RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583153.2

PTPRM-214, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRM, Length 713 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-214ENST00000583153 UNC13CQ8NB66 2214 aa8.2□□□□□ -1.1
PTPRM-214ENST00000583153 IGHV1OR21-1A0A087WYE8 117 aa8.2□□□□□ -1.1
PTPRM-214ENST00000583153 KIR2DS5A0A0G2JLQ3 304 aa8.2□□□□□ -1.1
PTPRM-214ENST00000583153 A0A0G2JNG1 304 aa8.2□□□□□ -1.1
PTPRM-214ENST00000583153 TCRBV7S2A1N4TA0A589 114 aa8.2□□□□□ -1.1
PTPRM-214ENST00000583153 EIF4E1BA6NMX2 242 aaKnown RBP8.2□□□□□ -1.1
PTPRM-214ENST00000583153 A8MU76 341 aa8.2□□□□□ -1.1
PTPRM-214ENST00000583153 KIR2DS3K7RE56 304 aa8.2□□□□□ -1.1
PTPRM-214ENST00000583153 CHUKO15111 745 aa8.2□□□□□ -1.1
PTPRM-214ENST00000583153 PSMD3O43242 534 aa8.2□□□□□ -1.1
PTPRM-214ENST00000583153 DUX1O43812 170 aa8.2□□□□□ -1.1
PTPRM-214ENST00000583153 POP7O75817 140 aaKnown RBP8.2□□□□□ -1.1
PTPRM-214ENST00000583153 VIPP01282 170 aa8.2□□□□□ -1.1
PTPRM-214ENST00000583153 IFNB1P01574 187 aa8.2□□□□□ -1.1
PTPRM-214ENST00000583153 ITGA2BP08514 1039 aa8.2□□□□□ -1.1
PTPRM-214ENST00000583153 CCDC175P0C221 793 aa8.2□□□□□ -1.1
PTPRM-214ENST00000583153 MSH3P20585 1137 aa8.2□□□□□ -1.1
PTPRM-214ENST00000583153 IDSP22304 550 aa8.2□□□□□ -1.1
PTPRM-214ENST00000583153 RPL10P27635 214 aaKnown RBP8.2□□□□□ -1.1
PTPRM-214ENST00000583153 PBLDP30039 288 aaPredicted RBP8.2□□□□□ -1.1
PTPRM-214ENST00000583153 SLC5A2P31639 672 aa8.2□□□□□ -1.1
PTPRM-214ENST00000583153 STIP1P31948 543 aaKnown RBP8.2□□□□□ -1.1
PTPRM-214ENST00000583153 CSTF2P33240 577 aaKnown RBP eCLIP8.2□□□□□ -1.1
PTPRM-214ENST00000583153 MLLT3P42568 568 aaPredicted RBP8.2□□□□□ -1.1
PTPRM-214ENST00000583153 FASLGP48023 281 aa8.2□□□□□ -1.1
PTPRM-214ENST00000583153 LMAN1P49257 510 aa8.2□□□□□ -1.1
PTPRM-214ENST00000583153 DRG2P55039 364 aaKnown RBP8.2□□□□□ -1.1
PTPRM-214ENST00000583153 CXADRP78310 365 aa8.2□□□□□ -1.1
PTPRM-214ENST00000583153 PDE1BQ01064 536 aa8.2□□□□□ -1.1
PTPRM-214ENST00000583153 SEPT6Q14141 434 aa8.2□□□□□ -1.1
PTPRM-214ENST00000583153 KIR2DS5Q14953 304 aa8.2□□□□□ -1.1
PTPRM-214ENST00000583153 NR1D2Q14995 579 aa8.2□□□□□ -1.1
PTPRM-214ENST00000583153 RPS6KA1Q15418 735 aa8.2□□□□□ -1.1
PTPRM-214ENST00000583153 CLPPQ16740 277 aaPredicted RBP8.2□□□□□ -1.1
PTPRM-214ENST00000583153 KHDC1Q4VXA5 237 aaKnown RBP8.2□□□□□ -1.1
PTPRM-214ENST00000583153 GPRC6AQ5T6X5 926 aa8.2□□□□□ -1.1
PTPRM-214ENST00000583153 IGF2-ASQ6U949 168 aa8.2□□□□□ -1.1
PTPRM-214ENST00000583153 RANBP10Q6VN20 620 aa8.2□□□□□ -1.1
PTPRM-214ENST00000583153 DET1Q7L5Y6 550 aa8.2□□□□□ -1.1
PTPRM-214ENST00000583153 TMPRSS9Q7Z410 1059 aa8.2□□□□□ -1.1
PTPRM-214ENST00000583153 ZNF438Q7Z4V0 828 aa8.2□□□□□ -1.1
PTPRM-214ENST00000583153 AMZ2Q86W34 360 aa8.2□□□□□ -1.1
PTPRM-214ENST00000583153 LRRC8AQ8IWT6 810 aa8.2□□□□□ -1.1
PTPRM-214ENST00000583153 KRT222Q8N1A0 295 aa8.2□□□□□ -1.1
PTPRM-214ENST00000583153 AVL9Q8NBF6 648 aa8.2□□□□□ -1.1
PTPRM-214ENST00000583153 RCBTB1Q8NDN9 531 aa8.2□□□□□ -1.1
PTPRM-214ENST00000583153 OR4D9Q8NGE8 314 aa8.2□□□□□ -1.1
PTPRM-214ENST00000583153 USP7Q93009 1102 aa8.2□□□□□ -1.1
PTPRM-214ENST00000583153 CXorf40BQ96DE9 158 aa8.2□□□□□ -1.1
PTPRM-214ENST00000583153 DCUN1D1Q96GG9 259 aa8.2□□□□□ -1.1
PTPRM-214ENST00000583153 CRELD1Q96HD1 420 aa8.2□□□□□ -1.1
PTPRM-214ENST00000583153 CCDC74BQ96LY2 380 aa8.2□□□□□ -1.1
PTPRM-214ENST00000583153 FCRL3Q96P31 734 aaPredicted RBP8.2□□□□□ -1.1
PTPRM-214ENST00000583153 DPYSL5Q9BPU6 564 aa8.2□□□□□ -1.1
PTPRM-214ENST00000583153 ASB8Q9H765 288 aa8.2□□□□□ -1.1
PTPRM-214ENST00000583153 SARS2Q9NP81 518 aaKnown RBP8.2□□□□□ -1.1
PTPRM-214ENST00000583153 CPNE7Q9UBL6 633 aa8.2□□□□□ -1.1
PTPRM-214ENST00000583153 SLC23A2Q9UGH3 650 aa8.2□□□□□ -1.1
PTPRM-214ENST00000583153 KLHL3Q9UH77 587 aa8.2□□□□□ -1.1
PTPRM-214ENST00000583153 FEZ2Q9UHY8 353 aaPredicted RBP8.2□□□□□ -1.1
PTPRM-214ENST00000583153 CRLS1Q9UJA2 301 aa8.2□□□□□ -1.1
PTPRM-214ENST00000583153 ZNF148Q9UQR1 794 aa8.2□□□□□ -1.1
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PTPRM-214ENST00000583153 IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 117 aa8.19□□□□□ -1.1
PTPRM-214ENST00000583153 OR2AG2A6NM03 316 aa8.19□□□□□ -1.1
PTPRM-214ENST00000583153 CDRT15L2A8MXV6 281 aa8.19□□□□□ -1.1
PTPRM-214ENST00000583153 E7EVH7 732 aa8.19□□□□□ -1.1
PTPRM-214ENST00000583153 GPR39O43194 453 aa8.19□□□□□ -1.1
PTPRM-214ENST00000583153 SRP72O76094 671 aaKnown RBP8.19□□□□□ -1.1
PTPRM-214ENST00000583153 PRAMEF1O95521 474 aa8.19□□□□□ -1.1
PTPRM-214ENST00000583153 METTL18O95568 372 aa8.19□□□□□ -1.1
PTPRM-214ENST00000583153 GAS8O95995 478 aa8.19□□□□□ -1.1
PTPRM-214ENST00000583153 RALBP11234 206 aa8.19□□□□□ -1.1
PTPRM-214ENST00000583153 AMD1P17707 334 aa8.19□□□□□ -1.1
PTPRM-214ENST00000583153 TPH1P17752 444 aa8.19□□□□□ -1.1
PTPRM-214ENST00000583153 ADRA1AP35348 466 aa8.19□□□□□ -1.1
PTPRM-214ENST00000583153 HADHAP40939 763 aa8.19□□□□□ -1.1
PTPRM-214ENST00000583153 HALP42357 657 aa8.19□□□□□ -1.1
PTPRM-214ENST00000583153 CLCNKAP51800 687 aa8.19□□□□□ -1.1
PTPRM-214ENST00000583153 LIMK2P53671 638 aa8.19□□□□□ -1.1
PTPRM-214ENST00000583153 GDF10P55107 478 aa8.19□□□□□ -1.1
PTPRM-214ENST00000583153 TMPRSS3P57727 454 aa8.19□□□□□ -1.1
PTPRM-214ENST00000583153 TLE3Q04726 772 aa8.19□□□□□ -1.1
PTPRM-214ENST00000583153 KLF1Q13351 362 aaPredicted RBP8.19□□□□□ -1.1
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PTPRM-214ENST00000583153 SNX1Q13596 522 aa8.19□□□□□ -1.1
PTPRM-214ENST00000583153 C16orf72Q14CZ0 275 aa8.19□□□□□ -1.1
PTPRM-214ENST00000583153 LONRF2Q1L5Z9 754 aa8.19□□□□□ -1.1
PTPRM-214ENST00000583153 P3H1Q32P28 736 aa8.19□□□□□ -1.1
PTPRM-214ENST00000583153 FNBP1LQ5T0N5 605 aa8.19□□□□□ -1.1
PTPRM-214ENST00000583153 CHCHD2P9Q5T1J5 151 aaPredicted RBP8.19□□□□□ -1.1
PTPRM-214ENST00000583153 TMEM71Q6P5X7 295 aa8.19□□□□□ -1.1
PTPRM-214ENST00000583153 TMEM220Q6QAJ8 160 aa8.19□□□□□ -1.1
PTPRM-214ENST00000583153 ZNF574Q6ZN55 896 aaPredicted RBP8.19□□□□□ -1.1
PTPRM-214ENST00000583153 FAM129CQ86XR2 697 aa8.19□□□□□ -1.1
PTPRM-214ENST00000583153 SLITRK4Q8IW52 837 aa8.19□□□□□ -1.1
PTPRM-214ENST00000583153 RASGEF1AQ8N9B8 481 aa8.19□□□□□ -1.1
PTPRM-214ENST00000583153 DNAAF3Q8N9W5 541 aa8.19□□□□□ -1.1
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