RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000618610.1

PTPRT-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type T, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRT, Length 3,230 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRT-211ENST00000618610 CCDC185Q8N715 623 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPRT-211ENST00000618610 LRRC20Q8TCA0 184 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPRT-211ENST00000618610 UBASH3BQ8TF42 649 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPRT-211ENST00000618610 CLEC4CQ8WTT0 213 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPRT-211ENST00000618610 NUDT8Q8WV74 236 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPRT-211ENST00000618610 AFG1LQ8WV93 481 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPRT-211ENST00000618610 PYCR2Q96C36 320 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPRT-211ENST00000618610 DUS3LQ96G46 650 aaKnown RBP8.12□□□□□ -1.11
PTPRT-211ENST00000618610 BTN2A3PQ96KV6 586 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPRT-211ENST00000618610 C8orf48Q96LL4 319 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPRT-211ENST00000618610 MCMBPQ9BTE3 642 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPRT-211ENST00000618610 SNRNP25Q9BV90 132 aaKnown RBP8.12□□□□□ -1.11
PTPRT-211ENST00000618610 VPS33BQ9H267 617 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPRT-211ENST00000618610 SETD4Q9NVD3 440 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPRT-211ENST00000618610 CAMSAP3Q9P1Y5 1249 aaPredicted RBP8.12□□□□□ -1.11
PTPRT-211ENST00000618610 VTI1BQ9UEU0 232 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPRT-211ENST00000618610 AKAP8LQ9ULX6 646 aaKnown RBP eCLIP8.12□□□□□ -1.11
PTPRT-211ENST00000618610 HCN4Q9Y3Q4 1203 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPRT-211ENST00000618610 LAMA1P25391 3075 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPRT-211ENST00000618610 ACKR2O00590 384 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPRT-211ENST00000618610 SLC22A1O15245 554 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPRT-211ENST00000618610 HS6ST1O60243 411 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPRT-211ENST00000618610 ATG7O95352 703 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPRT-211ENST00000618610 FTH1P02794 183 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPRT-211ENST00000618610 POLBP06746 335 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPRT-211ENST00000618610 PSKH1P11801 424 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPRT-211ENST00000618610 TGM2P21980 687 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPRT-211ENST00000618610 PCMT1P22061 227 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPRT-211ENST00000618610 CDH13P55290 713 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPRT-211ENST00000618610 HTRA3P83110 453 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPRT-211ENST00000618610 FOXD4Q12950 439 aaPredicted RBP8.12□□□□□ -1.11
PTPRT-211ENST00000618610 TRAF3Q13114 568 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPRT-211ENST00000618610 TP53BP2Q13625 1128 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPRT-211ENST00000618610 FBXO48Q5FWF7 155 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPRT-211ENST00000618610 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP8.12□□□□□ -1.11
PTPRT-211ENST00000618610 GRTP1Q5TC63 336 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPRT-211ENST00000618610 ZNF544Q6NX49 715 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPRT-211ENST00000618610 SPESP1Q6UW49 350 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPRT-211ENST00000618610 EID3Q8N140 333 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPRT-211ENST00000618610 PYROXD2Q8N2H3 581 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPRT-211ENST00000618610 ZIC5Q96T25 663 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPRT-211ENST00000618610 CPNE1Q99829 537 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPRT-211ENST00000618610 UCK2Q9BZX2 261 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPRT-211ENST00000618610 TRIM15Q9C019 465 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPRT-211ENST00000618610 NUAK2Q9H093 628 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPRT-211ENST00000618610 TAS2R9Q9NYW1 312 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPRT-211ENST00000618610 FBXO10Q9UK96 956 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPRT-211ENST00000618610 MTF2Q9Y483 593 aaPredicted RBP8.12□□□□□ -1.11
PTPRT-211ENST00000618610 SNX8Q9Y5X2 465 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPRT-211ENST00000618610 A0A0U1RQS6 177 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPRT-211ENST00000618610 OR6C70A6NIJ9 312 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPRT-211ENST00000618610 AQP12BA6NM10 295 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPRT-211ENST00000618610 EFCAB9A8MZ26 197 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPRT-211ENST00000618610 CTDSP2O14595 271 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPRT-211ENST00000618610 ANGPT2O15123 496 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPRT-211ENST00000618610 TBC1D4O60343 1298 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPRT-211ENST00000618610 B4GALT4O60513 344 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPRT-211ENST00000618610 MITFO75030 526 aaPredicted RBP8.12□□□□□ -1.11
PTPRT-211ENST00000618610 RECQL5O94762 991 aaPredicted RBP8.12□□□□□ -1.11
PTPRT-211ENST00000618610 APOA1P02647 267 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPRT-211ENST00000618610 MT-ND2P03891 347 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPRT-211ENST00000618610 ZNF250P15622 560 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPRT-211ENST00000618610 CTRB1P17538 263 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPRT-211ENST00000618610 POU3F3P20264 500 aaPredicted RBP8.12□□□□□ -1.11
PTPRT-211ENST00000618610 CYP2A7P20853 494 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPRT-211ENST00000618610 SLC6A2P23975 617 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPRT-211ENST00000618610 GJA5P36382 358 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPRT-211ENST00000618610 PSMD8P48556 350 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPRT-211ENST00000618610 MASP1P48740 699 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPRT-211ENST00000618610 OAZ1P54368 228 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPRT-211ENST00000618610 DAG1Q14118 895 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPRT-211ENST00000618610 SIM2Q14190 667 aaPredicted RBP8.12□□□□□ -1.11
PTPRT-211ENST00000618610 SELPLGQ14242 412 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPRT-211ENST00000618610 IRF3Q14653 427 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPRT-211ENST00000618610 MAPRE2Q15555 327 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPRT-211ENST00000618610 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP8.12□□□□□ -1.11
PTPRT-211ENST00000618610 UGT3A2Q3SY77 523 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPRT-211ENST00000618610 BOLA3Q53S33 107 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPRT-211ENST00000618610 TOR2AQ5JU69 321 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPRT-211ENST00000618610 TPRG1LQ5T0D9 272 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPRT-211ENST00000618610 STEAP4Q687X5 459 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPRT-211ENST00000618610 CTRB2Q6GPI1 263 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPRT-211ENST00000618610 AQP12AQ8IXF9 295 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPRT-211ENST00000618610 FAM86B1Q8N7N1 296 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPRT-211ENST00000618610 ANGPTL6Q8NI99 470 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPRT-211ENST00000618610 NPLOC4Q8TAT6 608 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPRT-211ENST00000618610 CHAC2Q8WUX2 184 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPRT-211ENST00000618610 TRIM63Q969Q1 353 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPRT-211ENST00000618610 C18orf25Q96B23 403 aaPredicted RBP8.12□□□□□ -1.11
PTPRT-211ENST00000618610 FAM149B1Q96BN6 582 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPRT-211ENST00000618610 PHOX2BQ99453 314 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPRT-211ENST00000618610 MYOCQ99972 504 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPRT-211ENST00000618610 NTN4Q9HB63 628 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPRT-211ENST00000618610 TIGARQ9NQ88 270 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPRT-211ENST00000618610 POLR3BQ9NW08 1133 aaPredicted RBP8.12□□□□□ -1.11
PTPRT-211ENST00000618610 FAM118AQ9NWS6 357 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPRT-211ENST00000618610 CIB4A0PJX0 185 aa8.11□□□□□ -1.11
PTPRT-211ENST00000618610 BCLAF3A2AJT9 711 aaKnown RBP8.11□□□□□ -1.11
PTPRT-211ENST00000618610 AGAP5A6NIR3 686 aa8.11□□□□□ -1.11
PTPRT-211ENST00000618610 C2CD4BA6NLJ0 364 aa8.11□□□□□ -1.11
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