3BP5-208ENST00000459627 VCLP18206 1134 aa23.46■■□□□ 1.35
SH3BP5-208ENST00000459627 XRCC1P18887 633 aaPredicted RBP23.46■■□□□ 1.35
SH3BP5-208ENST00000459627 ITGALP20701 1170 aa23.46■■□□□ 1.35
SH3BP5-208ENST00000459627 FDFT1P37268 417 aa23.46■■□□□ 1.35
SH3BP5-208ENST00000459627 GPLD1P80108 840 aa23.46■■□□□ 1.35
SH3BP5-208ENST00000459627 PDE1BQ01064 536 aa23.46■■□□□ 1.35
SH3BP5-208ENST00000459627 TMEM71Q6P5X7 295 aa23.46■■□□□ 1.35
SH3BP5-208ENST00000459627 ABRAXAS1Q6UWZ7 409 aa23.46■■□□□ 1.35
SH3BP5-208ENST00000459627 XKR5Q6UX68 686 aa23.46■■□□□ 1.35
SH3BP5-208ENST00000459627 TAS2R42Q7RTR8 314 aa23.46■■□□□ 1.35
SH3BP5-208ENST00000459627 REXO1L1PQ8IX06 675 aa23.46■■□□□ 1.35
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SH3BP5-208ENST00000459627 LILRA3Q8N6C8 439 aaPredicted RBP23.46■■□□□ 1.35
SH3BP5-208ENST00000459627 GPR150Q8NGU9 434 aa23.46■■□□□ 1.35
SH3BP5-208ENST00000459627 SH3KBP1Q96B97 665 aa23.46■■□□□ 1.35
SH3BP5-208ENST00000459627 CMKLR1Q99788 373 aa23.46■■□□□ 1.35
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SH3BP5-208ENST00000459627 SMARCAL1Q9NZC9 954 aa23.46■■□□□ 1.35
SH3BP5-208ENST00000459627 OGFRQ9NZT2 677 aa23.46■■□□□ 1.35
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SH3BP5-208ENST00000459627 DUS1LQ6P1R4 473 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.34
SH3BP5-208ENST00000459627 TMEM26Q6ZUK4 368 aa23.45■■□□□ 1.34
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SH3BP5-208ENST00000459627 SERPINA9Q86WD7 417 aa23.45■■□□□ 1.34
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SH3BP5-208ENST00000459627 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa23.45■■□□□ 1.34
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SH3BP5-208ENST00000459627 DCUN1D1Q96GG9 259 aa23.45■■□□□ 1.34
SH3BP5-208ENST00000459627 CDKN2AIPNLQ96HQ2 116 aa23.45■■□□□ 1.34
SH3BP5-208ENST00000459627 MS4A14Q96JA4 679 aa23.45■■□□□ 1.34
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SH3BP5-208ENST00000459627 SLC2A6Q9UGQ3 507 aa23.45■■□□□ 1.34
SH3BP5-208ENST00000459627 C9orf172C9J069 976 aa23.44■■□□□ 1.34
SH3BP5-208ENST00000459627 POLBP06746 335 aa23.44■■□□□ 1.34
SH3BP5-208ENST00000459627 FGF3P11487 239 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
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SH3BP5-208ENST00000459627 GPR18Q14330 331 aa23.44■■□□□ 1.34
SH3BP5-208ENST00000459627 AGAP9Q5VTM2 703 aa23.44■■□□□ 1.34
SH3BP5-208ENST00000459627 GSTA5Q7RTV2 222 aa23.44■■□□□ 1.34
SH3BP5-208ENST00000459627 LINC00523Q86TU6 105 aa23.44■■□□□ 1.34
SH3BP5-208ENST00000459627 ZFAND4Q86XD8 727 aa23.44■■□□□ 1.34
SH3BP5-208ENST00000459627 ULK4Q96C45 1275 aa23.44■■□□□ 1.34
SH3BP5-208ENST00000459627 RNF31Q96EP0 1072 aa23.44■■□□□ 1.34
SH3BP5-208ENST00000459627 LDHAL6BQ9BYZ2 381 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
SH3BP5-208ENST00000459627 WWP1Q9H0M0 922 aa23.44■■□□□ 1.34
SH3BP5-208ENST00000459627 TRMT1Q9NXH9 659 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
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SH3BP5-208ENST00000459627 PTPRQQ9UMZ3 2332 aa23.43■■□□□ 1.34
SH3BP5-208ENST00000459627 LILRA5A6NI73 299 aa23.43■■□□□ 1.34
SH3BP5-208ENST00000459627 AGAP14A8MT82 685 aa23.43■■□□□ 1.34
SH3BP5-208ENST00000459627 APRTP07741 180 aa23.43■■□□□ 1.34
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SH3BP5-208ENST00000459627 CDH17Q12864 832 aa23.43■■□□□ 1.34
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SH3BP5-208ENST00000459627 RPE65Q16518 533 aa23.43■■□□□ 1.34
SH3BP5-208ENST00000459627 CLPPQ16740 277 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
SH3BP5-208ENST00000459627 SLC35F6Q8N357 371 aa23.43■■□□□ 1.34
SH3BP5-208ENST00000459627 PRELID2Q8N945 189 aa23.43■■□□□ 1.34
SH3BP5-208ENST00000459627 SPDYE1Q8NFV5 336 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
SH3BP5-208ENST00000459627 STYXQ8WUJ0 223 aa23.43■■□□□ 1.34
SH3BP5-208ENST00000459627 RSC1A1Q92681 617 aa23.43■■□□□ 1.34
SH3BP5-208ENST00000459627 ZNF778Q96MU6 729 aa23.43■■□□□ 1.34
SH3BP5-208ENST00000459627 COPS8Q99627 209 aa23.43■■□□□ 1.34
SH3BP5-208ENST00000459627 PRORYQ9H606 182 aa23.43■■□□□ 1.34
SH3BP5-208ENST00000459627 AKAP7Q9P0M2 348 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
SH3BP5-208ENST00000459627 DRG1Q9Y295 367 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
SH3BP5-208ENST00000459627 CCDC162PA2VCL2 907 aa23.42■■□□□ 1.34
SH3BP5-208ENST00000459627 MGAT4DA6NG13 374 aa23.42■■□□□ 1.34
SH3BP5-208ENST00000459627 MROH6A6NGR9 719 aa23.42■■□□□ 1.34
SH3BP5-208ENST00000459627 EFCAB7A8K855 629 aa23.42■■□□□ 1.34
SH3BP5-208ENST00000459627 SUN1O94901 812 aa23.42■■□□□ 1.34
SH3BP5-208ENST00000459627 ACRV1P26436 265 aa23.42■■□□□ 1.34
SH3BP5-208ENST00000459627 CSTF2P33240 577 aaKnown RBP eCLIP23.42■■□□□ 1.34
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SH3BP5-208ENST00000459627 EPHA4P54764 986 aa23.42■■□□□ 1.34
SH3BP5-208ENST00000459627 DBN1Q16643 649 aa23.42■■□□□ 1.34
SH3BP5-208ENST00000459627 WASH2PQ6VEQ5 465 aa23.42■■□□□ 1.34
SH3BP5-208ENST00000459627 FAM129CQ86XR2 697 aa23.42■■□□□ 1.34
SH3BP5-208ENST00000459627 CLDN19Q8N6F1 224 aa23.42■■□□□ 1.34
SH3BP5-208ENST00000459627 FCRL3Q96P31 734 aaPredicted RBP23.42■■□□□ 1.34
SH3BP5-208ENST00000459627 INSM2Q96T92 566 aaPredicted RBP23.42■■□□□ 1.34
SH3BP5-208ENST00000459627 SLC40A1Q9NP59 571 aa23.42■■□□□ 1.34
SH3BP5-208ENST00000459627 CASS4Q9NQ75 786 aa23.42■■□□□ 1.34
SH3BP5-208ENST00000459627 WASH6PQ9NQA3 447 aa23.42■■□□□ 1.34
SH3BP5-208ENST00000459627 IMP3Q9NV31 184 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
SH3BP5-208ENST00000459627 ZDHHC3Q9NYG2 299 aa23.42■■□□□ 1.34
SH3BP5-208ENST00000459627 PCDHGA7Q9Y5G6 932 aa23.42■■□□□ 1.34
SH3BP5-208ENST00000459627 DNMT3AQ9Y6K1 912 aaPredicted RBP23.42■■□□□ 1.34
SH3BP5-208ENST00000459627 TRBV5-4A0A0C4DH59 114 aa23.41■■□□□ 1.34
SH3BP5-208ENST00000459627 HGSO14964 777 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
SH3BP5-208ENST00000459627 UBXN7O94888 489 aa23.41■■□□□ 1.34
SH3BP5-208ENST00000459627 AMD1P17707 334 aa23.41■■□□□ 1.34
SH3BP5-208ENST00000459627 MSNP26038 577 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
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