RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000326294.3

PTPRCAP-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRCAP, Length 1,292 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCAP-201ENST00000326294 KCTD19Q17RG1 926 aaPredicted RBP19.2■□□□□ 0.66
PTPRCAP-201ENST00000326294 GPR33Q49SQ1 333 aa19.2■□□□□ 0.66
PTPRCAP-201ENST00000326294 XKR5Q6UX68 686 aa19.2■□□□□ 0.66
PTPRCAP-201ENST00000326294 RCBTB1Q8NDN9 531 aa19.2■□□□□ 0.66
PTPRCAP-201ENST00000326294 HNRNPLLQ8WVV9 542 aaKnown RBP19.2■□□□□ 0.66
PTPRCAP-201ENST00000326294 CDKN2AIPNLQ96HQ2 116 aa19.2■□□□□ 0.66
PTPRCAP-201ENST00000326294 COPS8Q99627 209 aa19.2■□□□□ 0.66
PTPRCAP-201ENST00000326294 DPYSL5Q9BPU6 564 aa19.2■□□□□ 0.66
PTPRCAP-201ENST00000326294 TBC1D10AQ9BXI6 508 aa19.2■□□□□ 0.66
PTPRCAP-201ENST00000326294 LDHAL6BQ9BYZ2 381 aaPredicted RBP19.2■□□□□ 0.66
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZMYND15Q9H091 742 aa19.2■□□□□ 0.66
PTPRCAP-201ENST00000326294 UCK1Q9HA47 277 aa19.2■□□□□ 0.66
PTPRCAP-201ENST00000326294 EIF2B3Q9NR50 452 aaKnown RBP19.2■□□□□ 0.66
PTPRCAP-201ENST00000326294 HOMER3Q9NSC5 361 aa19.2■□□□□ 0.66
PTPRCAP-201ENST00000326294 PISDQ9UG56 409 aa19.2■□□□□ 0.66
PTPRCAP-201ENST00000326294 PIKFYVEQ9Y2I7 2098 aa19.2■□□□□ 0.66
PTPRCAP-201ENST00000326294 IGLV3-16A0A075B6K0 115 aa19.19■□□□□ 0.66
PTPRCAP-201ENST00000326294 VIPP01282 170 aa19.19■□□□□ 0.66
PTPRCAP-201ENST00000326294 ITIH1P19827 911 aa19.19■□□□□ 0.66
PTPRCAP-201ENST00000326294 ACRV1P26436 265 aa19.19■□□□□ 0.66
PTPRCAP-201ENST00000326294 ITPKBP27987 946 aa19.19■□□□□ 0.66
PTPRCAP-201ENST00000326294 CACNG1Q06432 222 aa19.19■□□□□ 0.66
PTPRCAP-201ENST00000326294 CCDC173Q0VFZ6 552 aa19.19■□□□□ 0.66
PTPRCAP-201ENST00000326294 CLCA4Q14CN2 919 aa19.19■□□□□ 0.66
PTPRCAP-201ENST00000326294 COL28A1Q2UY09 1125 aa19.19■□□□□ 0.66
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZRANB3Q5FWF4 1079 aa19.19■□□□□ 0.66
PTPRCAP-201ENST00000326294 TMEM71Q6P5X7 295 aa19.19■□□□□ 0.66
PTPRCAP-201ENST00000326294 GSTA5Q7RTV2 222 aa19.19■□□□□ 0.66
PTPRCAP-201ENST00000326294 SERPINA9Q86WD7 417 aa19.19■□□□□ 0.66
PTPRCAP-201ENST00000326294 TRIM48Q8IWZ4 208 aa19.19■□□□□ 0.66
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZNF248Q8NDW4 579 aa19.19■□□□□ 0.66
PTPRCAP-201ENST00000326294 OR13J1Q8NGT2 312 aa19.19■□□□□ 0.66
PTPRCAP-201ENST00000326294 TMEM159Q96B96 161 aa19.19■□□□□ 0.66
PTPRCAP-201ENST00000326294 DCUN1D1Q96GG9 259 aa19.19■□□□□ 0.66
PTPRCAP-201ENST00000326294 AHCYL2Q96HN2 611 aaKnown RBP19.19■□□□□ 0.66
PTPRCAP-201ENST00000326294 MS4A14Q96JA4 679 aa19.19■□□□□ 0.66
PTPRCAP-201ENST00000326294 PBKQ96KB5 322 aa19.19■□□□□ 0.66
PTPRCAP-201ENST00000326294 RANBP9Q96S59 729 aa19.19■□□□□ 0.66
PTPRCAP-201ENST00000326294 POT1Q9NUX5 634 aa19.19■□□□□ 0.66
PTPRCAP-201ENST00000326294 TRMT1Q9NXH9 659 aaKnown RBP19.19■□□□□ 0.66
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZDHHC3Q9NYG2 299 aa19.19■□□□□ 0.66
PTPRCAP-201ENST00000326294 PRAMEF33A0A0G2JMD5 474 aa19.18■□□□□ 0.66
PTPRCAP-201ENST00000326294 HEATR9A2RTY3 570 aa19.18■□□□□ 0.66
PTPRCAP-201ENST00000326294 MGAT4DA6NG13 374 aa19.18■□□□□ 0.66
PTPRCAP-201ENST00000326294 HGSO14964 777 aaPredicted RBP19.18■□□□□ 0.66
PTPRCAP-201ENST00000326294 RRP8O43159 456 aaKnown RBP19.18■□□□□ 0.66
PTPRCAP-201ENST00000326294 GAS8O95995 478 aa19.18■□□□□ 0.66
PTPRCAP-201ENST00000326294 JMJD7P0C870 316 aa19.18■□□□□ 0.66
PTPRCAP-201ENST00000326294 MPSTP25325 297 aa19.18■□□□□ 0.66
PTPRCAP-201ENST00000326294 ETV5P41161 510 aa19.18■□□□□ 0.66
PTPRCAP-201ENST00000326294 ABCG1P45844 678 aa19.18■□□□□ 0.66
PTPRCAP-201ENST00000326294 MAPK9P45984 424 aa19.18■□□□□ 0.66
PTPRCAP-201ENST00000326294 PRLHRP49683 370 aa19.18■□□□□ 0.66
PTPRCAP-201ENST00000326294 BASP1P80723 227 aaKnown RBP19.18■□□□□ 0.66
PTPRCAP-201ENST00000326294 TRA2AQ13595 282 aaKnown RBP eCLIP19.18■□□□□ 0.66
PTPRCAP-201ENST00000326294 TTC27Q6P3X3 843 aa19.18■□□□□ 0.66
PTPRCAP-201ENST00000326294 C4orf22Q6V702 233 aa19.18■□□□□ 0.66
PTPRCAP-201ENST00000326294 TMEM26Q6ZUK4 368 aa19.18■□□□□ 0.66
PTPRCAP-201ENST00000326294 PIANPQ8IYJ0 282 aa19.18■□□□□ 0.66
PTPRCAP-201ENST00000326294 GPR150Q8NGU9 434 aa19.18■□□□□ 0.66
PTPRCAP-201ENST00000326294 HEXDCQ8WVB3 486 aa19.18■□□□□ 0.66
PTPRCAP-201ENST00000326294 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP19.18■□□□□ 0.66
PTPRCAP-201ENST00000326294 LINC00615Q96LM1 132 aaPredicted RBP19.18■□□□□ 0.66
PTPRCAP-201ENST00000326294 CMKLR1Q99788 373 aa19.18■□□□□ 0.66
PTPRCAP-201ENST00000326294 EPB41L1Q9H4G0 881 aa19.18■□□□□ 0.66
PTPRCAP-201ENST00000326294 SMARCAL1Q9NZC9 954 aa19.18■□□□□ 0.66
PTPRCAP-201ENST00000326294 OGFRQ9NZT2 677 aa19.18■□□□□ 0.66
PTPRCAP-201ENST00000326294 SLC2A6Q9UGQ3 507 aa19.18■□□□□ 0.66
PTPRCAP-201ENST00000326294 TTC7AQ9ULT0 858 aaPredicted RBP19.18■□□□□ 0.66
PTPRCAP-201ENST00000326294 PSMD13Q9UNM6 376 aa19.18■□□□□ 0.66
PTPRCAP-201ENST00000326294 PCDHGA7Q9Y5G6 932 aa19.18■□□□□ 0.66
PTPRCAP-201ENST00000326294 CCDC162PA2VCL2 907 aa19.17■□□□□ 0.66
PTPRCAP-201ENST00000326294 OR51F1A6NGY5 319 aa19.17■□□□□ 0.66
PTPRCAP-201ENST00000326294 USP27XA6NNY8 438 aa19.17■□□□□ 0.66
PTPRCAP-201ENST00000326294 CFAP99D6REC4 459 aa19.17■□□□□ 0.66
PTPRCAP-201ENST00000326294 RALBP11234 206 aa19.17■□□□□ 0.66
PTPRCAP-201ENST00000326294 MSNP26038 577 aaKnown RBP19.17■□□□□ 0.66
PTPRCAP-201ENST00000326294 FOXN2P32314 431 aa19.17■□□□□ 0.66
PTPRCAP-201ENST00000326294 HALP42357 657 aa19.17■□□□□ 0.66
PTPRCAP-201ENST00000326294 PPM1FP49593 454 aaPredicted RBP19.17■□□□□ 0.66
PTPRCAP-201ENST00000326294 DBN1Q16643 649 aa19.17■□□□□ 0.66
PTPRCAP-201ENST00000326294 SKIDA1Q1XH10 827 aa19.17■□□□□ 0.66
PTPRCAP-201ENST00000326294 TSTD2Q5T7W7 516 aa19.17■□□□□ 0.66
PTPRCAP-201ENST00000326294 METRNLQ641Q3 311 aa19.17■□□□□ 0.66
PTPRCAP-201ENST00000326294 WDR74Q6RFH5 385 aaPredicted RBP19.17■□□□□ 0.66
PTPRCAP-201ENST00000326294 LRRC69Q6ZNQ3 347 aa19.17■□□□□ 0.66
PTPRCAP-201ENST00000326294 TAS2R42Q7RTR8 314 aa19.17■□□□□ 0.66
PTPRCAP-201ENST00000326294 SPACA3Q8IXA5 215 aa19.17■□□□□ 0.66
PTPRCAP-201ENST00000326294 OR2L2Q8NH16 312 aa19.17■□□□□ 0.66
PTPRCAP-201ENST00000326294 COG1Q8WTW3 980 aa19.17■□□□□ 0.66
PTPRCAP-201ENST00000326294 CXorf40BQ96DE9 158 aa19.17■□□□□ 0.66
PTPRCAP-201ENST00000326294 CRELD1Q96HD1 420 aa19.17■□□□□ 0.66
PTPRCAP-201ENST00000326294 NAF1Q96HR8 494 aaKnown RBP19.17■□□□□ 0.66
PTPRCAP-201ENST00000326294 OSBPL9Q96SU4 736 aa19.17■□□□□ 0.66
PTPRCAP-201ENST00000326294 AP1M1Q9BXS5 423 aa19.17■□□□□ 0.66
PTPRCAP-201ENST00000326294 SLC40A1Q9NP59 571 aa19.17■□□□□ 0.66
PTPRCAP-201ENST00000326294 PDP2Q9P2J9 529 aa19.17■□□□□ 0.66
PTPRCAP-201ENST00000326294 FAM8A1Q9UBU6 413 aa19.17■□□□□ 0.66
PTPRCAP-201ENST00000326294 RIMKLBQ9ULI2 386 aa19.17■□□□□ 0.66
PTPRCAP-201ENST00000326294 LHX6Q9UPM6 363 aa19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.5 ms