RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000283875.5

GTF2E1-201, Transcript of general transcription factor IIE subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GTF2E1, Length 3,012 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E1-201ENST00000283875 CYB5R1Q9UHQ9 305 aa7.3□□□□□ -1.24
GTF2E1-201ENST00000283875 RAPGEFL1Q9UHV5 662 aa7.3□□□□□ -1.24
GTF2E1-201ENST00000283875 STAP1Q9ULZ2 295 aa7.3□□□□□ -1.24
GTF2E1-201ENST00000283875 SNX6Q9UNH7 406 aa7.3□□□□□ -1.24
GTF2E1-201ENST00000283875 LIPT1Q9Y234 373 aa7.3□□□□□ -1.24
GTF2E1-201ENST00000283875 RAP2CQ9Y3L5 183 aa7.3□□□□□ -1.24
GTF2E1-201ENST00000283875 SLC1A7O00341 560 aa7.3□□□□□ -1.24
GTF2E1-201ENST00000283875 DSCR3O14972 297 aa7.3□□□□□ -1.24
GTF2E1-201ENST00000283875 AKR7A2O43488 359 aa7.3□□□□□ -1.24
GTF2E1-201ENST00000283875 HS6ST1O60243 411 aa7.3□□□□□ -1.24
GTF2E1-201ENST00000283875 PRPSAP2O60256 369 aa7.3□□□□□ -1.24
GTF2E1-201ENST00000283875 MED26O95402 600 aa7.3□□□□□ -1.24
GTF2E1-201ENST00000283875 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
GTF2E1-201ENST00000283875 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
GTF2E1-201ENST00000283875 HNF4AP41235 474 aa7.3□□□□□ -1.24
GTF2E1-201ENST00000283875 CLK2P49760 499 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
GTF2E1-201ENST00000283875 MEOX2P50222 304 aa7.3□□□□□ -1.24
GTF2E1-201ENST00000283875 MAP2K6P52564 334 aa7.3□□□□□ -1.24
GTF2E1-201ENST00000283875 RPP38P78345 283 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
GTF2E1-201ENST00000283875 VGLL4Q14135 290 aa7.3□□□□□ -1.24
GTF2E1-201ENST00000283875 DPYSL3Q14195 570 aa7.3□□□□□ -1.24
GTF2E1-201ENST00000283875 CTU2Q2VPK5 515 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
GTF2E1-201ENST00000283875 PRR16Q569H4 304 aa7.3□□□□□ -1.24
GTF2E1-201ENST00000283875 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
GTF2E1-201ENST00000283875 LRFN4Q6PJG9 635 aa7.3□□□□□ -1.24
GTF2E1-201ENST00000283875 PADI6Q6TGC4 694 aa7.3□□□□□ -1.24
GTF2E1-201ENST00000283875 CYP2R1Q6VVX0 501 aa7.3□□□□□ -1.24
GTF2E1-201ENST00000283875 CFAP77Q6ZQR2 320 aa7.3□□□□□ -1.24
GTF2E1-201ENST00000283875 ARHGAP36Q6ZRI8 547 aa7.3□□□□□ -1.24
GTF2E1-201ENST00000283875 OVCH2Q7RTZ1 564 aa7.3□□□□□ -1.24
GTF2E1-201ENST00000283875 C8orf59Q8N0T1 100 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
GTF2E1-201ENST00000283875 YIPF7Q8N8F6 280 aa7.3□□□□□ -1.24
GTF2E1-201ENST00000283875 OR4D10Q8NGI6 311 aa7.3□□□□□ -1.24
GTF2E1-201ENST00000283875 AKAP1Q92667 903 aaKnown RBP eCLIP7.3□□□□□ -1.24
GTF2E1-201ENST00000283875 PDLIM5Q96HC4 596 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
GTF2E1-201ENST00000283875 SIGLEC11Q96RL6 698 aa7.3□□□□□ -1.24
GTF2E1-201ENST00000283875 BCL2L14Q9BZR8 327 aa7.3□□□□□ -1.24
GTF2E1-201ENST00000283875 DUSP21Q9H596 190 aa7.3□□□□□ -1.24
GTF2E1-201ENST00000283875 KAT8Q9H7Z6 458 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
GTF2E1-201ENST00000283875 HEXA-AS1Q9H8Q6 139 aa7.3□□□□□ -1.24
GTF2E1-201ENST00000283875 LRRC4Q9HBW1 653 aa7.3□□□□□ -1.24
GTF2E1-201ENST00000283875 MED9Q9NWA0 146 aa7.3□□□□□ -1.24
GTF2E1-201ENST00000283875 ZFR2Q9UPR6 939 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
GTF2E1-201ENST00000283875 PCDHB3Q9Y5E6 796 aa7.3□□□□□ -1.24
GTF2E1-201ENST00000283875 SNX5Q9Y5X3 404 aa7.3□□□□□ -1.24
GTF2E1-201ENST00000283875 PEX16Q9Y5Y5 336 aa7.3□□□□□ -1.24
GTF2E1-201ENST00000283875 CIB4A0PJX0 185 aa7.3□□□□□ -1.24
GTF2E1-201ENST00000283875 PMS2P1A4D2B8 440 aa7.3□□□□□ -1.24
GTF2E1-201ENST00000283875 MROH6A6NGR9 719 aa7.3□□□□□ -1.24
GTF2E1-201ENST00000283875 OR6C70A6NIJ9 312 aa7.3□□□□□ -1.24
GTF2E1-201ENST00000283875 UPK1AO00322 258 aa7.3□□□□□ -1.24
GTF2E1-201ENST00000283875 CYP11A1P05108 521 aa7.3□□□□□ -1.24
GTF2E1-201ENST00000283875 UMPSP11172 480 aa7.3□□□□□ -1.24
GTF2E1-201ENST00000283875 DCDC1P59894 354 aa7.3□□□□□ -1.24
GTF2E1-201ENST00000283875 EPS8Q12929 822 aa7.3□□□□□ -1.24
GTF2E1-201ENST00000283875 ZNF169Q14929 603 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
GTF2E1-201ENST00000283875 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP7.3□□□□□ -1.24
GTF2E1-201ENST00000283875 BTBD16Q32M84 506 aa7.3□□□□□ -1.24
GTF2E1-201ENST00000283875 TTC23Q5W5X9 447 aa7.3□□□□□ -1.24
GTF2E1-201ENST00000283875 REP15Q6BDI9 236 aa7.3□□□□□ -1.24
GTF2E1-201ENST00000283875 FAM109BQ6ICB4 259 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
GTF2E1-201ENST00000283875 OR5T2Q8NGG2 359 aa7.3□□□□□ -1.24
GTF2E1-201ENST00000283875 OR52N1Q8NH53 320 aa7.3□□□□□ -1.24
GTF2E1-201ENST00000283875 GANCQ8TET4 914 aa7.3□□□□□ -1.24
GTF2E1-201ENST00000283875 ROPN1LQ96C74 230 aa7.3□□□□□ -1.24
GTF2E1-201ENST00000283875 MOGAT1Q96PD6 335 aa7.3□□□□□ -1.24
GTF2E1-201ENST00000283875 MNTQ99583 582 aa7.3□□□□□ -1.24
GTF2E1-201ENST00000283875 MLPHQ9BV36 600 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
GTF2E1-201ENST00000283875 CINPQ9BW66 212 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
GTF2E1-201ENST00000283875 ING2Q9H160 280 aa7.3□□□□□ -1.24
GTF2E1-201ENST00000283875 MIR1-1HGQ9H1L0 117 aa7.3□□□□□ -1.24
GTF2E1-201ENST00000283875 SOX17Q9H6I2 414 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
GTF2E1-201ENST00000283875 BRD9Q9H8M2 597 aa7.3□□□□□ -1.24
GTF2E1-201ENST00000283875 CYP3A43Q9HB55 503 aa7.3□□□□□ -1.24
GTF2E1-201ENST00000283875 AGPAT3Q9NRZ7 376 aa7.3□□□□□ -1.24
GTF2E1-201ENST00000283875 RAB20Q9NX57 234 aa7.3□□□□□ -1.24
GTF2E1-201ENST00000283875 ATP6AP2A0A1C7CYW4 349 aa7.29□□□□□ -1.24
GTF2E1-201ENST00000283875 TMEM150BA6NC51 233 aa7.29□□□□□ -1.24
GTF2E1-201ENST00000283875 LACTBL1A8MY62 500 aa7.29□□□□□ -1.24
GTF2E1-201ENST00000283875 G3V2L1 256 aa7.29□□□□□ -1.24
GTF2E1-201ENST00000283875 ZBTB39O15060 712 aa7.29□□□□□ -1.24
GTF2E1-201ENST00000283875 PSIP1O75475 530 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
GTF2E1-201ENST00000283875 SOAT2O75908 522 aa7.29□□□□□ -1.24
GTF2E1-201ENST00000283875 POP4O95707 220 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
GTF2E1-201ENST00000283875 ITGAMP11215 1152 aa7.29□□□□□ -1.24
GTF2E1-201ENST00000283875 SRCP12931 536 aa7.29□□□□□ -1.24
GTF2E1-201ENST00000283875 TCF4P15884 667 aa7.29□□□□□ -1.24
GTF2E1-201ENST00000283875 RYKP34925 604 aa7.29□□□□□ -1.24
GTF2E1-201ENST00000283875 ARSFP54793 590 aa7.29□□□□□ -1.24
GTF2E1-201ENST00000283875 ISL1P61371 349 aa7.29□□□□□ -1.24
GTF2E1-201ENST00000283875 RPS6P62753 249 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
GTF2E1-201ENST00000283875 SPIRE1Q08AE8 756 aa7.29□□□□□ -1.24
GTF2E1-201ENST00000283875 CSTF3Q12996 717 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
GTF2E1-201ENST00000283875 TRAF3Q13114 568 aa7.29□□□□□ -1.24
GTF2E1-201ENST00000283875 MTM1Q13496 603 aa7.29□□□□□ -1.24
GTF2E1-201ENST00000283875 TAB1Q15750 504 aa7.29□□□□□ -1.24
GTF2E1-201ENST00000283875 MPP7Q5T2T1 576 aa7.29□□□□□ -1.24
GTF2E1-201ENST00000283875 EFL1Q7Z2Z2 1120 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
GTF2E1-201ENST00000283875 FAM160B2Q86V87 743 aa7.29□□□□□ -1.24
GTF2E1-201ENST00000283875 COMMD7Q86VX2 200 aa7.29□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.2 ms