RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628306.2

CAPNS1-216, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,389 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-216ENST00000628306 PDIA2Q13087 525 aaKnown RBP23.93■■□□□ 1.42
CAPNS1-216ENST00000628306 CLCA4Q14CN2 919 aa23.93■■□□□ 1.42
CAPNS1-216ENST00000628306 TMCO4Q5TGY1 634 aa23.93■■□□□ 1.42
CAPNS1-216ENST00000628306 BRAT1Q6PJG6 821 aa23.93■■□□□ 1.42
CAPNS1-216ENST00000628306 C17orf82Q86X59 251 aaPredicted RBP23.93■■□□□ 1.42
CAPNS1-216ENST00000628306 TEX26Q8N6G2 289 aa23.93■■□□□ 1.42
CAPNS1-216ENST00000628306 OR56A4Q8NGH8 313 aa23.93■■□□□ 1.42
CAPNS1-216ENST00000628306 TMEM159Q96B96 161 aa23.93■■□□□ 1.42
CAPNS1-216ENST00000628306 ECHDC3Q96DC8 303 aa23.93■■□□□ 1.42
CAPNS1-216ENST00000628306 PWWP2AQ96N64 755 aa23.93■■□□□ 1.42
CAPNS1-216ENST00000628306 SERPINB12Q96P63 405 aa23.93■■□□□ 1.42
CAPNS1-216ENST00000628306 FCRL5Q96RD9 977 aa23.93■■□□□ 1.42
CAPNS1-216ENST00000628306 CCDC77Q9BR77 488 aa23.93■■□□□ 1.42
CAPNS1-216ENST00000628306 SEPT10Q9P0V9 454 aa23.93■■□□□ 1.42
CAPNS1-216ENST00000628306 LRIT1Q9P2V4 623 aa23.93■■□□□ 1.42
CAPNS1-216ENST00000628306 UBA2Q9UBT2 640 aaPredicted RBP23.93■■□□□ 1.42
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CAPNS1-216ENST00000628306 GOLGA6L10A6NI86 522 aa23.92■■□□□ 1.42
CAPNS1-216ENST00000628306 IQCJ-SCHIP1C9J366 451 aaPredicted RBP23.92■■□□□ 1.42
CAPNS1-216ENST00000628306 NUDT21O43809 227 aaKnown RBP23.92■■□□□ 1.42
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CAPNS1-216ENST00000628306 RECQL5O94762 991 aaPredicted RBP23.92■■□□□ 1.42
CAPNS1-216ENST00000628306 PEX11BO96011 259 aa23.92■■□□□ 1.42
CAPNS1-216ENST00000628306 HOXC4P09017 264 aaPredicted RBP23.92■■□□□ 1.42
CAPNS1-216ENST00000628306 GSTA2P09210 222 aa23.92■■□□□ 1.42
CAPNS1-216ENST00000628306 GOLGA6DP0CG33 693 aa23.92■■□□□ 1.42
CAPNS1-216ENST00000628306 ZBTB17Q13105 803 aa23.92■■□□□ 1.42
CAPNS1-216ENST00000628306 PRPSAP1Q14558 356 aa23.92■■□□□ 1.42
CAPNS1-216ENST00000628306 CCDC38Q502W7 563 aa23.92■■□□□ 1.42
CAPNS1-216ENST00000628306 MANEAQ5SRI9 462 aa23.92■■□□□ 1.42
CAPNS1-216ENST00000628306 FNBP1LQ5T0N5 605 aa23.92■■□□□ 1.42
CAPNS1-216ENST00000628306 LRRC8BQ6P9F7 803 aa23.92■■□□□ 1.42
CAPNS1-216ENST00000628306 LIPIQ6XZB0 460 aa23.92■■□□□ 1.42
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF574Q6ZN55 896 aaPredicted RBP23.92■■□□□ 1.42
CAPNS1-216ENST00000628306 ATG14Q6ZNE5 492 aa23.92■■□□□ 1.42
CAPNS1-216ENST00000628306 TAF8Q7Z7C8 310 aa23.92■■□□□ 1.42
CAPNS1-216ENST00000628306 CAND1Q86VP6 1230 aaKnown RBP23.92■■□□□ 1.42
CAPNS1-216ENST00000628306 CNTD1Q8N815 330 aa23.92■■□□□ 1.42
CAPNS1-216ENST00000628306 PYROXD1Q8WU10 500 aa23.92■■□□□ 1.42
CAPNS1-216ENST00000628306 GOLGA6AQ9NYA3 693 aa23.92■■□□□ 1.42
CAPNS1-216ENST00000628306 DOPEY2Q9Y3R5 2298 aa23.92■■□□□ 1.42
CAPNS1-216ENST00000628306 TNFRSF10CO14798 259 aa23.91■■□□□ 1.42
CAPNS1-216ENST00000628306 PRAMEF11O60813 436 aa23.91■■□□□ 1.42
CAPNS1-216ENST00000628306 MYZAPP0CAP1 466 aa23.91■■□□□ 1.42
CAPNS1-216ENST00000628306 CD68P34810 354 aaPredicted RBP23.91■■□□□ 1.42
CAPNS1-216ENST00000628306 IFFO1Q0D2I5 559 aa23.91■■□□□ 1.42
CAPNS1-216ENST00000628306 GRM3Q14832 879 aa23.91■■□□□ 1.42
CAPNS1-216ENST00000628306 CEP85LQ5SZL2 805 aa23.91■■□□□ 1.42
CAPNS1-216ENST00000628306 ARMC3Q5W041 872 aa23.91■■□□□ 1.42
CAPNS1-216ENST00000628306 KCTD11Q693B1 232 aa23.91■■□□□ 1.42
CAPNS1-216ENST00000628306 ERAP2Q6P179 960 aa23.91■■□□□ 1.42
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF438Q7Z4V0 828 aa23.91■■□□□ 1.42
CAPNS1-216ENST00000628306 NRROSQ86YC3 692 aa23.91■■□□□ 1.42
CAPNS1-216ENST00000628306 PMEPA1Q969W9 287 aa23.91■■□□□ 1.42
CAPNS1-216ENST00000628306 TUBGCP5Q96RT8 1024 aa23.91■■□□□ 1.42
CAPNS1-216ENST00000628306 TMBIM4Q9HC24 238 aa23.91■■□□□ 1.42
CAPNS1-216ENST00000628306 FETUBQ9UGM5 382 aa23.91■■□□□ 1.42
CAPNS1-216ENST00000628306 AAR2Q9Y312 384 aaKnown RBP23.91■■□□□ 1.42
CAPNS1-216ENST00000628306 TEX264Q9Y6I9 313 aa23.91■■□□□ 1.42
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CAPNS1-216ENST00000628306 H3BQF6 201 aa23.91■■□□□ 1.42
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CAPNS1-216ENST00000628306 CCL4P13236 92 aa23.91■■□□□ 1.42
CAPNS1-216ENST00000628306 CSNK1DP48730 415 aa23.91■■□□□ 1.42
CAPNS1-216ENST00000628306 MAPK10P53779 464 aa23.91■■□□□ 1.42
CAPNS1-216ENST00000628306 RASA2Q15283 850 aa23.91■■□□□ 1.42
CAPNS1-216ENST00000628306 CYS1Q717R9 158 aa23.91■■□□□ 1.42
CAPNS1-216ENST00000628306 ZBED8Q8IZ13 594 aa23.91■■□□□ 1.42
CAPNS1-216ENST00000628306 NSMCE1Q8WV22 266 aa23.91■■□□□ 1.42
CAPNS1-216ENST00000628306 PGM2Q96G03 612 aa23.91■■□□□ 1.42
CAPNS1-216ENST00000628306 CMKLR1Q99788 373 aa23.91■■□□□ 1.42
CAPNS1-216ENST00000628306 ARHGAP9Q9BRR9 750 aa23.91■■□□□ 1.42
CAPNS1-216ENST00000628306 B3GNT4Q9C0J1 378 aa23.91■■□□□ 1.42
CAPNS1-216ENST00000628306 RDH14Q9HBH5 336 aa23.91■■□□□ 1.42
CAPNS1-216ENST00000628306 LRRC4CQ9HCJ2 640 aa23.91■■□□□ 1.42
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CAPNS1-216ENST00000628306 ST14Q9Y5Y6 855 aa23.91■■□□□ 1.42
CAPNS1-216ENST00000628306 GOLGA8MH3BSY2 632 aa23.9■■□□□ 1.42
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CAPNS1-216ENST00000628306 PSMB4P28070 264 aa23.9■■□□□ 1.42
CAPNS1-216ENST00000628306 PHBP35232 272 aa23.9■■□□□ 1.42
CAPNS1-216ENST00000628306 MMP13P45452 471 aa23.9■■□□□ 1.42
CAPNS1-216ENST00000628306 MAZP56270 477 aaKnown RBP23.9■■□□□ 1.42
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CAPNS1-216ENST00000628306 MSS51Q4VC12 460 aa23.9■■□□□ 1.42
CAPNS1-216ENST00000628306 COLEC12Q5KU26 742 aa23.9■■□□□ 1.42
CAPNS1-216ENST00000628306 AGBL2Q5U5Z8 902 aa23.9■■□□□ 1.42
CAPNS1-216ENST00000628306 ARHGAP36Q6ZRI8 547 aa23.9■■□□□ 1.42
CAPNS1-216ENST00000628306 C9orf72Q96LT7 481 aa23.9■■□□□ 1.42
CAPNS1-216ENST00000628306 NAT9Q9BTE0 207 aa23.9■■□□□ 1.42
CAPNS1-216ENST00000628306 SLC12A9Q9BXP2 914 aa23.9■■□□□ 1.42
CAPNS1-216ENST00000628306 GLOD4Q9HC38 313 aa23.9■■□□□ 1.42
CAPNS1-216ENST00000628306 HAUS2Q9NVX0 235 aa23.9■■□□□ 1.42
CAPNS1-216ENST00000628306 RBM22Q9NW64 420 aaKnown RBP eCLIP23.9■■□□□ 1.42
CAPNS1-216ENST00000628306 HMGB1P1B2RPK0 211 aaPredicted RBP23.89■■□□□ 1.41
CAPNS1-216ENST00000628306 TRAFD1O14545 582 aaPredicted RBP23.89■■□□□ 1.41
CAPNS1-216ENST00000628306 LMAN1P49257 510 aa23.89■■□□□ 1.41
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