RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588815.5

CAPNS1-206, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,471 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-206ENST00000588815 IL2P60568 153 aa30.63■■■□□ 2.49
CAPNS1-206ENST00000588815 TP53I13Q8NBR0 393 aaPredicted RBP30.63■■■□□ 2.49
CAPNS1-206ENST00000588815 DENND6BQ8NEG7 585 aa30.63■■■□□ 2.49
CAPNS1-206ENST00000588815 RAB3IL1Q8TBN0 382 aa30.63■■■□□ 2.49
CAPNS1-206ENST00000588815 COX14Q96I36 57 aa30.63■■■□□ 2.49
CAPNS1-206ENST00000588815 SCYL1Q96KG9 808 aa30.63■■■□□ 2.49
CAPNS1-206ENST00000588815 COPG2Q9UBF2 871 aa30.63■■■□□ 2.49
CAPNS1-206ENST00000588815 EBF1Q9UH73 591 aa30.63■■■□□ 2.49
CAPNS1-206ENST00000588815 K7ESM1 405 aa30.62■■■□□ 2.49
CAPNS1-206ENST00000588815 DNAJC6O75061 913 aa30.62■■■□□ 2.49
CAPNS1-206ENST00000588815 PAK4O96013 591 aaPredicted RBP30.62■■■□□ 2.49
CAPNS1-206ENST00000588815 BPGMP07738 259 aa30.62■■■□□ 2.49
CAPNS1-206ENST00000588815 TRIM23P36406 574 aa30.62■■■□□ 2.49
CAPNS1-206ENST00000588815 GMPRP36959 345 aa30.62■■■□□ 2.49
CAPNS1-206ENST00000588815 RGS4P49798 205 aa30.62■■■□□ 2.49
CAPNS1-206ENST00000588815 FAM124AQ86V42 546 aa30.62■■■□□ 2.49
CAPNS1-206ENST00000588815 PELI3Q8N2H9 469 aa30.62■■■□□ 2.49
CAPNS1-206ENST00000588815 SIDT2Q8NBJ9 832 aaKnown RBP30.62■■■□□ 2.49
CAPNS1-206ENST00000588815 RHEBL1Q8TAI7 183 aa30.62■■■□□ 2.49
CAPNS1-206ENST00000588815 LENG8Q96PV6 779 aaPredicted RBP30.62■■■□□ 2.49
CAPNS1-206ENST00000588815 ANKRD12Q6UB98 2062 aa30.61■■■□□ 2.49
CAPNS1-206ENST00000588815 IQCF5A8MTL0 148 aa30.61■■■□□ 2.49
CAPNS1-206ENST00000588815 STK25O00506 426 aa30.61■■■□□ 2.49
CAPNS1-206ENST00000588815 INPP4BO15327 924 aa30.61■■■□□ 2.49
CAPNS1-206ENST00000588815 TRIM16O95361 564 aa30.61■■■□□ 2.49
CAPNS1-206ENST00000588815 GSTM1P09488 218 aa30.61■■■□□ 2.49
CAPNS1-206ENST00000588815 CBSLP0DN79 551 aa30.61■■■□□ 2.49
CAPNS1-206ENST00000588815 CD1DP15813 335 aa30.61■■■□□ 2.49
CAPNS1-206ENST00000588815 DGKAP23743 735 aa30.61■■■□□ 2.49
CAPNS1-206ENST00000588815 CBSP35520 551 aa30.61■■■□□ 2.49
CAPNS1-206ENST00000588815 ZXDAP98168 799 aa30.61■■■□□ 2.49
CAPNS1-206ENST00000588815 GSTM4Q03013 218 aa30.61■■■□□ 2.49
CAPNS1-206ENST00000588815 FGL2Q14314 439 aa30.61■■■□□ 2.49
CAPNS1-206ENST00000588815 TECRLQ5HYJ1 363 aa30.61■■■□□ 2.49
CAPNS1-206ENST00000588815 ANO7Q6IWH7 933 aa30.61■■■□□ 2.49
CAPNS1-206ENST00000588815 OTOAQ7RTW8 1153 aa30.61■■■□□ 2.49
CAPNS1-206ENST00000588815 CAMKK1Q8N5S9 505 aa30.61■■■□□ 2.49
CAPNS1-206ENST00000588815 GIMAP7Q8NHV1 300 aa30.61■■■□□ 2.49
CAPNS1-206ENST00000588815 SREK1Q8WXA9 508 aaKnown RBP30.61■■■□□ 2.49
CAPNS1-206ENST00000588815 FAM126AQ9BYI3 521 aaPredicted RBP30.61■■■□□ 2.49
CAPNS1-206ENST00000588815 TFB2MQ9H5Q4 396 aaKnown RBP30.61■■■□□ 2.49
CAPNS1-206ENST00000588815 SARS2Q9NP81 518 aaKnown RBP30.61■■■□□ 2.49
CAPNS1-206ENST00000588815 SIT1Q9Y3P8 196 aa30.61■■■□□ 2.49
CAPNS1-206ENST00000588815 CPA3P15088 417 aa30.6■■■□□ 2.49
CAPNS1-206ENST00000588815 ACSL1P33121 698 aa30.6■■■□□ 2.49
CAPNS1-206ENST00000588815 PRLHRP49683 370 aa30.6■■■□□ 2.49
CAPNS1-206ENST00000588815 GABPB1Q06547 395 aaPredicted RBP30.6■■■□□ 2.49
CAPNS1-206ENST00000588815 GTF2H3Q13889 308 aa30.6■■■□□ 2.49
CAPNS1-206ENST00000588815 KHDC1Q4VXA5 237 aaKnown RBP30.6■■■□□ 2.49
CAPNS1-206ENST00000588815 NUDCD3Q8IVD9 361 aa30.6■■■□□ 2.49
CAPNS1-206ENST00000588815 ZBTB2Q8N680 514 aa30.6■■■□□ 2.49
CAPNS1-206ENST00000588815 LRRC8CQ8TDW0 803 aa30.6■■■□□ 2.49
CAPNS1-206ENST00000588815 FAM136AQ96C01 138 aa30.6■■■□□ 2.49
CAPNS1-206ENST00000588815 TEX101Q9BY14 249 aa30.6■■■□□ 2.49
CAPNS1-206ENST00000588815 SIRPGQ9P1W8 387 aa30.6■■■□□ 2.49
CAPNS1-206ENST00000588815 GALPQ9UBC7 116 aa30.6■■■□□ 2.49
CAPNS1-206ENST00000588815 PRR23AA6NEV1 266 aa30.59■■■□□ 2.49
CAPNS1-206ENST00000588815 TARM1B6A8C7 271 aa30.59■■■□□ 2.49
CAPNS1-206ENST00000588815 C10orf142B7Z368 130 aa30.59■■■□□ 2.49
CAPNS1-206ENST00000588815 GPR89AB7ZAQ6 455 aa30.59■■■□□ 2.49
CAPNS1-206ENST00000588815 MTX2O75431 263 aa30.59■■■□□ 2.49
CAPNS1-206ENST00000588815 APBB3O95704 486 aa30.59■■■□□ 2.49
CAPNS1-206ENST00000588815 SEMA4FO95754 770 aa30.59■■■□□ 2.49
CAPNS1-206ENST00000588815 PCCBP05166 539 aa30.59■■■□□ 2.49
CAPNS1-206ENST00000588815 GPR89BP0CG08 455 aa30.59■■■□□ 2.49
CAPNS1-206ENST00000588815 CDK3Q00526 305 aa30.59■■■□□ 2.49
CAPNS1-206ENST00000588815 IRF4Q15306 451 aa30.59■■■□□ 2.49
CAPNS1-206ENST00000588815 BCL7AQ4VC05 210 aa30.59■■■□□ 2.49
CAPNS1-206ENST00000588815 TMEM151AQ8N4L1 468 aa30.59■■■□□ 2.49
CAPNS1-206ENST00000588815 RASGEF1AQ8N9B8 481 aa30.59■■■□□ 2.49
CAPNS1-206ENST00000588815 PLA2G15Q8NCC3 412 aa30.59■■■□□ 2.49
CAPNS1-206ENST00000588815 SLC30A3Q99726 388 aa30.59■■■□□ 2.49
CAPNS1-206ENST00000588815 XPR1Q9UBH6 696 aa30.59■■■□□ 2.49
CAPNS1-206ENST00000588815 GPR34Q9UPC5 381 aa30.59■■■□□ 2.49
CAPNS1-206ENST00000588815 KLF11O14901 512 aa30.58■■■□□ 2.49
CAPNS1-206ENST00000588815 SGTAO43765 313 aa30.58■■■□□ 2.49
CAPNS1-206ENST00000588815 CDK14O94921 469 aa30.58■■■□□ 2.49
CAPNS1-206ENST00000588815 ENO3P13929 434 aaPredicted RBP30.58■■■□□ 2.49
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CAPNS1-206ENST00000588815 GLRBP48167 497 aa30.58■■■□□ 2.49
CAPNS1-206ENST00000588815 PRKAA2P54646 552 aa30.58■■■□□ 2.49
CAPNS1-206ENST00000588815 PCLAFQ15004 111 aa30.58■■■□□ 2.49
CAPNS1-206ENST00000588815 PLEKHS1Q5SXH7 462 aa30.58■■■□□ 2.49
CAPNS1-206ENST00000588815 ISCA2Q86U28 154 aa30.58■■■□□ 2.49
CAPNS1-206ENST00000588815 HEATR4Q86WZ0 1026 aa30.58■■■□□ 2.49
CAPNS1-206ENST00000588815 LKAAEAR1Q8TD35 194 aa30.58■■■□□ 2.49
CAPNS1-206ENST00000588815 SGF29Q96ES7 293 aa30.58■■■□□ 2.49
CAPNS1-206ENST00000588815 PHPT1Q9NRX4 125 aaPredicted RBP30.58■■■□□ 2.49
CAPNS1-206ENST00000588815 TSPAN12O95859 305 aa30.57■■■□□ 2.48
CAPNS1-206ENST00000588815 MYL2P10916 166 aa30.57■■■□□ 2.48
CAPNS1-206ENST00000588815 NEFHP12036 1026 aa30.57■■■□□ 2.48
CAPNS1-206ENST00000588815 AOAHP28039 575 aa30.57■■■□□ 2.48
CAPNS1-206ENST00000588815 PPP2CBP62714 309 aa30.57■■■□□ 2.48
CAPNS1-206ENST00000588815 PPP2CAP67775 309 aa30.57■■■□□ 2.48
CAPNS1-206ENST00000588815 IRX4P78413 519 aa30.57■■■□□ 2.48
CAPNS1-206ENST00000588815 ZYG11AQ6WRX3 759 aa30.57■■■□□ 2.48
CAPNS1-206ENST00000588815 MAMSTRQ6ZN01 415 aa30.57■■■□□ 2.48
CAPNS1-206ENST00000588815 ADGRG6Q86SQ4 1221 aa30.57■■■□□ 2.48
CAPNS1-206ENST00000588815 CPNE9Q8IYJ1 553 aa30.57■■■□□ 2.48
CAPNS1-206ENST00000588815 KIAA1191Q96A73 305 aa30.57■■■□□ 2.48
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