RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442481.5

PRAME-210, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 3

Gene PRAME, Length 581 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-210ENST00000442481 MRFAP1Q9Y605 127 aa11.52□□□□□ -0.57
PRAME-210ENST00000442481 KIR2DS5A0A0G2JLQ3 304 aa11.51□□□□□ -0.57
PRAME-210ENST00000442481 A0A0G2JNG1 304 aa11.51□□□□□ -0.57
PRAME-210ENST00000442481 LOC101059948A0A1B0GTJ6 334 aa11.51□□□□□ -0.57
PRAME-210ENST00000442481 A8MU76 341 aa11.51□□□□□ -0.57
PRAME-210ENST00000442481 ANKRD66B4E2M5 251 aa11.51□□□□□ -0.57
PRAME-210ENST00000442481 KIR2DS3K7RE56 304 aa11.51□□□□□ -0.57
PRAME-210ENST00000442481 RFPL1O75677 317 aa11.51□□□□□ -0.57
PRAME-210ENST00000442481 ASMTLO95671 621 aa11.51□□□□□ -0.57
PRAME-210ENST00000442481 ANKRD34CP0C6C1 535 aa11.51□□□□□ -0.57
PRAME-210ENST00000442481 OAS2P29728 719 aaKnown RBP11.51□□□□□ -0.57
PRAME-210ENST00000442481 CD68P34810 354 aaPredicted RBP11.51□□□□□ -0.57
PRAME-210ENST00000442481 PTPN7P35236 360 aa11.51□□□□□ -0.57
PRAME-210ENST00000442481 XRCC4Q13426 336 aa11.51□□□□□ -0.57
PRAME-210ENST00000442481 KIR2DS5Q14953 304 aa11.51□□□□□ -0.57
PRAME-210ENST00000442481 PYCR3Q53H96 274 aa11.51□□□□□ -0.57
PRAME-210ENST00000442481 ALS2CLQ60I27 953 aa11.51□□□□□ -0.57
PRAME-210ENST00000442481 ITPRIPL1Q6GPH6 555 aa11.51□□□□□ -0.57
PRAME-210ENST00000442481 LYSMD3Q7Z3D4 306 aa11.51□□□□□ -0.57
PRAME-210ENST00000442481 SCAMP4Q969E2 229 aa11.51□□□□□ -0.57
PRAME-210ENST00000442481 VAT1Q99536 393 aa11.51□□□□□ -0.57
PRAME-210ENST00000442481 FSD1LQ9BXM9 530 aa11.51□□□□□ -0.57
PRAME-210ENST00000442481 GPR63Q9BZJ6 419 aa11.51□□□□□ -0.57
PRAME-210ENST00000442481 SPRY4Q9C004 299 aa11.51□□□□□ -0.57
PRAME-210ENST00000442481 PKD2L2Q9NZM6 624 aa11.51□□□□□ -0.57
PRAME-210ENST00000442481 FAM153AQ9UHL3 310 aa11.51□□□□□ -0.57
PRAME-210ENST00000442481 EFR3BQ9Y2G0 817 aa11.51□□□□□ -0.57
PRAME-210ENST00000442481 PPIL1Q9Y3C6 166 aa11.51□□□□□ -0.57
PRAME-210ENST00000442481 RPS6KL1Q9Y6S9 549 aa11.51□□□□□ -0.57
PRAME-210ENST00000442481 BLACEA4D250 179 aa11.5□□□□□ -0.57
PRAME-210ENST00000442481 CES2O00748 559 aa11.5□□□□□ -0.57
PRAME-210ENST00000442481 TOX3O15405 576 aaPredicted RBP11.5□□□□□ -0.57
PRAME-210ENST00000442481 AGFG2O95081 481 aa11.5□□□□□ -0.57
PRAME-210ENST00000442481 RECKO95980 971 aa11.5□□□□□ -0.57
PRAME-210ENST00000442481 MT-ND3P03897 115 aa11.5□□□□□ -0.57
PRAME-210ENST00000442481 FUCA1P04066 466 aa11.5□□□□□ -0.57
PRAME-210ENST00000442481 CCNYL3P0C7X3 344 aa11.5□□□□□ -0.57
PRAME-210ENST00000442481 PAFAH1B1P43034 410 aa11.5□□□□□ -0.57
PRAME-210ENST00000442481 POLD2P49005 469 aa11.5□□□□□ -0.57
PRAME-210ENST00000442481 STC1P52823 247 aa11.5□□□□□ -0.57
PRAME-210ENST00000442481 WNT3AP56704 352 aa11.5□□□□□ -0.57
PRAME-210ENST00000442481 PTSQ03393 145 aa11.5□□□□□ -0.57
PRAME-210ENST00000442481 CKAP4Q07065 602 aaKnown RBP11.5□□□□□ -0.57
PRAME-210ENST00000442481 IL11RAQ14626 422 aa11.5□□□□□ -0.57
PRAME-210ENST00000442481 LONRF2Q1L5Z9 754 aa11.5□□□□□ -0.57
PRAME-210ENST00000442481 CHCHD2P9Q5T1J5 151 aaPredicted RBP11.5□□□□□ -0.57
PRAME-210ENST00000442481 FHL5Q5TD97 284 aa11.5□□□□□ -0.57
PRAME-210ENST00000442481 HIST2H2BCQ6DN03 193 aa11.5□□□□□ -0.57
PRAME-210ENST00000442481 TECPR1Q7Z6L1 1165 aa11.5□□□□□ -0.57
PRAME-210ENST00000442481 TRIM74Q86UV6 250 aa11.5□□□□□ -0.57
PRAME-210ENST00000442481 PHYKPLQ8IUZ5 450 aa11.5□□□□□ -0.57
PRAME-210ENST00000442481 CBARPQ8N350 705 aaPredicted RBP11.5□□□□□ -0.57
PRAME-210ENST00000442481 TTC13Q8NBP0 860 aa11.5□□□□□ -0.57
PRAME-210ENST00000442481 CCDC110Q8TBZ0 833 aa11.5□□□□□ -0.57
PRAME-210ENST00000442481 STAMBPL1Q96FJ0 436 aa11.5□□□□□ -0.57
PRAME-210ENST00000442481 CTRCQ99895 268 aa11.5□□□□□ -0.57
PRAME-210ENST00000442481 RIOK2Q9BVS4 552 aaKnown RBP11.5□□□□□ -0.57
PRAME-210ENST00000442481 ULBP3Q9BZM4 244 aa11.5□□□□□ -0.57
PRAME-210ENST00000442481 ABCG8Q9H221 673 aa11.5□□□□□ -0.57
PRAME-210ENST00000442481 TMEM9Q9P0T7 183 aa11.5□□□□□ -0.57
PRAME-210ENST00000442481 ZNHIT2Q9UHR6 403 aa11.5□□□□□ -0.57
PRAME-210ENST00000442481 TRHDEQ9UKU6 1024 aa11.5□□□□□ -0.57
PRAME-210ENST00000442481 PLAAQ9Y263 795 aa11.5□□□□□ -0.57
PRAME-210ENST00000442481 TP53TG5Q9Y2B4 290 aa11.5□□□□□ -0.57
PRAME-210ENST00000442481 ZNF711Q9Y462 761 aa11.5□□□□□ -0.57
PRAME-210ENST00000442481 KCNMB2Q9Y691 235 aa11.5□□□□□ -0.57
PRAME-210ENST00000442481 UTP20O75691 2785 aaKnown RBP11.49□□□□□ -0.57
PRAME-210ENST00000442481 TCRBV7S2A1N4TA0A589 114 aa11.49□□□□□ -0.57
PRAME-210ENST00000442481 LILRA5A6NI73 299 aa11.49□□□□□ -0.57
PRAME-210ENST00000442481 ENO4A6NNW6 628 aa11.49□□□□□ -0.57
PRAME-210ENST00000442481 PGRMC1O00264 195 aaKnown RBP11.49□□□□□ -0.57
PRAME-210ENST00000442481 NDST3O95803 873 aa11.49□□□□□ -0.57
PRAME-210ENST00000442481 DLGAP3O95886 979 aa11.49□□□□□ -0.57
PRAME-210ENST00000442481 FGGP02679 453 aa11.49□□□□□ -0.57
PRAME-210ENST00000442481 F3P13726 295 aa11.49□□□□□ -0.57
PRAME-210ENST00000442481 PSMB4P28070 264 aa11.49□□□□□ -0.57
PRAME-210ENST00000442481 DLSTP36957 453 aa11.49□□□□□ -0.57
PRAME-210ENST00000442481 CHRNA4P43681 627 aa11.49□□□□□ -0.57
PRAME-210ENST00000442481 MAPK9P45984 424 aa11.49□□□□□ -0.57
PRAME-210ENST00000442481 FOXM1Q08050 763 aa11.49□□□□□ -0.57
PRAME-210ENST00000442481 NFATC2Q13469 925 aa11.49□□□□□ -0.57
PRAME-210ENST00000442481 TUBB2AQ13885 445 aa11.49□□□□□ -0.57
PRAME-210ENST00000442481 PRPSAP1Q14558 356 aa11.49□□□□□ -0.57
PRAME-210ENST00000442481 WHAMMP3Q1A5X7 153 aa11.49□□□□□ -0.57
PRAME-210ENST00000442481 C6orf15Q6UXA7 325 aaPredicted RBP11.49□□□□□ -0.57
PRAME-210ENST00000442481 ARHGEF18Q6ZSZ5 1173 aa11.49□□□□□ -0.57
PRAME-210ENST00000442481 ASB18Q6ZVZ8 466 aa11.49□□□□□ -0.57
PRAME-210ENST00000442481 MARK2Q7KZI7 788 aaKnown RBP11.49□□□□□ -0.57
PRAME-210ENST00000442481 SLC13A5Q86YT5 568 aaPredicted RBP11.49□□□□□ -0.57
PRAME-210ENST00000442481 CREG2Q8IUH2 290 aa11.49□□□□□ -0.57
PRAME-210ENST00000442481 UNC5BQ8IZJ1 945 aa11.49□□□□□ -0.57
PRAME-210ENST00000442481 RASGEF1CQ8N431 466 aa11.49□□□□□ -0.57
PRAME-210ENST00000442481 TAB3Q8N5C8 712 aaPredicted RBP11.49□□□□□ -0.57
PRAME-210ENST00000442481 GALNT11Q8NCW6 608 aa11.49□□□□□ -0.57
PRAME-210ENST00000442481 ACTRT1Q8TDG2 376 aa11.49□□□□□ -0.57
PRAME-210ENST00000442481 BLOC1S5Q8TDH9 187 aa11.49□□□□□ -0.57
PRAME-210ENST00000442481 OXNAD1Q96HP4 312 aaPredicted RBP11.49□□□□□ -0.57
PRAME-210ENST00000442481 FCRL5Q96RD9 977 aa11.49□□□□□ -0.57
PRAME-210ENST00000442481 TRIB3Q96RU7 358 aa11.49□□□□□ -0.57
PRAME-210ENST00000442481 AGAP2Q99490 1192 aa11.49□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52.8 ms