RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000258341.4

LAMC1-201, Transcript of laminin subunit gamma 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LAMC1, Length 7,889 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC1-201ENST00000258341 SLC25A25Q6KCM7 469 aa16.28■□□□□ 0.2
LAMC1-201ENST00000258341 MED27Q6P2C8 311 aa16.28■□□□□ 0.2
LAMC1-201ENST00000258341 ZNF527Q8NB42 609 aa16.28■□□□□ 0.2
LAMC1-201ENST00000258341 MRPL45Q9BRJ2 306 aaKnown RBP16.28■□□□□ 0.2
LAMC1-201ENST00000258341 TBC1D10AQ9BXI6 508 aa16.28■□□□□ 0.2
LAMC1-201ENST00000258341 DIP2BQ9P265 1576 aa16.28■□□□□ 0.2
LAMC1-201ENST00000258341 NUP205Q92621 2012 aa16.28■□□□□ 0.2
LAMC1-201ENST00000258341 CDH4P55283 916 aa16.28■□□□□ 0.2
LAMC1-201ENST00000258341 DLG2Q15700 870 aa16.28■□□□□ 0.2
LAMC1-201ENST00000258341 INO80EQ8NBZ0 244 aaPredicted RBP16.28■□□□□ 0.2
LAMC1-201ENST00000258341 GIPC3Q8TF64 312 aa16.28■□□□□ 0.2
LAMC1-201ENST00000258341 DIRAS2Q96HU8 199 aa16.28■□□□□ 0.2
LAMC1-201ENST00000258341 CHIAQ9BZP6 476 aa16.28■□□□□ 0.2
LAMC1-201ENST00000258341 ACP6Q9NPH0 428 aa16.28■□□□□ 0.2
LAMC1-201ENST00000258341 RAI2Q9Y5P3 530 aa16.28■□□□□ 0.2
LAMC1-201ENST00000258341 CAPN14A8MX76 684 aa16.28■□□□□ 0.2
LAMC1-201ENST00000258341 L7N2F9 121 aa16.28■□□□□ 0.2
LAMC1-201ENST00000258341 TNFRSF11BO00300 401 aa16.28■□□□□ 0.2
LAMC1-201ENST00000258341 NOL4O94818 638 aa16.28■□□□□ 0.2
LAMC1-201ENST00000258341 ICAM3P32942 547 aa16.28■□□□□ 0.2
LAMC1-201ENST00000258341 VAMP2P63027 116 aa16.28■□□□□ 0.2
LAMC1-201ENST00000258341 SMG7Q92540 1137 aaKnown RBP16.28■□□□□ 0.2
LAMC1-201ENST00000258341 GTPBP3Q969Y2 492 aaKnown RBP16.28■□□□□ 0.2
LAMC1-201ENST00000258341 HOPXQ9BPY8 73 aaPredicted RBP16.28■□□□□ 0.2
LAMC1-201ENST00000258341 METTL8Q9H825 291 aaKnown RBP16.28■□□□□ 0.2
LAMC1-201ENST00000258341 MRPS17Q9Y2R5 130 aaKnown RBP16.28■□□□□ 0.2
LAMC1-201ENST00000258341 TRAPPC6AO75865 159 aa16.28■□□□□ 0.2
LAMC1-201ENST00000258341 LINGO3P0C6S8 592 aa16.28■□□□□ 0.2
LAMC1-201ENST00000258341 OGNP20774 298 aaKnown RBP16.28■□□□□ 0.2
LAMC1-201ENST00000258341 KCNJ5P48544 419 aa16.28■□□□□ 0.2
LAMC1-201ENST00000258341 GTF2H2Q13888 395 aa16.28■□□□□ 0.2
LAMC1-201ENST00000258341 GTF2H2CQ6P1K8 395 aa16.28■□□□□ 0.2
LAMC1-201ENST00000258341 LINGO2Q7L985 606 aa16.28■□□□□ 0.2
LAMC1-201ENST00000258341 KXD1Q9BQD3 176 aa16.28■□□□□ 0.2
LAMC1-201ENST00000258341 B3GALT2O43825 422 aa16.28■□□□□ 0.2
LAMC1-201ENST00000258341 GJB1P08034 283 aa16.28■□□□□ 0.2
LAMC1-201ENST00000258341 SMARCB1Q12824 385 aa16.28■□□□□ 0.2
LAMC1-201ENST00000258341 FAM92BQ6ZTR7 304 aa16.28■□□□□ 0.2
LAMC1-201ENST00000258341 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP16.28■□□□□ 0.2
LAMC1-201ENST00000258341 SRMSQ9H3Y6 488 aa16.28■□□□□ 0.2
LAMC1-201ENST00000258341 IFT52Q9Y366 437 aa16.28■□□□□ 0.2
LAMC1-201ENST00000258341 PLK4O00444 970 aa16.27■□□□□ 0.2
LAMC1-201ENST00000258341 ITIH1P19827 911 aa16.27■□□□□ 0.2
LAMC1-201ENST00000258341 RPIAP49247 311 aa16.27■□□□□ 0.2
LAMC1-201ENST00000258341 AP2S1P53680 142 aaPredicted RBP16.27■□□□□ 0.2
LAMC1-201ENST00000258341 CDK18Q07002 472 aa16.27■□□□□ 0.2
LAMC1-201ENST00000258341 TAF10Q12962 218 aa16.27■□□□□ 0.2
LAMC1-201ENST00000258341 ITGA7Q13683 1181 aa16.27■□□□□ 0.2
LAMC1-201ENST00000258341 POTEHQ6S545 545 aa16.27■□□□□ 0.2
LAMC1-201ENST00000258341 PNLDC1Q8NA58 520 aaKnown RBP16.27■□□□□ 0.2
LAMC1-201ENST00000258341 ZNF398Q8TD17 642 aa16.27■□□□□ 0.2
LAMC1-201ENST00000258341 TCF12Q99081 682 aa16.27■□□□□ 0.2
LAMC1-201ENST00000258341 DPYSL5Q9BPU6 564 aa16.27■□□□□ 0.2
LAMC1-201ENST00000258341 HEBP2Q9Y5Z4 205 aa16.27■□□□□ 0.2
LAMC1-201ENST00000258341 WASHC1A8K0Z3 465 aa16.27■□□□□ 0.2
LAMC1-201ENST00000258341 WASH3PC4AMC7 463 aa16.27■□□□□ 0.2
LAMC1-201ENST00000258341 RENP00797 406 aa16.27■□□□□ 0.2
LAMC1-201ENST00000258341 CAPZA1P52907 286 aa16.27■□□□□ 0.2
LAMC1-201ENST00000258341 LINGO4Q6UY18 593 aa16.27■□□□□ 0.2
LAMC1-201ENST00000258341 WASH2PQ6VEQ5 465 aa16.27■□□□□ 0.2
LAMC1-201ENST00000258341 ADGRA1Q86SQ6 560 aa16.27■□□□□ 0.2
LAMC1-201ENST00000258341 ZBTB2Q8N680 514 aa16.27■□□□□ 0.2
LAMC1-201ENST00000258341 RASSF5Q8WWW0 418 aa16.27■□□□□ 0.2
LAMC1-201ENST00000258341 KLK6Q92876 244 aa16.27■□□□□ 0.2
LAMC1-201ENST00000258341 CDH19Q9H159 772 aa16.27■□□□□ 0.2
LAMC1-201ENST00000258341 HPSEQ9Y251 543 aa16.27■□□□□ 0.2
LAMC1-201ENST00000258341 AKAP8O43823 692 aaKnown RBP16.27■□□□□ 0.2
LAMC1-201ENST00000258341 RPP40O75818 363 aaKnown RBP16.27■□□□□ 0.2
LAMC1-201ENST00000258341 RYKP34925 604 aa16.27■□□□□ 0.2
LAMC1-201ENST00000258341 MLLT3P42568 568 aaPredicted RBP16.27■□□□□ 0.2
LAMC1-201ENST00000258341 MAGEA2P43356 314 aa16.27■□□□□ 0.2
LAMC1-201ENST00000258341 ARNTL2Q8WYA1 636 aa16.27■□□□□ 0.2
LAMC1-201ENST00000258341 APOLD1Q96LR9 279 aa16.27■□□□□ 0.2
LAMC1-201ENST00000258341 TCF7L1Q9HCS4 588 aa16.27■□□□□ 0.2
LAMC1-201ENST00000258341 MIOSQ9NXC5 875 aa16.27■□□□□ 0.2
LAMC1-201ENST00000258341 S100A2P29034 98 aa16.27■□□□□ 0.2
LAMC1-201ENST00000258341 KIR3DL1P43629 444 aa16.27■□□□□ 0.2
LAMC1-201ENST00000258341 GNPDA1P46926 289 aa16.27■□□□□ 0.2
LAMC1-201ENST00000258341 RIN1Q13671 783 aa16.27■□□□□ 0.2
LAMC1-201ENST00000258341 VITQ6UXI7 678 aa16.27■□□□□ 0.2
LAMC1-201ENST00000258341 OR2T12Q8NG77 320 aa16.27■□□□□ 0.2
LAMC1-201ENST00000258341 RFT1Q96AA3 541 aa16.27■□□□□ 0.2
LAMC1-201ENST00000258341 NME6O75414 186 aaPredicted RBP16.27■□□□□ 0.19
LAMC1-201ENST00000258341 NOGQ13253 232 aa16.27■□□□□ 0.19
LAMC1-201ENST00000258341 SPIN3Q5JUX0 258 aa16.27■□□□□ 0.19
LAMC1-201ENST00000258341 CDKAL1Q5VV42 579 aa16.27■□□□□ 0.19
LAMC1-201ENST00000258341 C1orf186Q6ZWK4 172 aa16.27■□□□□ 0.19
LAMC1-201ENST00000258341 ECHDC2Q86YB7 292 aa16.27■□□□□ 0.19
LAMC1-201ENST00000258341 C8orf48Q96LL4 319 aa16.27■□□□□ 0.19
LAMC1-201ENST00000258341 C5orf60A6NFR6 353 aa16.27■□□□□ 0.19
LAMC1-201ENST00000258341 RGS10O43665 173 aa16.27■□□□□ 0.19
LAMC1-201ENST00000258341 CPNE3O75131 537 aaKnown RBP16.27■□□□□ 0.19
LAMC1-201ENST00000258341 FABP3P05413 133 aa16.27■□□□□ 0.19
LAMC1-201ENST00000258341 ATP5A1P25705 553 aaKnown RBP16.27■□□□□ 0.19
LAMC1-201ENST00000258341 OR3A3P47888 321 aa16.27■□□□□ 0.19
LAMC1-201ENST00000258341 OR3A2P47893 321 aa16.27■□□□□ 0.19
LAMC1-201ENST00000258341 CCR3P51677 355 aa16.27■□□□□ 0.19
LAMC1-201ENST00000258341 GK5Q6ZS86 529 aa16.27■□□□□ 0.19
LAMC1-201ENST00000258341 HFE2Q6ZVN8 426 aa16.27■□□□□ 0.19
LAMC1-201ENST00000258341 TBC1D17Q9HA65 648 aa16.27■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.4 ms