RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284957.9

RABGEF1-201, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RABGEF1, Length 3,733 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-201ENST00000284957 BIRC2Q13490 618 aa9.21□□□□□ -0.94
RABGEF1-201ENST00000284957 PPP1R3AQ16821 1122 aa9.21□□□□□ -0.94
RABGEF1-201ENST00000284957 ZNF284Q2VY69 593 aa9.21□□□□□ -0.94
RABGEF1-201ENST00000284957 CFAP157Q5JU67 520 aa9.21□□□□□ -0.94
RABGEF1-201ENST00000284957 RALGPS2Q86X27 583 aaPredicted RBP9.21□□□□□ -0.94
RABGEF1-201ENST00000284957 DLG3Q92796 817 aa9.21□□□□□ -0.94
RABGEF1-201ENST00000284957 SIKE1Q9BRV8 207 aa9.21□□□□□ -0.94
RABGEF1-201ENST00000284957 NMUR2Q9GZQ4 415 aa9.21□□□□□ -0.94
RABGEF1-201ENST00000284957 ADAMTS6Q9UKP5 1117 aa9.21□□□□□ -0.94
RABGEF1-201ENST00000284957 NARSO43776 548 aaKnown RBP9.2□□□□□ -0.94
RABGEF1-201ENST00000284957 SMIM24O75264 130 aa9.2□□□□□ -0.94
RABGEF1-201ENST00000284957 TSPAN8P19075 237 aa9.2□□□□□ -0.94
RABGEF1-201ENST00000284957 AOAHP28039 575 aa9.2□□□□□ -0.94
RABGEF1-201ENST00000284957 AKT1P31749 480 aa9.2□□□□□ -0.94
RABGEF1-201ENST00000284957 SERPINB5P36952 375 aa9.2□□□□□ -0.94
RABGEF1-201ENST00000284957 GBX1Q14549 363 aa9.2□□□□□ -0.94
RABGEF1-201ENST00000284957 TGFBIQ15582 683 aa9.2□□□□□ -0.94
RABGEF1-201ENST00000284957 FAM46CQ5VWP2 391 aa9.2□□□□□ -0.94
RABGEF1-201ENST00000284957 EPGNQ6UW88 154 aa9.2□□□□□ -0.94
RABGEF1-201ENST00000284957 BEND7Q8N7W2 519 aaPredicted RBP9.2□□□□□ -0.94
RABGEF1-201ENST00000284957 RAB7BQ96AH8 199 aa9.2□□□□□ -0.94
RABGEF1-201ENST00000284957 NSUN5Q96P11 429 aaKnown RBP9.2□□□□□ -0.94
RABGEF1-201ENST00000284957 WWP1Q9H0M0 922 aa9.2□□□□□ -0.94
RABGEF1-201ENST00000284957 ASB1Q9Y576 335 aa9.2□□□□□ -0.94
RABGEF1-201ENST00000284957 CAPN7Q9Y6W3 813 aa9.2□□□□□ -0.94
RABGEF1-201ENST00000284957 NCF1BA6NI72 391 aaPredicted RBP9.2□□□□□ -0.94
RABGEF1-201ENST00000284957 NCF1CA8MVU1 366 aaPredicted RBP9.2□□□□□ -0.94
RABGEF1-201ENST00000284957 SUPT3HB4E1H0 165 aa9.2□□□□□ -0.94
RABGEF1-201ENST00000284957 NEMP1O14524 444 aa9.2□□□□□ -0.94
RABGEF1-201ENST00000284957 INPP4BO15327 924 aa9.2□□□□□ -0.94
RABGEF1-201ENST00000284957 SUPT3HO75486 399 aa9.2□□□□□ -0.94
RABGEF1-201ENST00000284957 SUPT7LO94864 414 aa9.2□□□□□ -0.94
RABGEF1-201ENST00000284957 T-ENOLP0DO92 83 aa9.2□□□□□ -0.94
RABGEF1-201ENST00000284957 NCF1P14598 390 aaPredicted RBP9.2□□□□□ -0.94
RABGEF1-201ENST00000284957 COL9A1P20849 921 aa9.2□□□□□ -0.94
RABGEF1-201ENST00000284957 NTSR1P30989 418 aa9.2□□□□□ -0.94
RABGEF1-201ENST00000284957 HNRNPH1P31943 449 aaKnown RBP9.2□□□□□ -0.94
RABGEF1-201ENST00000284957 SCTRP47872 440 aa9.2□□□□□ -0.94
RABGEF1-201ENST00000284957 AGTR2P50052 363 aa9.2□□□□□ -0.94
RABGEF1-201ENST00000284957 CDH13P55290 713 aa9.2□□□□□ -0.94
RABGEF1-201ENST00000284957 RPS14P62263 151 aaKnown RBP9.2□□□□□ -0.94
RABGEF1-201ENST00000284957 SLC9B1Q4ZJI4 515 aa9.2□□□□□ -0.94
RABGEF1-201ENST00000284957 GBP7Q8N8V2 638 aaPredicted RBP9.2□□□□□ -0.94
RABGEF1-201ENST00000284957 RASGEF1AQ8N9B8 481 aa9.2□□□□□ -0.94
RABGEF1-201ENST00000284957 NUS1Q96E22 293 aa9.2□□□□□ -0.94
RABGEF1-201ENST00000284957 SLC6A17Q9H1V8 727 aa9.2□□□□□ -0.94
RABGEF1-201ENST00000284957 DNAJC28Q9NX36 388 aa9.2□□□□□ -0.94
RABGEF1-201ENST00000284957 UTP6Q9NYH9 597 aaKnown RBP9.2□□□□□ -0.94
RABGEF1-201ENST00000284957 OR2AG2A6NM03 316 aa9.2□□□□□ -0.94
RABGEF1-201ENST00000284957 SKAP2O75563 359 aaPredicted RBP9.2□□□□□ -0.94
RABGEF1-201ENST00000284957 OR56A5P0C7T3 313 aa9.2□□□□□ -0.94
RABGEF1-201ENST00000284957 GFAPP14136 432 aa9.2□□□□□ -0.94
RABGEF1-201ENST00000284957 DGKAP23743 735 aa9.2□□□□□ -0.94
RABGEF1-201ENST00000284957 CTSCP53634 463 aa9.2□□□□□ -0.94
RABGEF1-201ENST00000284957 DPTQ07507 201 aa9.2□□□□□ -0.94
RABGEF1-201ENST00000284957 ACTN3Q08043 901 aaPredicted RBP9.2□□□□□ -0.94
RABGEF1-201ENST00000284957 GALNT1Q10472 559 aaPredicted RBP9.2□□□□□ -0.94
RABGEF1-201ENST00000284957 SETDB1Q15047 1291 aa9.2□□□□□ -0.94
RABGEF1-201ENST00000284957 RAB11FIP1Q6WKZ4 1283 aaPredicted RBP9.2□□□□□ -0.94
RABGEF1-201ENST00000284957 ZNF765Q7L2R6 523 aa9.2□□□□□ -0.94
RABGEF1-201ENST00000284957 GPSM1Q86YR5 675 aa9.2□□□□□ -0.94
RABGEF1-201ENST00000284957 VRK3Q8IV63 474 aa9.2□□□□□ -0.94
RABGEF1-201ENST00000284957 FBXO39Q8N4B4 442 aa9.2□□□□□ -0.94
RABGEF1-201ENST00000284957 PANX3Q96QZ0 392 aa9.2□□□□□ -0.94
RABGEF1-201ENST00000284957 KLHL42Q9P2K6 505 aa9.2□□□□□ -0.94
RABGEF1-201ENST00000284957 ZFP69BQ9UJL9 534 aa9.2□□□□□ -0.94
RABGEF1-201ENST00000284957 CDYLQ9Y232 598 aa9.2□□□□□ -0.94
RABGEF1-201ENST00000284957 A0A1B0GTL3 188 aa9.19□□□□□ -0.94
RABGEF1-201ENST00000284957 A0A1W2PP55 124 aa9.19□□□□□ -0.94
RABGEF1-201ENST00000284957 CCDC189A1A4V9 331 aa9.19□□□□□ -0.94
RABGEF1-201ENST00000284957 TMEM202A6NGA9 273 aa9.19□□□□□ -0.94
RABGEF1-201ENST00000284957 SYCE1LA8MT33 242 aa9.19□□□□□ -0.94
RABGEF1-201ENST00000284957 SYNCRIPO60506 623 aaKnown RBP9.19□□□□□ -0.94
RABGEF1-201ENST00000284957 MAGEC1O60732 1142 aa9.19□□□□□ -0.94
RABGEF1-201ENST00000284957 C5AR1P21730 350 aa9.19□□□□□ -0.94
RABGEF1-201ENST00000284957 PHKG1Q16816 387 aa9.19□□□□□ -0.94
RABGEF1-201ENST00000284957 SH2D4BQ5SQS7 431 aa9.19□□□□□ -0.94
RABGEF1-201ENST00000284957 ESAMQ96AP7 390 aa9.19□□□□□ -0.94
RABGEF1-201ENST00000284957 DCUN1D1Q96GG9 259 aa9.19□□□□□ -0.94
RABGEF1-201ENST00000284957 PHF7Q9BWX1 381 aaPredicted RBP9.19□□□□□ -0.94
RABGEF1-201ENST00000284957 C1QTNF3Q9BXJ4 246 aa9.19□□□□□ -0.94
RABGEF1-201ENST00000284957 KCTD5Q9NXV2 234 aa9.19□□□□□ -0.94
RABGEF1-201ENST00000284957 EPB41L3Q9Y2J2 1087 aaPredicted RBP9.19□□□□□ -0.94
RABGEF1-201ENST00000284957 FCHO1O14526 889 aa9.19□□□□□ -0.94
RABGEF1-201ENST00000284957 HDAC3O15379 428 aa9.19□□□□□ -0.94
RABGEF1-201ENST00000284957 LZTS3O60299 673 aaPredicted RBP9.19□□□□□ -0.94
RABGEF1-201ENST00000284957 MSH3P20585 1137 aa9.19□□□□□ -0.94
RABGEF1-201ENST00000284957 EEF1DP29692 281 aaKnown RBP9.19□□□□□ -0.94
RABGEF1-201ENST00000284957 SH3BP2P78314 561 aa9.19□□□□□ -0.94
RABGEF1-201ENST00000284957 TMEM115Q12893 351 aaPredicted RBP9.19□□□□□ -0.94
RABGEF1-201ENST00000284957 LDLRAP1Q5SW96 308 aa9.19□□□□□ -0.94
RABGEF1-201ENST00000284957 CUZD1Q86UP6 607 aa9.19□□□□□ -0.94
RABGEF1-201ENST00000284957 TRIM74Q86UV6 250 aa9.19□□□□□ -0.94
RABGEF1-201ENST00000284957 NLRP8Q86W28 1048 aa9.19□□□□□ -0.94
RABGEF1-201ENST00000284957 HDDC3Q8N4P3 179 aa9.19□□□□□ -0.94
RABGEF1-201ENST00000284957 PLA2G15Q8NCC3 412 aa9.19□□□□□ -0.94
RABGEF1-201ENST00000284957 OR2T3Q8NH03 318 aa9.19□□□□□ -0.94
RABGEF1-201ENST00000284957 STN1Q9H668 368 aaKnown RBP9.19□□□□□ -0.94
RABGEF1-201ENST00000284957 ZBTB26Q9HCK0 441 aa9.19□□□□□ -0.94
RABGEF1-201ENST00000284957 ARMCX1Q9P291 453 aa9.19□□□□□ -0.94
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.2 ms