RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590874.5

CAPNS1-211, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 926 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-211ENST00000590874 BLACEA4D250 179 aa25.17■■□□□ 1.62
CAPNS1-211ENST00000590874 CCNYL3P0C7X3 344 aa25.17■■□□□ 1.62
CAPNS1-211ENST00000590874 NELFEP18615 380 aaKnown RBP25.17■■□□□ 1.62
CAPNS1-211ENST00000590874 IDSP22304 550 aa25.17■■□□□ 1.62
CAPNS1-211ENST00000590874 CDK18Q07002 472 aa25.17■■□□□ 1.62
CAPNS1-211ENST00000590874 ATCAYQ86WG3 371 aa25.17■■□□□ 1.62
CAPNS1-211ENST00000590874 LURAP1LQ8IV03 231 aa25.17■■□□□ 1.62
CAPNS1-211ENST00000590874 RBM12BQ8IXT5 1001 aaKnown RBP25.17■■□□□ 1.62
CAPNS1-211ENST00000590874 SPATA22Q8NHS9 363 aa25.17■■□□□ 1.62
CAPNS1-211ENST00000590874 ZDHHC12Q96GR4 267 aa25.17■■□□□ 1.62
CAPNS1-211ENST00000590874 RUFY1Q96T51 708 aa25.17■■□□□ 1.62
CAPNS1-211ENST00000590874 PADI1Q9ULC6 663 aa25.17■■□□□ 1.62
CAPNS1-211ENST00000590874 NBASA2RRP1 2371 aa25.17■■□□□ 1.62
CAPNS1-211ENST00000590874 LRRK2Q5S007 2527 aa25.17■■□□□ 1.62
CAPNS1-211ENST00000590874 PIPSLA2A3N6 862 aa25.16■■□□□ 1.62
CAPNS1-211ENST00000590874 DNAJB5O75953 348 aa25.16■■□□□ 1.62
CAPNS1-211ENST00000590874 MT-CYBP00156 380 aaPredicted RBP25.16■■□□□ 1.62
CAPNS1-211ENST00000590874 FANCCQ00597 558 aa25.16■■□□□ 1.62
CAPNS1-211ENST00000590874 KCNAB1Q14722 419 aa25.16■■□□□ 1.62
CAPNS1-211ENST00000590874 SLC9A4Q6AI14 798 aa25.16■■□□□ 1.62
CAPNS1-211ENST00000590874 NPNTQ6UXI9 565 aa25.16■■□□□ 1.62
CAPNS1-211ENST00000590874 B4GALNT4Q76KP1 1039 aa25.16■■□□□ 1.62
CAPNS1-211ENST00000590874 TRAPPC5Q8IUR0 188 aa25.16■■□□□ 1.62
CAPNS1-211ENST00000590874 VPS35Q96QK1 796 aa25.16■■□□□ 1.62
CAPNS1-211ENST00000590874 RAB33BQ9H082 229 aa25.16■■□□□ 1.62
CAPNS1-211ENST00000590874 SLC25A51Q9H1U9 297 aa25.16■■□□□ 1.62
CAPNS1-211ENST00000590874 BPIFA1Q9NP55 256 aa25.16■■□□□ 1.62
CAPNS1-211ENST00000590874 IGHV5-51A0A0C4DH38 117 aa25.15■■□□□ 1.62
CAPNS1-211ENST00000590874 LRRD1A4D1F6 860 aa25.15■■□□□ 1.62
CAPNS1-211ENST00000590874 MT-ND3P03897 115 aa25.15■■□□□ 1.62
CAPNS1-211ENST00000590874 FOLR1P15328 257 aa25.15■■□□□ 1.62
CAPNS1-211ENST00000590874 CASP14P31944 242 aa25.15■■□□□ 1.62
CAPNS1-211ENST00000590874 ATP13A5Q4VNC0 1218 aa25.15■■□□□ 1.62
CAPNS1-211ENST00000590874 PWWP2BQ6NUJ5 590 aa25.15■■□□□ 1.62
CAPNS1-211ENST00000590874 GPR150Q8NGU9 434 aa25.15■■□□□ 1.62
CAPNS1-211ENST00000590874 SLC41A2Q96JW4 573 aa25.15■■□□□ 1.62
CAPNS1-211ENST00000590874 OLFM3Q96PB7 478 aa25.15■■□□□ 1.62
CAPNS1-211ENST00000590874 TRIM55Q9BYV6 548 aa25.15■■□□□ 1.62
CAPNS1-211ENST00000590874 ACTL8Q9H568 366 aa25.15■■□□□ 1.62
CAPNS1-211ENST00000590874 AKIRIN1Q9H9L7 192 aaPredicted RBP25.15■■□□□ 1.62
CAPNS1-211ENST00000590874 CBX8Q9HC52 389 aa25.15■■□□□ 1.62
CAPNS1-211ENST00000590874 SEMA5BQ9P283 1151 aa25.15■■□□□ 1.62
CAPNS1-211ENST00000590874 C3orf70A6NLC5 250 aaPredicted RBP25.14■■□□□ 1.62
CAPNS1-211ENST00000590874 NDST3O95803 873 aa25.14■■□□□ 1.62
CAPNS1-211ENST00000590874 GYPCP04921 128 aa25.14■■□□□ 1.62
CAPNS1-211ENST00000590874 H2AFZP0C0S5 128 aa25.14■■□□□ 1.62
CAPNS1-211ENST00000590874 UQCRFS1P47985 274 aa25.14■■□□□ 1.62
CAPNS1-211ENST00000590874 TMEM115Q12893 351 aaPredicted RBP25.14■■□□□ 1.62
CAPNS1-211ENST00000590874 TUBB3Q13509 450 aa25.14■■□□□ 1.62
CAPNS1-211ENST00000590874 H2AFVQ71UI9 128 aa25.14■■□□□ 1.62
CAPNS1-211ENST00000590874 APLFQ8IW19 511 aaPredicted RBP25.14■■□□□ 1.62
CAPNS1-211ENST00000590874 PDE7BQ9NP56 450 aa25.14■■□□□ 1.62
CAPNS1-211ENST00000590874 C21orf140B9A014 251 aa25.13■■□□□ 1.61
CAPNS1-211ENST00000590874 APOL1O14791 398 aa25.13■■□□□ 1.61
CAPNS1-211ENST00000590874 RECKO95980 971 aa25.13■■□□□ 1.61
CAPNS1-211ENST00000590874 SEMA5AQ13591 1074 aa25.13■■□□□ 1.61
CAPNS1-211ENST00000590874 SLC14A2Q15849 920 aa25.13■■□□□ 1.61
CAPNS1-211ENST00000590874 CERS6Q6ZMG9 384 aa25.13■■□□□ 1.61
CAPNS1-211ENST00000590874 SIDT2Q8NBJ9 832 aaKnown RBP25.13■■□□□ 1.61
CAPNS1-211ENST00000590874 GDAP1Q8TB36 358 aa25.13■■□□□ 1.61
CAPNS1-211ENST00000590874 TRAF3IP1Q8TDR0 691 aaPredicted RBP25.13■■□□□ 1.61
CAPNS1-211ENST00000590874 CTNNBL1Q8WYA6 563 aaPredicted RBP25.13■■□□□ 1.61
CAPNS1-211ENST00000590874 RARRES3Q9UL19 164 aa25.13■■□□□ 1.61
CAPNS1-211ENST00000590874 LUC7L2Q9Y383 392 aaKnown RBP25.13■■□□□ 1.61
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF487B1APH4 448 aa25.12■■□□□ 1.61
CAPNS1-211ENST00000590874 PMPCBO75439 489 aa25.12■■□□□ 1.61
CAPNS1-211ENST00000590874 VCLP18206 1134 aa25.12■■□□□ 1.61
CAPNS1-211ENST00000590874 FECHP22830 423 aa25.12■■□□□ 1.61
CAPNS1-211ENST00000590874 HALP42357 657 aa25.12■■□□□ 1.61
CAPNS1-211ENST00000590874 UBASH3AP57075 661 aa25.12■■□□□ 1.61
CAPNS1-211ENST00000590874 RPS18P62269 152 aaKnown RBP25.12■■□□□ 1.61
CAPNS1-211ENST00000590874 GTF2H3Q13889 308 aa25.12■■□□□ 1.61
CAPNS1-211ENST00000590874 MESDQ14696 234 aa25.12■■□□□ 1.61
CAPNS1-211ENST00000590874 PDK1Q15118 436 aa25.12■■□□□ 1.61
CAPNS1-211ENST00000590874 NOMO1Q15155 1222 aa25.12■■□□□ 1.61
CAPNS1-211ENST00000590874 CYB5D1Q6P9G0 228 aa25.12■■□□□ 1.61
CAPNS1-211ENST00000590874 FAM199XQ6PEV8 388 aaPredicted RBP25.12■■□□□ 1.61
CAPNS1-211ENST00000590874 LUZP1Q86V48 1076 aa25.12■■□□□ 1.61
CAPNS1-211ENST00000590874 UBXN4Q92575 508 aa25.12■■□□□ 1.61
CAPNS1-211ENST00000590874 GLOD4Q9HC38 313 aa25.12■■□□□ 1.61
CAPNS1-211ENST00000590874 UBP1Q9NZI7 540 aa25.12■■□□□ 1.61
CAPNS1-211ENST00000590874 LCMT1Q9UIC8 334 aa25.12■■□□□ 1.61
CAPNS1-211ENST00000590874 PPP1R12AO14974 1030 aaPredicted RBP25.11■■□□□ 1.61
CAPNS1-211ENST00000590874 GPR39O43194 453 aa25.11■■□□□ 1.61
CAPNS1-211ENST00000590874 EBLN1P0CF75 366 aa25.11■■□□□ 1.61
CAPNS1-211ENST00000590874 CA5AP35218 305 aa25.11■■□□□ 1.61
CAPNS1-211ENST00000590874 RPE65Q16518 533 aa25.11■■□□□ 1.61
CAPNS1-211ENST00000590874 CPZQ66K79 652 aa25.11■■□□□ 1.61
CAPNS1-211ENST00000590874 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP25.11■■□□□ 1.61
CAPNS1-211ENST00000590874 FAM83HQ6ZRV2 1179 aaPredicted RBP25.11■■□□□ 1.61
CAPNS1-211ENST00000590874 MAP3K3Q99759 626 aa25.11■■□□□ 1.61
CAPNS1-211ENST00000590874 IL26Q9NPH9 171 aa25.11■■□□□ 1.61
CAPNS1-211ENST00000590874 PSMD13Q9UNM6 376 aa25.11■■□□□ 1.61
CAPNS1-211ENST00000590874 HMGCLP35914 325 aa25.1■■□□□ 1.61
CAPNS1-211ENST00000590874 CTSCP53634 463 aa25.1■■□□□ 1.61
CAPNS1-211ENST00000590874 DMPKQ09013 629 aa25.1■■□□□ 1.61
CAPNS1-211ENST00000590874 UGT8Q16880 541 aa25.1■■□□□ 1.61
CAPNS1-211ENST00000590874 HIST2H2BCQ6DN03 193 aa25.1■■□□□ 1.61
CAPNS1-211ENST00000590874 CCDC70Q6NSX1 233 aa25.1■■□□□ 1.61
CAPNS1-211ENST00000590874 RASGEF1AQ8N9B8 481 aa25.1■■□□□ 1.61
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