RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428482.5

HDLBP-216, Transcript of high density lipoprotein binding protein, humanhuman

TSL 5

Gene HDLBP, Length 1,096 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDLBP-216ENST00000428482 NOA1Q8NC60 698 aaKnown RBP10.06□□□□□ -0.8
HDLBP-216ENST00000428482 MAGOHBQ96A72 148 aaKnown RBP10.06□□□□□ -0.8
HDLBP-216ENST00000428482 LIN37Q96GY3 246 aaPredicted RBP10.06□□□□□ -0.8
HDLBP-216ENST00000428482 TIMM29Q9BSF4 260 aa10.06□□□□□ -0.8
HDLBP-216ENST00000428482 LRRC40Q9H9A6 602 aa10.06□□□□□ -0.8
HDLBP-216ENST00000428482 POLR1BQ9H9Y6 1135 aa10.06□□□□□ -0.8
HDLBP-216ENST00000428482 ZNF624Q9P2J8 865 aaPredicted RBP10.06□□□□□ -0.8
HDLBP-216ENST00000428482 KLHL3Q9UH77 587 aa10.06□□□□□ -0.8
HDLBP-216ENST00000428482 PSMD13Q9UNM6 376 aa10.06□□□□□ -0.8
HDLBP-216ENST00000428482 LHX6Q9UPM6 363 aa10.06□□□□□ -0.8
HDLBP-216ENST00000428482 PKP3Q9Y446 797 aa10.06□□□□□ -0.8
HDLBP-216ENST00000428482 PRSS21Q9Y6M0 314 aa10.06□□□□□ -0.8
HDLBP-216ENST00000428482 SLC30A1Q9Y6M5 507 aa10.06□□□□□ -0.8
HDLBP-216ENST00000428482 AHCTF1Q8WYP5 2266 aa10.06□□□□□ -0.8
HDLBP-216ENST00000428482 FER1L5A0AVI2 2057 aa10.06□□□□□ -0.8
HDLBP-216ENST00000428482 CCDC187A0A096LP49 1063 aa10.05□□□□□ -0.8
HDLBP-216ENST00000428482 CDRT15L2A8MXV6 281 aa10.05□□□□□ -0.8
HDLBP-216ENST00000428482 C9orf172C9J069 976 aa10.05□□□□□ -0.8
HDLBP-216ENST00000428482 DYNC1I1O14576 645 aa10.05□□□□□ -0.8
HDLBP-216ENST00000428482 PLD2O14939 933 aa10.05□□□□□ -0.8
HDLBP-216ENST00000428482 PRAMEF10O60809 474 aa10.05□□□□□ -0.8
HDLBP-216ENST00000428482 TMEM63AO94886 807 aa10.05□□□□□ -0.8
HDLBP-216ENST00000428482 CDK14O94921 469 aa10.05□□□□□ -0.8
HDLBP-216ENST00000428482 TNFSF15O95150 251 aa10.05□□□□□ -0.8
HDLBP-216ENST00000428482 EPOP01588 193 aa10.05□□□□□ -0.8
HDLBP-216ENST00000428482 CDK4P11802 303 aa10.05□□□□□ -0.8
HDLBP-216ENST00000428482 LPOP22079 712 aaPredicted RBP10.05□□□□□ -0.8
HDLBP-216ENST00000428482 TNFRSF8P28908 595 aa10.05□□□□□ -0.8
HDLBP-216ENST00000428482 CCKBRP32239 447 aa10.05□□□□□ -0.8
HDLBP-216ENST00000428482 FOXN2P32314 431 aa10.05□□□□□ -0.8
HDLBP-216ENST00000428482 RPL22P35268 128 aaKnown RBP10.05□□□□□ -0.8
HDLBP-216ENST00000428482 PTGIRP43119 386 aa10.05□□□□□ -0.8
HDLBP-216ENST00000428482 FASLGP48023 281 aa10.05□□□□□ -0.8
HDLBP-216ENST00000428482 ZFP36L1Q07352 338 aaKnown RBP10.05□□□□□ -0.8
HDLBP-216ENST00000428482 TMEM115Q12893 351 aaPredicted RBP10.05□□□□□ -0.8
HDLBP-216ENST00000428482 CBLBQ13191 982 aa10.05□□□□□ -0.8
HDLBP-216ENST00000428482 SEMA5AQ13591 1074 aa10.05□□□□□ -0.8
HDLBP-216ENST00000428482 PRPSAP1Q14558 356 aa10.05□□□□□ -0.8
HDLBP-216ENST00000428482 SEMA3AQ14563 771 aa10.05□□□□□ -0.8
HDLBP-216ENST00000428482 TGIF1Q15583 401 aa10.05□□□□□ -0.8
HDLBP-216ENST00000428482 DBN1Q16643 649 aa10.05□□□□□ -0.8
HDLBP-216ENST00000428482 ERCC6LQ2NKX8 1250 aa10.05□□□□□ -0.8
HDLBP-216ENST00000428482 P3H1Q32P28 736 aa10.05□□□□□ -0.8
HDLBP-216ENST00000428482 SNAP47Q5SQN1 464 aa10.05□□□□□ -0.8
HDLBP-216ENST00000428482 FNBP1LQ5T0N5 605 aa10.05□□□□□ -0.8
HDLBP-216ENST00000428482 ANKRD22Q5VYY1 191 aa10.05□□□□□ -0.8
HDLBP-216ENST00000428482 CCDC137Q6PK04 289 aaKnown RBP10.05□□□□□ -0.8
HDLBP-216ENST00000428482 NAPRTQ6XQN6 538 aa10.05□□□□□ -0.8
HDLBP-216ENST00000428482 RAVER1Q8IY67 606 aaKnown RBP10.05□□□□□ -0.8
HDLBP-216ENST00000428482 SPDYE1Q8NFV5 336 aaPredicted RBP10.05□□□□□ -0.8
HDLBP-216ENST00000428482 OR13J1Q8NGT2 312 aa10.05□□□□□ -0.8
HDLBP-216ENST00000428482 GRK7Q8WTQ7 553 aa10.05□□□□□ -0.8
HDLBP-216ENST00000428482 BBC3Q96PG8 261 aaPredicted RBP10.05□□□□□ -0.8
HDLBP-216ENST00000428482 LRRC1Q9BTT6 524 aa10.05□□□□□ -0.8
HDLBP-216ENST00000428482 AP1M1Q9BXS5 423 aa10.05□□□□□ -0.8
HDLBP-216ENST00000428482 FAM129AQ9BZQ8 928 aa10.05□□□□□ -0.8
HDLBP-216ENST00000428482 TRABDQ9H4I3 376 aa10.05□□□□□ -0.8
HDLBP-216ENST00000428482 ASB8Q9H765 288 aa10.05□□□□□ -0.8
HDLBP-216ENST00000428482 CPNE5Q9HCH3 593 aa10.05□□□□□ -0.8
HDLBP-216ENST00000428482 TRIM39Q9HCM9 518 aa10.05□□□□□ -0.8
HDLBP-216ENST00000428482 RAB6BQ9NRW1 208 aa10.05□□□□□ -0.8
HDLBP-216ENST00000428482 KCNK4Q9NYG8 393 aa10.05□□□□□ -0.8
HDLBP-216ENST00000428482 HACD3Q9P035 362 aa10.05□□□□□ -0.8
HDLBP-216ENST00000428482 CRLS1Q9UJA2 301 aa10.05□□□□□ -0.8
HDLBP-216ENST00000428482 NEU2Q9Y3R4 380 aa10.05□□□□□ -0.8
HDLBP-216ENST00000428482 A0A087WV48 116 aa10.04□□□□□ -0.8
HDLBP-216ENST00000428482 DXOO77932 396 aaKnown RBP10.04□□□□□ -0.8
HDLBP-216ENST00000428482 TYRP1P17643 537 aa10.04□□□□□ -0.8
HDLBP-216ENST00000428482 WT1P19544 449 aaPredicted RBP10.04□□□□□ -0.8
HDLBP-216ENST00000428482 SLC19A1P41440 591 aa10.04□□□□□ -0.8
HDLBP-216ENST00000428482 TNNT3P45378 269 aaPredicted RBP10.04□□□□□ -0.8
HDLBP-216ENST00000428482 ABCG1P45844 678 aa10.04□□□□□ -0.8
HDLBP-216ENST00000428482 PREPP48147 710 aa10.04□□□□□ -0.8
HDLBP-216ENST00000428482 LEPRP48357 1165 aaKnown RBP10.04□□□□□ -0.8
HDLBP-216ENST00000428482 ARCN1P48444 511 aaKnown RBP10.04□□□□□ -0.8
HDLBP-216ENST00000428482 LSSP48449 732 aa10.04□□□□□ -0.8
HDLBP-216ENST00000428482 PPM1FP49593 454 aaPredicted RBP10.04□□□□□ -0.8
HDLBP-216ENST00000428482 MAPK10P53779 464 aa10.04□□□□□ -0.8
HDLBP-216ENST00000428482 PCBP4P57723 403 aaKnown RBP10.04□□□□□ -0.8
HDLBP-216ENST00000428482 BASP1P80723 227 aaKnown RBP10.04□□□□□ -0.8
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HDLBP-216ENST00000428482 GTF2H3Q13889 308 aa10.04□□□□□ -0.8
HDLBP-216ENST00000428482 GPR18Q14330 331 aa10.04□□□□□ -0.8
HDLBP-216ENST00000428482 PARP6Q2NL67 630 aa10.04□□□□□ -0.8
HDLBP-216ENST00000428482 ZNF658BQ4V348 819 aaPredicted RBP10.04□□□□□ -0.8
HDLBP-216ENST00000428482 IYDQ6PHW0 289 aa10.04□□□□□ -0.8
HDLBP-216ENST00000428482 TMEM220Q6QAJ8 160 aa10.04□□□□□ -0.8
HDLBP-216ENST00000428482 C4orf22Q6V702 233 aa10.04□□□□□ -0.8
HDLBP-216ENST00000428482 RAB11FIP2Q7L804 512 aa10.04□□□□□ -0.8
HDLBP-216ENST00000428482 VASH2Q86V25 355 aa10.04□□□□□ -0.8
HDLBP-216ENST00000428482 JAMLQ86YT9 394 aa10.04□□□□□ -0.8
HDLBP-216ENST00000428482 CACTIN-AS1Q8N1I8 211 aa10.04□□□□□ -0.8
HDLBP-216ENST00000428482 NXPE1Q8N323 547 aa10.04□□□□□ -0.8
HDLBP-216ENST00000428482 LRRN4CLQ8ND94 238 aa10.04□□□□□ -0.8
HDLBP-216ENST00000428482 SGF29Q96ES7 293 aa10.04□□□□□ -0.8
HDLBP-216ENST00000428482 KRT12Q99456 494 aa10.04□□□□□ -0.8
HDLBP-216ENST00000428482 SLC38A3Q99624 504 aa10.04□□□□□ -0.8
HDLBP-216ENST00000428482 ANKZF1Q9H8Y5 726 aa10.04□□□□□ -0.8
HDLBP-216ENST00000428482 RMI1Q9H9A7 625 aa10.04□□□□□ -0.8
HDLBP-216ENST00000428482 APMAPQ9HDC9 416 aa10.04□□□□□ -0.8
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