RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439415.1

CBX1P4-201, Transcript of chromobox 1 pseudogene 4, humanhuman

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Gene CBX1P4, Length 457 nt, Biotype processed pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1P4-201ENST00000439415 CYP11B2P19099 503 aa4.61□□□□□ -1.67
CBX1P4-201ENST00000439415 NR4A1P22736 598 aa4.61□□□□□ -1.67
CBX1P4-201ENST00000439415 RPA1P27694 616 aa4.61□□□□□ -1.67
CBX1P4-201ENST00000439415 NMBRP28336 390 aa4.61□□□□□ -1.67
CBX1P4-201ENST00000439415 TACR3P29371 465 aa4.61□□□□□ -1.67
CBX1P4-201ENST00000439415 PEX19P40855 299 aa4.61□□□□□ -1.67
CBX1P4-201ENST00000439415 GRIA3P42263 894 aa4.61□□□□□ -1.67
CBX1P4-201ENST00000439415 PSMC4P43686 418 aa4.61□□□□□ -1.67
CBX1P4-201ENST00000439415 ASMTP46597 345 aa4.61□□□□□ -1.67
CBX1P4-201ENST00000439415 ASCL1P50553 236 aa4.61□□□□□ -1.67
CBX1P4-201ENST00000439415 UCP2P55851 309 aa4.61□□□□□ -1.67
CBX1P4-201ENST00000439415 HNRNPKP61978 463 aaKnown RBP eCLIP4.61□□□□□ -1.67
CBX1P4-201ENST00000439415 HOXA4Q00056 320 aaPredicted RBP4.61□□□□□ -1.67
CBX1P4-201ENST00000439415 CDK3Q00526 305 aa4.61□□□□□ -1.67
CBX1P4-201ENST00000439415 PMPCAQ10713 525 aa4.61□□□□□ -1.67
CBX1P4-201ENST00000439415 SLC39A14Q15043 492 aa4.61□□□□□ -1.67
CBX1P4-201ENST00000439415 IQCCQ4KMZ1 466 aa4.61□□□□□ -1.67
CBX1P4-201ENST00000439415 TIGD2Q4W5G0 525 aa4.61□□□□□ -1.67
CBX1P4-201ENST00000439415 HS1BP3Q53T59 392 aa4.61□□□□□ -1.67
CBX1P4-201ENST00000439415 AWAT1Q58HT5 328 aa4.61□□□□□ -1.67
CBX1P4-201ENST00000439415 ALG10Q5BKT4 473 aa4.61□□□□□ -1.67
CBX1P4-201ENST00000439415 ALG10BQ5I7T1 473 aa4.61□□□□□ -1.67
CBX1P4-201ENST00000439415 TEX35Q5T0J7 233 aa4.61□□□□□ -1.67
CBX1P4-201ENST00000439415 TXNRD3NBQ6F5E7 133 aa4.61□□□□□ -1.67
CBX1P4-201ENST00000439415 METTL2BQ6P1Q9 378 aaKnown RBP4.61□□□□□ -1.67
CBX1P4-201ENST00000439415 NOTUMQ6P988 496 aa4.61□□□□□ -1.67
CBX1P4-201ENST00000439415 RNF207Q6ZRF8 634 aa4.61□□□□□ -1.67
CBX1P4-201ENST00000439415 TPRG1Q6ZUI0 275 aa4.61□□□□□ -1.67
CBX1P4-201ENST00000439415 SLC29A4Q7RTT9 530 aa4.61□□□□□ -1.67
CBX1P4-201ENST00000439415 ARMC9Q7Z3E5 817 aa4.61□□□□□ -1.67
CBX1P4-201ENST00000439415 PEG10Q86TG7 708 aaKnown RBP4.61□□□□□ -1.67
CBX1P4-201ENST00000439415 CCDC83Q8IWF9 413 aa4.61□□□□□ -1.67
CBX1P4-201ENST00000439415 ELMOD2Q8IZ81 293 aa4.61□□□□□ -1.67
CBX1P4-201ENST00000439415 KDM8Q8N371 416 aa4.61□□□□□ -1.67
CBX1P4-201ENST00000439415 FBXW8Q8N3Y1 598 aa4.61□□□□□ -1.67
CBX1P4-201ENST00000439415 CMASQ8NFW8 434 aaPredicted RBP4.61□□□□□ -1.67
CBX1P4-201ENST00000439415 OR1J2Q8NGS2 313 aa4.61□□□□□ -1.67
CBX1P4-201ENST00000439415 B4GALNT2Q8NHY0 566 aa4.61□□□□□ -1.67
CBX1P4-201ENST00000439415 WDR20Q8TBZ3 569 aa4.61□□□□□ -1.67
CBX1P4-201ENST00000439415 Q8TCH9 128 aa4.61□□□□□ -1.67
CBX1P4-201ENST00000439415 LRRC8CQ8TDW0 803 aa4.61□□□□□ -1.67
CBX1P4-201ENST00000439415 RAD54LQ92698 747 aa4.61□□□□□ -1.67
CBX1P4-201ENST00000439415 TMEM186Q96B77 213 aa4.61□□□□□ -1.67
CBX1P4-201ENST00000439415 ALG14Q96F25 216 aa4.61□□□□□ -1.67
CBX1P4-201ENST00000439415 METTL2AQ96IZ6 378 aaKnown RBP4.61□□□□□ -1.67
CBX1P4-201ENST00000439415 FEVQ99581 238 aa4.61□□□□□ -1.67
CBX1P4-201ENST00000439415 OLFM1Q99784 485 aa4.61□□□□□ -1.67
CBX1P4-201ENST00000439415 MACROD1Q9BQ69 325 aa4.61□□□□□ -1.67
CBX1P4-201ENST00000439415 GTPBP2Q9BX10 602 aaKnown RBP4.61□□□□□ -1.67
CBX1P4-201ENST00000439415 RAD21L1Q9H4I0 556 aa4.61□□□□□ -1.67
CBX1P4-201ENST00000439415 SRD5A3Q9H8P0 318 aa4.61□□□□□ -1.67
CBX1P4-201ENST00000439415 RNPEPL1Q9HAU8 725 aa4.61□□□□□ -1.67
CBX1P4-201ENST00000439415 ACSS1Q9NUB1 689 aaPredicted RBP4.61□□□□□ -1.67
CBX1P4-201ENST00000439415 P4HTMQ9NXG6 502 aa4.61□□□□□ -1.67
CBX1P4-201ENST00000439415 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP4.61□□□□□ -1.67
CBX1P4-201ENST00000439415 CISD1Q9NZ45 108 aaKnown RBP4.61□□□□□ -1.67
CBX1P4-201ENST00000439415 ZNF624Q9P2J8 865 aaPredicted RBP4.61□□□□□ -1.67
CBX1P4-201ENST00000439415 STON1Q9Y6Q2 735 aa4.61□□□□□ -1.67
CBX1P4-201ENST00000439415 DUSP10Q9Y6W6 482 aa4.61□□□□□ -1.67
CBX1P4-201ENST00000439415 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP4.61□□□□□ -1.67
CBX1P4-201ENST00000439415 WDR97A6NE52 1622 aa4.61□□□□□ -1.67
CBX1P4-201ENST00000439415 KIF21BO75037 1637 aa4.61□□□□□ -1.67
CBX1P4-201ENST00000439415 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa4.6□□□□□ -1.67
CBX1P4-201ENST00000439415 A0A0A6YYC8 382 aaPredicted RBP4.6□□□□□ -1.67
CBX1P4-201ENST00000439415 CLRN2A0PK11 232 aa4.6□□□□□ -1.67
CBX1P4-201ENST00000439415 LINC00473A8K010 186 aa4.6□□□□□ -1.67
CBX1P4-201ENST00000439415 KPNA7A9QM74 516 aa4.6□□□□□ -1.67
CBX1P4-201ENST00000439415 I3L1I5 382 aaPredicted RBP4.6□□□□□ -1.67
CBX1P4-201ENST00000439415 M0QZ24 198 aa4.6□□□□□ -1.67
CBX1P4-201ENST00000439415 ZNF623O75123 536 aa4.6□□□□□ -1.67
CBX1P4-201ENST00000439415 SNX4O95219 450 aa4.6□□□□□ -1.67
CBX1P4-201ENST00000439415 TOP3BO95985 862 aaKnown RBP4.6□□□□□ -1.67
CBX1P4-201ENST00000439415 C1QTNF9P0C862 333 aa4.6□□□□□ -1.67
CBX1P4-201ENST00000439415 PLA2G4BP0C869 781 aa4.6□□□□□ -1.67
CBX1P4-201ENST00000439415 CD58P19256 250 aa4.6□□□□□ -1.67
CBX1P4-201ENST00000439415 AZGP1P25311 298 aaKnown RBP4.6□□□□□ -1.67
CBX1P4-201ENST00000439415 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP4.6□□□□□ -1.67
CBX1P4-201ENST00000439415 CNR2P34972 360 aa4.6□□□□□ -1.67
CBX1P4-201ENST00000439415 SERPINB6P35237 376 aa4.6□□□□□ -1.67
CBX1P4-201ENST00000439415 MAGEA4P43358 317 aa4.6□□□□□ -1.67
CBX1P4-201ENST00000439415 IFNAR2P48551 515 aa4.6□□□□□ -1.67
CBX1P4-201ENST00000439415 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP4.6□□□□□ -1.67
CBX1P4-201ENST00000439415 HSPA2P54652 639 aa4.6□□□□□ -1.67
CBX1P4-201ENST00000439415 PRKCEQ02156 737 aa4.6□□□□□ -1.67
CBX1P4-201ENST00000439415 TNK1Q13470 666 aa4.6□□□□□ -1.67
CBX1P4-201ENST00000439415 LPIN1Q14693 890 aa4.6□□□□□ -1.67
CBX1P4-201ENST00000439415 NR1D2Q14995 579 aa4.6□□□□□ -1.67
CBX1P4-201ENST00000439415 KCNA10Q16322 511 aa4.6□□□□□ -1.67
CBX1P4-201ENST00000439415 CEP55Q53EZ4 464 aa4.6□□□□□ -1.67
CBX1P4-201ENST00000439415 IFI44LQ53G44 452 aa4.6□□□□□ -1.67
CBX1P4-201ENST00000439415 LRRC73Q5JTD7 316 aa4.6□□□□□ -1.67
CBX1P4-201ENST00000439415 DDX59Q5T1V6 619 aaKnown RBP eCLIP4.6□□□□□ -1.67
CBX1P4-201ENST00000439415 TSTD2Q5T7W7 516 aa4.6□□□□□ -1.67
CBX1P4-201ENST00000439415 PRAMEF8Q5VWM4 474 aa4.6□□□□□ -1.67
CBX1P4-201ENST00000439415 GGNBP1Q5YKI7 109 aa4.6□□□□□ -1.67
CBX1P4-201ENST00000439415 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP4.6□□□□□ -1.67
CBX1P4-201ENST00000439415 BRAT1Q6PJG6 821 aa4.6□□□□□ -1.67
CBX1P4-201ENST00000439415 FIGLAQ6QHK4 219 aa4.6□□□□□ -1.67
CBX1P4-201ENST00000439415 ENPP7Q6UWV6 458 aa4.6□□□□□ -1.67
CBX1P4-201ENST00000439415 Q6ZNX1 250 aa4.6□□□□□ -1.67
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