RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409911.5

LRRTM4-205, Transcript of leucine rich repeat transmembrane neuronal 4, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 5 BASIC

Gene LRRTM4, Length 2,976 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM4-205ENST00000409911 SPPL3Q8TCT6 385 aa6.7□□□□□ -1.34
LRRTM4-205ENST00000409911 SYN2Q92777 582 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
LRRTM4-205ENST00000409911 USP13Q92995 863 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
LRRTM4-205ENST00000409911 GPRASP2Q96D09 838 aa6.7□□□□□ -1.34
LRRTM4-205ENST00000409911 NPAS1Q99742 590 aa6.7□□□□□ -1.34
LRRTM4-205ENST00000409911 NAT9Q9BTE0 207 aa6.7□□□□□ -1.34
LRRTM4-205ENST00000409911 ACPTQ9BZG2 426 aa6.7□□□□□ -1.34
LRRTM4-205ENST00000409911 SPATC1LQ9H0A9 340 aa6.7□□□□□ -1.34
LRRTM4-205ENST00000409911 PDLIM7Q9NR12 457 aa6.7□□□□□ -1.34
LRRTM4-205ENST00000409911 SETD4Q9NVD3 440 aa6.7□□□□□ -1.34
LRRTM4-205ENST00000409911 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
LRRTM4-205ENST00000409911 A0A0B4J269 797 aa6.7□□□□□ -1.34
LRRTM4-205ENST00000409911 E2F8A0AVK6 867 aa6.7□□□□□ -1.34
LRRTM4-205ENST00000409911 TMEM82A0PJX8 343 aa6.7□□□□□ -1.34
LRRTM4-205ENST00000409911 KRT87PA6NCN2 255 aa6.7□□□□□ -1.34
LRRTM4-205ENST00000409911 ZNF197O14709 1029 aa6.7□□□□□ -1.34
LRRTM4-205ENST00000409911 GPR37O15354 613 aa6.7□□□□□ -1.34
LRRTM4-205ENST00000409911 SLC31A2O15432 143 aa6.7□□□□□ -1.34
LRRTM4-205ENST00000409911 IPO13O94829 963 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
LRRTM4-205ENST00000409911 ACSL3O95573 720 aa6.7□□□□□ -1.34
LRRTM4-205ENST00000409911 MBP02144 154 aa6.7□□□□□ -1.34
LRRTM4-205ENST00000409911 ADRB2P07550 413 aa6.7□□□□□ -1.34
LRRTM4-205ENST00000409911 PFKMP08237 780 aa6.7□□□□□ -1.34
LRRTM4-205ENST00000409911 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
LRRTM4-205ENST00000409911 PLS3P13797 630 aa6.7□□□□□ -1.34
LRRTM4-205ENST00000409911 PPP3CAQ08209 521 aa6.7□□□□□ -1.34
LRRTM4-205ENST00000409911 PSMD5Q16401 504 aa6.7□□□□□ -1.34
LRRTM4-205ENST00000409911 C11orf88Q6PI97 169 aa6.7□□□□□ -1.34
LRRTM4-205ENST00000409911 CENPUQ71F23 418 aa6.7□□□□□ -1.34
LRRTM4-205ENST00000409911 ZNF571Q7Z3V5 609 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
LRRTM4-205ENST00000409911 CDKL3Q8IVW4 592 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
LRRTM4-205ENST00000409911 LRRC57Q8N9N7 239 aa6.7□□□□□ -1.34
LRRTM4-205ENST00000409911 IL17RCQ8NAC3 791 aa6.7□□□□□ -1.34
LRRTM4-205ENST00000409911 CLRN3Q8NCR9 226 aa6.7□□□□□ -1.34
LRRTM4-205ENST00000409911 OR4M1Q8NGD0 313 aa6.7□□□□□ -1.34
LRRTM4-205ENST00000409911 ZNF461Q8TAF7 563 aa6.7□□□□□ -1.34
LRRTM4-205ENST00000409911 ZFP90Q8TF47 636 aa6.7□□□□□ -1.34
LRRTM4-205ENST00000409911 RAB2BQ8WUD1 216 aa6.7□□□□□ -1.34
LRRTM4-205ENST00000409911 DEDD2Q8WXF8 326 aa6.7□□□□□ -1.34
LRRTM4-205ENST00000409911 OXNAD1Q96HP4 312 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
LRRTM4-205ENST00000409911 KLHL15Q96M94 604 aa6.7□□□□□ -1.34
LRRTM4-205ENST00000409911 RBM4BQ9BQ04 359 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
LRRTM4-205ENST00000409911 RBM4Q9BWF3 364 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
LRRTM4-205ENST00000409911 OSBPL11Q9BXB4 747 aa6.7□□□□□ -1.34
LRRTM4-205ENST00000409911 FAM126AQ9BYI3 521 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
LRRTM4-205ENST00000409911 GPR88Q9GZN0 384 aa6.7□□□□□ -1.34
LRRTM4-205ENST00000409911 VRTNQ9H8Y1 702 aa6.7□□□□□ -1.34
LRRTM4-205ENST00000409911 POLR1BQ9H9Y6 1135 aa6.7□□□□□ -1.34
LRRTM4-205ENST00000409911 CDHR5Q9HBB8 845 aa6.7□□□□□ -1.34
LRRTM4-205ENST00000409911 ACTR10Q9NZ32 417 aa6.7□□□□□ -1.34
LRRTM4-205ENST00000409911 ARMCX1Q9P291 453 aa6.7□□□□□ -1.34
LRRTM4-205ENST00000409911 ASH2LQ9UBL3 628 aa6.7□□□□□ -1.34
LRRTM4-205ENST00000409911 AMFRQ9UKV5 643 aa6.7□□□□□ -1.34
LRRTM4-205ENST00000409911 TMPRSS11EQ9UL52 423 aa6.7□□□□□ -1.34
LRRTM4-205ENST00000409911 PCDHA10Q9Y5I2 948 aa6.7□□□□□ -1.34
LRRTM4-205ENST00000409911 TNPO3Q9Y5L0 923 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
LRRTM4-205ENST00000409911 SESN1Q9Y6P5 492 aa6.7□□□□□ -1.34
LRRTM4-205ENST00000409911 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP6.7□□□□□ -1.34
LRRTM4-205ENST00000409911 MFSD2BA6NFX1 497 aa6.69□□□□□ -1.34
LRRTM4-205ENST00000409911 SAGE2PA6NJ88 616 aa6.69□□□□□ -1.34
LRRTM4-205ENST00000409911 A8MV72 311 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
LRRTM4-205ENST00000409911 H0YCG3 227 aa6.69□□□□□ -1.34
LRRTM4-205ENST00000409911 KIAA0355O15063 1070 aa6.69□□□□□ -1.34
LRRTM4-205ENST00000409911 AKAP8O43823 692 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
LRRTM4-205ENST00000409911 TOP3BO95985 862 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
LRRTM4-205ENST00000409911 H2AFZP0C0S5 128 aa6.69□□□□□ -1.34
LRRTM4-205ENST00000409911 SMIM6P0DI80 62 aa6.69□□□□□ -1.34
LRRTM4-205ENST00000409911 DARSP14868 501 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
LRRTM4-205ENST00000409911 SPNP16150 400 aa6.69□□□□□ -1.34
LRRTM4-205ENST00000409911 CKMT2P17540 419 aa6.69□□□□□ -1.34
LRRTM4-205ENST00000409911 GNPDA1P46926 289 aa6.69□□□□□ -1.34
LRRTM4-205ENST00000409911 WNT7BP56706 349 aa6.69□□□□□ -1.34
LRRTM4-205ENST00000409911 ZNF45Q02386 682 aa6.69□□□□□ -1.34
LRRTM4-205ENST00000409911 KRR1Q13601 381 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
LRRTM4-205ENST00000409911 LY6KQ17RY6 165 aa6.69□□□□□ -1.34
LRRTM4-205ENST00000409911 KLHL26Q53HC5 615 aa6.69□□□□□ -1.34
LRRTM4-205ENST00000409911 TOR1AIP1Q5JTV8 583 aa6.69□□□□□ -1.34
LRRTM4-205ENST00000409911 MANEALQ5VSG8 457 aa6.69□□□□□ -1.34
LRRTM4-205ENST00000409911 TFAP2EQ6VUC0 442 aa6.69□□□□□ -1.34
LRRTM4-205ENST00000409911 H2AFVQ71UI9 128 aa6.69□□□□□ -1.34
LRRTM4-205ENST00000409911 JAMLQ86YT9 394 aa6.69□□□□□ -1.34
LRRTM4-205ENST00000409911 EPHX4Q8IUS5 362 aa6.69□□□□□ -1.34
LRRTM4-205ENST00000409911 NIPA2Q8N8Q9 360 aa6.69□□□□□ -1.34
LRRTM4-205ENST00000409911 MFSD2AQ8NA29 543 aa6.69□□□□□ -1.34
LRRTM4-205ENST00000409911 GLB1L3Q8NCI6 653 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
LRRTM4-205ENST00000409911 C3orf58Q8NDZ4 430 aa6.69□□□□□ -1.34
LRRTM4-205ENST00000409911 TMEM161BQ8NDZ6 487 aa6.69□□□□□ -1.34
LRRTM4-205ENST00000409911 DNAJB8Q8NHS0 232 aa6.69□□□□□ -1.34
LRRTM4-205ENST00000409911 LMO3Q8TAP4 145 aa6.69□□□□□ -1.34
LRRTM4-205ENST00000409911 COPS5Q92905 334 aa6.69□□□□□ -1.34
LRRTM4-205ENST00000409911 KAT5Q92993 513 aa6.69□□□□□ -1.34
LRRTM4-205ENST00000409911 ZNF845Q96IR2 970 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
LRRTM4-205ENST00000409911 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
LRRTM4-205ENST00000409911 TEX12Q9BXU0 123 aa6.69□□□□□ -1.34
LRRTM4-205ENST00000409911 GPR63Q9BZJ6 419 aa6.69□□□□□ -1.34
LRRTM4-205ENST00000409911 MMP27Q9H306 513 aa6.69□□□□□ -1.34
LRRTM4-205ENST00000409911 CATSPERBQ9H7T0 1116 aa6.69□□□□□ -1.34
LRRTM4-205ENST00000409911 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
LRRTM4-205ENST00000409911 ANKEF1Q9NU02 776 aa6.69□□□□□ -1.34
LRRTM4-205ENST00000409911 GCNT4Q9P109 453 aa6.69□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.9 ms