RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580081.1

CLTC-212, Transcript of clathrin heavy chain, humanhuman

TSL 4

Gene CLTC, Length 575 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTC-212ENST00000580081 DHRS4L1P0CG22 281 aa8.66□□□□□ -1.02
CLTC-212ENST00000580081 CCDC166P0CW27 439 aa8.66□□□□□ -1.02
CLTC-212ENST00000580081 CHRM3P20309 590 aa8.66□□□□□ -1.02
CLTC-212ENST00000580081 OXTRP30559 389 aa8.66□□□□□ -1.02
CLTC-212ENST00000580081 SERPINB4P48594 390 aa8.66□□□□□ -1.02
CLTC-212ENST00000580081 WDR4P57081 412 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
CLTC-212ENST00000580081 ZXDAP98168 799 aa8.66□□□□□ -1.02
CLTC-212ENST00000580081 B4GALNT1Q00973 533 aa8.66□□□□□ -1.02
CLTC-212ENST00000580081 IRF9Q00978 393 aa8.66□□□□□ -1.02
CLTC-212ENST00000580081 TIAL1Q01085 375 aaKnown RBP eCLIP8.66□□□□□ -1.02
CLTC-212ENST00000580081 GUCY1A3Q02108 690 aa8.66□□□□□ -1.02
CLTC-212ENST00000580081 ZNF460Q14592 562 aa8.66□□□□□ -1.02
CLTC-212ENST00000580081 WSCD2Q2TBF2 565 aa8.66□□□□□ -1.02
CLTC-212ENST00000580081 TTLL9Q3SXZ7 439 aa8.66□□□□□ -1.02
CLTC-212ENST00000580081 TBC1D3GQ6DHY5 549 aa8.66□□□□□ -1.02
CLTC-212ENST00000580081 TBC1D3CQ6IPX1 549 aa8.66□□□□□ -1.02
CLTC-212ENST00000580081 PNCKQ6P2M8 343 aa8.66□□□□□ -1.02
CLTC-212ENST00000580081 FAM124AQ86V42 546 aa8.66□□□□□ -1.02
CLTC-212ENST00000580081 PIM3Q86V86 326 aa8.66□□□□□ -1.02
CLTC-212ENST00000580081 TAX1BP1Q86VP1 789 aa8.66□□□□□ -1.02
CLTC-212ENST00000580081 TRIM42Q8IWZ5 723 aa8.66□□□□□ -1.02
CLTC-212ENST00000580081 TBC1D3Q8IZP1 549 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
CLTC-212ENST00000580081 PLD6Q8N2A8 252 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
CLTC-212ENST00000580081 NKAPQ8N5F7 415 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
CLTC-212ENST00000580081 CLDN19Q8N6F1 224 aa8.66□□□□□ -1.02
CLTC-212ENST00000580081 DENND6BQ8NEG7 585 aa8.66□□□□□ -1.02
CLTC-212ENST00000580081 RDH11Q8TC12 318 aa8.66□□□□□ -1.02
CLTC-212ENST00000580081 CD200R1Q8TD46 325 aa8.66□□□□□ -1.02
CLTC-212ENST00000580081 KCTD4Q8WVF5 259 aa8.66□□□□□ -1.02
CLTC-212ENST00000580081 INPP5DQ92835 1189 aa8.66□□□□□ -1.02
CLTC-212ENST00000580081 HIC2Q96JB3 615 aa8.66□□□□□ -1.02
CLTC-212ENST00000580081 ZNF514Q96K75 400 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
CLTC-212ENST00000580081 GPR21Q99679 349 aa8.66□□□□□ -1.02
CLTC-212ENST00000580081 PAIP2Q9BPZ3 127 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
CLTC-212ENST00000580081 SLC17A9Q9BYT1 436 aa8.66□□□□□ -1.02
CLTC-212ENST00000580081 EPHX3Q9H6B9 360 aa8.66□□□□□ -1.02
CLTC-212ENST00000580081 NMRAL1Q9HBL8 299 aa8.66□□□□□ -1.02
CLTC-212ENST00000580081 LATS2Q9NRM7 1088 aa8.66□□□□□ -1.02
CLTC-212ENST00000580081 SPATS2LQ9NUQ6 558 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
CLTC-212ENST00000580081 EMCNQ9ULC0 261 aa8.66□□□□□ -1.02
CLTC-212ENST00000580081 CNOT6Q9ULM6 557 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
CLTC-212ENST00000580081 DHRS7Q9Y394 339 aa8.66□□□□□ -1.02
CLTC-212ENST00000580081 PRR23AA6NEV1 266 aa8.65□□□□□ -1.02
CLTC-212ENST00000580081 K7ESM1 405 aa8.65□□□□□ -1.02
CLTC-212ENST00000580081 EIF3FO00303 357 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
CLTC-212ENST00000580081 KPNA5O15131 536 aa8.65□□□□□ -1.02
CLTC-212ENST00000580081 INPP4BO15327 924 aa8.65□□□□□ -1.02
CLTC-212ENST00000580081 BIRC5O15392 142 aa8.65□□□□□ -1.02
CLTC-212ENST00000580081 SEMA4FO95754 770 aa8.65□□□□□ -1.02
CLTC-212ENST00000580081 TOP3BO95985 862 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
CLTC-212ENST00000580081 PCCBP05166 539 aa8.65□□□□□ -1.02
CLTC-212ENST00000580081 RBP1P09455 135 aa8.65□□□□□ -1.02
CLTC-212ENST00000580081 GSTM1P09488 218 aa8.65□□□□□ -1.02
CLTC-212ENST00000580081 LSP1P33241 339 aa8.65□□□□□ -1.02
CLTC-212ENST00000580081 NUDT1P36639 197 aa8.65□□□□□ -1.02
CLTC-212ENST00000580081 RGS4P49798 205 aa8.65□□□□□ -1.02
CLTC-212ENST00000580081 CCR5P51681 352 aa8.65□□□□□ -1.02
CLTC-212ENST00000580081 CLCN7P51798 805 aa8.65□□□□□ -1.02
CLTC-212ENST00000580081 IL2P60568 153 aa8.65□□□□□ -1.02
CLTC-212ENST00000580081 ATP6V0D1P61421 351 aa8.65□□□□□ -1.02
CLTC-212ENST00000580081 GNGT1P63211 74 aa8.65□□□□□ -1.02
CLTC-212ENST00000580081 CBX1P83916 185 aa8.65□□□□□ -1.02
CLTC-212ENST00000580081 GSTM4Q03013 218 aa8.65□□□□□ -1.02
CLTC-212ENST00000580081 SIGLEC14Q08ET2 396 aa8.65□□□□□ -1.02
CLTC-212ENST00000580081 GTF2H3Q13889 308 aa8.65□□□□□ -1.02
CLTC-212ENST00000580081 FGL2Q14314 439 aa8.65□□□□□ -1.02
CLTC-212ENST00000580081 CSHL1Q14406 222 aa8.65□□□□□ -1.02
CLTC-212ENST00000580081 ACAP2Q15057 778 aa8.65□□□□□ -1.02
CLTC-212ENST00000580081 IRF4Q15306 451 aa8.65□□□□□ -1.02
CLTC-212ENST00000580081 PDK4Q16654 411 aa8.65□□□□□ -1.02
CLTC-212ENST00000580081 BCL7AQ4VC05 210 aa8.65□□□□□ -1.02
CLTC-212ENST00000580081 ZNF787Q6DD87 383 aa8.65□□□□□ -1.02
CLTC-212ENST00000580081 ANO7Q6IWH7 933 aa8.65□□□□□ -1.02
CLTC-212ENST00000580081 LRRC8EQ6NSJ5 796 aa8.65□□□□□ -1.02
CLTC-212ENST00000580081 C16orf46Q6P387 395 aa8.65□□□□□ -1.02
CLTC-212ENST00000580081 PAQR3Q6TCH7 311 aa8.65□□□□□ -1.02
CLTC-212ENST00000580081 TMEM207Q6UWW9 146 aa8.65□□□□□ -1.02
CLTC-212ENST00000580081 HEATR4Q86WZ0 1026 aa8.65□□□□□ -1.02
CLTC-212ENST00000580081 CAMKK1Q8N5S9 505 aa8.65□□□□□ -1.02
CLTC-212ENST00000580081 CCDC63Q8NA47 563 aa8.65□□□□□ -1.02
CLTC-212ENST00000580081 SIDT2Q8NBJ9 832 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
CLTC-212ENST00000580081 TP53I13Q8NBR0 393 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
CLTC-212ENST00000580081 ARMC2Q8NEN0 867 aa8.65□□□□□ -1.02
CLTC-212ENST00000580081 GIMAP7Q8NHV1 300 aa8.65□□□□□ -1.02
CLTC-212ENST00000580081 ANKRD49Q8WVL7 239 aa8.65□□□□□ -1.02
CLTC-212ENST00000580081 CKAP2Q8WWK9 683 aa8.65□□□□□ -1.02
CLTC-212ENST00000580081 NXNL1Q96CM4 212 aa8.65□□□□□ -1.02
CLTC-212ENST00000580081 CCDC97Q96F63 343 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
CLTC-212ENST00000580081 COX14Q96I36 57 aa8.65□□□□□ -1.02
CLTC-212ENST00000580081 SCYL1Q96KG9 808 aa8.65□□□□□ -1.02
CLTC-212ENST00000580081 MAGEB18Q96M61 343 aa8.65□□□□□ -1.02
CLTC-212ENST00000580081 GPR78Q96P69 363 aa8.65□□□□□ -1.02
CLTC-212ENST00000580081 LENG8Q96PV6 779 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
CLTC-212ENST00000580081 HHIPQ96QV1 700 aa8.65□□□□□ -1.02
CLTC-212ENST00000580081 MRPL57Q9BQC6 102 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
CLTC-212ENST00000580081 FAM126AQ9BYI3 521 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
CLTC-212ENST00000580081 DERL2Q9GZP9 239 aa8.65□□□□□ -1.02
CLTC-212ENST00000580081 MRPL46Q9H2W6 279 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
CLTC-212ENST00000580081 WDR26Q9H7D7 661 aa8.65□□□□□ -1.02
CLTC-212ENST00000580081 TRIM39Q9HCM9 518 aa8.65□□□□□ -1.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.4 ms