RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000027404.11

Ptprn-201, Transcript of Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ptprn, Length 3,554 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptprn-201ENSMUST00000027404 NbnQ9R207 751 aa15.91■□□□□ 0.14
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Scamp3O35609 349 aa15.9■□□□□ 0.14
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Hcn1O88704 910 aa15.9■□□□□ 0.14
Ptprn-201ENSMUST00000027404 PthlhP22858 175 aa15.9■□□□□ 0.14
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Psme2P97372 239 aa15.9■□□□□ 0.14
Ptprn-201ENSMUST00000027404 PamP97467 979 aa15.9■□□□□ 0.14
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Hdgfl2Q3UMU9 669 aa15.9■□□□□ 0.14
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Actr3bQ641P0 418 aa15.9■□□□□ 0.14
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Smoc1Q8BLY1 463 aaKnown RBP15.9■□□□□ 0.14
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Hacd3Q8K2C9 362 aa15.9■□□□□ 0.14
Ptprn-201ENSMUST00000027404 BroxQ8K2Q7 411 aa15.9■□□□□ 0.14
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Olfr273Q8VG87 317 aa15.9■□□□□ 0.14
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Znf622Q91VY9 476 aa15.9■□□□□ 0.14
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Pcdhb8Q91XZ2 779 aa15.9■□□□□ 0.14
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Stard13Q923Q2 1113 aa15.9■□□□□ 0.14
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Tomm70Q9CZW5 611 aa15.9■□□□□ 0.14
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Tnfsf13Q9D777 241 aa15.9■□□□□ 0.14
Ptprn-201ENSMUST00000027404 PrebQ9WUQ2 417 aa15.9■□□□□ 0.14
Ptprn-201ENSMUST00000027404 M1apQ9Z0E1 529 aa15.9■□□□□ 0.14
Ptprn-201ENSMUST00000027404 PigfO09101 219 aa15.9■□□□□ 0.14
Ptprn-201ENSMUST00000027404 ThrbP37242 461 aa15.9■□□□□ 0.14
Ptprn-201ENSMUST00000027404 MitfQ08874 526 aa15.9■□□□□ 0.14
Ptprn-201ENSMUST00000027404 IspdQ5RJG7 447 aa15.9■□□□□ 0.14
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Slc13a5Q67BT3 572 aa15.9■□□□□ 0.14
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Olfr1252Q7TQZ2 314 aa15.9■□□□□ 0.14
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Suz12Q80U70 741 aaKnown RBP15.9■□□□□ 0.14
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Syt12Q920N7 421 aa15.9■□□□□ 0.14
Ptprn-201ENSMUST00000027404 DdoQ922Z0 341 aa15.9■□□□□ 0.14
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Mta3Q924K8 591 aa15.9■□□□□ 0.14
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Eif2b2Q99LD9 351 aa15.9■□□□□ 0.14
Ptprn-201ENSMUST00000027404 PgcQ9D7R7 392 aa15.9■□□□□ 0.14
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Cdh17Q9R100 827 aa15.9■□□□□ 0.14
Ptprn-201ENSMUST00000027404 4933424G06RikA0A140LIP3 267 aa15.9■□□□□ 0.14
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Veph1A1A535 833 aa15.9■□□□□ 0.14
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Maml2F6U238 1170 aa15.9■□□□□ 0.14
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Vmn2r46L7N282 809 aa15.9■□□□□ 0.14
Ptprn-201ENSMUST00000027404 NagluO88325 739 aa15.9■□□□□ 0.14
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gria1P23818 907 aa15.9■□□□□ 0.14
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Serpina5P70458 405 aa15.9■□□□□ 0.14
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Dusp2Q05922 318 aa15.9■□□□□ 0.14
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Zyg11bQ3UFS0 744 aa15.9■□□□□ 0.14
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Tmem247Q497K7 211 aa15.9■□□□□ 0.14
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Cpa6Q5U901 438 aa15.9■□□□□ 0.14
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Cdc14bQ6PFY9 485 aa15.9■□□□□ 0.14
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Aoc2Q812C9 757 aa15.9■□□□□ 0.14
Ptprn-201ENSMUST00000027404 TiprlQ8BH58 271 aa15.9■□□□□ 0.14
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Asb2Q8K0L0 634 aa15.9■□□□□ 0.14
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ebf4Q8K4J2 599 aa15.9■□□□□ 0.14
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Lactb2Q99KR3 288 aa15.9■□□□□ 0.14
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Pramel1Q99MW3 458 aa15.9■□□□□ 0.14
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Dnajb4Q9D832 337 aa15.9■□□□□ 0.14
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Aff4Q9ESC8 1160 aa15.9■□□□□ 0.14
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Rfc2Q9WUK4 349 aaKnown RBP15.9■□□□□ 0.14
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Osbpl10S4R1M9 766 aa15.9■□□□□ 0.14
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Pcm1Q9R0L6 2025 aa15.89■□□□□ 0.13
Ptprn-201ENSMUST00000027404 PcntP48725 2898 aa15.89■□□□□ 0.13
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Adh6bA0A1D5RMB0 384 aa15.89■□□□□ 0.13
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Lgr4A2ARI4 951 aa15.89■□□□□ 0.13
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Olfr1200A2ATJ4 336 aa15.89■□□□□ 0.13
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Pate3B3GLJ3 98 aa15.89■□□□□ 0.13
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Zfp563B8JJZ9 448 aa15.89■□□□□ 0.13
Ptprn-201ENSMUST00000027404 HunkO88866 714 aa15.89■□□□□ 0.13
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Klf10O89091 479 aa15.89■□□□□ 0.13
Ptprn-201ENSMUST00000027404 WarsP32921 481 aa15.89■□□□□ 0.13
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Sox2P48432 319 aa15.89■□□□□ 0.13
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Slc30a3P97441 388 aa15.89■□□□□ 0.13
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gpr162Q3UN16 588 aa15.89■□□□□ 0.13
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Fam71bQ5STT6 665 aa15.89■□□□□ 0.13
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Fzd6Q61089 709 aa15.89■□□□□ 0.13
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Dusp11Q6NXK5 321 aaKnown RBP15.89■□□□□ 0.13
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Dlgap3Q6PFD5 977 aa15.89■□□□□ 0.13
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Olfr366Q7TRY4 309 aa15.89■□□□□ 0.13
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Cpped1Q8BFS6 312 aa15.89■□□□□ 0.13
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Slco2b1Q8BXB6 683 aa15.89■□□□□ 0.13
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gucy1b2Q8BXH3 824 aa15.89■□□□□ 0.13
Ptprn-201ENSMUST00000027404 OoepQ9CWE6 164 aa15.89■□□□□ 0.13
Ptprn-201ENSMUST00000027404 VasnQ9CZT5 673 aa15.89■□□□□ 0.13
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Q9D1K7 174 aaKnown RBP15.89■□□□□ 0.13
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Armc1Q9D7A8 282 aa15.89■□□□□ 0.13
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Arhgap36B1AUC7 590 aa15.89■□□□□ 0.13
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gm21897J3KMP5 500 aa15.89■□□□□ 0.13
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gm21750L7N228 499 aa15.89■□□□□ 0.13
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Tnfsf4P43488 198 aa15.89■□□□□ 0.13
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Vsx2Q61412 361 aa15.89■□□□□ 0.13
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Q6P2K3 674 aa15.89■□□□□ 0.13
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Olfr1128Q7TR47 311 aa15.89■□□□□ 0.13
Ptprn-201ENSMUST00000027404 H2-Q4Q8HWB2 354 aa15.89■□□□□ 0.13
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Taf10Q8K0H5 218 aa15.89■□□□□ 0.13
Ptprn-201ENSMUST00000027404 ManbaQ8K2I4 879 aa15.89■□□□□ 0.13
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Q922M7 232 aa15.89■□□□□ 0.13
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Tex13bQ99MW5 186 aa15.89■□□□□ 0.13
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ndufb5Q9CQH3 189 aa15.89■□□□□ 0.13
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Cyb5r1Q9DB73 305 aa15.89■□□□□ 0.13
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Tmprss6Q9DBI0 811 aa15.89■□□□□ 0.13
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Scube2Q9JJS0 997 aa15.89■□□□□ 0.13
Ptprn-201ENSMUST00000027404 CtszQ9WUU7 306 aa15.89■□□□□ 0.13
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Arrdc4A0A0B4J1F4 415 aa15.88■□□□□ 0.13
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gm13040A2A8C4 496 aa15.88■□□□□ 0.13
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gm13101A2ASJ0 481 aa15.88■□□□□ 0.13
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Zmynd12A2BGJ5 363 aa15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 24 ms