RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000236273.8

SYF2-201, Transcript of SYF2 pre-mRNA splicing factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SYF2, Length 1,345 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2-201ENST00000236273 UBE2IP63279 158 aaKnown RBP21.88■■□□□ 1.09
SYF2-201ENST00000236273 PRAMEP78395 509 aa21.88■■□□□ 1.09
SYF2-201ENST00000236273 C2orf54Q08AI8 447 aa21.88■■□□□ 1.09
SYF2-201ENST00000236273 MSS51Q4VC12 460 aa21.88■■□□□ 1.09
SYF2-201ENST00000236273 PACS1Q6VY07 963 aa21.88■■□□□ 1.09
SYF2-201ENST00000236273 LDB1Q86U70 411 aaPredicted RBP21.88■■□□□ 1.09
SYF2-201ENST00000236273 TMEM135Q86UB9 458 aa21.88■■□□□ 1.09
SYF2-201ENST00000236273 HOOK3Q86VS8 718 aa21.88■■□□□ 1.09
SYF2-201ENST00000236273 Q8N9G6 341 aaPredicted RBP21.88■■□□□ 1.09
SYF2-201ENST00000236273 ABCG4Q9H172 646 aa21.88■■□□□ 1.09
SYF2-201ENST00000236273 LRRN3Q9H3W5 708 aa21.88■■□□□ 1.09
SYF2-201ENST00000236273 SARS2Q9NP81 518 aaKnown RBP21.88■■□□□ 1.09
SYF2-201ENST00000236273 CDC23Q9UJX2 597 aa21.88■■□□□ 1.09
SYF2-201ENST00000236273 CLCA2Q9UQC9 943 aa21.88■■□□□ 1.09
SYF2-201ENST00000236273 KIR2DS5A0A0G2JLQ3 304 aa21.87■■□□□ 1.09
SYF2-201ENST00000236273 PRAMEF33A0A0G2JMD5 474 aa21.87■■□□□ 1.09
SYF2-201ENST00000236273 A0A0G2JNG1 304 aa21.87■■□□□ 1.09
SYF2-201ENST00000236273 ZCWPW2A0A1B0GU75 182 aa21.87■■□□□ 1.09
SYF2-201ENST00000236273 FAM237BA0A1B0GVD1 139 aa21.87■■□□□ 1.09
SYF2-201ENST00000236273 OR5K4A6NMS3 321 aa21.87■■□□□ 1.09
SYF2-201ENST00000236273 CFAP99D6REC4 459 aa21.87■■□□□ 1.09
SYF2-201ENST00000236273 KIR2DS3K7RE56 304 aa21.87■■□□□ 1.09
SYF2-201ENST00000236273 XRCC1P18887 633 aaPredicted RBP21.87■■□□□ 1.09
SYF2-201ENST00000236273 IDSP22304 550 aa21.87■■□□□ 1.09
SYF2-201ENST00000236273 OR1D5P58170 312 aa21.87■■□□□ 1.09
SYF2-201ENST00000236273 KIR2DS5Q14953 304 aa21.87■■□□□ 1.09
SYF2-201ENST00000236273 SEPT7Q16181 437 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
SYF2-201ENST00000236273 ANKRD20A4Q4UJ75 823 aa21.87■■□□□ 1.09
SYF2-201ENST00000236273 HIBCHQ6NVY1 386 aaPredicted RBP21.87■■□□□ 1.09
SYF2-201ENST00000236273 TMPRSS9Q7Z410 1059 aa21.87■■□□□ 1.09
SYF2-201ENST00000236273 PCGF5Q86SE9 256 aa21.87■■□□□ 1.09
SYF2-201ENST00000236273 CCNJLQ8IV13 435 aa21.87■■□□□ 1.09
SYF2-201ENST00000236273 PWWP2AQ96N64 755 aa21.87■■□□□ 1.09
SYF2-201ENST00000236273 C17orf113A0A1B0GUU1 675 aa21.86■■□□□ 1.09
SYF2-201ENST00000236273 MAGEB16A2A368 324 aa21.86■■□□□ 1.09
SYF2-201ENST00000236273 RHPN2P1A8MT19 583 aa21.86■■□□□ 1.09
SYF2-201ENST00000236273 CD3EAPO15446 510 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
SYF2-201ENST00000236273 RAD51CO43502 376 aa21.86■■□□□ 1.09
SYF2-201ENST00000236273 AP2A2O94973 939 aa21.86■■□□□ 1.09
SYF2-201ENST00000236273 SEC31AO94979 1220 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
SYF2-201ENST00000236273 VAPBO95292 243 aa21.86■■□□□ 1.09
SYF2-201ENST00000236273 CAPNS1P04632 268 aa21.86■■□□□ 1.09
SYF2-201ENST00000236273 RPLP0P05388 317 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
SYF2-201ENST00000236273 PBLDP30039 288 aaPredicted RBP21.86■■□□□ 1.09
SYF2-201ENST00000236273 NSG1P42857 185 aa21.86■■□□□ 1.09
SYF2-201ENST00000236273 GPR3P46089 330 aa21.86■■□□□ 1.09
SYF2-201ENST00000236273 FASTKD1Q53R41 847 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
SYF2-201ENST00000236273 LYPLAL1Q5VWZ2 237 aa21.86■■□□□ 1.09
SYF2-201ENST00000236273 KIAA0930Q6ICG6 404 aaPredicted RBP21.86■■□□□ 1.09
SYF2-201ENST00000236273 CERS6Q6ZMG9 384 aa21.86■■□□□ 1.09
SYF2-201ENST00000236273 ZNF761Q86XN6 746 aaPredicted RBP21.86■■□□□ 1.09
SYF2-201ENST00000236273 CATSPERZQ9NTU4 200 aa21.86■■□□□ 1.09
SYF2-201ENST00000236273 CPNE7Q9UBL6 633 aa21.86■■□□□ 1.09
SYF2-201ENST00000236273 TPRP12270 2363 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
SYF2-201ENST00000236273 OR52A4PA6NMU1 304 aa21.85■■□□□ 1.09
SYF2-201ENST00000236273 GOLGA8KD6RF30 607 aa21.85■■□□□ 1.09
SYF2-201ENST00000236273 GOLGA8TH3BQL2 631 aa21.85■■□□□ 1.09
SYF2-201ENST00000236273 BANF1O75531 89 aa21.85■■□□□ 1.09
SYF2-201ENST00000236273 TCEA3O75764 348 aa21.85■■□□□ 1.09
SYF2-201ENST00000236273 VCLP18206 1134 aa21.85■■□□□ 1.09
SYF2-201ENST00000236273 CD1CP29017 333 aa21.85■■□□□ 1.09
SYF2-201ENST00000236273 RPL21P46778 160 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
SYF2-201ENST00000236273 HHEXQ03014 270 aa21.85■■□□□ 1.09
SYF2-201ENST00000236273 CFHR1Q03591 330 aa21.85■■□□□ 1.09
SYF2-201ENST00000236273 MORF4L2Q15014 288 aa21.85■■□□□ 1.09
SYF2-201ENST00000236273 ISXQ2M1V0 245 aa21.85■■□□□ 1.09
SYF2-201ENST00000236273 IGDCC3Q8IVU1 814 aa21.85■■□□□ 1.09
SYF2-201ENST00000236273 WDR48Q8TAF3 677 aa21.85■■□□□ 1.09
SYF2-201ENST00000236273 CCM2Q9BSQ5 444 aa21.85■■□□□ 1.09
SYF2-201ENST00000236273 TRIM31Q9BZY9 425 aa21.85■■□□□ 1.09
SYF2-201ENST00000236273 ATXN7L1Q9ULK2 861 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
SYF2-201ENST00000236273 PCDHB1Q9Y5F3 818 aa21.85■■□□□ 1.09
SYF2-201ENST00000236273 FREM2Q5SZK8 3169 aa21.85■■□□□ 1.09
SYF2-201ENST00000236273 KIF26BQ2KJY2 2108 aa21.85■■□□□ 1.09
SYF2-201ENST00000236273 KLHL33A6NCF5 533 aa21.84■■□□□ 1.09
SYF2-201ENST00000236273 PDZK1P1A8MUH7 402 aa21.84■■□□□ 1.09
SYF2-201ENST00000236273 URI1O94763 535 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
SYF2-201ENST00000236273 SLC2A4P14672 509 aa21.84■■□□□ 1.09
SYF2-201ENST00000236273 ALDH4A1P30038 563 aa21.84■■□□□ 1.09
SYF2-201ENST00000236273 ITGA8P53708 1063 aa21.84■■□□□ 1.09
SYF2-201ENST00000236273 DHX9Q08211 1270 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
SYF2-201ENST00000236273 SQSTM1Q13501 440 aa21.84■■□□□ 1.09
SYF2-201ENST00000236273 CASC4Q6P4E1 433 aa21.84■■□□□ 1.09
SYF2-201ENST00000236273 SLC9B2Q86UD5 537 aa21.84■■□□□ 1.09
SYF2-201ENST00000236273 CFAP206Q8IYR0 622 aa21.84■■□□□ 1.09
SYF2-201ENST00000236273 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
SYF2-201ENST00000236273 WDR83Q9BRX9 315 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
SYF2-201ENST00000236273 PLAC1Q9HBJ0 212 aa21.84■■□□□ 1.09
SYF2-201ENST00000236273 IL1RAPL1Q9NZN1 696 aa21.84■■□□□ 1.09
SYF2-201ENST00000236273 PSMD13Q9UNM6 376 aa21.84■■□□□ 1.09
SYF2-201ENST00000236273 SNX24Q9Y343 169 aa21.84■■□□□ 1.09
SYF2-201ENST00000236273 ACACBO00763 2458 aa21.84■■□□□ 1.09
SYF2-201ENST00000236273 IGHV1OR21-1A0A087WYE8 117 aa21.83■■□□□ 1.09
SYF2-201ENST00000236273 A0A1W2PNU3 283 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.09
SYF2-201ENST00000236273 FAM187AA6NFU0 413 aa21.83■■□□□ 1.09
SYF2-201ENST00000236273 EFCAB8A8MWE9 144 aa21.83■■□□□ 1.09
SYF2-201ENST00000236273 C1QTNF9BB2RNN3 333 aa21.83■■□□□ 1.09
SYF2-201ENST00000236273 CSO75390 466 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.09
SYF2-201ENST00000236273 C1QTNF9P0C862 333 aa21.83■■□□□ 1.09
SYF2-201ENST00000236273 RPE65Q16518 533 aa21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.7 ms