RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000309641.10

PDE4D-201, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PDE4D, Length 2,025 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-201ENST00000309641 SNX2O60749 519 aa8.94□□□□□ -0.98
PDE4D-201ENST00000309641 TTC4O95801 387 aa8.94□□□□□ -0.98
PDE4D-201ENST00000309641 S1PR4O95977 384 aa8.94□□□□□ -0.98
PDE4D-201ENST00000309641 GPR89BP0CG08 455 aa8.94□□□□□ -0.98
PDE4D-201ENST00000309641 BRAFP15056 766 aa8.94□□□□□ -0.98
PDE4D-201ENST00000309641 PAMP19021 973 aa8.94□□□□□ -0.98
PDE4D-201ENST00000309641 GABRB3P28472 473 aa8.94□□□□□ -0.98
PDE4D-201ENST00000309641 NSG1P42857 185 aa8.94□□□□□ -0.98
PDE4D-201ENST00000309641 MAGEA4P43358 317 aa8.94□□□□□ -0.98
PDE4D-201ENST00000309641 PRLHRP49683 370 aa8.94□□□□□ -0.98
PDE4D-201ENST00000309641 CAV1Q03135 178 aa8.94□□□□□ -0.98
PDE4D-201ENST00000309641 TYSND1Q2T9J0 566 aa8.94□□□□□ -0.98
PDE4D-201ENST00000309641 PROX2Q3B8N5 592 aa8.94□□□□□ -0.98
PDE4D-201ENST00000309641 ZNF658BQ4V348 819 aaPredicted RBP8.94□□□□□ -0.98
PDE4D-201ENST00000309641 C6orf132Q5T0Z8 1188 aa8.94□□□□□ -0.98
PDE4D-201ENST00000309641 CNSTQ6PJW8 725 aa8.94□□□□□ -0.98
PDE4D-201ENST00000309641 PACS1Q6VY07 963 aa8.94□□□□□ -0.98
PDE4D-201ENST00000309641 GKN2Q86XP6 184 aa8.94□□□□□ -0.98
PDE4D-201ENST00000309641 KRT222Q8N1A0 295 aa8.94□□□□□ -0.98
PDE4D-201ENST00000309641 SPDYE1Q8NFV5 336 aaPredicted RBP8.94□□□□□ -0.98
PDE4D-201ENST00000309641 GPR150Q8NGU9 434 aa8.94□□□□□ -0.98
PDE4D-201ENST00000309641 PYROXD1Q8WU10 500 aa8.94□□□□□ -0.98
PDE4D-201ENST00000309641 TBRG4Q969Z0 631 aaKnown RBP eCLIP8.94□□□□□ -0.98
PDE4D-201ENST00000309641 CERS2Q96G23 380 aa8.94□□□□□ -0.98
PDE4D-201ENST00000309641 BIRC8Q96P09 236 aa8.94□□□□□ -0.98
PDE4D-201ENST00000309641 NAT9Q9BTE0 207 aa8.94□□□□□ -0.98
PDE4D-201ENST00000309641 GSDMCQ9BYG8 508 aa8.94□□□□□ -0.98
PDE4D-201ENST00000309641 ZCCHC2Q9C0B9 1178 aaKnown RBP8.94□□□□□ -0.98
PDE4D-201ENST00000309641 ANKZF1Q9H8Y5 726 aa8.94□□□□□ -0.98
PDE4D-201ENST00000309641 SMYD2Q9NRG4 433 aa8.94□□□□□ -0.98
PDE4D-201ENST00000309641 FAM114A2Q9NRY5 505 aa8.94□□□□□ -0.98
PDE4D-201ENST00000309641 TOR4AQ9NXH8 423 aa8.94□□□□□ -0.98
PDE4D-201ENST00000309641 PSMD13Q9UNM6 376 aa8.94□□□□□ -0.98
PDE4D-201ENST00000309641 WDR37Q9Y2I8 494 aa8.94□□□□□ -0.98
PDE4D-201ENST00000309641 PSAT1Q9Y617 370 aa8.94□□□□□ -0.98
PDE4D-201ENST00000309641 A6NCN8 305 aa8.93□□□□□ -0.98
PDE4D-201ENST00000309641 CFAP99D6REC4 459 aa8.93□□□□□ -0.98
PDE4D-201ENST00000309641 TPP1O14773 563 aa8.93□□□□□ -0.98
PDE4D-201ENST00000309641 NDUFS3O75489 264 aa8.93□□□□□ -0.98
PDE4D-201ENST00000309641 HAUS5O94927 633 aa8.93□□□□□ -0.98
PDE4D-201ENST00000309641 C1QAP02745 245 aa8.93□□□□□ -0.98
PDE4D-201ENST00000309641 FAM153BP0C7A2 387 aa8.93□□□□□ -0.98
PDE4D-201ENST00000309641 RALBP11234 206 aa8.93□□□□□ -0.98
PDE4D-201ENST00000309641 PMLP29590 882 aa8.93□□□□□ -0.98
PDE4D-201ENST00000309641 TTPAP49638 278 aa8.93□□□□□ -0.98
PDE4D-201ENST00000309641 PGGT1BP53609 377 aa8.93□□□□□ -0.98
PDE4D-201ENST00000309641 EIF3BP55884 814 aaKnown RBP8.93□□□□□ -0.98
PDE4D-201ENST00000309641 MAZP56270 477 aaKnown RBP8.93□□□□□ -0.98
PDE4D-201ENST00000309641 THOC5Q13769 683 aaKnown RBP8.93□□□□□ -0.98
PDE4D-201ENST00000309641 LRP8Q14114 963 aa8.93□□□□□ -0.98
PDE4D-201ENST00000309641 ITIH4Q14624 930 aa8.93□□□□□ -0.98
PDE4D-201ENST00000309641 BRD3Q15059 726 aa8.93□□□□□ -0.98
PDE4D-201ENST00000309641 FAM153CQ494X1 144 aa8.93□□□□□ -0.98
PDE4D-201ENST00000309641 BCL7AQ4VC05 210 aa8.93□□□□□ -0.98
PDE4D-201ENST00000309641 CTSL3PQ5NE16 218 aa8.93□□□□□ -0.98
PDE4D-201ENST00000309641 TEDDM1Q5T9Z0 273 aa8.93□□□□□ -0.98
PDE4D-201ENST00000309641 ARMC3Q5W041 872 aa8.93□□□□□ -0.98
PDE4D-201ENST00000309641 MRNIPQ6NTE8 343 aa8.93□□□□□ -0.98
PDE4D-201ENST00000309641 ZCCHC8Q6NZY4 707 aaKnown RBP8.93□□□□□ -0.98
PDE4D-201ENST00000309641 GUSBP11Q6P575 273 aa8.93□□□□□ -0.98
PDE4D-201ENST00000309641 CERS6Q6ZMG9 384 aa8.93□□□□□ -0.98
PDE4D-201ENST00000309641 AMZ2Q86W34 360 aa8.93□□□□□ -0.98
PDE4D-201ENST00000309641 LPGAT1Q92604 370 aa8.93□□□□□ -0.98
PDE4D-201ENST00000309641 CNDP2Q96KP4 475 aaKnown RBP8.93□□□□□ -0.98
PDE4D-201ENST00000309641 FMO2Q99518 471 aa8.93□□□□□ -0.98
PDE4D-201ENST00000309641 P2RY12Q9H244 342 aa8.93□□□□□ -0.98
PDE4D-201ENST00000309641 LRRC4CQ9HCJ2 640 aa8.93□□□□□ -0.98
PDE4D-201ENST00000309641 PPANQ9NQ55 473 aaKnown RBP8.93□□□□□ -0.98
PDE4D-201ENST00000309641 MOCS1Q9NZB8 636 aa8.93□□□□□ -0.98
PDE4D-201ENST00000309641 GALPQ9UBC7 116 aa8.93□□□□□ -0.98
PDE4D-201ENST00000309641 FBXO5Q9UKT4 447 aa8.93□□□□□ -0.98
PDE4D-201ENST00000309641 FREM2Q5SZK8 3169 aa8.93□□□□□ -0.98
PDE4D-201ENST00000309641 MGAT4DA6NG13 374 aa8.93□□□□□ -0.98
PDE4D-201ENST00000309641 CXorf49A8MYA2 514 aaPredicted RBP8.93□□□□□ -0.98
PDE4D-201ENST00000309641 PRMT5O14744 637 aaPredicted RBP8.93□□□□□ -0.98
PDE4D-201ENST00000309641 NDC80O14777 642 aa8.93□□□□□ -0.98
PDE4D-201ENST00000309641 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP8.93□□□□□ -0.98
PDE4D-201ENST00000309641 NIPSNAP2O75323 286 aa8.93□□□□□ -0.98
PDE4D-201ENST00000309641 SLU7O95391 586 aaKnown RBP8.93□□□□□ -0.98
PDE4D-201ENST00000309641 PDHA2P29803 388 aa8.93□□□□□ -0.98
PDE4D-201ENST00000309641 FMO4P31512 558 aa8.93□□□□□ -0.98
PDE4D-201ENST00000309641 PREPP48147 710 aa8.93□□□□□ -0.98
PDE4D-201ENST00000309641 NOVA1P51513 510 aaKnown RBP8.93□□□□□ -0.98
PDE4D-201ENST00000309641 CSE1LP55060 971 aaKnown RBP8.93□□□□□ -0.98
PDE4D-201ENST00000309641 CLDN6P56747 220 aa8.93□□□□□ -0.98
PDE4D-201ENST00000309641 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP8.93□□□□□ -0.98
PDE4D-201ENST00000309641 CLCA4Q14CN2 919 aa8.93□□□□□ -0.98
PDE4D-201ENST00000309641 TRIP6Q15654 476 aaKnown RBP8.93□□□□□ -0.98
PDE4D-201ENST00000309641 KYNUQ16719 465 aa8.93□□□□□ -0.98
PDE4D-201ENST00000309641 CCDC157Q569K6 752 aa8.93□□□□□ -0.98
PDE4D-201ENST00000309641 ZNF549Q6P9A3 640 aa8.93□□□□□ -0.98
PDE4D-201ENST00000309641 C3orf62Q6ZUJ4 267 aa8.93□□□□□ -0.98
PDE4D-201ENST00000309641 SDCCAG8Q86SQ7 713 aaPredicted RBP8.93□□□□□ -0.98
PDE4D-201ENST00000309641 CFAP206Q8IYR0 622 aa8.93□□□□□ -0.98
PDE4D-201ENST00000309641 GPR156Q8NFN8 814 aa8.93□□□□□ -0.98
PDE4D-201ENST00000309641 GSDMBQ8TAX9 411 aa8.93□□□□□ -0.98
PDE4D-201ENST00000309641 SLC37A2Q8TED4 501 aa8.93□□□□□ -0.98
PDE4D-201ENST00000309641 ZDHHC1Q8WTX9 485 aa8.93□□□□□ -0.98
PDE4D-201ENST00000309641 ZNF514Q96K75 400 aaPredicted RBP8.93□□□□□ -0.98
PDE4D-201ENST00000309641 LINC00615Q96LM1 132 aaPredicted RBP8.93□□□□□ -0.98
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 64.7 ms