RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000630659.2

BBS1-225, Transcript of Bardet-Biedl syndrome 1, human

TSL 5 BASIC

Gene BBS1, Length 1,934 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BBS1-225	ENST00000630659	SNX15	Q9NRS6	342 aa		15.17	■□□□□ 0.02
BBS1-225	ENST00000630659	AGPAT4	Q9NRZ5	378 aa		15.17	■□□□□ 0.02
BBS1-225	ENST00000630659	COPG1	Q9Y678	874 aa	Known RBP	15.17	■□□□□ 0.02
BBS1-225	ENST00000630659	ZFP37	Q9Y6Q3	630 aa	Predicted RBP	15.17	■□□□□ 0.02
BBS1-225	ENST00000630659	RNF103-CHMP3	A0A140T963	221 aa		15.17	■□□□□ 0.02
BBS1-225	ENST00000630659	ISPD	A4D126	451 aa		15.17	■□□□□ 0.02
BBS1-225	ENST00000630659	PHGDH	O43175	533 aa	Known RBP	15.17	■□□□□ 0.02
BBS1-225	ENST00000630659	TGM5	O43548	720 aa		15.17	■□□□□ 0.02
BBS1-225	ENST00000630659	PMPCB	O75439	489 aa		15.17	■□□□□ 0.02
BBS1-225	ENST00000630659	CXCL14	O95715	111 aa		15.17	■□□□□ 0.02
BBS1-225	ENST00000630659	CKMT2	P17540	419 aa		15.17	■□□□□ 0.02
BBS1-225	ENST00000630659	OPRL1	P41146	370 aa		15.17	■□□□□ 0.02
BBS1-225	ENST00000630659	ATXN3	P54252	364 aa	Predicted RBP	15.17	■□□□□ 0.02
BBS1-225	ENST00000630659	SQLE	Q14534	574 aa		15.17	■□□□□ 0.02
BBS1-225	ENST00000630659	AASDH	Q4L235	1098 aa	Predicted RBP	15.17	■□□□□ 0.02
BBS1-225	ENST00000630659	SMUG1	Q53HV7	270 aa		15.17	■□□□□ 0.02
BBS1-225	ENST00000630659	TMEM240	Q5SV17	173 aa		15.17	■□□□□ 0.02
BBS1-225	ENST00000630659	PRMT9	Q6P2P2	845 aa		15.17	■□□□□ 0.02
BBS1-225	ENST00000630659	C11orf74	Q86VG3	221 aa		15.17	■□□□□ 0.02
BBS1-225	ENST00000630659	LACC1	Q8IV20	430 aa		15.17	■□□□□ 0.02
BBS1-225	ENST00000630659	CPNE9	Q8IYJ1	553 aa		15.17	■□□□□ 0.02
BBS1-225	ENST00000630659	LSM14A	Q8ND56	463 aa	Known RBP	15.17	■□□□□ 0.02
BBS1-225	ENST00000630659	CHAC2	Q8WUX2	184 aa		15.17	■□□□□ 0.02
BBS1-225	ENST00000630659	MAEL	Q96JY0	434 aa	Known RBP	15.17	■□□□□ 0.02
BBS1-225	ENST00000630659	FAR2	Q96K12	515 aa		15.17	■□□□□ 0.02
BBS1-225	ENST00000630659	MRGPRX2	Q96LB1	330 aa		15.17	■□□□□ 0.02
BBS1-225	ENST00000630659	GATA5	Q9BWX5	397 aa	Predicted RBP	15.17	■□□□□ 0.02
BBS1-225	ENST00000630659	MAGEH1	Q9H213	219 aa		15.17	■□□□□ 0.02
BBS1-225	ENST00000630659	MUC13	Q9H3R2	512 aa		15.17	■□□□□ 0.02
BBS1-225	ENST00000630659	WDR55	Q9H6Y2	383 aa	Predicted RBP	15.17	■□□□□ 0.02
BBS1-225	ENST00000630659	MRM3	Q9HC36	420 aa	Known RBP	15.17	■□□□□ 0.02
BBS1-225	ENST00000630659	SMPD3	Q9NY59	655 aa	Predicted RBP	15.17	■□□□□ 0.02
BBS1-225	ENST00000630659	CXXC1	Q9P0U4	656 aa	Predicted RBP	15.17	■□□□□ 0.02
BBS1-225	ENST00000630659	AGO1	Q9UL18	857 aa	Known RBP	15.17	■□□□□ 0.02
BBS1-225	ENST00000630659	ANKRD6	Q9Y2G4	727 aa		15.17	■□□□□ 0.02
BBS1-225	ENST00000630659	ANAPC1	Q9H1A4	1944 aa		15.16	■□□□□ 0.02
BBS1-225	ENST00000630659	ZCWPW2	A0A1B0GU75	182 aa		15.16	■□□□□ 0.02
BBS1-225	ENST00000630659	C16orf96	A6NNT2	1141 aa		15.16	■□□□□ 0.02
BBS1-225	ENST00000630659		E7ENX8	843 aa		15.16	■□□□□ 0.02
BBS1-225	ENST00000630659	NEMP1	O14524	444 aa		15.16	■□□□□ 0.02
BBS1-225	ENST00000630659	PRAMEF11	O60813	436 aa		15.16	■□□□□ 0.02
BBS1-225	ENST00000630659	ABCB7	O75027	752 aa		15.16	■□□□□ 0.02
BBS1-225	ENST00000630659	SRP72	O76094	671 aa	Known RBP	15.16	■□□□□ 0.02
BBS1-225	ENST00000630659	GNAO1	P09471	354 aa		15.16	■□□□□ 0.02
BBS1-225	ENST00000630659	ERVK-10	P10266	1014 aa		15.16	■□□□□ 0.02
BBS1-225	ENST00000630659	TFEB	P19484	476 aa		15.16	■□□□□ 0.02
BBS1-225	ENST00000630659	EN2	P19622	333 aa	Predicted RBP	15.16	■□□□□ 0.02
BBS1-225	ENST00000630659	TCEA1	P23193	301 aa	Known RBP	15.16	■□□□□ 0.02
BBS1-225	ENST00000630659	PSMA4	P25789	261 aa	Known RBP	15.16	■□□□□ 0.02
BBS1-225	ENST00000630659	TPTE	P56180	551 aa		15.16	■□□□□ 0.02
BBS1-225	ENST00000630659	ITK	Q08881	620 aa		15.16	■□□□□ 0.02
BBS1-225	ENST00000630659	DMPK	Q09013	629 aa		15.16	■□□□□ 0.02
BBS1-225	ENST00000630659	BNIP2	Q12982	314 aa		15.16	■□□□□ 0.02
BBS1-225	ENST00000630659	LRP8	Q14114	963 aa		15.16	■□□□□ 0.02
BBS1-225	ENST00000630659	E2F2	Q14209	437 aa		15.16	■□□□□ 0.02
BBS1-225	ENST00000630659	SF3B4	Q15427	424 aa	Known RBP eCLIP	15.16	■□□□□ 0.02
BBS1-225	ENST00000630659	NEDD8	Q15843	81 aa		15.16	■□□□□ 0.02
BBS1-225	ENST00000630659	PCID2	Q5JVF3	399 aa		15.16	■□□□□ 0.02
BBS1-225	ENST00000630659	ADGRF1	Q5T601	910 aa		15.16	■□□□□ 0.02
BBS1-225	ENST00000630659	DENND5A	Q6IQ26	1287 aa		15.16	■□□□□ 0.02
BBS1-225	ENST00000630659	KDELC1	Q6UW63	502 aa		15.16	■□□□□ 0.02
BBS1-225	ENST00000630659	ZYG11A	Q6WRX3	759 aa		15.16	■□□□□ 0.02
BBS1-225	ENST00000630659	USP51	Q70EK9	711 aa		15.16	■□□□□ 0.02
BBS1-225	ENST00000630659	CLEC14A	Q86T13	490 aa		15.16	■□□□□ 0.02
BBS1-225	ENST00000630659	CCDC117	Q8IWD4	279 aa	Predicted RBP	15.16	■□□□□ 0.02
BBS1-225	ENST00000630659	AFAP1L2	Q8N4X5	818 aa		15.16	■□□□□ 0.02
BBS1-225	ENST00000630659	WBP2	Q969T9	261 aa		15.16	■□□□□ 0.02
BBS1-225	ENST00000630659	IMP4	Q96G21	291 aa	Known RBP	15.16	■□□□□ 0.02
BBS1-225	ENST00000630659	MED30	Q96HR3	178 aa		15.16	■□□□□ 0.02
BBS1-225	ENST00000630659	NPAS2	Q99743	824 aa		15.16	■□□□□ 0.02
BBS1-225	ENST00000630659	SLC25A23	Q9BV35	468 aa		15.16	■□□□□ 0.02
BBS1-225	ENST00000630659	KIFC1	Q9BW19	673 aa		15.16	■□□□□ 0.02
BBS1-225	ENST00000630659	FSD1L	Q9BXM9	530 aa		15.16	■□□□□ 0.02
BBS1-225	ENST00000630659	NAA50	Q9GZZ1	169 aa	Known RBP	15.16	■□□□□ 0.02
BBS1-225	ENST00000630659	IL21	Q9HBE4	155 aa		15.16	■□□□□ 0.02
BBS1-225	ENST00000630659	NMRAL1	Q9HBL8	299 aa		15.16	■□□□□ 0.02
BBS1-225	ENST00000630659	CHRAC1	Q9NRG0	131 aa		15.16	■□□□□ 0.02
BBS1-225	ENST00000630659	CACNA2D2	Q9NY47	1150 aa		15.16	■□□□□ 0.02
BBS1-225	ENST00000630659	TMEM181	Q9P2C4	612 aa		15.16	■□□□□ 0.02
BBS1-225	ENST00000630659	GOLGA8CP	A6NN73	597 aa		15.15	■□□□□ 0.02
BBS1-225	ENST00000630659	NOTO	A8MTQ0	251 aa		15.15	■□□□□ 0.02
BBS1-225	ENST00000630659		H3BNC9	293 aa		15.15	■□□□□ 0.02
BBS1-225	ENST00000630659	GRID2	O43424	1007 aa		15.15	■□□□□ 0.02
BBS1-225	ENST00000630659	CLDN11	O75508	207 aa		15.15	■□□□□ 0.02
BBS1-225	ENST00000630659	TIPRL	O75663	272 aa		15.15	■□□□□ 0.02
BBS1-225	ENST00000630659	MATN1	P21941	496 aa		15.15	■□□□□ 0.02
BBS1-225	ENST00000630659	GSTM2	P28161	218 aa		15.15	■□□□□ 0.02
BBS1-225	ENST00000630659	WNT3A	P56704	352 aa		15.15	■□□□□ 0.02
BBS1-225	ENST00000630659	RPS24	P62847	133 aa	Known RBP	15.15	■□□□□ 0.02
BBS1-225	ENST00000630659	CBX2	Q14781	532 aa	Predicted RBP	15.15	■□□□□ 0.02
BBS1-225	ENST00000630659	RBM48	Q5RL73	367 aa	Known RBP	15.15	■□□□□ 0.02
BBS1-225	ENST00000630659	C6orf10	Q5SRN2	563 aa		15.15	■□□□□ 0.02
BBS1-225	ENST00000630659	NXN	Q6DKJ4	435 aa		15.15	■□□□□ 0.02
BBS1-225	ENST00000630659	PSRC1	Q6PGN9	363 aa	Predicted RBP	15.15	■□□□□ 0.02
BBS1-225	ENST00000630659	LILRA6	Q6PI73	481 aa		15.15	■□□□□ 0.02
BBS1-225	ENST00000630659	RANBP10	Q6VN20	620 aa		15.15	■□□□□ 0.02
BBS1-225	ENST00000630659	NAPRT	Q6XQN6	538 aa		15.15	■□□□□ 0.02
BBS1-225	ENST00000630659	VASH1	Q7L8A9	365 aa	Predicted RBP	15.15	■□□□□ 0.02
BBS1-225	ENST00000630659	DCP2	Q8IU60	420 aa	Known RBP	15.15	■□□□□ 0.02
BBS1-225	ENST00000630659	CYGB	Q8WWM9	190 aa		15.15	■□□□□ 0.02

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