RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384631.1

RNU6-178P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 178, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-178P, Length 104 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-178P-201ENST00000384631 PBX2P40425 430 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-178P-201ENST00000384631 PTDSS1P48651 473 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
RNU6-178P-201ENST00000384631 CCR4P51679 360 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-178P-201ENST00000384631 CYP4F2P78329 520 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-178P-201ENST00000384631 SHC2P98077 582 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-178P-201ENST00000384631 ROM1Q03395 351 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-178P-201ENST00000384631 GRIN1Q05586 938 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-178P-201ENST00000384631 ZP2Q05996 745 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-178P-201ENST00000384631 RBPJQ06330 500 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-178P-201ENST00000384631 CXCL9Q07325 125 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-178P-201ENST00000384631 ACSM1Q08AH1 577 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-178P-201ENST00000384631 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
RNU6-178P-201ENST00000384631 BST1Q10588 318 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-178P-201ENST00000384631 MERTKQ12866 999 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-178P-201ENST00000384631 NFATC3Q12968 1075 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-178P-201ENST00000384631 DYRK1AQ13627 763 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-178P-201ENST00000384631 FHL3Q13643 280 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-178P-201ENST00000384631 RUNX2Q13950 521 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-178P-201ENST00000384631 GPR176Q14439 515 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-178P-201ENST00000384631 MVPQ14764 893 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
RNU6-178P-201ENST00000384631 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP4.7□□□□□ -1.66
RNU6-178P-201ENST00000384631 PDK3Q15120 406 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-178P-201ENST00000384631 ANGPT1Q15389 498 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-178P-201ENST00000384631 MAPK6Q16659 721 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-178P-201ENST00000384631 ZNF750Q32MQ0 723 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-178P-201ENST00000384631 HSDL1Q3SXM5 330 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-178P-201ENST00000384631 IQCCQ4KMZ1 466 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-178P-201ENST00000384631 CBWD6Q4V339 395 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-178P-201ENST00000384631 ZMAT1Q5H9K5 638 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-178P-201ENST00000384631 CBWD3Q5JTY5 395 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-178P-201ENST00000384631 LDLRAP1Q5SW96 308 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-178P-201ENST00000384631 WLSQ5T9L3 541 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-178P-201ENST00000384631 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
RNU6-178P-201ENST00000384631 BTBD8Q5XKL5 378 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-178P-201ENST00000384631 PMS2CLQ68D20 193 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-178P-201ENST00000384631 CDPF1Q6NVV7 123 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-178P-201ENST00000384631 MSANTD2Q6P1R3 559 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-178P-201ENST00000384631 C11orf57Q6ZUT1 292 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
RNU6-178P-201ENST00000384631 USP30Q70CQ3 517 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-178P-201ENST00000384631 COPS6Q7L5N1 327 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-178P-201ENST00000384631 GPRIN1Q7Z2K8 1008 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-178P-201ENST00000384631 BMP8AQ7Z5Y6 402 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-178P-201ENST00000384631 KCTD20Q7Z5Y7 419 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-178P-201ENST00000384631 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
RNU6-178P-201ENST00000384631 PHLDB2Q86SQ0 1253 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-178P-201ENST00000384631 CENPLQ8N0S6 344 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
RNU6-178P-201ENST00000384631 CADM3Q8N126 398 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-178P-201ENST00000384631 RNF148Q8N7C7 305 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-178P-201ENST00000384631 NECAB1Q8N987 351 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-178P-201ENST00000384631 ICA1LQ8NDH6 482 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-178P-201ENST00000384631 STKLD1Q8NE28 680 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-178P-201ENST00000384631 ZNF680Q8NEM1 530 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-178P-201ENST00000384631 OR10S1Q8NGN2 331 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-178P-201ENST00000384631 TAS1R2Q8TE23 839 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-178P-201ENST00000384631 TRIB2Q92519 343 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-178P-201ENST00000384631 SEPT8Q92599 483 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-178P-201ENST00000384631 TOP1MTQ969P6 601 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-178P-201ENST00000384631 HAVCR1Q96D42 359 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-178P-201ENST00000384631 TMA16Q96EY4 203 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
RNU6-178P-201ENST00000384631 FANCD2OSQ96PS1 177 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-178P-201ENST00000384631 LRRC37BQ96QE4 947 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-178P-201ENST00000384631 PANX1Q96RD7 426 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-178P-201ENST00000384631 CHP1Q99653 195 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-178P-201ENST00000384631 NUDT22Q9BRQ3 303 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-178P-201ENST00000384631 CCM2Q9BSQ5 444 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-178P-201ENST00000384631 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-178P-201ENST00000384631 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-178P-201ENST00000384631 TMEM168Q9H0V1 697 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-178P-201ENST00000384631 FAM83DQ9H4H8 585 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-178P-201ENST00000384631 FBXO44Q9H4M3 255 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-178P-201ENST00000384631 ANKZF1Q9H8Y5 726 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-178P-201ENST00000384631 C8orf4Q9NR00 106 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-178P-201ENST00000384631 KCMF1Q9P0J7 381 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-178P-201ENST00000384631 SLC7A8Q9UHI5 535 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-178P-201ENST00000384631 CRLS1Q9UJA2 301 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-178P-201ENST00000384631 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
RNU6-178P-201ENST00000384631 PALD1Q9ULE6 856 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-178P-201ENST00000384631 ENTPD4Q9Y227 616 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-178P-201ENST00000384631 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-178P-201ENST00000384631 MAST3O60307 1309 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-178P-201ENST00000384631 NINLQ9Y2I6 1382 aa4.69□□□□□ -1.66
RNU6-178P-201ENST00000384631 A0A1B0GUL7 405 aa4.69□□□□□ -1.66
RNU6-178P-201ENST00000384631 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa4.69□□□□□ -1.66
RNU6-178P-201ENST00000384631 AQP7P3A6NL99 342 aa4.69□□□□□ -1.66
RNU6-178P-201ENST00000384631 GOLGA8JA6NMD2 632 aa4.69□□□□□ -1.66
RNU6-178P-201ENST00000384631 C22orf46C9J442 243 aa4.69□□□□□ -1.66
RNU6-178P-201ENST00000384631 SLCO1B7G3V0H7 640 aa4.69□□□□□ -1.66
RNU6-178P-201ENST00000384631 GOLGA8TH3BQL2 631 aa4.69□□□□□ -1.66
RNU6-178P-201ENST00000384631 PDLIM1O00151 329 aa4.69□□□□□ -1.66
RNU6-178P-201ENST00000384631 SNAP23O00161 211 aa4.69□□□□□ -1.66
RNU6-178P-201ENST00000384631 HAS3O00219 553 aa4.69□□□□□ -1.66
RNU6-178P-201ENST00000384631 GPR171O14626 319 aa4.69□□□□□ -1.66
RNU6-178P-201ENST00000384631 CALUO43852 315 aaPredicted RBP4.69□□□□□ -1.66
RNU6-178P-201ENST00000384631 CDH16O75309 829 aa4.69□□□□□ -1.66
RNU6-178P-201ENST00000384631 SERPINI2O75830 405 aa4.69□□□□□ -1.66
RNU6-178P-201ENST00000384631 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP4.69□□□□□ -1.66
RNU6-178P-201ENST00000384631 HMBSP08397 361 aa4.69□□□□□ -1.66
RNU6-178P-201ENST00000384631 KRT19P08727 400 aa4.69□□□□□ -1.66
RNU6-178P-201ENST00000384631 GOLGA8HP0CJ92 632 aa4.69□□□□□ -1.66
RNU6-178P-201ENST00000384631 SLC2A3P11169 496 aa4.69□□□□□ -1.66
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.9 ms