RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000355233.9

PTPRD-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRD, Length 8,251 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-201ENST00000355233 GRIA3P42263 894 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 MAGEA2P43356 314 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 FAM153CQ494X1 144 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 C16orf46Q6P387 395 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 PAOXQ6QHF9 649 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 LRRC70Q7Z2Q7 622 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 RNF157Q96PX1 679 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 HGH1Q9BTY7 390 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 PORCNQ9H237 461 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 UBQLN2Q9UHD9 624 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 CDH10Q9Y6N8 788 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 ZNF536O15090 1300 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 KANTRA0A1W2PQU2 76 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 RDH16O75452 317 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 AP2A1O95782 977 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 CST1P01037 141 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 GKN3PP0CG01 181 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 HPGDP15428 266 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 IGFBP5P24593 272 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 NDUFS1P28331 727 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 LIMK2P53671 638 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 TEKQ02763 1124 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 ACSM2AQ08AH3 577 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 MAMLD1Q13495 774 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 SELPLGQ14242 412 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 SLC25A52Q3SY17 297 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 ACSM2BQ68CK6 577 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP4.87□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 GPIHBP1Q8IV16 184 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 LIX1LQ8IVB5 337 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 ZNF548Q8NEK5 533 aaPredicted RBP4.87□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 FNDC8Q8TC99 324 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 METTL6Q8TCB7 284 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 NXNL1Q96CM4 212 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 OSBPL7Q9BZF2 842 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 DPAGT1Q9H3H5 408 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 SEMA6BQ9H3T3 888 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 SLC22A11Q9NSA0 550 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 ABCG2Q9UNQ0 655 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP4.87□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 RIIAD1A6NNX1 92 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 DHX15O43143 795 aaKnown RBP4.86□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 FDPSP14324 419 aaKnown RBP4.86□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP4.86□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 YWHAQP27348 245 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 HLA-FP30511 346 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 GPC1P35052 558 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 MATKP42679 507 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 ACTA2P62736 377 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 ACTG2P63267 376 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 RALGDSQ12967 914 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 RSU1Q15404 277 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 NEPROQ6NW34 567 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 ARHGAP12Q8IWW6 846 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 OFCC1Q8IZS5 231 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 EPS8L1Q8TE68 723 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 BAP1Q92560 729 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 SPON2Q9BUD6 331 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP4.86□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 DOLKQ9UPQ8 538 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 KCNE2Q9Y6J6 123 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 METTL18O95568 372 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 CHRM3P20309 590 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 NOS3P29474 1203 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 RPS5P46782 204 aaKnown RBP4.86□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 KHKP50053 298 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 RAB4BP61018 213 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 PPARDQ03181 441 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 MERTKQ12866 999 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 CAMK2DQ13557 499 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 LRIF1Q5T3J3 769 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 KIAA0930Q6ICG6 404 aaPredicted RBP4.86□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 GPR180Q86V85 440 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 MRPL41Q8IXM3 137 aaKnown RBP4.86□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 ZC3H3Q8IXZ2 948 aaKnown RBP4.86□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 OR4C15Q8NGM1 316 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 TBC1D15Q8TC07 691 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 PHYHIPQ92561 330 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 SLC35C1Q96A29 364 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 ACSF2Q96CM8 615 aaPredicted RBP4.86□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 XKR8Q9H6D3 395 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 NUP50Q9UKX7 468 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 IFT52Q9Y366 437 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 Q9Y3F1 56 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 TELO2Q9Y4R8 837 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 SNX10Q9Y5X0 201 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 MN1Q10571 1320 aaPredicted RBP4.86□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 BCAS2O75934 225 aaPredicted RBP4.86□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 AK1P00568 194 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 CYP11A1P05108 521 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 MTHFD1P11586 935 aaKnown RBP4.86□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 SOAT1P35610 550 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 OMPP47874 163 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 ZRANB3Q5FWF4 1079 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 CHSY3Q70JA7 882 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 TRIM74Q86UV6 250 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 TRIM73Q86UV7 250 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 LAPTM4BQ86VI4 370 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 UBR7Q8N806 425 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 SIMC1Q8NDZ2 872 aa4.86□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.2 ms