RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429017.2

HOXD8-202, Transcript of homeobox D8, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HOXD8, Length 1,608 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8-202ENST00000429017 HSPA9P38646 679 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
HOXD8-202ENST00000429017 MMP13P45452 471 aa6.47□□□□□ -1.37
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HOXD8-202ENST00000429017 DSC2Q02487 901 aa6.47□□□□□ -1.37
HOXD8-202ENST00000429017 NIPAL4Q0D2K0 466 aa6.47□□□□□ -1.37
HOXD8-202ENST00000429017 ABHD18Q0P651 414 aa6.47□□□□□ -1.37
HOXD8-202ENST00000429017 MARC1Q5VT66 337 aa6.47□□□□□ -1.37
HOXD8-202ENST00000429017 TMCO3Q6UWJ1 677 aa6.47□□□□□ -1.37
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HOXD8-202ENST00000429017 STARD8Q92502 1023 aa6.47□□□□□ -1.37
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HOXD8-202ENST00000429017 AHCYL2Q96HN2 611 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
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HOXD8-202ENST00000429017 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP6.47□□□□□ -1.37
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HOXD8-202ENST00000429017 CHKBQ9Y259 395 aa6.47□□□□□ -1.37
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HOXD8-202ENST00000429017 MFSD11O43934 449 aa6.46□□□□□ -1.38
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HOXD8-202ENST00000429017 DESP17661 470 aa6.46□□□□□ -1.38
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HOXD8-202ENST00000429017 PCK1P35558 622 aa6.46□□□□□ -1.38
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HOXD8-202ENST00000429017 ZNF135P52742 658 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
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HOXD8-202ENST00000429017 RNF224P0DH78 156 aa6.45□□□□□ -1.38
HOXD8-202ENST00000429017 GZMAP12544 262 aa6.45□□□□□ -1.38
HOXD8-202ENST00000429017 F3P13726 295 aa6.45□□□□□ -1.38
HOXD8-202ENST00000429017 ZNF30P17039 623 aa6.45□□□□□ -1.38
HOXD8-202ENST00000429017 ZNF8P17098 575 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
HOXD8-202ENST00000429017 TYRP1P17643 537 aa6.45□□□□□ -1.38
HOXD8-202ENST00000429017 CES1P23141 567 aa6.45□□□□□ -1.38
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HOXD8-202ENST00000429017 ITKQ08881 620 aa6.45□□□□□ -1.38
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HOXD8-202ENST00000429017 KLRB1Q12918 225 aa6.45□□□□□ -1.38
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HOXD8-202ENST00000429017 ATP13A4Q4VNC1 1196 aa6.45□□□□□ -1.38
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HOXD8-202ENST00000429017 LPCAT1Q8NF37 534 aa6.45□□□□□ -1.38
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HOXD8-202ENST00000429017 KIAA1143Q96AT1 154 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
HOXD8-202ENST00000429017 MISP3Q96FF7 219 aa6.45□□□□□ -1.38
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