RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000430766.1

PTPRD-AS1-201, PTPRD antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PTPRD-AS1, Length 1,959 nt, Biotype lincRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 C1orf159Q96HA4 380 aa8.22□□□□□ -1.09
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 GDAP1L1Q96MZ0 367 aa8.22□□□□□ -1.09
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SYTL2Q9HCH5 934 aa8.22□□□□□ -1.09
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 IFT80Q9P2H3 777 aaPredicted RBP8.22□□□□□ -1.09
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 TSPAN16Q9UKR8 245 aa8.22□□□□□ -1.09
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ROS1P08922 2347 aa8.22□□□□□ -1.09
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 RAI1Q7Z5J4 1906 aaPredicted RBP8.22□□□□□ -1.09
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 TUBAL3A6NHL2 446 aa8.22□□□□□ -1.09
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SNX2O60749 519 aa8.22□□□□□ -1.09
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 TRUB2O95900 331 aaKnown RBP8.22□□□□□ -1.09
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ITGA2P17301 1181 aa8.22□□□□□ -1.09
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CCNFP41002 786 aa8.22□□□□□ -1.09
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SLC19A1P41440 591 aa8.22□□□□□ -1.09
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CASP4P49662 377 aa8.22□□□□□ -1.09
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ARSEP51690 589 aa8.22□□□□□ -1.09
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 MTA1Q13330 715 aa8.22□□□□□ -1.09
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 DOC2BQ14184 412 aa8.22□□□□□ -1.09
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 TDRD12Q587J7 1177 aaKnown RBP8.22□□□□□ -1.09
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SYPL2Q5VXT5 272 aa8.22□□□□□ -1.09
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 KBTBD2Q8IY47 623 aa8.22□□□□□ -1.09
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 OR11G2Q8NGC1 345 aa8.22□□□□□ -1.09
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ZFAND2BQ8WV99 257 aa8.22□□□□□ -1.09
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 RNASE6Q93091 150 aaKnown RBP8.22□□□□□ -1.09
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 NUS1Q96E22 293 aa8.22□□□□□ -1.09
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SH3GL2Q99962 352 aa8.22□□□□□ -1.09
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 KCTD5Q9NXV2 234 aa8.22□□□□□ -1.09
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 GNPTGQ9UJJ9 305 aa8.22□□□□□ -1.09
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 A0A0G2JNJ9 132 aa8.21□□□□□ -1.09
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 TMEM89A2RUT3 159 aa8.21□□□□□ -1.09
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 RASGRF2O14827 1237 aa8.21□□□□□ -1.09
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 VEGFDO43915 354 aa8.21□□□□□ -1.09
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 HPP00738 406 aa8.21□□□□□ -1.09
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SETSIPP0DME0 302 aa8.21□□□□□ -1.09
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 GGCXP38435 758 aa8.21□□□□□ -1.09
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 GEMIN4P57678 1058 aaKnown RBP8.21□□□□□ -1.09
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ACKR1Q16570 336 aa8.21□□□□□ -1.09
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 MARK2Q7KZI7 788 aaKnown RBP8.21□□□□□ -1.09
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 FAM20CQ8IXL6 584 aa8.21□□□□□ -1.09
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CARFQ8N187 725 aa8.21□□□□□ -1.09
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 OR10Q1Q8NGQ4 319 aa8.21□□□□□ -1.09
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 COQ10AQ96MF6 247 aa8.21□□□□□ -1.09
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 FGFBP2Q9BYJ0 223 aa8.21□□□□□ -1.09
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 MRM3Q9HC36 420 aaKnown RBP8.21□□□□□ -1.09
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ZNF624Q9P2J8 865 aaPredicted RBP8.21□□□□□ -1.09
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 Q9UFV3 132 aa8.21□□□□□ -1.09
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CDYLQ9Y232 598 aa8.21□□□□□ -1.09
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 KCNK6Q9Y257 313 aa8.21□□□□□ -1.09
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 TMEM98Q9Y2Y6 226 aa8.21□□□□□ -1.09
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ALG6Q9Y672 507 aa8.21□□□□□ -1.09
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 YLPM1P49750 1951 aaKnown RBP8.21□□□□□ -1.1
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 UBA6A0AVT1 1052 aaPredicted RBP8.21□□□□□ -1.1
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ZNF749O43361 778 aa8.21□□□□□ -1.1
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 FBXO21O94952 628 aa8.21□□□□□ -1.1
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 MSL3P1P0C860 447 aa8.21□□□□□ -1.1
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ARAFP10398 606 aa8.21□□□□□ -1.1
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CCR1P32246 355 aa8.21□□□□□ -1.1
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 PTGER1P34995 402 aa8.21□□□□□ -1.1
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ETFBP38117 255 aa8.21□□□□□ -1.1
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 RAD23BP54727 409 aa8.21□□□□□ -1.1
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 DCDP81605 110 aaKnown RBP8.21□□□□□ -1.1
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 VEZF1Q14119 521 aa8.21□□□□□ -1.1
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SQLEQ14534 574 aa8.21□□□□□ -1.1
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 OCLNQ16625 522 aa8.21□□□□□ -1.1
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 FBXL19-AS1Q494R0 122 aa8.21□□□□□ -1.1
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP8.21□□□□□ -1.1
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 BRAT1Q6PJG6 821 aa8.21□□□□□ -1.1
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 WDR53Q7Z5U6 358 aaPredicted RBP8.21□□□□□ -1.1
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 TRIM48Q8IWZ4 208 aa8.21□□□□□ -1.1
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 RBM12BQ8IXT5 1001 aaKnown RBP8.21□□□□□ -1.1
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 LRRC46Q96FV0 321 aa8.21□□□□□ -1.1
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 AP1M1Q9BXS5 423 aa8.21□□□□□ -1.1
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 RMI1Q9H9A7 625 aa8.21□□□□□ -1.1
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 POT1Q9NUX5 634 aa8.21□□□□□ -1.1
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SCHIP1Q9P0W5 487 aaPredicted RBP8.21□□□□□ -1.1
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 HESX1Q9UBX0 185 aa8.21□□□□□ -1.1
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 FOXD3Q9UJU5 478 aaPredicted RBP8.21□□□□□ -1.1
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CADP27708 2225 aa8.2□□□□□ -1.1
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 DNAH1Q9P2D7 4330 aa8.2□□□□□ -1.1
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 A0A1B0GTH9 108 aa8.2□□□□□ -1.1
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP8.2□□□□□ -1.1
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 TMEM150CB9EJG8 249 aa8.2□□□□□ -1.1
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 IGSF6O95976 241 aa8.2□□□□□ -1.1
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 OR1E1P30953 314 aa8.2□□□□□ -1.1
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 UBA7P41226 1012 aa8.2□□□□□ -1.1
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 GPR18Q14330 331 aa8.2□□□□□ -1.1
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CLEC12BQ2HXU8 276 aa8.2□□□□□ -1.1
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 EMC4Q5J8M3 183 aa8.2□□□□□ -1.1
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 DPPA4Q7L190 304 aa8.2□□□□□ -1.1
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CHST15Q7LFX5 561 aaPredicted RBP8.2□□□□□ -1.1
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 STRADAQ7RTN6 431 aa8.2□□□□□ -1.1
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ZSWIM9Q86XI8 627 aa8.2□□□□□ -1.1
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ARHGAP12Q8IWW6 846 aa8.2□□□□□ -1.1
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP8.2□□□□□ -1.1
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ZNF683Q8IZ20 524 aa8.2□□□□□ -1.1
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SIRT6Q8N6T7 355 aa8.2□□□□□ -1.1
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 PROKR1Q8TCW9 393 aa8.2□□□□□ -1.1
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SNX21Q969T3 373 aa8.2□□□□□ -1.1
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 TNMDQ9H2S6 317 aa8.2□□□□□ -1.1
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP8.2□□□□□ -1.1
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SUV39H2Q9H5I1 410 aa8.2□□□□□ -1.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.7 ms