RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588494.5

NEDD4L-222, Transcript of neural precursor cell expressed, developmentally down-regulated 4-like, E3 ubiquitin protein ligase, human

TSL 4

Gene NEDD4L, Length 505 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NEDD4L-222	ENST00000588494	SCMH1	Q96GD3	660 aa		3.03	□□□□□ -1.92
NEDD4L-222	ENST00000588494	ADGRG7	Q96K78	797 aa		3.03	□□□□□ -1.92
NEDD4L-222	ENST00000588494	LYZL4	Q96KX0	146 aa		3.03	□□□□□ -1.92
NEDD4L-222	ENST00000588494	OR2A14	Q96R47	310 aa		3.03	□□□□□ -1.92
NEDD4L-222	ENST00000588494	SEMA3C	Q99985	751 aa		3.03	□□□□□ -1.92
NEDD4L-222	ENST00000588494	TEX12	Q9BXU0	123 aa		3.03	□□□□□ -1.92
NEDD4L-222	ENST00000588494	NKIRAS2	Q9NYR9	191 aa		3.03	□□□□□ -1.92
NEDD4L-222	ENST00000588494	SUCLA2	Q9P2R7	463 aa	Predicted RBP	3.03	□□□□□ -1.92
NEDD4L-222	ENST00000588494	UBA2	Q9UBT2	640 aa	Predicted RBP	3.03	□□□□□ -1.92
NEDD4L-222	ENST00000588494	POLG2	Q9UHN1	485 aa		3.03	□□□□□ -1.92
NEDD4L-222	ENST00000588494	RPS6KA6	Q9UK32	745 aa		3.03	□□□□□ -1.92
NEDD4L-222	ENST00000588494	FBXW11	Q9UKB1	542 aa		3.03	□□□□□ -1.92
NEDD4L-222	ENST00000588494	UGGT1	Q9NYU2	1555 aa		3.03	□□□□□ -1.92
NEDD4L-222	ENST00000588494	GCN1	Q92616	2671 aa	Known RBP	3.03	□□□□□ -1.92
NEDD4L-222	ENST00000588494	SLIT2	O94813	1529 aa		3.03	□□□□□ -1.92
NEDD4L-222	ENST00000588494	TPR	P12270	2363 aa	Known RBP	3.02	□□□□□ -1.93
NEDD4L-222	ENST00000588494	BPTF	Q12830	3046 aa		3.02	□□□□□ -1.93
NEDD4L-222	ENST00000588494		A0A0G2JPF8	293 aa		3.02	□□□□□ -1.93
NEDD4L-222	ENST00000588494	KANSL1L	A0AUZ9	987 aa		3.02	□□□□□ -1.93
NEDD4L-222	ENST00000588494	CPED1	A4D0V7	1026 aa		3.02	□□□□□ -1.93
NEDD4L-222	ENST00000588494	SYNDIG1L	A6NDD5	238 aa		3.02	□□□□□ -1.93
NEDD4L-222	ENST00000588494	LRRC72	A6NJI9	287 aa		3.02	□□□□□ -1.93
NEDD4L-222	ENST00000588494	HNRNPCL3	B7ZW38	293 aa		3.02	□□□□□ -1.93
NEDD4L-222	ENST00000588494	CLGN	O14967	610 aa		3.02	□□□□□ -1.93
NEDD4L-222	ENST00000588494	SMAD6	O43541	496 aa	Known RBP	3.02	□□□□□ -1.93
NEDD4L-222	ENST00000588494	ZBTB11	O95625	1053 aa	Predicted RBP	3.02	□□□□□ -1.93
NEDD4L-222	ENST00000588494	HNRNPCL4	P0DMR1	293 aa		3.02	□□□□□ -1.93
NEDD4L-222	ENST00000588494	SRC	P12931	536 aa		3.02	□□□□□ -1.93
NEDD4L-222	ENST00000588494	PLA2G2A	P14555	144 aa		3.02	□□□□□ -1.93
NEDD4L-222	ENST00000588494	ZNF12	P17014	697 aa		3.02	□□□□□ -1.93
NEDD4L-222	ENST00000588494	SAT1	P21673	171 aa		3.02	□□□□□ -1.93
NEDD4L-222	ENST00000588494	PON1	P27169	355 aa		3.02	□□□□□ -1.93
NEDD4L-222	ENST00000588494	TNFRSF8	P28908	595 aa		3.02	□□□□□ -1.93
NEDD4L-222	ENST00000588494	GNL1	P36915	607 aa	Predicted RBP	3.02	□□□□□ -1.93
NEDD4L-222	ENST00000588494	EIF2D	P41214	584 aa	Known RBP	3.02	□□□□□ -1.93
NEDD4L-222	ENST00000588494	TMPO	P42166	694 aa	Known RBP	3.02	□□□□□ -1.93
NEDD4L-222	ENST00000588494	MSH2	P43246	934 aa		3.02	□□□□□ -1.93
NEDD4L-222	ENST00000588494	AMPH	P49418	695 aa		3.02	□□□□□ -1.93
NEDD4L-222	ENST00000588494	THBS3	P49746	956 aa		3.02	□□□□□ -1.93
NEDD4L-222	ENST00000588494	DSCR9	P59020	149 aa		3.02	□□□□□ -1.93
NEDD4L-222	ENST00000588494	NANOS2	P60321	138 aa	Known RBP	3.02	□□□□□ -1.93
NEDD4L-222	ENST00000588494	PPP2R2B	Q00005	443 aa		3.02	□□□□□ -1.93
NEDD4L-222	ENST00000588494	STK4	Q13043	487 aa		3.02	□□□□□ -1.93
NEDD4L-222	ENST00000588494	TNFAIP1	Q13829	316 aa		3.02	□□□□□ -1.93
NEDD4L-222	ENST00000588494	OASL	Q15646	514 aa	Known RBP	3.02	□□□□□ -1.93
NEDD4L-222	ENST00000588494	IZUMO4	Q1ZYL8	232 aa		3.02	□□□□□ -1.93
NEDD4L-222	ENST00000588494	MFSD4B	Q5TF39	518 aa		3.02	□□□□□ -1.93
NEDD4L-222	ENST00000588494	IRAK1BP1	Q5VVH5	260 aa		3.02	□□□□□ -1.93
NEDD4L-222	ENST00000588494	C16orf54	Q6UWD8	224 aa		3.02	□□□□□ -1.93
NEDD4L-222	ENST00000588494	DLK2	Q6UY11	383 aa		3.02	□□□□□ -1.93
NEDD4L-222	ENST00000588494	ENOSF1	Q7L5Y1	443 aa		3.02	□□□□□ -1.93
NEDD4L-222	ENST00000588494	BHLHA9	Q7RTU4	235 aa		3.02	□□□□□ -1.93
NEDD4L-222	ENST00000588494	ZDHHC17	Q8IUH5	632 aa		3.02	□□□□□ -1.93
NEDD4L-222	ENST00000588494	EPHX4	Q8IUS5	362 aa		3.02	□□□□□ -1.93
NEDD4L-222	ENST00000588494	UNC5CL	Q8IV45	518 aa		3.02	□□□□□ -1.93
NEDD4L-222	ENST00000588494	ODF3L1	Q8IXM7	274 aa		3.02	□□□□□ -1.93
NEDD4L-222	ENST00000588494	ZNF34	Q8IZ26	560 aa		3.02	□□□□□ -1.93
NEDD4L-222	ENST00000588494	BEST3	Q8N1M1	668 aa		3.02	□□□□□ -1.93
NEDD4L-222	ENST00000588494	AFAP1	Q8N556	730 aa		3.02	□□□□□ -1.93
NEDD4L-222	ENST00000588494		Q8N9P0	234 aa	Predicted RBP	3.02	□□□□□ -1.93
NEDD4L-222	ENST00000588494	POC5	Q8NA72	575 aa		3.02	□□□□□ -1.93
NEDD4L-222	ENST00000588494	ACVR1C	Q8NER5	493 aa		3.02	□□□□□ -1.93
NEDD4L-222	ENST00000588494	UTP15	Q8TED0	518 aa	Known RBP	3.02	□□□□□ -1.93
NEDD4L-222	ENST00000588494	WFIKKN2	Q8TEU8	576 aa		3.02	□□□□□ -1.93
NEDD4L-222	ENST00000588494	TANK	Q92844	425 aa		3.02	□□□□□ -1.93
NEDD4L-222	ENST00000588494	RHBDF1	Q96CC6	855 aa		3.02	□□□□□ -1.93
NEDD4L-222	ENST00000588494	TMEM19	Q96HH6	336 aa		3.02	□□□□□ -1.93
NEDD4L-222	ENST00000588494	EGLN2	Q96KS0	407 aa		3.02	□□□□□ -1.93
NEDD4L-222	ENST00000588494	PCYT2	Q99447	389 aa		3.02	□□□□□ -1.93
NEDD4L-222	ENST00000588494	HRH4	Q9H3N8	390 aa		3.02	□□□□□ -1.93
NEDD4L-222	ENST00000588494	DNAJC18	Q9H819	358 aa		3.02	□□□□□ -1.93
NEDD4L-222	ENST00000588494	EPB41L5	Q9HCM4	733 aa		3.02	□□□□□ -1.93
NEDD4L-222	ENST00000588494	CLIC5	Q9NZA1	410 aa		3.02	□□□□□ -1.93
NEDD4L-222	ENST00000588494	SIX4	Q9UIU6	781 aa		3.02	□□□□□ -1.93
NEDD4L-222	ENST00000588494	FBXL2	Q9UKC9	423 aa		3.02	□□□□□ -1.93
NEDD4L-222	ENST00000588494	VDAC3	Q9Y277	283 aa		3.02	□□□□□ -1.93
NEDD4L-222	ENST00000588494	AMDHD2	Q9Y303	409 aa		3.02	□□□□□ -1.93
NEDD4L-222	ENST00000588494	CMAHP	Q9Y471	501 aa		3.02	□□□□□ -1.93
NEDD4L-222	ENST00000588494	ADGRB2	O60241	1585 aa		3.02	□□□□□ -1.93
NEDD4L-222	ENST00000588494	SAMD9L	Q8IVG5	1584 aa		3.02	□□□□□ -1.93
NEDD4L-222	ENST00000588494	CFAP74	Q9C0B2	1584 aa		3.02	□□□□□ -1.93
NEDD4L-222	ENST00000588494	ASXL1	Q8IXJ9	1541 aa		3.02	□□□□□ -1.93
NEDD4L-222	ENST00000588494	C5orf42	Q9H799	3197 aa		3.02	□□□□□ -1.93
NEDD4L-222	ENST00000588494	ABCC5	O15440	1437 aa		3.02	□□□□□ -1.93
NEDD4L-222	ENST00000588494	REV3L	O60673	3130 aa		3.02	□□□□□ -1.93
NEDD4L-222	ENST00000588494	CACNA1I	Q9P0X4	2223 aa		3.01	□□□□□ -1.93
NEDD4L-222	ENST00000588494	TNR	Q92752	1358 aa		3.01	□□□□□ -1.93
NEDD4L-222	ENST00000588494	MROH1	Q8NDA8	1641 aa		3.01	□□□□□ -1.93
NEDD4L-222	ENST00000588494	NCOR1	O75376	2440 aa		3.01	□□□□□ -1.93
NEDD4L-222	ENST00000588494	MYO18B	Q8IUG5	2567 aa		3.01	□□□□□ -1.93
NEDD4L-222	ENST00000588494	IGKV2D-30	A0A075B6S6	120 aa		3.01	□□□□□ -1.93
NEDD4L-222	ENST00000588494	HNRNPCL2	B2RXH8	293 aa		3.01	□□□□□ -1.93
NEDD4L-222	ENST00000588494	ZBTB43	O43298	467 aa		3.01	□□□□□ -1.93
NEDD4L-222	ENST00000588494	PLPP2	O43688	288 aa		3.01	□□□□□ -1.93
NEDD4L-222	ENST00000588494	RFPL2	O75678	378 aa		3.01	□□□□□ -1.93
NEDD4L-222	ENST00000588494	BEST1	O76090	585 aa		3.01	□□□□□ -1.93
NEDD4L-222	ENST00000588494	PMS2P2	O95744	297 aa		3.01	□□□□□ -1.93
NEDD4L-222	ENST00000588494	CORO1A	P31146	461 aa	Known RBP	3.01	□□□□□ -1.93
NEDD4L-222	ENST00000588494	ACSL1	P33121	698 aa		3.01	□□□□□ -1.93
NEDD4L-222	ENST00000588494	MATR3	P43243	847 aa	Known RBP eCLIP	3.01	□□□□□ -1.93	3e-6	■■□□□ 12.9

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