RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000639501.1

PMS1-222, Transcript of PMS1 homolog 1, mismatch repair system component, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PMS1, Length 2,506 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS1-222ENST00000639501 PRKACGP22612 351 aa20.29■□□□□ 0.84
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PMS1-222ENST00000639501 RAVER1Q8IY67 606 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
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PMS1-222ENST00000639501 FBXO30Q8TB52 745 aa20.29■□□□□ 0.84
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PMS1-222ENST00000639501 FEM1AQ9BSK4 669 aa20.29■□□□□ 0.84
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PMS1-222ENST00000639501 TRIB2Q92519 343 aa20.28■□□□□ 0.84
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PMS1-222ENST00000639501 C16orf70Q9BSU1 422 aa20.28■□□□□ 0.84
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PMS1-222ENST00000639501 LOC100130705A0A1B0GUX0 176 aa20.26■□□□□ 0.83
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PMS1-222ENST00000639501 ENPP3O14638 875 aa20.26■□□□□ 0.83
PMS1-222ENST00000639501 SLC22A1O15245 554 aa20.26■□□□□ 0.83
PMS1-222ENST00000639501 NCF1P14598 390 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
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