RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000348564.10

PTPRC-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 4,626 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-201ENST00000348564 NKAIN2Q5VXU1 208 aa4.38□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 FAM72DQ6L9T8 149 aa4.38□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 AADACL2Q6P093 401 aa4.38□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 LDB1Q86U70 411 aaPredicted RBP4.38□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 FAM72BQ86X60 149 aa4.38□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 MCEMP1Q8IX19 187 aa4.38□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 DDIASQ8IXT1 998 aa4.38□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 KRT78Q8N1N4 520 aa4.38□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 CLDN19Q8N6F1 224 aa4.38□□□□□ -1.71
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PTPRC-201ENST00000348564 OR2A12Q8NGT7 310 aa4.38□□□□□ -1.71
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PTPRC-201ENST00000348564 C9orf72Q96LT7 481 aa4.38□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 RILPQ96NA2 401 aa4.38□□□□□ -1.71
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PTPRC-201ENST00000348564 GAL3ST4Q96RP7 486 aa4.38□□□□□ -1.71
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PTPRC-201ENST00000348564 CARD9Q9H257 536 aa4.38□□□□□ -1.71
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PTPRC-201ENST00000348564 CAPN5O15484 640 aaPredicted RBP4.37□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 LRP3O75074 770 aa4.37□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 PPFIA2O75334 1257 aa4.37□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 ERAL1O75616 437 aaKnown RBP4.37□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 PGLSO95336 258 aa4.37□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 STATHP02808 62 aa4.37□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 CCT5P48643 541 aa4.37□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 CCR4P51679 360 aa4.37□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 CCR5P51681 352 aa4.37□□□□□ -1.71
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PTPRC-201ENST00000348564 PCID2Q5JVF3 399 aa4.37□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 GPRC6AQ5T6X5 926 aa4.37□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 CD300LGQ6UXG3 332 aa4.37□□□□□ -1.71
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PTPRC-201ENST00000348564 RBM18Q96H35 190 aaKnown RBP4.37□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 HERPUD2Q9BSE4 406 aa4.37□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 CNOT10Q9H9A5 744 aaKnown RBP4.37□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 ACTR5Q9H9F9 607 aaPredicted RBP4.37□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 TRIM39Q9HCM9 518 aa4.37□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 PRDM8Q9NQV8 689 aa4.37□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 AGPAT4Q9NRZ5 378 aa4.37□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 DNAJC11Q9NVH1 559 aa4.37□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 HS3ST3A1Q9Y663 406 aa4.37□□□□□ -1.71
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