RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000403027.6

CNOT8-202, Transcript of CCR4-NOT transcription complex subunit 8, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CNOT8, Length 2,604 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT8-202ENST00000403027 CHRNA6Q15825 494 aa15.49■□□□□ 0.07
CNOT8-202ENST00000403027 ASTLQ6HA08 431 aaPredicted RBP15.49■□□□□ 0.07
CNOT8-202ENST00000403027 SBSNQ6UWP8 590 aa15.49■□□□□ 0.07
CNOT8-202ENST00000403027 RFLNAQ6ZTI6 216 aa15.49■□□□□ 0.07
CNOT8-202ENST00000403027 STK40Q8N2I9 435 aa15.49■□□□□ 0.07
CNOT8-202ENST00000403027 OR2T11Q8NH01 316 aa15.49■□□□□ 0.07
CNOT8-202ENST00000403027 ASB9Q96DX5 294 aa15.49■□□□□ 0.07
CNOT8-202ENST00000403027 C1QTNF3Q9BXJ4 246 aa15.49■□□□□ 0.07
CNOT8-202ENST00000403027 SLCO3A1Q9UIG8 710 aa15.49■□□□□ 0.07
CNOT8-202ENST00000403027 SARDHQ9UL12 918 aa15.49■□□□□ 0.07
CNOT8-202ENST00000403027 PDLIM1O00151 329 aa15.49■□□□□ 0.07
CNOT8-202ENST00000403027 TRIM38O00635 465 aa15.49■□□□□ 0.07
CNOT8-202ENST00000403027 CASQ2O14958 399 aaPredicted RBP15.49■□□□□ 0.07
CNOT8-202ENST00000403027 TRIM24O15164 1050 aa15.49■□□□□ 0.07
CNOT8-202ENST00000403027 SRCP12931 536 aa15.49■□□□□ 0.07
CNOT8-202ENST00000403027 ZNF7P17097 686 aaPredicted RBP15.49■□□□□ 0.07
CNOT8-202ENST00000403027 LBPP18428 481 aa15.49■□□□□ 0.07
CNOT8-202ENST00000403027 MPP7Q5T2T1 576 aa15.49■□□□□ 0.07
CNOT8-202ENST00000403027 TRIM74Q86UV6 250 aa15.49■□□□□ 0.07
CNOT8-202ENST00000403027 TRIM73Q86UV7 250 aa15.49■□□□□ 0.07
CNOT8-202ENST00000403027 CPXM2Q8N436 756 aa15.49■□□□□ 0.07
CNOT8-202ENST00000403027 GPR26Q8NDV2 337 aa15.49■□□□□ 0.07
CNOT8-202ENST00000403027 OR2AP1Q8NGE2 309 aa15.49■□□□□ 0.07
CNOT8-202ENST00000403027 BEGAINQ9BUH8 593 aa15.49■□□□□ 0.07
CNOT8-202ENST00000403027 NSUN3Q9H649 340 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
CNOT8-202ENST00000403027 ATP13A3Q9H7F0 1226 aa15.49■□□□□ 0.07
CNOT8-202ENST00000403027 NOL11Q9H8H0 719 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
CNOT8-202ENST00000403027 SDR39U1Q9NRG7 319 aaPredicted RBP15.49■□□□□ 0.07
CNOT8-202ENST00000403027 MRGBPQ9NV56 204 aa15.49■□□□□ 0.07
CNOT8-202ENST00000403027 CROTQ9UKG9 612 aa15.49■□□□□ 0.07
CNOT8-202ENST00000403027 SLC7A2P52569 658 aa15.48■□□□□ 0.07
CNOT8-202ENST00000403027 ERVPABLB-1P60509 514 aa15.48■□□□□ 0.07
CNOT8-202ENST00000403027 RPS6KA2Q15349 733 aa15.48■□□□□ 0.07
CNOT8-202ENST00000403027 CERS6Q6ZMG9 384 aa15.48■□□□□ 0.07
CNOT8-202ENST00000403027 SNX20Q7Z614 316 aa15.48■□□□□ 0.07
CNOT8-202ENST00000403027 ADGRG2Q8IZP9 1017 aa15.48■□□□□ 0.07
CNOT8-202ENST00000403027 MIER2Q8N344 545 aa15.48■□□□□ 0.07
CNOT8-202ENST00000403027 PIP4K2CQ8TBX8 421 aa15.48■□□□□ 0.07
CNOT8-202ENST00000403027 NCSTNQ92542 709 aa15.48■□□□□ 0.07
CNOT8-202ENST00000403027 C1orf50Q9BV19 199 aa15.48■□□□□ 0.07
CNOT8-202ENST00000403027 CD300AQ9UGN4 299 aa15.48■□□□□ 0.07
CNOT8-202ENST00000403027 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa15.48■□□□□ 0.07
CNOT8-202ENST00000403027 LTBP2Q14767 1821 aa15.48■□□□□ 0.07
CNOT8-202ENST00000403027 GLYATL1P3A0A0U1RQE8 302 aa15.48■□□□□ 0.07
CNOT8-202ENST00000403027 LOC107983988A0A1B0GUW6 1196 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
CNOT8-202ENST00000403027 ADGRE1Q14246 886 aa15.48■□□□□ 0.07
CNOT8-202ENST00000403027 CAPRIN1Q14444 709 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
CNOT8-202ENST00000403027 LETMD1Q6P1Q0 360 aa15.48■□□□□ 0.07
CNOT8-202ENST00000403027 TXNDC11Q6PKC3 985 aa15.48■□□□□ 0.07
CNOT8-202ENST00000403027 FRA10AC1Q70Z53 315 aa15.48■□□□□ 0.07
CNOT8-202ENST00000403027 AMIGO2Q86SJ2 522 aa15.48■□□□□ 0.07
CNOT8-202ENST00000403027 NUDT8Q8WV74 236 aa15.48■□□□□ 0.07
CNOT8-202ENST00000403027 DLG3Q92796 817 aa15.48■□□□□ 0.07
CNOT8-202ENST00000403027 VPS33AQ96AX1 596 aa15.48■□□□□ 0.07
CNOT8-202ENST00000403027 NMD3Q96D46 503 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
CNOT8-202ENST00000403027 TCF25Q9BQ70 676 aa15.48■□□□□ 0.07
CNOT8-202ENST00000403027 TMEM181Q9P2C4 612 aa15.48■□□□□ 0.07
CNOT8-202ENST00000403027 AP4B1Q9Y6B7 739 aa15.48■□□□□ 0.07
CNOT8-202ENST00000403027 COMMD10Q9Y6G5 202 aa15.48■□□□□ 0.07
CNOT8-202ENST00000403027 DENND4CQ5VZ89 1909 aa15.48■□□□□ 0.07
CNOT8-202ENST00000403027 KATNA1O75449 491 aa15.47■□□□□ 0.07
CNOT8-202ENST00000403027 MLYCDO95822 493 aa15.47■□□□□ 0.07
CNOT8-202ENST00000403027 IGSF6O95976 241 aa15.47■□□□□ 0.07
CNOT8-202ENST00000403027 GDF5P43026 501 aa15.47■□□□□ 0.07
CNOT8-202ENST00000403027 PSMD8P48556 350 aa15.47■□□□□ 0.07
CNOT8-202ENST00000403027 ATP4BP51164 291 aa15.47■□□□□ 0.07
CNOT8-202ENST00000403027 CHN2P52757 468 aa15.47■□□□□ 0.07
CNOT8-202ENST00000403027 FUT11Q495W5 492 aa15.47■□□□□ 0.07
CNOT8-202ENST00000403027 C8orf82Q6P1X6 216 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
CNOT8-202ENST00000403027 CRTC1Q6UUV9 634 aa15.47■□□□□ 0.07
CNOT8-202ENST00000403027 ST13P4Q8IZP2 240 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
CNOT8-202ENST00000403027 GRIN3AQ8TCU5 1115 aa15.47■□□□□ 0.07
CNOT8-202ENST00000403027 LRTOMTQ8WZ04 291 aa15.47■□□□□ 0.07
CNOT8-202ENST00000403027 TBRG4Q969Z0 631 aaKnown RBP eCLIP15.47■□□□□ 0.074e-6■■■■■ 48.1
CNOT8-202ENST00000403027 LINC00597Q9H2U6 94 aa15.47■□□□□ 0.07
CNOT8-202ENST00000403027 ASAH2Q9NR71 780 aa15.47■□□□□ 0.07
CNOT8-202ENST00000403027 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
CNOT8-202ENST00000403027 GPR45Q9Y5Y3 372 aa15.47■□□□□ 0.07
CNOT8-202ENST00000403027 HCFC2Q9Y5Z7 792 aa15.47■□□□□ 0.07
CNOT8-202ENST00000403027 GIPC1O14908 333 aa15.47■□□□□ 0.07
CNOT8-202ENST00000403027 CYBBP04839 570 aa15.47■□□□□ 0.07
CNOT8-202ENST00000403027 UROSP10746 265 aa15.47■□□□□ 0.07
CNOT8-202ENST00000403027 ACRV1P26436 265 aa15.47■□□□□ 0.07
CNOT8-202ENST00000403027 RPL10P27635 214 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
CNOT8-202ENST00000403027 SERPINA4P29622 427 aa15.47■□□□□ 0.07
CNOT8-202ENST00000403027 CREB5Q02930 508 aa15.47■□□□□ 0.07
CNOT8-202ENST00000403027 PHKG1Q16816 387 aa15.47■□□□□ 0.07
CNOT8-202ENST00000403027 LRRC66Q68CR7 880 aa15.47■□□□□ 0.07
CNOT8-202ENST00000403027 GPRIN3Q6ZVF9 776 aa15.47■□□□□ 0.07
CNOT8-202ENST00000403027 OR56A4Q8NGH8 313 aa15.47■□□□□ 0.07
CNOT8-202ENST00000403027 PDLIM5Q96HC4 596 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
CNOT8-202ENST00000403027 LMLNQ96KR4 655 aa15.47■□□□□ 0.07
CNOT8-202ENST00000403027 C6orf203Q9P0P8 240 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
CNOT8-202ENST00000403027 ATXN10Q9UBB4 475 aa15.47■□□□□ 0.07
CNOT8-202ENST00000403027 CRLS1Q9UJA2 301 aa15.47■□□□□ 0.07
CNOT8-202ENST00000403027 MAFFQ9ULX9 164 aa15.47■□□□□ 0.07
CNOT8-202ENST00000403027 PCDHB1Q9Y5F3 818 aa15.47■□□□□ 0.07
CNOT8-202ENST00000403027 NEDD8-MDP1E9PL57 170 aa15.47■□□□□ 0.07
CNOT8-202ENST00000403027 FFAR2O15552 330 aa15.47■□□□□ 0.07
CNOT8-202ENST00000403027 ADH1AP07327 375 aa15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.3 ms