RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000614197.4

NPIPB4-222, Transcript of nuclear pore complex interacting protein family member B4, human

TSL 5 BASIC

Gene NPIPB4, Length 1,216 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NPIPB4-222	ENST00000614197	TMEM26	Q6ZUK4	368 aa		10.79	□□□□□ -0.68
NPIPB4-222	ENST00000614197	ZNF605	Q86T29	641 aa		10.79	□□□□□ -0.68
NPIPB4-222	ENST00000614197	TTC30B	Q8N4P2	665 aa		10.79	□□□□□ -0.68
NPIPB4-222	ENST00000614197	BEND7	Q8N7W2	519 aa	Predicted RBP	10.79	□□□□□ -0.68
NPIPB4-222	ENST00000614197	ACRBP	Q8NEB7	543 aa		10.79	□□□□□ -0.68
NPIPB4-222	ENST00000614197	ZNF398	Q8TD17	642 aa		10.79	□□□□□ -0.68
NPIPB4-222	ENST00000614197	ZDHHC12	Q96GR4	267 aa		10.79	□□□□□ -0.68
NPIPB4-222	ENST00000614197	OXNAD1	Q96HP4	312 aa	Predicted RBP	10.79	□□□□□ -0.68
NPIPB4-222	ENST00000614197	SPATA13	Q96N96	652 aa		10.79	□□□□□ -0.68
NPIPB4-222	ENST00000614197	EFHD1	Q9BUP0	239 aa		10.79	□□□□□ -0.68
NPIPB4-222	ENST00000614197	WASH6P	Q9NQA3	447 aa		10.79	□□□□□ -0.68
NPIPB4-222	ENST00000614197	FOXJ2	Q9P0K8	574 aa		10.79	□□□□□ -0.68
NPIPB4-222	ENST00000614197	IL17C	Q9P0M4	197 aa		10.79	□□□□□ -0.68
NPIPB4-222	ENST00000614197	TRIM10	Q9UDY6	481 aa		10.79	□□□□□ -0.68
NPIPB4-222	ENST00000614197	CRLS1	Q9UJA2	301 aa		10.79	□□□□□ -0.68
NPIPB4-222	ENST00000614197	ADGRG1	Q9Y653	693 aa		10.79	□□□□□ -0.68
NPIPB4-222	ENST00000614197	DNMT3A	Q9Y6K1	912 aa	Predicted RBP	10.79	□□□□□ -0.68
NPIPB4-222	ENST00000614197	LRP4	O75096	1905 aa		10.79	□□□□□ -0.68
NPIPB4-222	ENST00000614197	CFAP47	Q6ZTR5	3102 aa		10.78	□□□□□ -0.68
NPIPB4-222	ENST00000614197	FREM2	Q5SZK8	3169 aa		10.78	□□□□□ -0.68
NPIPB4-222	ENST00000614197	RP1	P56715	2156 aa		10.78	□□□□□ -0.68
NPIPB4-222	ENST00000614197		A6NCN8	305 aa		10.78	□□□□□ -0.68
NPIPB4-222	ENST00000614197	IQCJ-SCHIP1	C9J366	451 aa	Predicted RBP	10.78	□□□□□ -0.68
NPIPB4-222	ENST00000614197	POLR1C	O15160	346 aa	Predicted RBP	10.78	□□□□□ -0.68
NPIPB4-222	ENST00000614197	CAPN5	O15484	640 aa	Predicted RBP	10.78	□□□□□ -0.68
NPIPB4-222	ENST00000614197	PSMD3	O43242	534 aa		10.78	□□□□□ -0.68
NPIPB4-222	ENST00000614197	EFS	O43281	561 aa		10.78	□□□□□ -0.68
NPIPB4-222	ENST00000614197	BUD23	O43709	281 aa	Known RBP	10.78	□□□□□ -0.68
NPIPB4-222	ENST00000614197	POP7	O75817	140 aa	Known RBP	10.78	□□□□□ -0.68
NPIPB4-222	ENST00000614197	PRAMEF1	O95521	474 aa		10.78	□□□□□ -0.68
NPIPB4-222	ENST00000614197	AGT	P01019	485 aa		10.78	□□□□□ -0.68
NPIPB4-222	ENST00000614197	SFTPC	P11686	197 aa		10.78	□□□□□ -0.68
NPIPB4-222	ENST00000614197	TYRP1	P17643	537 aa		10.78	□□□□□ -0.68
NPIPB4-222	ENST00000614197	ITGAL	P20701	1170 aa		10.78	□□□□□ -0.68
NPIPB4-222	ENST00000614197	RPL10	P27635	214 aa	Known RBP	10.78	□□□□□ -0.68
NPIPB4-222	ENST00000614197	PSMB4	P28070	264 aa		10.78	□□□□□ -0.68
NPIPB4-222	ENST00000614197	PBLD	P30039	288 aa	Predicted RBP	10.78	□□□□□ -0.68
NPIPB4-222	ENST00000614197	UBE2I	P63279	158 aa	Known RBP	10.78	□□□□□ -0.68
NPIPB4-222	ENST00000614197	KRT33B	Q14525	404 aa		10.78	□□□□□ -0.68
NPIPB4-222	ENST00000614197	PLCL1	Q15111	1095 aa		10.78	□□□□□ -0.68
NPIPB4-222	ENST00000614197	P3H1	Q32P28	736 aa		10.78	□□□□□ -0.68
NPIPB4-222	ENST00000614197	GPRC6A	Q5T6X5	926 aa		10.78	□□□□□ -0.68
NPIPB4-222	ENST00000614197	KIAA1614	Q5VZ46	1190 aa		10.78	□□□□□ -0.68
NPIPB4-222	ENST00000614197	ARMC6	Q6NXE6	501 aa		10.78	□□□□□ -0.68
NPIPB4-222	ENST00000614197	ABRAXAS1	Q6UWZ7	409 aa		10.78	□□□□□ -0.68
NPIPB4-222	ENST00000614197	RAD9B	Q6WBX8	426 aa		10.78	□□□□□ -0.68
NPIPB4-222	ENST00000614197	VASH2	Q86V25	355 aa		10.78	□□□□□ -0.68
NPIPB4-222	ENST00000614197	CACNA2D3	Q8IZS8	1091 aa		10.78	□□□□□ -0.68
NPIPB4-222	ENST00000614197	DDHD1	Q8NEL9	900 aa		10.78	□□□□□ -0.68
NPIPB4-222	ENST00000614197	HEXDC	Q8WVB3	486 aa		10.78	□□□□□ -0.68
NPIPB4-222	ENST00000614197	UBE2Q2	Q8WVN8	375 aa		10.78	□□□□□ -0.68
NPIPB4-222	ENST00000614197	JPH3	Q8WXH2	748 aa	Predicted RBP	10.78	□□□□□ -0.68
NPIPB4-222	ENST00000614197	ULK4	Q96C45	1275 aa		10.78	□□□□□ -0.68
NPIPB4-222	ENST00000614197	TGM7	Q96PF1	710 aa		10.78	□□□□□ -0.68
NPIPB4-222	ENST00000614197	TBC1D10A	Q9BXI6	508 aa		10.78	□□□□□ -0.68
NPIPB4-222	ENST00000614197	TSGA10	Q9BZW7	698 aa		10.78	□□□□□ -0.68
NPIPB4-222	ENST00000614197	TRIT1	Q9H3H1	467 aa	Known RBP	10.78	□□□□□ -0.68
NPIPB4-222	ENST00000614197	ASB8	Q9H765	288 aa		10.78	□□□□□ -0.68
NPIPB4-222	ENST00000614197	VPS37B	Q9H9H4	285 aa		10.78	□□□□□ -0.68
NPIPB4-222	ENST00000614197	TMEM9	Q9P0T7	183 aa		10.78	□□□□□ -0.68
NPIPB4-222	ENST00000614197	PDP2	Q9P2J9	529 aa		10.78	□□□□□ -0.68
NPIPB4-222	ENST00000614197	PCYT1B	Q9Y5K3	369 aa	Predicted RBP	10.78	□□□□□ -0.68
NPIPB4-222	ENST00000614197	B3GALT1	Q9Y5Z6	326 aa		10.78	□□□□□ -0.68
NPIPB4-222	ENST00000614197	SLC30A1	Q9Y6M5	507 aa		10.78	□□□□□ -0.68
NPIPB4-222	ENST00000614197	DUSP10	Q9Y6W6	482 aa		10.78	□□□□□ -0.68
NPIPB4-222	ENST00000614197	SPEG	Q15772	3267 aa		10.77	□□□□□ -0.68
NPIPB4-222	ENST00000614197	GRID2IP	A4D2P6	1211 aa		10.77	□□□□□ -0.69
NPIPB4-222	ENST00000614197	RCCD1	A6NED2	376 aa		10.77	□□□□□ -0.69
NPIPB4-222	ENST00000614197	OR2AG2	A6NM03	316 aa		10.77	□□□□□ -0.69
NPIPB4-222	ENST00000614197	HAX1	O00165	279 aa		10.77	□□□□□ -0.69
NPIPB4-222	ENST00000614197	TOX3	O15405	576 aa	Predicted RBP	10.77	□□□□□ -0.69
NPIPB4-222	ENST00000614197	ZZEF1	O43149	2961 aa		10.77	□□□□□ -0.69
NPIPB4-222	ENST00000614197	UGT1A9	O60656	530 aa		10.77	□□□□□ -0.69
NPIPB4-222	ENST00000614197	RAD1	O60671	282 aa		10.77	□□□□□ -0.69
NPIPB4-222	ENST00000614197	PRB1	P04280	392 aa		10.77	□□□□□ -0.69
NPIPB4-222	ENST00000614197	ITGB2	P05107	769 aa		10.77	□□□□□ -0.69
NPIPB4-222	ENST00000614197	SLC35G4	P0C7Q5	338 aa		10.77	□□□□□ -0.69
NPIPB4-222	ENST00000614197	UGT1A6	P19224	532 aa		10.77	□□□□□ -0.69
NPIPB4-222	ENST00000614197	UGT1A1	P22309	533 aa		10.77	□□□□□ -0.69
NPIPB4-222	ENST00000614197	UGT1A4	P22310	534 aa		10.77	□□□□□ -0.69
NPIPB4-222	ENST00000614197	MAP4	P27816	1152 aa	Known RBP	10.77	□□□□□ -0.69
NPIPB4-222	ENST00000614197	CDC25B	P30305	580 aa		10.77	□□□□□ -0.69
NPIPB4-222	ENST00000614197	UGT1A3	P35503	534 aa		10.77	□□□□□ -0.69
NPIPB4-222	ENST00000614197	ARL4D	P49703	201 aa		10.77	□□□□□ -0.69
NPIPB4-222	ENST00000614197	DRG2	P55039	364 aa	Known RBP	10.77	□□□□□ -0.69
NPIPB4-222	ENST00000614197	MC2R	Q01718	297 aa		10.77	□□□□□ -0.69
NPIPB4-222	ENST00000614197	FOXM1	Q08050	763 aa		10.77	□□□□□ -0.69
NPIPB4-222	ENST00000614197	FNBP1L	Q5T0N5	605 aa		10.77	□□□□□ -0.69
NPIPB4-222	ENST00000614197	SEL1L2	Q5TEA6	688 aa		10.77	□□□□□ -0.69
NPIPB4-222	ENST00000614197	ANKS6	Q68DC2	871 aa		10.77	□□□□□ -0.69
NPIPB4-222	ENST00000614197	TMEM220	Q6QAJ8	160 aa		10.77	□□□□□ -0.69
NPIPB4-222	ENST00000614197	SPC24	Q8NBT2	197 aa		10.77	□□□□□ -0.69
NPIPB4-222	ENST00000614197	OR4K2	Q8NGD2	314 aa		10.77	□□□□□ -0.69
NPIPB4-222	ENST00000614197	CCDC110	Q8TBZ0	833 aa		10.77	□□□□□ -0.69
NPIPB4-222	ENST00000614197	MED8	Q96G25	268 aa		10.77	□□□□□ -0.69
NPIPB4-222	ENST00000614197	TBL1Y	Q9BQ87	522 aa		10.77	□□□□□ -0.69
NPIPB4-222	ENST00000614197	APOL2	Q9BQE5	337 aa		10.77	□□□□□ -0.69
NPIPB4-222	ENST00000614197	LACRT	Q9GZZ8	138 aa		10.77	□□□□□ -0.69
NPIPB4-222	ENST00000614197	C10orf88	Q9H8K7	445 aa		10.77	□□□□□ -0.69
NPIPB4-222	ENST00000614197	UGT1A7	Q9HAW7	530 aa		10.77	□□□□□ -0.69

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