RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000233025.11

SPCS1-201, Transcript of signal peptidase complex subunit 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SPCS1, Length 1,082 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPCS1-201ENST00000233025 NUDCD1Q96RS6 583 aa16.05■□□□□ 0.16
SPCS1-201ENST00000233025 WDR24Q96S15 920 aa16.05■□□□□ 0.16
SPCS1-201ENST00000233025 CARD9Q9H257 536 aa16.05■□□□□ 0.16
SPCS1-201ENST00000233025 VPS16Q9H269 839 aa16.05■□□□□ 0.16
SPCS1-201ENST00000233025 NOD2Q9HC29 1040 aa16.05■□□□□ 0.16
SPCS1-201ENST00000233025 MCCC2Q9HCC0 563 aa16.05■□□□□ 0.16
SPCS1-201ENST00000233025 FAM207AQ9NSI2 230 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
SPCS1-201ENST00000233025 PCMTD2Q9NV79 361 aa16.05■□□□□ 0.16
SPCS1-201ENST00000233025 TLCD2A6NGC4 264 aa16.04■□□□□ 0.16
SPCS1-201ENST00000233025 OR52A4PA6NMU1 304 aa16.04■□□□□ 0.16
SPCS1-201ENST00000233025 MASP2O00187 686 aa16.04■□□□□ 0.16
SPCS1-201ENST00000233025 KLF7O75840 302 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
SPCS1-201ENST00000233025 UNGP13051 313 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
SPCS1-201ENST00000233025 ZNF30P17039 623 aa16.04■□□□□ 0.16
SPCS1-201ENST00000233025 ART1P52961 327 aa16.04■□□□□ 0.16
SPCS1-201ENST00000233025 TPI1P60174 286 aa16.04■□□□□ 0.16
SPCS1-201ENST00000233025 HSD11B2P80365 405 aa16.04■□□□□ 0.16
SPCS1-201ENST00000233025 LBRQ14739 615 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
SPCS1-201ENST00000233025 ZNF169Q14929 603 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
SPCS1-201ENST00000233025 SEPT7Q16181 437 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
SPCS1-201ENST00000233025 ZNF324BQ6AW86 544 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
SPCS1-201ENST00000233025 IGFL2Q6UWQ7 119 aa16.04■□□□□ 0.16
SPCS1-201ENST00000233025 RBM43Q6ZSC3 357 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
SPCS1-201ENST00000233025 RBM12BQ8IXT5 1001 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
SPCS1-201ENST00000233025 PGBD5Q8N414 524 aa16.04■□□□□ 0.16
SPCS1-201ENST00000233025 NPWQ8N729 165 aa16.04■□□□□ 0.16
SPCS1-201ENST00000233025 COG1Q8WTW3 980 aa16.04■□□□□ 0.16
SPCS1-201ENST00000233025 PCDHB18PQ96TA0 734 aa16.04■□□□□ 0.16
SPCS1-201ENST00000233025 NLRC4Q9NPP4 1024 aa16.04■□□□□ 0.16
SPCS1-201ENST00000233025 OLAHQ9NV23 265 aa16.04■□□□□ 0.16
SPCS1-201ENST00000233025 SLC23A2Q9UGH3 650 aa16.04■□□□□ 0.16
SPCS1-201ENST00000233025 NBEAL1Q6ZS30 2694 aa16.03■□□□□ 0.16
SPCS1-201ENST00000233025 INTS1Q8N201 2190 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
SPCS1-201ENST00000233025 FAM221AA4D161 298 aa16.03■□□□□ 0.16
SPCS1-201ENST00000233025 PCDH17O14917 1159 aa16.03■□□□□ 0.16
SPCS1-201ENST00000233025 ZNF8P17098 575 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
SPCS1-201ENST00000233025 HTR7P34969 479 aa16.03■□□□□ 0.16
SPCS1-201ENST00000233025 TLE4Q04727 773 aa16.03■□□□□ 0.16
SPCS1-201ENST00000233025 CDC16Q13042 620 aa16.03■□□□□ 0.16
SPCS1-201ENST00000233025 HENMT1Q5T8I9 393 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
SPCS1-201ENST00000233025 FCRL6Q6DN72 434 aa16.03■□□□□ 0.16
SPCS1-201ENST00000233025 FAM180AQ6UWF9 173 aa16.03■□□□□ 0.16
SPCS1-201ENST00000233025 ABRAXAS1Q6UWZ7 409 aa16.03■□□□□ 0.16
SPCS1-201ENST00000233025 TRIM72Q6ZMU5 477 aa16.03■□□□□ 0.16
SPCS1-201ENST00000233025 MGME1Q9BQP7 344 aa16.03■□□□□ 0.16
SPCS1-201ENST00000233025 ATXN10Q9UBB4 475 aa16.03■□□□□ 0.16
SPCS1-201ENST00000233025 NEU2Q9Y3R4 380 aa16.03■□□□□ 0.16
SPCS1-201ENST00000233025 FN1P02751 2386 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.16
SPCS1-201ENST00000233025 TCRBV5S1A1TA0A578 114 aa16.02■□□□□ 0.16
SPCS1-201ENST00000233025 PDZK1P1A8MUH7 402 aa16.02■□□□□ 0.16
SPCS1-201ENST00000233025 DFFAO00273 331 aa16.02■□□□□ 0.16
SPCS1-201ENST00000233025 PDHA1P08559 390 aa16.02■□□□□ 0.16
SPCS1-201ENST00000233025 HSPA9P38646 679 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.16
SPCS1-201ENST00000233025 HADHAP40939 763 aa16.02■□□□□ 0.16
SPCS1-201ENST00000233025 KIR3DL1P43629 444 aa16.02■□□□□ 0.16
SPCS1-201ENST00000233025 ARL4DP49703 201 aa16.02■□□□□ 0.16
SPCS1-201ENST00000233025 PTCHD3Q3KNS1 767 aa16.02■□□□□ 0.16
SPCS1-201ENST00000233025 PLA2G4EQ3MJ16 856 aa16.02■□□□□ 0.16
SPCS1-201ENST00000233025 ZNF789Q5FWF6 425 aa16.02■□□□□ 0.16
SPCS1-201ENST00000233025 ARMC12Q5T9G4 340 aa16.02■□□□□ 0.16
SPCS1-201ENST00000233025 MTFR2Q6P444 385 aa16.02■□□□□ 0.16
SPCS1-201ENST00000233025 BCORP1Q8N888 145 aa16.02■□□□□ 0.16
SPCS1-201ENST00000233025 CLIP3Q96DZ5 547 aa16.02■□□□□ 0.16
SPCS1-201ENST00000233025 CD180Q99467 661 aa16.02■□□□□ 0.16
SPCS1-201ENST00000233025 P4HTMQ9NXG6 502 aa16.02■□□□□ 0.16
SPCS1-201ENST00000233025 PADI2Q9Y2J8 665 aa16.02■□□□□ 0.16
SPCS1-201ENST00000233025 A0A0J9YYE9 177 aa16.01■□□□□ 0.15
SPCS1-201ENST00000233025 TMEM200CA6NKL6 621 aa16.01■□□□□ 0.15
SPCS1-201ENST00000233025 CCL21O00585 134 aa16.01■□□□□ 0.15
SPCS1-201ENST00000233025 CCP110O43303 1012 aa16.01■□□□□ 0.15
SPCS1-201ENST00000233025 FZD6O60353 706 aa16.01■□□□□ 0.15
SPCS1-201ENST00000233025 MTA2O94776 668 aa16.01■□□□□ 0.15
SPCS1-201ENST00000233025 PEX11BO96011 259 aa16.01■□□□□ 0.15
SPCS1-201ENST00000233025 TRBC1P01850 177 aa16.01■□□□□ 0.15
SPCS1-201ENST00000233025 IGHEP01854 428 aa16.01■□□□□ 0.15
SPCS1-201ENST00000233025 GPD1P21695 349 aa16.01■□□□□ 0.15
SPCS1-201ENST00000233025 FECHP22830 423 aa16.01■□□□□ 0.15
SPCS1-201ENST00000233025 EMP3P54852 163 aa16.01■□□□□ 0.15
SPCS1-201ENST00000233025 AIF1P55008 147 aa16.01■□□□□ 0.15
SPCS1-201ENST00000233025 SSPNQ14714 243 aa16.01■□□□□ 0.15
SPCS1-201ENST00000233025 SYCP1Q15431 976 aa16.01■□□□□ 0.15
SPCS1-201ENST00000233025 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
SPCS1-201ENST00000233025 ZNF385CQ66K41 422 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
SPCS1-201ENST00000233025 SCYL2Q6P3W7 929 aa16.01■□□□□ 0.15
SPCS1-201ENST00000233025 MON1BQ7L1V2 547 aa16.01■□□□□ 0.15
SPCS1-201ENST00000233025 PHF13Q86YI8 300 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
SPCS1-201ENST00000233025 RAVER1Q8IY67 606 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
SPCS1-201ENST00000233025 ACBD4Q8NC06 268 aa16.01■□□□□ 0.15
SPCS1-201ENST00000233025 DNAJB14Q8TBM8 379 aa16.01■□□□□ 0.15
SPCS1-201ENST00000233025 CXorf40BQ96DE9 158 aa16.01■□□□□ 0.15
SPCS1-201ENST00000233025 ZNF599Q96NL3 588 aa16.01■□□□□ 0.15
SPCS1-201ENST00000233025 DHRS4Q9BTZ2 278 aa16.01■□□□□ 0.15
SPCS1-201ENST00000233025 FANCLQ9NW38 375 aa16.01■□□□□ 0.15
SPCS1-201ENST00000233025 BTRCQ9Y297 605 aa16.01■□□□□ 0.15
SPCS1-201ENST00000233025 TRGV8A0A0C4DH27 118 aa16■□□□□ 0.15
SPCS1-201ENST00000233025 LGALS16A8MUM7 142 aa16■□□□□ 0.15
SPCS1-201ENST00000233025 CHUKO15111 745 aa16■□□□□ 0.15
SPCS1-201ENST00000233025 LCA5LO95447 670 aa16■□□□□ 0.15
SPCS1-201ENST00000233025 RPL10P27635 214 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
SPCS1-201ENST00000233025 PBX1P40424 430 aa16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.2 ms