RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409985.5

PMS1-205, Transcript of PMS1 homolog 1, mismatch repair system component, humanhuman

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Gene PMS1, Length 1,882 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS1-205ENST00000409985 E5RI56 91 aa23.49■■□□□ 1.35
PMS1-205ENST00000409985 H3BNH8 94 aa23.49■■□□□ 1.35
PMS1-205ENST00000409985 NIPSNAP2O75323 286 aa23.49■■□□□ 1.35
PMS1-205ENST00000409985 HTR1EP28566 365 aa23.49■■□□□ 1.35
PMS1-205ENST00000409985 HMGCLP35914 325 aa23.49■■□□□ 1.35
PMS1-205ENST00000409985 CDKN1CP49918 316 aaPredicted RBP23.49■■□□□ 1.35
PMS1-205ENST00000409985 CLCN7P51798 805 aa23.49■■□□□ 1.35
PMS1-205ENST00000409985 POLR2JP52435 117 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
PMS1-205ENST00000409985 GK3PQ14409 553 aa23.49■■□□□ 1.35
PMS1-205ENST00000409985 TGFBIQ15582 683 aa23.49■■□□□ 1.35
PMS1-205ENST00000409985 RBBP7Q16576 425 aa23.49■■□□□ 1.35
PMS1-205ENST00000409985 SMU1Q2TAY7 513 aa23.49■■□□□ 1.35
PMS1-205ENST00000409985 METTL2BQ6P1Q9 378 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
PMS1-205ENST00000409985 RBM44Q6ZP01 1051 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
PMS1-205ENST00000409985 PROSER1Q86XN7 944 aa23.49■■□□□ 1.35
PMS1-205ENST00000409985 ADGRG5Q8IZF4 528 aa23.49■■□□□ 1.35
PMS1-205ENST00000409985 CARNMT1Q8N4J0 409 aa23.49■■□□□ 1.35
PMS1-205ENST00000409985 TSPAN14Q8NG11 270 aa23.49■■□□□ 1.35
PMS1-205ENST00000409985 GRIN3AQ8TCU5 1115 aa23.49■■□□□ 1.35
PMS1-205ENST00000409985 TMEM79Q9BSE2 394 aa23.49■■□□□ 1.35
PMS1-205ENST00000409985 TUBA8Q9NY65 449 aaPredicted RBP23.49■■□□□ 1.35
PMS1-205ENST00000409985 TIMM22Q9Y584 194 aa23.49■■□□□ 1.35
PMS1-205ENST00000409985 ARNTLO00327 626 aa23.48■■□□□ 1.35
PMS1-205ENST00000409985 PRMT5O14744 637 aaPredicted RBP23.48■■□□□ 1.35
PMS1-205ENST00000409985 ARPC2O15144 300 aa23.48■■□□□ 1.35
PMS1-205ENST00000409985 ARHGEF15O94989 841 aa23.48■■□□□ 1.35
PMS1-205ENST00000409985 ENO2P09104 434 aaPredicted RBP23.48■■□□□ 1.35
PMS1-205ENST00000409985 CHRM3P20309 590 aa23.48■■□□□ 1.35
PMS1-205ENST00000409985 SGSHP51688 502 aa23.48■■□□□ 1.35
PMS1-205ENST00000409985 NME5P56597 212 aa23.48■■□□□ 1.35
PMS1-205ENST00000409985 AP1S1P61966 158 aa23.48■■□□□ 1.35
PMS1-205ENST00000409985 C6orf136Q5SQH8 315 aa23.48■■□□□ 1.35
PMS1-205ENST00000409985 DTNBP1Q96EV8 351 aa23.48■■□□□ 1.35
PMS1-205ENST00000409985 ALG2Q9H553 416 aa23.48■■□□□ 1.35
PMS1-205ENST00000409985 SLC8A2Q9UPR5 921 aa23.48■■□□□ 1.35
PMS1-205ENST00000409985 ADAM12O43184 909 aa23.47■■□□□ 1.35
PMS1-205ENST00000409985 ABLIM3O94929 683 aa23.47■■□□□ 1.35
PMS1-205ENST00000409985 MYOGP15173 224 aa23.47■■□□□ 1.35
PMS1-205ENST00000409985 OR1D2P34982 312 aa23.47■■□□□ 1.35
PMS1-205ENST00000409985 GSK3BP49841 420 aa23.47■■□□□ 1.35
PMS1-205ENST00000409985 AGTR2P50052 363 aa23.47■■□□□ 1.35
PMS1-205ENST00000409985 PRKG2Q13237 762 aa23.47■■□□□ 1.35
PMS1-205ENST00000409985 PITRM1Q5JRX3 1037 aa23.47■■□□□ 1.35
PMS1-205ENST00000409985 SPRED1Q7Z699 444 aa23.47■■□□□ 1.35
PMS1-205ENST00000409985 TMEM173Q86WV6 379 aaPredicted RBP23.47■■□□□ 1.35
PMS1-205ENST00000409985 SPPL2CQ8IUH8 684 aa23.47■■□□□ 1.35
PMS1-205ENST00000409985 TBC1D21Q8IYX1 336 aa23.47■■□□□ 1.35
PMS1-205ENST00000409985 BCL7CQ8WUZ0 217 aaPredicted RBP23.47■■□□□ 1.35
PMS1-205ENST00000409985 PRO3102Q9H379 93 aa23.47■■□□□ 1.35
PMS1-205ENST00000409985 IL1RL2Q9HB29 575 aa23.47■■□□□ 1.35
PMS1-205ENST00000409985 DNMT3BQ9UBC3 853 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
PMS1-205ENST00000409985 SLC30A1Q9Y6M5 507 aa23.47■■□□□ 1.35
PMS1-205ENST00000409985 ASPDHA6ND91 283 aa23.47■■□□□ 1.35
PMS1-205ENST00000409985 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa23.47■■□□□ 1.35
PMS1-205ENST00000409985 OR1I1O60431 355 aa23.47■■□□□ 1.35
PMS1-205ENST00000409985 OR6B1O95007 311 aa23.47■■□□□ 1.35
PMS1-205ENST00000409985 C1RP00736 705 aa23.47■■□□□ 1.35
PMS1-205ENST00000409985 MSH3P20585 1137 aa23.47■■□□□ 1.35
PMS1-205ENST00000409985 ALDH3B2P48448 385 aa23.47■■□□□ 1.35
PMS1-205ENST00000409985 EMX2Q04743 252 aa23.47■■□□□ 1.35
PMS1-205ENST00000409985 EML3Q32P44 896 aa23.47■■□□□ 1.35
PMS1-205ENST00000409985 KCTD21Q4G0X4 260 aa23.47■■□□□ 1.35
PMS1-205ENST00000409985 ATP6AP1LQ52LC2 224 aa23.47■■□□□ 1.35
PMS1-205ENST00000409985 TMTC4Q5T4D3 741 aa23.47■■□□□ 1.35
PMS1-205ENST00000409985 LYPLAL1Q5VWZ2 237 aa23.47■■□□□ 1.35
PMS1-205ENST00000409985 KRT80Q6KB66 452 aa23.47■■□□□ 1.35
PMS1-205ENST00000409985 SPRED2Q7Z698 418 aa23.47■■□□□ 1.35
PMS1-205ENST00000409985 ZFAND4Q86XD8 727 aa23.47■■□□□ 1.35
PMS1-205ENST00000409985 ZNF461Q8TAF7 563 aa23.47■■□□□ 1.35
PMS1-205ENST00000409985 CD320Q9NPF0 282 aa23.47■■□□□ 1.35
PMS1-205ENST00000409985 OLAHQ9NV23 265 aa23.47■■□□□ 1.35
PMS1-205ENST00000409985 KIAA1671Q9BY89 1806 aa23.46■■□□□ 1.35
PMS1-205ENST00000409985 SZT2Q5T011 3432 aa23.46■■□□□ 1.35
PMS1-205ENST00000409985 TRIM64CA6NLI5 447 aa23.46■■□□□ 1.35
PMS1-205ENST00000409985 PRDX3P30048 256 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
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PMS1-205ENST00000409985 ECT2LQ008S8 904 aa23.46■■□□□ 1.35
PMS1-205ENST00000409985 ATP6AP1Q15904 470 aa23.46■■□□□ 1.35
PMS1-205ENST00000409985 CRY1Q16526 586 aa23.46■■□□□ 1.35
PMS1-205ENST00000409985 MYLK3Q32MK0 819 aa23.46■■□□□ 1.35
PMS1-205ENST00000409985 CPNE9Q8IYJ1 553 aa23.46■■□□□ 1.35
PMS1-205ENST00000409985 PDPRQ8NCN5 879 aa23.46■■□□□ 1.35
PMS1-205ENST00000409985 ZFP28Q8NHY6 868 aa23.46■■□□□ 1.35
PMS1-205ENST00000409985 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa23.46■■□□□ 1.35
PMS1-205ENST00000409985 GKN1Q9NS71 199 aa23.46■■□□□ 1.35
PMS1-205ENST00000409985 OR51B4Q9Y5P0 310 aa23.46■■□□□ 1.35
PMS1-205ENST00000409985 TCRBV5S2A0A599 114 aa23.45■■□□□ 1.35
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PMS1-205ENST00000409985 HID1Q8IV36 788 aa23.45■■□□□ 1.35
PMS1-205ENST00000409985 EFHBQ8N7U6 833 aa23.45■■□□□ 1.35
PMS1-205ENST00000409985 HJURPQ8NCD3 748 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.35
PMS1-205ENST00000409985 OR2T11Q8NH01 316 aa23.45■■□□□ 1.35
PMS1-205ENST00000409985 RMND5BQ96G75 393 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.35
PMS1-205ENST00000409985 YME1L1Q96TA2 773 aa23.45■■□□□ 1.35
PMS1-205ENST00000409985 KCTD14Q9BQ13 255 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.35
PMS1-205ENST00000409985 GRIP2Q9C0E4 1043 aa23.45■■□□□ 1.35
PMS1-205ENST00000409985 CLK4Q9HAZ1 481 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.35
PMS1-205ENST00000409985 GFRA2O00451 464 aa23.45■■□□□ 1.34
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