RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000575783.5

CTDNEP1-211, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

TSL 5

Gene CTDNEP1, Length 876 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-211ENST00000575783 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
CTDNEP1-211ENST00000575783 JCHAINP01591 159 aa15.94■□□□□ 0.14
CTDNEP1-211ENST00000575783 RAB40ALP0C0E4 278 aa15.94■□□□□ 0.14
CTDNEP1-211ENST00000575783 IL4RP24394 825 aa15.94■□□□□ 0.14
CTDNEP1-211ENST00000575783 MIPP30301 263 aa15.94■□□□□ 0.14
CTDNEP1-211ENST00000575783 CDH6P55285 790 aa15.94■□□□□ 0.14
CTDNEP1-211ENST00000575783 GSDMDP57764 484 aa15.94■□□□□ 0.14
CTDNEP1-211ENST00000575783 TUBB4BP68371 445 aa15.94■□□□□ 0.14
CTDNEP1-211ENST00000575783 HSD11B2P80365 405 aa15.94■□□□□ 0.14
CTDNEP1-211ENST00000575783 TUBB2AQ13885 445 aa15.94■□□□□ 0.14
CTDNEP1-211ENST00000575783 PLEKHS1Q5SXH7 462 aa15.94■□□□□ 0.14
CTDNEP1-211ENST00000575783 TMCO3Q6UWJ1 677 aa15.94■□□□□ 0.14
CTDNEP1-211ENST00000575783 ABRAXAS1Q6UWZ7 409 aa15.94■□□□□ 0.14
CTDNEP1-211ENST00000575783 ADGRG6Q86SQ4 1221 aa15.94■□□□□ 0.14
CTDNEP1-211ENST00000575783 MLKLQ8NB16 471 aa15.94■□□□□ 0.14
CTDNEP1-211ENST00000575783 ST6GALNAC3Q8NDV1 305 aa15.94■□□□□ 0.14
CTDNEP1-211ENST00000575783 LPCAT1Q8NF37 534 aa15.94■□□□□ 0.14
CTDNEP1-211ENST00000575783 INPP5DQ92835 1189 aa15.94■□□□□ 0.14
CTDNEP1-211ENST00000575783 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
CTDNEP1-211ENST00000575783 TUBB2BQ9BVA1 445 aa15.94■□□□□ 0.14
CTDNEP1-211ENST00000575783 SPATA16Q9BXB7 569 aa15.94■□□□□ 0.14
CTDNEP1-211ENST00000575783 AGPAT4Q9NRZ5 378 aa15.94■□□□□ 0.14
CTDNEP1-211ENST00000575783 DTLQ9NZJ0 730 aa15.94■□□□□ 0.14
CTDNEP1-211ENST00000575783 PKD2L2Q9NZM6 624 aa15.94■□□□□ 0.14
CTDNEP1-211ENST00000575783 TMEM63CQ9P1W3 806 aa15.94■□□□□ 0.14
CTDNEP1-211ENST00000575783 EPHB6O15197 1021 aa15.93■□□□□ 0.14
CTDNEP1-211ENST00000575783 KMOO15229 486 aa15.93■□□□□ 0.14
CTDNEP1-211ENST00000575783 DDX3YO15523 660 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
CTDNEP1-211ENST00000575783 RNF8O76064 485 aa15.93■□□□□ 0.14
CTDNEP1-211ENST00000575783 IDSP22304 550 aa15.93■□□□□ 0.14
CTDNEP1-211ENST00000575783 CA5AP35218 305 aa15.93■□□□□ 0.14
CTDNEP1-211ENST00000575783 IHHQ14623 411 aa15.93■□□□□ 0.14
CTDNEP1-211ENST00000575783 LLGL1Q15334 1064 aa15.93■□□□□ 0.14
CTDNEP1-211ENST00000575783 ANKRD20A8PQ5CZ79 823 aa15.93■□□□□ 0.14
CTDNEP1-211ENST00000575783 CRB2Q5IJ48 1285 aa15.93■□□□□ 0.14
CTDNEP1-211ENST00000575783 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
CTDNEP1-211ENST00000575783 ALS2CLQ60I27 953 aa15.93■□□□□ 0.14
CTDNEP1-211ENST00000575783 LRRTM4Q86VH4 590 aa15.93■□□□□ 0.14
CTDNEP1-211ENST00000575783 RAVER1Q8IY67 606 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
CTDNEP1-211ENST00000575783 MCOLN2Q8IZK6 566 aa15.93■□□□□ 0.14
CTDNEP1-211ENST00000575783 CCHCR1Q8TD31 782 aa15.93■□□□□ 0.14
CTDNEP1-211ENST00000575783 CLIP3Q96DZ5 547 aa15.93■□□□□ 0.14
CTDNEP1-211ENST00000575783 BARD1Q99728 777 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
CTDNEP1-211ENST00000575783 AGPAT1Q99943 283 aa15.93■□□□□ 0.14
CTDNEP1-211ENST00000575783 POLR1EQ9GZS1 481 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
CTDNEP1-211ENST00000575783 TAB2Q9NYJ8 693 aa15.93■□□□□ 0.14
CTDNEP1-211ENST00000575783 TTLL3Q9Y4R7 772 aa15.93■□□□□ 0.14
CTDNEP1-211ENST00000575783 CROCCQ5TZA2 2017 aa15.93■□□□□ 0.14
CTDNEP1-211ENST00000575783 H3BRJ5 948 aa15.92■□□□□ 0.14
CTDNEP1-211ENST00000575783 CHUKO15111 745 aa15.92■□□□□ 0.14
CTDNEP1-211ENST00000575783 MTX2O75431 263 aa15.92■□□□□ 0.14
CTDNEP1-211ENST00000575783 PRLP01236 227 aa15.92■□□□□ 0.14
CTDNEP1-211ENST00000575783 ALPPP05187 535 aa15.92■□□□□ 0.14
CTDNEP1-211ENST00000575783 OTX2P32243 289 aa15.92■□□□□ 0.14
CTDNEP1-211ENST00000575783 ZNF135P52742 658 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
CTDNEP1-211ENST00000575783 DSC2Q02487 901 aa15.92■□□□□ 0.14
CTDNEP1-211ENST00000575783 MAMLD1Q13495 774 aa15.92■□□□□ 0.14
CTDNEP1-211ENST00000575783 ZNF569Q5MCW4 686 aa15.92■□□□□ 0.14
CTDNEP1-211ENST00000575783 KLHL35Q6PF15 583 aa15.92■□□□□ 0.14
CTDNEP1-211ENST00000575783 CYP4V2Q6ZWL3 525 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
CTDNEP1-211ENST00000575783 CUZD1Q86UP6 607 aa15.92■□□□□ 0.14
CTDNEP1-211ENST00000575783 KMT5CQ86Y97 462 aa15.92■□□□□ 0.14
CTDNEP1-211ENST00000575783 DSELQ8IZU8 1212 aa15.92■□□□□ 0.14
CTDNEP1-211ENST00000575783 D2HGDHQ8N465 521 aa15.92■□□□□ 0.14
CTDNEP1-211ENST00000575783 ZADH2Q8N4Q0 377 aa15.92■□□□□ 0.14
CTDNEP1-211ENST00000575783 CPT1BQ92523 772 aa15.92■□□□□ 0.14
CTDNEP1-211ENST00000575783 ZNF653Q96CK0 615 aa15.92■□□□□ 0.14
CTDNEP1-211ENST00000575783 ZNF501Q96CX3 271 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
CTDNEP1-211ENST00000575783 TDRD1Q9BXT4 1180 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
CTDNEP1-211ENST00000575783 COPG2Q9UBF2 871 aa15.92■□□□□ 0.14
CTDNEP1-211ENST00000575783 WDR37Q9Y2I8 494 aa15.92■□□□□ 0.14
CTDNEP1-211ENST00000575783 DCHS2Q6V1P9 2916 aa15.91■□□□□ 0.14
CTDNEP1-211ENST00000575783 HEATR9A2RTY3 570 aa15.91■□□□□ 0.14
CTDNEP1-211ENST00000575783 RGSL1A5PLK6 1076 aa15.91■□□□□ 0.14
CTDNEP1-211ENST00000575783 GPR89AB7ZAQ6 455 aa15.91■□□□□ 0.14
CTDNEP1-211ENST00000575783 GPR89BP0CG08 455 aa15.91■□□□□ 0.14
CTDNEP1-211ENST00000575783 FECHP22830 423 aa15.91■□□□□ 0.14
CTDNEP1-211ENST00000575783 ARL4AP40617 200 aa15.91■□□□□ 0.14
CTDNEP1-211ENST00000575783 PLCL1Q15111 1095 aa15.91■□□□□ 0.14
CTDNEP1-211ENST00000575783 TMTC4Q5T4D3 741 aa15.91■□□□□ 0.14
CTDNEP1-211ENST00000575783 AGAP9Q5VTM2 703 aa15.91■□□□□ 0.14
CTDNEP1-211ENST00000575783 ACAD10Q6JQN1 1059 aa15.91■□□□□ 0.14
CTDNEP1-211ENST00000575783 WASH2PQ6VEQ5 465 aa15.91■□□□□ 0.14
CTDNEP1-211ENST00000575783 KCNMB4Q86W47 210 aa15.91■□□□□ 0.14
CTDNEP1-211ENST00000575783 PSTKQ8IV42 348 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
CTDNEP1-211ENST00000575783 TEX26Q8N6G2 289 aa15.91■□□□□ 0.14
CTDNEP1-211ENST00000575783 OR8K5Q8NH50 307 aa15.91■□□□□ 0.14
CTDNEP1-211ENST00000575783 LURAP1Q96LR2 239 aa15.91■□□□□ 0.14
CTDNEP1-211ENST00000575783 LRFN5Q96NI6 719 aa15.91■□□□□ 0.14
CTDNEP1-211ENST00000575783 TIMM29Q9BSF4 260 aa15.91■□□□□ 0.14
CTDNEP1-211ENST00000575783 PCDH9Q9HC56 1237 aa15.91■□□□□ 0.14
CTDNEP1-211ENST00000575783 SAMSN1Q9NSI8 373 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
CTDNEP1-211ENST00000575783 PARVAQ9NVD7 372 aa15.91■□□□□ 0.14
CTDNEP1-211ENST00000575783 PCDHGA10Q9Y5H3 936 aa15.91■□□□□ 0.14
CTDNEP1-211ENST00000575783 MTORP42345 2549 aa15.9■□□□□ 0.14
CTDNEP1-211ENST00000575783 TLCD2A6NGC4 264 aa15.9■□□□□ 0.14
CTDNEP1-211ENST00000575783 TMCO5BA8MYB1 307 aa15.9■□□□□ 0.14
CTDNEP1-211ENST00000575783 ATMINO43313 823 aaPredicted RBP15.9■□□□□ 0.14
CTDNEP1-211ENST00000575783 CDK14O94921 469 aa15.9■□□□□ 0.14
CTDNEP1-211ENST00000575783 LCA5LO95447 670 aa15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.6 ms