RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000419445.5

PGGT1B-203, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PGGT1B, Length 9,545 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-203ENST00000419445 TSNQ15631 228 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF658BQ4V348 819 aaPredicted RBP3.58□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 CCNYL2Q5T2Q4 361 aa3.58□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 ANKRD13BQ86YJ7 626 aa3.58□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 DNAJB3Q8WWF6 145 aa3.58□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 TBRG4Q969Z0 631 aaKnown RBP eCLIP3.58□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP3.58□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 MUC13Q9H3R2 512 aa3.58□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 C8orf4Q9NR00 106 aa3.58□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 STOML2Q9UJZ1 356 aa3.58□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 KCNE1BA0A087WTH5 132 aa3.58□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 RRN3P2A6NIE6 340 aa3.58□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 OR7A17O14581 309 aa3.58□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 DPM1O60762 260 aa3.58□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 RETP07949 1114 aa3.58□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 BMP4P12644 408 aa3.58□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 NCK1P16333 377 aa3.58□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 WNT3P56703 355 aa3.58□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 ERVK-8P63133 956 aa3.58□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 EMX1Q04741 257 aaPredicted RBP3.58□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 SUSD1Q6UWL2 747 aa3.58□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 R3HCC1LQ7Z5L2 792 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 CLVS1Q8IUQ0 354 aaPredicted RBP3.58□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 IPMKQ8NFU5 416 aa3.58□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 SMARCD1Q96GM5 515 aa3.58□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 FAM105AQ9NUU6 356 aa3.58□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 ACTL7AQ9Y615 435 aa3.58□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 DSCR3O14972 297 aa3.58□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 CLOCKO15516 846 aa3.58□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 ZBTB11O95625 1053 aaPredicted RBP3.58□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 TYMPP19971 482 aa3.58□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 LIMS1P48059 325 aa3.58□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 CLCQ05315 142 aa3.58□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 IFRD2Q12894 506 aaPredicted RBP3.58□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 DAG1Q14118 895 aa3.58□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 MAP7Q14244 749 aa3.58□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 IRF3Q14653 427 aa3.58□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 PTPRRQ15256 657 aa3.58□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 SV2CQ496J9 727 aa3.58□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 FLYWCH1Q4VC44 716 aa3.58□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 MLIPQ5VWP3 458 aa3.58□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 FAHD1Q6P587 224 aa3.58□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 TXNDC11Q6PKC3 985 aa3.58□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 TRIM46Q7Z4K8 759 aa3.58□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 SNX20Q7Z614 316 aa3.58□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF554Q86TJ5 538 aa3.58□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 PYCR2Q96C36 320 aa3.58□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 PHF21BQ96EK2 531 aa3.58□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 C8orf48Q96LL4 319 aa3.58□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 CPPED1Q9BRF8 314 aaPredicted RBP3.58□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 DCUN1D5Q9BTE7 237 aa3.58□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 Q9Y3F1 56 aa3.58□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 ARL5CA6NH57 179 aa3.58□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 DFNA5O60443 496 aa3.58□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 ABCB7O75027 752 aa3.58□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 ACVRL1P37023 503 aa3.58□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 PBX3P40426 434 aa3.58□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 MAXP61244 160 aa3.58□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 ZXDBP98169 803 aa3.58□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 NME3Q13232 169 aa3.58□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 PLCL1Q15111 1095 aa3.58□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 CYTH1Q15438 398 aa3.58□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 LARP7Q4G0J3 582 aaKnown RBP eCLIP3.58□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 PDCD4Q53EL6 469 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 RUNDC3AQ59EK9 446 aa3.58□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 DCP2Q8IU60 420 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 HID1Q8IV36 788 aa3.58□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 LAS2Q8IYD9 372 aa3.58□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 PPP1R14CQ8TAE6 165 aa3.58□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 REXO5Q96IC2 774 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 ALPK1Q96QP1 1244 aa3.58□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 GMIPQ9P107 970 aa3.58□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 DLGAP4Q9Y2H0 992 aa3.58□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 DYTNA2CJ06 578 aa3.58□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 PRMT5O14744 637 aaPredicted RBP3.58□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 SYNCRIPO60506 623 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 HUS1O60921 280 aa3.58□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 PTPN2P17706 415 aa3.58□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 EFNA1P20827 205 aaPredicted RBP3.58□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 ELK4P28324 431 aa3.58□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 CCR1P32246 355 aa3.58□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 OPRD1P41143 372 aa3.58□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 SERPINH1P50454 418 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 NUP107P57740 925 aa3.58□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 GABARAPL2P60520 117 aa3.58□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 SLC2A7Q6PXP3 512 aa3.58□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 PRSS48Q7RTY5 328 aa3.58□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 CHCHD4Q8N4Q1 142 aa3.58□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 OR6Q1Q8NGQ2 317 aa3.58□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 ZFP90Q8TF47 636 aa3.58□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 RPL3LQ92901 407 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 TMBIM1Q969X1 311 aa3.58□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 PABPC5Q96DU9 382 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 CCDC126Q96EE4 140 aa3.58□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 SUSD3Q96L08 255 aa3.58□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 UXTQ9UBK9 157 aaPredicted RBP3.58□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF232Q9UNY5 417 aa3.58□□□□□ -1.84
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