RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000577468.2

PTPRM-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRM, Length 701 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-204ENST00000577468 KRT16P08779 473 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 LINGO3P0C6S8 592 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 MYF5P13349 255 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 LAMP2P13473 410 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 FDPSP14324 419 aaKnown RBP3.04□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 PKMP14618 531 aaKnown RBP3.04□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 ETS1P14921 441 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 ITGAXP20702 1163 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 CYP3A5P20815 502 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 HNRNPA2B1P22626 353 aaKnown RBP3.04□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 CALB2P22676 271 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 ADRA1DP25100 572 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 ABCD3P28288 659 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 PTPN4P29074 926 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 TYK2P29597 1187 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 GCH1P30793 250 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 CHRNA3P32297 505 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 CHRNA7P36544 502 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 SLC1A4P43007 532 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 MAGEA11P43364 429 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 PIK3CGP48736 1102 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 LMAN1P49257 510 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 SLC11A2P49281 568 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 TMED10P49755 219 aaKnown RBP3.04□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 CLCNKBP51801 687 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 SELENOVP59797 346 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 HNRNPKP61978 463 aaKnown RBP eCLIP3.04□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 PSMC6P62333 389 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 SKP1P63208 163 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 FAM189BP81408 668 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 XIAPP98170 497 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 SPIBQ01892 262 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 TNFRSF17Q02223 184 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP3.04□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 ALDH6A1Q02252 535 aaKnown RBP3.04□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 CHRNDQ07001 517 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 OVGP1Q12889 678 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 TRAF2Q12933 501 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 LRRC32Q14392 662 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 TMEM132BQ14DG7 1078 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 KARSQ15046 597 aaKnown RBP3.04□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 TBCEQ15813 527 aaPredicted RBP3.04□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 PCGF3Q3KNV8 242 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 ANO6Q4KMQ2 910 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 NKAIN1Q4KMZ8 207 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 TMEM119Q4V9L6 283 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 ZCWPW2Q504Y3 356 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 GLE1Q53GS7 698 aaKnown RBP3.04□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 PAGE2BQ5JRK9 111 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 PRAMEF14Q5SWL7 426 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 CCNJQ5T5M9 372 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 ARHGEF16Q5VV41 709 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 GARNL3Q5VVW2 1013 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 DENND2CQ68D51 928 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 PLA2G4FQ68DD2 849 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 RINT1Q6NUQ1 792 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 C1orf94Q6P1W5 598 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 NFRKBQ6P4R8 1299 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 TMEM270Q6UE05 265 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 MFSD7Q6UXD7 560 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 C4orf22Q6V702 233 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 IDO2Q6ZQW0 420 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 RTL4Q6ZR62 310 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 RBM43Q6ZSC3 357 aaKnown RBP3.04□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 CYP4V2Q6ZWL3 525 aaPredicted RBP3.04□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 USP49Q70CQ1 688 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 MIGA2Q7L4E1 593 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 FAM122BQ7Z309 247 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 TMPRSS9Q7Z410 1059 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 DCXRQ7Z4W1 244 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 KCTD20Q7Z5Y7 419 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 BIVMQ86UB2 503 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 CXorf67Q86X51 503 aaPredicted RBP3.04□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 PALB2Q86YC2 1186 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 RASAL3Q86YV0 1011 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 TICAM1Q8IUC6 712 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 TBC1D10CQ8IV04 446 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 CNGA4Q8IV77 575 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 GPR65Q8IYL9 337 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 SLC38A6Q8IZM9 456 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 LINC00518Q8N0U6 118 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 IQCKQ8N0W5 287 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 NXPE1Q8N323 547 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 BOLLQ8N9W6 283 aaKnown RBP3.04□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 FSIP1Q8NA03 581 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 FNDC5Q8NAU1 212 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 POGLUT1Q8NBL1 392 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 FAM98AQ8NCA5 519 aaKnown RBP3.04□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 CLRN3Q8NCR9 226 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 OR6B3Q8NGW1 331 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 EXD1Q8NHP7 514 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 CD300LFQ8TDQ1 290 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 HCAR2Q8TDS4 363 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 SCARB1Q8WTV0 552 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 NSMCE1Q8WV22 266 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 KCNE4Q8WWG9 221 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 LINC00476Q8WZB0 136 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 DLG3Q92796 817 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 MR1Q95460 341 aa3.04□□□□□ -1.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.4 ms