RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000232888.6

RRP9-201, Transcript of ribosomal RNA processing 9, U3 small nucleolar RNA binding protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RRP9, Length 1,578 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP9-201ENST00000232888 ANTXRLA6NF34 631 aa23.43■■□□□ 1.34
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RRP9-201ENST00000232888 RAD51BO15315 384 aa23.43■■□□□ 1.34
RRP9-201ENST00000232888 MID1O15344 667 aa23.43■■□□□ 1.34
RRP9-201ENST00000232888 MMP20O60882 483 aa23.43■■□□□ 1.34
RRP9-201ENST00000232888 S100BP04271 92 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
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RRP9-201ENST00000232888 LIMD1Q9UGP4 676 aa23.43■■□□□ 1.34
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RRP9-201ENST00000232888 TNPO3Q9Y5L0 923 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
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RRP9-201ENST00000232888 ACTN3Q08043 901 aaPredicted RBP23.42■■□□□ 1.34
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RRP9-201ENST00000232888 AGERQ15109 404 aa23.42■■□□□ 1.34
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RRP9-201ENST00000232888 AGBL4Q5VU57 503 aa23.42■■□□□ 1.34
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RRP9-201ENST00000232888 CYHR1Q6ZMK1 362 aa23.42■■□□□ 1.34
RRP9-201ENST00000232888 NEK10Q6ZWH5 1172 aa23.42■■□□□ 1.34
RRP9-201ENST00000232888 CUZD1Q86UP6 607 aa23.42■■□□□ 1.34
RRP9-201ENST00000232888 AADATQ8N5Z0 425 aa23.42■■□□□ 1.34
RRP9-201ENST00000232888 SCML1Q9UN30 329 aa23.42■■□□□ 1.34
RRP9-201ENST00000232888 CDH23Q9H251 3354 aa23.42■■□□□ 1.34
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RRP9-201ENST00000232888 FCHO1O14526 889 aa23.41■■□□□ 1.34
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RRP9-201ENST00000232888 MOCOSQ96EN8 888 aa23.41■■□□□ 1.34
RRP9-201ENST00000232888 EBF4Q9BQW3 602 aa23.41■■□□□ 1.34
RRP9-201ENST00000232888 COL4A2P08572 1712 aa23.41■■□□□ 1.34
RRP9-201ENST00000232888 HGSO14964 777 aaPredicted RBP23.4■■□□□ 1.34
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RRP9-201ENST00000232888 DIAPH2O60879 1101 aa23.4■■□□□ 1.34
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RRP9-201ENST00000232888 UNC5CO95185 931 aa23.4■■□□□ 1.34
RRP9-201ENST00000232888 MLYCDO95822 493 aa23.4■■□□□ 1.34
RRP9-201ENST00000232888 SOD1P00441 154 aa23.4■■□□□ 1.34
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RRP9-201ENST00000232888 TM7SF2O76062 418 aa23.39■■□□□ 1.33
RRP9-201ENST00000232888 KLF8O95600 359 aaPredicted RBP23.39■■□□□ 1.33
RRP9-201ENST00000232888 VCLP18206 1134 aa23.39■■□□□ 1.33
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RRP9-201ENST00000232888 PCBP2Q15366 365 aaKnown RBP eCLIP23.39■■□□□ 1.33
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