RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568169.5

TCF4-238, Transcript of transcription factor 4, human

TSL 5

Gene TCF4, Length 870 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TCF4-238	ENST00000568169	TUBB3	Q13509	450 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TCF4-238	ENST00000568169	IL10RA	Q13651	578 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TCF4-238	ENST00000568169	KRT81	Q14533	505 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TCF4-238	ENST00000568169	SEPT7	Q16181	437 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
TCF4-238	ENST00000568169	ASIC2	Q16515	512 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TCF4-238	ENST00000568169	EIF2S3L	Q2VIR3	472 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
TCF4-238	ENST00000568169	PLA2G4E	Q3MJ16	856 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TCF4-238	ENST00000568169	TDRD12	Q587J7	1177 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
TCF4-238	ENST00000568169	NCBP2-AS2	Q69YL0	99 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TCF4-238	ENST00000568169	PDPK2P	Q6A1A2	396 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TCF4-238	ENST00000568169	FAM199X	Q6PEV8	388 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
TCF4-238	ENST00000568169	RBM43	Q6ZSC3	357 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
TCF4-238	ENST00000568169	LRRTM4	Q86VH4	590 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TCF4-238	ENST00000568169	TRAM1L1	Q8N609	369 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TCF4-238	ENST00000568169	SIDT2	Q8NBJ9	832 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
TCF4-238	ENST00000568169	UBXN4	Q92575	508 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TCF4-238	ENST00000568169	ZSCAN5A	Q9BUG6	496 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TCF4-238	ENST00000568169	NUP85	Q9BW27	656 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TCF4-238	ENST00000568169	ING2	Q9H160	280 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TCF4-238	ENST00000568169	ZFYVE1	Q9HBF4	777 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TCF4-238	ENST00000568169	CASS4	Q9NQ75	786 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TCF4-238	ENST00000568169	ACSS2	Q9NR19	701 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TCF4-238	ENST00000568169	DNAJC16	Q9Y2G8	782 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TCF4-238	ENST00000568169	ZNF451	Q9Y4E5	1061 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TCF4-238	ENST00000568169	PCDHGB7	Q9Y5F8	929 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TCF4-238	ENST00000568169	ARGFX	A6NJG6	315 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TCF4-238	ENST00000568169	OR52A4P	A6NMU1	304 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TCF4-238	ENST00000568169	JCHAIN	P01591	159 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TCF4-238	ENST00000568169	LPO	P22079	712 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
TCF4-238	ENST00000568169	IDS	P22304	550 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TCF4-238	ENST00000568169	VARS	P26640	1264 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
TCF4-238	ENST00000568169	ACY1	Q03154	408 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TCF4-238	ENST00000568169	MRPL49	Q13405	166 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
TCF4-238	ENST00000568169	DPYSL3	Q14195	570 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TCF4-238	ENST00000568169	KCNAB1	Q14722	419 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TCF4-238	ENST00000568169	CHRNA6	Q15825	494 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TCF4-238	ENST00000568169	KHDC1	Q4VXA5	237 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
TCF4-238	ENST00000568169	PRR30	Q53SZ7	412 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
TCF4-238	ENST00000568169	CCDC183	Q5T5S1	534 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TCF4-238	ENST00000568169	ALS2CL	Q60I27	953 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TCF4-238	ENST00000568169	ZNF787	Q6DD87	383 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TCF4-238	ENST00000568169	JMJD6	Q6NYC1	403 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
TCF4-238	ENST00000568169	ZNF517	Q6ZMY9	492 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
TCF4-238	ENST00000568169	MAMDC2	Q7Z304	686 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
TCF4-238	ENST00000568169	TMC3	Q7Z5M5	1100 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TCF4-238	ENST00000568169	C11orf96	Q7Z7L8	435 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TCF4-238	ENST00000568169	KMT5C	Q86Y97	462 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TCF4-238	ENST00000568169		Q8NA96	180 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TCF4-238	ENST00000568169	ADAMTS17	Q8TE56	1095 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TCF4-238	ENST00000568169	CXorf40B	Q96DE9	158 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TCF4-238	ENST00000568169	TRIB3	Q96RU7	358 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TCF4-238	ENST00000568169	ADGRE3	Q9BY15	652 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TCF4-238	ENST00000568169	RAD18	Q9NS91	495 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TCF4-238	ENST00000568169	FGF21	Q9NSA1	209 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TCF4-238	ENST00000568169	IP6K2	Q9UHH9	426 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TCF4-238	ENST00000568169	FARSA	Q9Y285	508 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
TCF4-238	ENST00000568169	WDR37	Q9Y2I8	494 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TCF4-238	ENST00000568169	ABCA12	Q86UK0	2595 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TCF4-238	ENST00000568169	PRRC2C	Q9Y520	2896 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
TCF4-238	ENST00000568169	DPM1	O60762	260 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TCF4-238	ENST00000568169	MTX2	O75431	263 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TCF4-238	ENST00000568169	CDK14	O94921	469 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TCF4-238	ENST00000568169	CLDN1	O95832	211 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TCF4-238	ENST00000568169	EBLN1	P0CF75	366 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TCF4-238	ENST00000568169	FECH	P22830	423 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TCF4-238	ENST00000568169	COL8A1	P27658	744 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TCF4-238	ENST00000568169	DCT	P40126	519 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TCF4-238	ENST00000568169	CD86	P42081	329 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TCF4-238	ENST00000568169	PTGIR	P43119	386 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TCF4-238	ENST00000568169	DRG2	P55039	364 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
TCF4-238	ENST00000568169	PDE1B	Q01064	536 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TCF4-238	ENST00000568169	KLHL30	Q0D2K2	578 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TCF4-238	ENST00000568169	SLC10A2	Q12908	348 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
TCF4-238	ENST00000568169	GALNT3	Q14435	633 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TCF4-238	ENST00000568169	CERS6	Q6ZMG9	384 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TCF4-238	ENST00000568169	HPS6	Q86YV9	775 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TCF4-238	ENST00000568169	CNTD1	Q8N815	330 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TCF4-238	ENST00000568169	LRRN4	Q8WUT4	740 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TCF4-238	ENST00000568169	HDAC11	Q96DB2	347 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TCF4-238	ENST00000568169	ZNF514	Q96K75	400 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
TCF4-238	ENST00000568169	BTBD6	Q96KE9	485 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TCF4-238	ENST00000568169	MAP3K3	Q99759	626 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TCF4-238	ENST00000568169	SLC29A3	Q9BZD2	475 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TCF4-238	ENST00000568169	MAGEE1	Q9HCI5	957 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TCF4-238	ENST00000568169	ANO10	Q9NW15	660 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TCF4-238	ENST00000568169	CHMP5	Q9NZZ3	219 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TCF4-238	ENST00000568169	TMPRSS11E	Q9UL52	423 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TCF4-238	ENST00000568169	SHOC2	Q9UQ13	582 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TCF4-238	ENST00000568169	PCSK5	Q92824	1860 aa		11.15	□□□□□ -0.63
TCF4-238	ENST00000568169	SNRNP200	O75643	2136 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
TCF4-238	ENST00000568169	KCNJ13	O60928	360 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TCF4-238	ENST00000568169	CPNE3	O75131	537 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
TCF4-238	ENST00000568169	LDLR	P01130	860 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TCF4-238	ENST00000568169	SKIL	P12757	684 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TCF4-238	ENST00000568169	BPI	P17213	487 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TCF4-238	ENST00000568169	VCL	P18206	1134 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TCF4-238	ENST00000568169	MX2	P20592	715 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TCF4-238	ENST00000568169	GBE1	Q04446	702 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TCF4-238	ENST00000568169	GPS2	Q13227	327 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TCF4-238	ENST00000568169	ATP13A4	Q4VNC1	1196 aa		11.14	□□□□□ -0.63

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